BACKGROUND: The membrane-bound proteins belonging to DUF677 (domain of unknown function 677) are found mainly in green plants. The function of the DUF677 gene (AT14A) has been investigated in Arabidopsis and tomato in relation to drought stress tolerance. Overexpression of AT14A improves drought tolerance in tomato, promotes growth in Arabidopsis during drought stress, and confers tolerance against oxidative damage caused by drought stress in suspension-cultured A. thaliana. However, the role of the DUF677 gene family has not yet been reported in cotton.
RESULTS: We identified 148 DUF677 gene
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Whole-cell biosensor (WCB) is a convenient and practical assay that can monitor bioavailable lead (Pb) contamination. However, existing Pb-responsive WCB struggle to meet practical detection needs due to the lack of sensitivity, specificity, and stability. In this study, we developed a Pb WCB using the Pb resistance transcriptional regulatory factor (PbrR) and green fluorescent protein (GFP), and improved its performance by directed evolution in conjunction with fluorescence-activated cell sorting (FACS). After 3 rounds of screening, we acquired a biosensor mutant (PbrR-E3). The evolved bi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sex chromosomes often evolve unique patterns of gene expression during spermatogenesis. In many species, sex-linked genes are downregulated during meiosis in response to asynapsis of the heterogametic sex chromosome pair (meiotic sex chromosome inactivation; MSCI). This process has evolved convergently across many taxa with independently derived sex chromosomes. Our understanding how quickly MSCI can evolve and whether it is connected to the degree of sequence degeneration remains limited. Teleost fish are a noteworthy group to investigate MSCI because sex chromosomes have evolved repeatedly a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The early detection of high-fitness viral variants is critical for pandemic response, yet limited experimental resources at the onset of variant emergence hinder effective identification. To address this, we introduce an active learning framework, VIRAL (Viral Identification via Rapid Active Learning), that integrates protein language model, Gaussian process with uncertainty estimation, and a biophysical model to predict the fitness of novel variants in a few-shot learning setting. By benchmarking on past SARS-CoV-2 data, we demonstrate that our method accelerates the identification of high-fi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Persistent SARS-CoV-2 infections involve prolonged viral replication and immune system interactions, potentially driving viral evolution and immune escape. This study examines viral characteristics and host gene expression changes in persistent infections. The nasopharyngeal samples from four patients with persistent SARS-CoV-2 infections at Tottori University Hospital, Japan, were analyzed. Viral isolates were cultured, and infectivity was assessed using TCID50 assays. To investigate host responses, RNA sequencing (RNA-seq) was performed to identify differentially expressed genes (DEGs), and
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The piRNA pathway protects animal germlines from active transposons. Mammals employ a cytoplasmic pathway to destroy transposon transcripts during germline reprogramming. This post-transcriptional mechanism is ancient and found throughout the animal kingdom. A nuclear piRNA pathway mediates transposon DNA re-methylation, which is believed to be bespoke to mammals. However, when exactly piRNA-directed DNA methylation evolved remains unknown. We found that a mammalian-like piRNA pathway evolved early in tetrapod evolution and is found and expressed in its current configuration in the axolotl sal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Knowledge gaps exist on whether SARS-CoV-2 co-infection alters recombination frequency or induces phylogenetic incongruities in endemic β-coronaviruses (HCoV-OC43, HCoV-HKU1), limiting our understanding of cross-species evolution. Among 7213 COVID-19 and 1590 non-COVID-19 acute respiratory cases (2021-2022) screened via multiplex PCR, β-coronavirus co-infections (SARS-CoV-2 + HCoV-OC43/HKU1) and single HCoV-OC43/HKU1 infections were identified. Whole-genome sequencing (Illumina NovaSeq) was performed. Phylogenies were reconstructed using Bayesian inference (MrBayes). Recombination was assessed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Little has been known until now about the population genomic processes underpinning pest insect species' rapid and ongoing adaptation to chemical insecticides. This paper elucidates these processes for six mutations encoding resistances to four insecticide classes in Chinese Spodoptera exigua: F116V in CYP9A186 against avermectins, T929I and L1014F in VGSC against pyrethroids, V1848I in VGSC against indoxacarb and I4790M and I4790K in RyR against diamides. Whole genome sequencing of 139 individuals from 20 populations across China revealed little genetic differentiation among the populations a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA hairpins may constitute a foundation of genetic evolution both in viruses and other organisms. Stem-loops theoretically comprise a stable part, the double-stranded stem, and a single-stranded loop allowing evolution. Here we tested for SARS-CoV-2 if "fertile" mutations were in loops while mutations in stems were poorly tolerated and rarely found in consensus genomes. We combined information on the frequencies of mutations, either "fertile" (present in ≥ 50 genomes) or "non-fertile" (neutral, weakly deleterious or lethal) in 61,397 SARS-CoV-2 genomes, and on whether these mutations occurred
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fosab is a key transcription factor to regulate the proliferation cycle of satellite cells in mammalian skeletal muscle. To verify its regulatory function in mandarin fish (Siniperca chuatsi) satellite cells, a whole-genome identification and evolutionary analysis were conducted, and the regulation of fosab to satellite cells development was explored by both gene overexpressing and knocking down analysis. The results revealed that mandarin fish have 5 fos family members (fosaa, fosab, fosb, fosl1a, and fosl2), which are relatively lowly conserved (36.0 %-88.6 %) in amino acid among vertebrates
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer progression is a complex, multi-stage development process characterized by dynamic changes at the molecular level. Understanding these changes may provide new insights into tumorigenesis and potential therapeutic targets. This study focuses on the evolutionary transcriptomics of cancer, specifically analyzing the Transcriptome Age Index (TAI) across different pathological stages. By examining various cancers at four distinct pathological stages, we identify a significant «hourglass» pattern in TAI indices of ductal carcinoma of the breast, bladder carcinoma, and liver carcinoma, suggest
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transition metal-hydrides have been widely exploited in catalysis for the hydrofunctionalization of unsaturated moieties, including carbonyls, alkenes and alkynes1. To complement heterolytic metal-hydride bond cleavage, metal-hydride hydrogen atom transfer (MHAT) has recently gained attention, as a promising strategy for radical hydrofunctionalization of unactivated alkenes2, thus enabling late-stage diversification of complex molecules3,4. However, owing to the weak interactions between the prochiral organic radical and the enantiopure catalyst5, asymmetric MHAT6 remains challenging. Here we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bifacial cambium, which produces xylem and phloem, and monopodial architecture, characterized by apical dominance and lateral branching from axillary buds, are key developmental features of seed plants, consisting of angiosperms and gymnosperms. These allow seed plants to adapt to diverse environments by optimizing resource allocation and structural integrity. In seed plants, SUPPRESSOR OF MAX2-LIKE (SMXL) family members function in phloem development and strigolactone-induced inhibition of axillary bud outgrowth. Although strigolactone signaling regulates most SMXL family members, the only kn
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SARS-CoV-2 continues to transmit and evolve in humans and animals. White-tailed deer (Odocoileus virginianus) have been previously identified as a zoonotic reservoir for SARS-CoV-2 with high rates of infection and probable spillback into humans. Here we report sampling 1,127 white-tailed deer (WTD) in Pennsylvania, and a genomic analysis of viral dynamics spanning 1,017 days between April 2021 and January 2024. To assess viral load and genotypes, RNA was isolated from retropharyngeal lymph nodes and analyzed using RT-qPCR and viral whole genome sequencing. Samples showed a 14.64% positivity ra
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
L-amino acid oxidase (laao) is a key immune factor capable of producing reactive oxygen species (ROS) and has been demonstrated to possess significant antibacterial and immunomodulatory functions in a variety of organisms. In recent years, increasing attention has been paid to the role of laao in the immune defense of fish against Cryptocaryon irritans infection. In this study, the laao of large yellow croaker (Larimichthys crocea) was successfully cloned, and its structural and functional characteristics were systematically analyzed. The full-length ORF of large yellow croaker was 1578 bp, en
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To advance our understanding of the molecular recombination dynamics of circulating human adenovirus species C (HAdV-C) strains, whole genome sequence (WGS) analysis of seven strains representing five genotypes (P1H1F1, P1H2F2, P89H5F5, P2H2F2, and Px1/Ps3H1F1) isolated from pediatric severe acute respiratory infection (SARI) cases in China were performed, involving sequence similarity assessment, phylogenetic inference, and recombination mapping. The genomic analysis of seven strains showed substantial nucleotide identity (93.5%-99.2%) and distinct recombination patterns. Further comparative
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial drug resistance poses a global health threat, requiring a deeper understanding of the evolutionary processes that lead to its emergence in pathogens. Complex evolutionary dynamics involve multiple mutations that can result in cooperative or competitive (clonal interference) effects. Candida albicans, a major fungal pathogen, displays high rates of copy number variation (CNV) and loss of heterozygosity (LOH). CNV and LOH events involve large numbers of genes and could synergize during evolutionary adaptation. Understanding the contributions of CNV and LOH to antifungal drug adapta
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The heparan sulfate (HS)-rich extracellular matrix (ECM) serves as an initial interaction site for the homotrimeric spike (S) protein of SARS-CoV-2 to facilitate subsequent docking to angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) receptors and cellular infection. More recent variants, notably Omicron, have evolved by swapping several amino acids to positively charged residues to enhance the interaction of the S-protein trimer with the negatively charged HS. However, these enhanced interactions may reduce Omicron's ability to move through the HS-rich ECM to effectively find ACE2 receptors and infect c
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenovirus (Ad) is a ubiquitous pathogen capable of infecting a wide range of animals and humans. Human Adenovirus (HAdV) can cause severe infection, particularly in individuals with compromised immune systems. To date, over 110 types of HAdV have been classified into seven species from A to G, with the majority belonging to the human adenovirus species D (HAdV-D). In the HAdV-D, the most significant factor for the creation of new adenovirus types is homologous recombination between viral genes involved in determining the virus tropism or evading immune system of host cells. The E4 gene, consi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydiae are a large group of obligate endosymbionts of eukaryotes that includes the Chlamydiaceae family, comprising several animal pathogens. Among Chlamydiaceae, Chlamydia trachomatis causes widespread ocular and urogenital infections in humans. Like many bacterial pathogens, all Chlamydiae manipulate host cells by injecting them with type III secretion effector proteins. We previously characterized the C. trachomatis effector CteG, which localizes at the host cell Golgi and plasma membrane during distinct phases of the chlamydial infectious cycle. Here, we show that CteG is a Chlamydiace
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования