Jumbo phages generally have large viral genomes packaged in large virions and exhibit a broad host spectrum. However, the detailed variation in host spectrum among jumbo phages, particularly in the context of bacterial phage defense systems, is not fully understood yet. In the present study, we isolated a novel Pseudomonas virus, ΦBRkr, from sewage water in Japan. Transmission electron microscopic analysis and whole-genome sequencing revealed that ΦBRkr is a jumbo phage with a total DNA length of 306,291 bp, and suggested a novel Pawinskivirus-like phage. Furthermore, ΦBRkr showed broader infe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome aging refers to age-related acquisition and expansion of de novo mutations in somatic cells, and is now increasingly viewed as a central driver of organismal aging. Loss of X chromosome (LOX), the state in which one X chromosome (ChrX) is missing, represents the most common genetically inferred type of acquired mutation in women. Recent technological advancements, along with the growing availability of large-scale cohorts for association studies, have provided powerful new insights into this phenomenon. The frequency and clone size of LOX increase significantly with age: with over 10% o
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV) is a persistent zoonotic and epidemic threat. We analyzed 807 publicly available human- and camel-derived MERS-CoV genomes collected during 2012-2024 to assess global genomic surveillance. Most sequences originated from Saudi Arabia and the United Arab Emirates. Major gaps in surveillance persist across Africa and South and Central Asia despite large camel populations, active trade, and evidence of viral circulation. Phylogenetic analysis confirmed predominance of clade B in the Arabian Peninsula and clade C in East Africa, consistent wit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Achondroplasia (ACH) is the most common non-lethal skeletal dysplasia and is caused in the vast majority of cases by a heterozygous gain-of-function variant in fibroblast growth factor receptor 3 (FGFR3, p.Gly380Arg). Hyperactive FGFR3 signaling constrains endochondral bone growth by suppressing growth-plate chondrocyte proliferation and hypertrophic differentiation. In the past decade, management has expanded beyond supportive care, and several mechanism-based interventions have shown disease-modifying effects in clinical studies. These include the activation of the NPR2/CNP axis with vosorit
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There are multiple mechanisms that can underlie parallel adaptation to similar habitats at the genetic level, including de novo mutations, introgression, and shared standing variation. While evidence for each pathway is emerging, few studies have directly examined how demographic processes, range expansion and introgression interact to shape the fate of adaptive alleles. In the Phalaenopsis amabilis complex, we applied a dimensionality reduction approach to identify environmental extremes and link alleles to ecological gradients. By combining gene-environment association analyses with demograp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although genetic diseases cause at least 30% of neuromotor disorders, genome sequencing is not routinely used for diagnosis in such patients. We assessed the diagnostic value in children with complex neuromotor phenotypes.
METHODS: We performed trio genome sequencing in 108 children with complex neuromotor phenotypes in 100 families. Genetic disease was diagnosed by a multidisciplinary clinical research team on the basis of each child's complete medical history, clinical course, family history, physical examination, imaging studies, and all other laboratory test results, as well a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin structure is essential for gene regulation and genome stability, as neurons must preserve their 3D genome organization throughout life. This structure gradually deteriorates with aging and is further disrupted in neurodegenerative diseases. To investigate whether aging and neurodegeneration share early chromatin changes or diverge, we perform Hi-C on cortical neurons from adult, aged, and brain-specific SIRT6-knockout (S6-KO) mice and compare them to the previously published Hi-C data sets from a CK-p25 Alzheimer's disease model stratified by γH2AX levels. All models show early featu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endogenous caulimovirid elements (ECVs) are widespread components of plant genomes and provide valuable information on the long-term evolution of plant viruses and their hosts. However, the mechanisms underlying their integration and subsequent genomic reorganization remain poorly understood. Here, we investigated the diversity, distribution, and structural organization of ECVs in 30 chromosome-level genome assemblies representing 15 species of the genus Prunus. A genome-wide search based on conserved reverse transcriptase (RT) domains identified 781 caulimovirid sequences, which were classifi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Navara (Oryza sativa L.) is a traditional pigmented rice landrace from Kerala, India, recognized for its nutritional and medicinal importanc … er rice gene pool. Collectively, these datasets provide a reusable genomic resource for comparative genomics, genetic-diversity analysis, marker development, conservation of traditional rice germplasm, and future functional investigation of pigmentation, nutritional, and agronomic traits.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BRCA2 is a central tumor suppressor protein best known for its roles in homologous recombination and replication fork stability. Increasing evidence, however, positions BRCA2 at the interface of transcription and replication, where it preserves genome stability under transcription-associated stress. BRCA2 regulates R-loop homeostasis, transcription-replication conflict resolution, and RNA polymerase II dynamics. Its loss leads to R-loop accumulation, transcriptional pausing, and elevated transcription-replication head-on collisions, particularly in highly transcribed regions. BRCA2 also promot
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the 2010s, Escherichia coli ST131 clade A tested sensitive to most antibiotics. In the 2020s, Europe experienced outbreaks of fluoroquinolone-resistant ST131-A that contained CTX-M β-lactamases and OXA-48-like carbapenemases. We investigated the acquisition of different antimicrobial resistance determinants in the emergence of multidrug-resistant (MDR) ST131-A. Phylogenetic analysis and Bayesian inference were utilized to define subclades and clusters (within subclades) and investigate the evolutionary history of ST131-A, using sequenced genomes and publicly available genomic data (n=2,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic liver disease is a rapidly growing cause of morbidity and mortality worldwide, and this increase is largely driven by steatotic liver disease (SLD) comprising metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD), alcohol-related liver disease (ALD), and MASLD and increased alcohol intake (MetALD). Hepatic steatosis and fibrosis are highly heritable and genetic variation has also been associated with the risk of hepatocellular carcinoma (HCC) and hepatic decompensation. This review summarizes the state of the art of genetics and genomics in SLD, with particular emphasis on p…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metschnikowia pulcherrima, an ascomycetous yeast, has been frequently isolated from various substrates associated with agriculture such as nutrient-rich plant materials (fruit, fruit juices and fermenting grape must), soil and with various insects including fruit flies. Due to the growing consumer demand for wines with reduced levels of additives such as sulphites, there has been great interest in this yeast species for its ability to compete with other fungi. Despite having similar phenotypes, many species related to M. pulcherrima have been described in the last 20 years based on the sequenc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Whole-genome sequencing (WGS) has been shown to improve diagnosis beyond standard-of-care genetic tests and guide precision treatment for childhood cancer. While WGS is now offered for children with suspected cancer in England, clinical workflows typically return results after several weeks whereas clinical decisions are often required within days. Here we evaluate feasibility and efficacy of a rapid WGS (rWGS) research workflow with streamlined bioinformatics to deliver clinical genomic findings (NCT07201038, Active, not recruiting). In 54 children with suspected or confirmed malignancy, rWGS
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Facial morphology is a highly heritable human trait, yet its underlying genetic architecture remains largely unresolved despite recent progress from genome-wide association studies (GWAS). Here, we integrated univariate and multivariate analyses of 230 facial phenotypes with GWAS and epigenome-wide association studies to identify genomic and epigenomic markers influencing facial variation in Chinese populations. Univariate analyses identified 144 single nucleotide polymorphisms (SNPs) and 34 CpG methylation sites, whereas multivariate canonical correlation analyses detected an additional 80 SN
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Across diverse organisms, the strength and ecological drivers of sexual selection vary enormously. In birds, some of the families with the most elaborate plumage and display-such as birds of paradise, manakins, and cotingas-are also specialist frugivores, yet links between shifts in diet, changes in breeding system, and the evolution of elaborate traits are poorly understood. We focus on manakins, a radiation of frugivorous Neotropical birds well known for spectacular courtship rituals and colorful plumage, and present an integrative analysis of the transition in both diet and mating systems i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Genomic profiling is used in the diagnosis, monitoring, and treatment of malignancies. Comprehensive genomic profiling (CGP) is a next-generation sequencing (NGS) approach that can test multiple genes simultaneously, potentially saving time, money, and sample material. Costs associated with genomic profiling could be a prohibitive barrier to the widespread implementation of genomic testing in routine clinical practice.
METHODS: A cost calculator was developed to demonstrate the cost difference between targeted panel NGS and individual single-gene testing (SGT). The calculator ev
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adjusting reproduction timing to environmental cues is essential for lifetime fitness. In many insects, reproductive diapause shows clinal variation along environmental gradients such as photoperiod and temperature. How such continuous trait variation may be encoded at the molecular level and maintained in the presence of gene flow remains largely elusive. The fruit fly Drosophila triauraria is distributed across a wide latitudinal range of the Japanese archipelago. Northern strains exhibit a strong photoperiodic reproductive diapause in females, whereas southern strains fail to arrest ovarian
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Agamidae (agamids, also known as dragon lizards or dragons) is a species-rich squamate family adapted to all non-polar continents except the Americas. Flying dragons (Draco) belong to this family and are widespread across South and Southeast Asia. To date, no nuclear genome assemblies of flying dragons have been published, limiting our understanding of the genetic underpinnings of their unique adaptive gliding trait and population dynamics. We report a high-quality chromosome-level assembly of Draco maculatus (the spotted flying dragon) with a size of 1.73Gb, a scaffold N50 of 255.50 Mb, a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.