The brain is a target organ for recreational drugs and HIV-1. Epidemiological data demonstrate that opioid abuse is a risk factor for HIV-1 infection and progression to AIDS. Chemokines and their receptors have been implicated in the neuropathogenesis of HIV-1 infections. However, little is known about the effects of opioids on the expression of chemokines and their receptors (the latter also are HIV-1 coreceptors) by cells of the CNS. Herein we describe the effects of morphine on gene expression of the alpha- and beta-chemokines and their receptors by the astrocytoma cell line U87 and by prim
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
EZH2 is an important enzymatic subunit of the epigenetic regulator polycomb repressive complex 2 (PRC2), which controls gene silencing through post-translational modification, and is overexpressed in various carcinomas and hematopoietic neoplasms. We found that the majority of cases of histiocytic and dendritic cell neoplasms, including histiocytic sarcoma, follicular dendritic cell sarcoma, Langerhans cell histiocytosis, and interdigitating dendritic cell sarcoma, show strong EZH2 expression by immunohistochemical staining, in contrast to benign histiocytic lesions and normal cellular counter
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cholangiocarcinoma (CCA) is a deadly and heterogeneous type of cancer characterized by a spectrum of epidemiologic associations as well as genetic and epigenetic alterations. We seek to understand how these features inter-relate in the earliest phase of cancer development and through the course of disease progression. For this, we studied murine models of liver injury integrating the most commonly occurring gene mutations of CCA - including Kras, Tp53, Arid1a and Smad4 - as well as murine hepatobiliary cancer models and derived primary cell lines based on these mutations. Among commonly mutate
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hedgehog (Hh) pathway inhibition in cancer has been evaluated in both the ligand-independent and ligand-dependent settings, where Hh signaling occurs either directly within the cancer cells or within the nonmalignant cells of the tumor microenvironment. Chondrosarcoma is a malignant tumor of cartilage in which there is ligand-dependent activation of Hh signaling. IPI-926 is a potent, orally delivered small molecule that inhibits Hh pathway signaling by binding to Smoothened (SMO). Here, the impact of Hh pathway inhibition on primary chondrosarcoma xenografts was assessed. Mice bearing primary
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-grade serous ovarian cancer (HGSOC) exhibits substantial molecular heterogeneity during disease progression. We investigated stage-specific changes in PI3K-AKT-associated signaling programs from early tumorigenesis to metastatic disease. Two publicly available microarray datasets, GSE36668 (normal, borderline, and carcinoma; n = 4 per group) and GSE73064 (primary tumor, ascites, and metastasis; n = 5 per group), were analyzed using differential expression, gene set enrichment, protein-protein interaction network analysis, and hub-gene identification. PI3K-AKT-associated genes were subsequ
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Luminal A breast cancer is the most prevalent hormone receptor-positive subtype, traditionally associated with favorable prognosis due to its low proliferative nature. However, emerging evidence highlights substantial molecular heterogeneity that complicates prognosis and therapeutic decision-making. A detailed understanding of this heterogeneity is essential to guide precision oncology strategies.
METHODS: We applied a systems biology approach integrating transcriptomic analysis, pathway enrichment, protein-protein interaction networks (PPIN), weighted gene co-expression network
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer is characterized as a multifactorial disease due to their complex genetic and molecular mechanisms that often converge across tissue types. Shared oncogenic pathways can help us understand these functions and discover broad-spectrum therapeutics. Earlier, most studies focused on finding specific drivers for individual cancer types. However, researchers are now more interested in identifying common molecular patterns across different cancers and developing therapies that can target multiple pathways at once. This study aimed to understand the common oncogenic pathways between breast, ova
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Upper tract urothelial carcinoma (UTUC) accounts for about 31% of urothelial malignancies in China, a markedly higher proportion than in Western countries. Limited molecular understanding hampers diagnosis and therapy. This study aimed to explore molecular mechanisms and identify potential biomarkers through a cohort-based integrative multi-omics analysis.
METHODS: We analyzed 48 paired UTUC tumor and adjacent normal tissues. RNA and whole-exome sequencing were performed to explore difference. Weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) was used to identify modules and hub
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emerging evidence supports the role of type 2 diabetes (T2D) mellitus as a risk factor for cancer progression. In this study, we investigated and identified biomarkers related to diabetes and pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) using systems biology to understand better the molecular landscape of PDAC and its connections with T2D.RNA-seq data related to blood samples of diabetes and pancreatic cancer were analyzed using bioinformatics tools in the Galaxy platform. After differential expression analysis using the DESeq2, the co-expression network associated with T2D and PDAC data was recons
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pre-existing of pulmonary tuberculosis (PTB) poses increased lung cancer risk, yet the molecular mechanisms remain inadequately understood. This study sought to elucidate the potential mechanisms by performing comprehensive analyses of differentially expressed genes (DEGs) in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from patients with PTB, lung adenocarcinoma (LUAD), and lung squamous cell carcinoma (LUSC). Microarray assays were employed to analyze the DEGs in PBMCs of these patients. The analyses revealed that, compared to healthy controls, the number of differentially expressed LncRNA in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gallbladder carcinoma is a malignant epithelial tumor of gallbladder with a high degree of malignancy. However, relationship between KNTC1 and MCM2 and gallbladder cancer is unclear.
METHODS: GSE139682 and GSE202479 were downloaded from gene expression omnibus (GEO). Differentially expressed genes (DEGs) were screened. Functional enrichment analysis and gene set enrichment analysis (GSEA) were performed. Protein-protein interaction (PPI) Network was constructed and analyzed. Gene expression heat map was drawn. Comparative toxicogenomics database (CTD) analysis was performed to fin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The incidence and mortality of lung cancer are the highest among all cancers. Patients with systemic sclerosis show a four-fold greater risk of lung cancer than the general population. However, the underlying mechanism remains poorly understood.
METHODS: The expression profiles of 355 peripheral blood samples were integratedly analyzed, including 70 cases of lung cancer, 61 cases of systemic sclerosis, and 224 healthy controls. After data normalization and cleaning, differentially expressed genes (DEGs) between disease and control were obtained and deeply analyzed by bioinformatic
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epithelial splicing regulatory protein 1 (ESRP1) has been described as an RNA-binding protein involved in cancer development. However, the expression and regulatory network of ESRP1 in cutaneous malignant melanoma (CMM) remain unclear.
METHODS: From the sequencing data of 103 CMM samples in The Cancer Genome Atlas database, the expression level of ESRP1 and its correlation with the clinicopathological characteristics were analyzed using the Oncomine 4.5, Gene Expression Profiling Interactive Analysis (GEPIA), and UALCAN tools, while LinkedOmics was used to identify differential ge
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neuroblastoma is a biologically and clinically heterogeneous disease. Based on recent studies demonstrating an association between the primary tumor site, prognosis, and commonly measured tumor biological features, we hypothesized that neuroblastomas arising in different sites would show distinct genomic features reflective of the developmental biology of the sympathicoadrenal nervous system.
METHODS: We first compared genomic and epigenomic data of primary diagnostic neuroblastomas originating in the adrenal gland (n = 646) compared to thoracic sympathetic ganglia (n = 118). We a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The definition of the gene expression profile of genes encoding Ion Channels and Transporters (ICT-GEP) represents a novel and attracting aspect in cancer. We determined the ICT-GEP of Follicular Lymphoma (FL), and compared it with that of the more aggressive Diffuse Large B Cell Lymphoma (DLBCL). cDNA microarray data were collected both from patients enrolled for this study, and from public datasets. In FL the ICT-GEP indicated the overexpression of both the K+ channel encoding gene KCNN4, and SLC2A1, which encodes the Glut1 glucose transporter. SLC2A1 turned out to represent the hub of a fun
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diagnosing acute leukemia is the necessary prerequisite to treating it. Multi-classification on the gene expression data of acute leukemia is help for diagnosing it which contains B-cell acute lymphoblastic leukemia (BALL), T-cell acute lymphoblastic leukemia (TALL) and acute myeloid leukemia (AML). However, selecting cancer-causing genes is a challenging problem in performing multi-classification. In this paper, weighted gene co-expression networks are employed to divide the genes into groups. Based on the dividing groups, a new regularized multinomial regression with overlapping group lasso
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nearly 10% of all pancreatic cancer (PCA) results from genetic predisposition. Although abnormalities in sporadic PCA have been described, little is known about the genetics of heritable PCA. The purpose of this study was to identify novel genes expressed in patients with a presumed genetic predisposition or "familial" PCA.
PATIENTS AND METHODS: We defined "familial" PCA as patients having one or more first-degree relatives with biopsy-proven adenocarcinoma of the pancreas. Using a PCR-based subtractive and enrichment procedure, representational difference analysis (RDA), pancreat
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although the prognosis of Hodgkin's disease is relatively good, around 20% of patients do not benefit from current therapies and succumb to their disease. A large-scale molecular characterization of disease might help improve HD management. Using cDNA arrays, we studied the mRNA expression levels of approximately 1000 selected genes in 34 benign and malignant lymphoid samples including 21 classical Hodgkin's disease (HD) tissue samples. Hierarchical clustering identified three main molecular groups of HD tumours relevant with respect to histology and clinical outcome (response to therapy and s
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have tested the hypothesis that H-ras transformed cells contain alterations in signal pathways important in controlling the expression of ornithine decarboxylase (ODC), the highly regulated rate-limiting activity in the biosynthesis of polyamines. Mouse 10T1/2 fibroblasts and a series of 10T1/2 H-ras transformed cell lines were treated with stimulators of cAMP synthesis (forskolin and cholera toxin), a biologically stable analogue of cAMP (8-bromo-cAMP), and an inhibitor of cAMP degradation (3-isobutyl-1-methylxanthine). Elevations in ODC gene expression were noted in H-ras transformed cell
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent efforts have been directed at identifying and characterizing candidate tumor suppressor genes and the activities of oncogenes in primary brain tumors. The p53 gene mapping to region p13 of chromosome 17 has several characteristics as a tumor suppressor gene. The wild-type p53 protein, which is a transcriptional activator, may serve as a barrier to the progression of neoplastic processes, and alterations of p53 are involved in genesis of various cancers including astrocytomas. The NF1 gene, which is responsible for the susceptibility to neurofibromatosis type 1, has recently been isolate
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.