Soils are typically considered to be suboptimal environments for enteric organisms, but there is increasing evidence that Escherichia coli populations can become resident in soil under favorable conditions. Previous work reported the growth of autochthonous E. coli in a maritime temperate Luvic Stagnosol soil, and this study aimed to characterize, by molecular and physiological means, the genetic diversity and physiology of environmentally persistent E. coli isolates leached from the soil. Molecular analysis (16S rRNA sequencing, enterobacterial repetitive intergenic consensus PCR, pulsed-fiel
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Escherichia coli serogroup O157:H7 has emerged as an important zoonotic bacterial pathogen, causing a range of symptoms from self-limiting bloody diarrhea to severe hemorrhagic colitis and hemolytic-uremic syndrome in humans. Beef and dairy cattle are considered the most important animal reservoirs for this pathogen. One of the important virulence characteristics of E. coli O157:H7 is the eaeA gene encoding the 97 kDa surface protein intimin. Intimin is required for attachment and effacement during the interaction of enterohemorrhagic E. coli with human and bovine neonatal enterocy
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study aimed to investigate Salmonella Enteritidis strains isolated from human and food sources in the north of Morocco by means of phenotypic and genotypic methods.
METHODOLOGY: Fifteen isolates from humans and food were submitted to phage typing, XbaI-macrorestriction (pulsed field gel electrophoresis [PFGE]), enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC-PCR), antimicrobial susceptibility testing, and PCR assay targeting the spvR and invA genes.
RESULTS: Six fingerprinting profiles were obtained with the ERIC-PCR method, four with PFGE profiling, five with antimicr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Etravirine (ETV) is a novel nonnucleoside reverse transcriptase inhibitor (NNRTI) with reduced cross-resistance to first-generation NNRTIs, which has been primarily studied in randomized clinical trials and not in routine clinical settings.
METHODS: ETV resistance-associated mutations (RAMs) were investigated by analysing 6072 genotypic tests. The antiviral activity of ETV was predicted using different interpretation systems: International AIDS Society-USA (IAS-USA), Stanford, Rega and Agence Nationale de Recherches sur le Sida et les hépatites virales (ANRS).
RESULTS: The preval
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The majority of commensal gastrointestinal bacteria used as probiotics are highly adapted to the specialised environment of the large bowel. However, unlike pathogenic bacteria; they are often inadequately equipped to endure the physicochemical stresses of gastrointestinal (GI) delivery in the host. Herein we outline a patho-biotechnology strategy to improve gastric delivery and host adaptation of a probiotic strain Bifidobacterium breve UCC2003 and the generally regarded as safe (GRAS) organism Lactococcus lactis NZ9000.
RESULTS: In vitro bile tolerance of both strains was signif
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Penicillin-binding proteins (PBPs) in representatives of two Streptococcus pneumoniae clonal groups that are prevalent in Poland, Poland 23F-16 and Poland 6B-20, were investigated by PBP profile analysis, antibody reactivity pattern analysis, and DNA sequence analysis of the transpeptidase (TP) domain-encoding regions of the pbp2x, pbp2b, and pbp1a genes. The isolates differed in their MICs of beta-lactam antibiotics. The majority of the 6B isolates were intermediately susceptible to penicillin (penicillin MICs, 0.12 to 0.5 microg/ml), whereas all 23F isolates were penicillin resistant (MICs,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shigella sonnei is a significant cause of diarrhoeal infection in both developing and industrialized countries. From 1999 to 2003, 445 strains of Shigella sonnei were isolated from patients admitted to the diarrhoea treatment centre of the International Center for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh. More than 60% of the isolates were resistant to nalidixic acid, 89% to sulfamethoxazole-trimethoprim and 9.5% to ampicillin. In addition, 4% of strains were resistant to multiple antibiotics (AmpR TetR SxtR StrR) and 4.2% of strains were sensitive to all antibiotics tested. None of the strains
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thirty-four cefotaxime-resistant Salmonella enterica serovar Typhimurium isolates representative of the isolates that caused outbreaks of gastroenteritis in 10 hospitals in seven regions of Russia and Belarus from 1994 to 2003 were analyzed. All isolates produced the CTX-M-5-like extended-spectrum beta-lactamase, which confers high-level resistance to cefotaxime and ceftriaxone and decreased susceptibility to ceftazidime. The bla(CTX-M) genes were located on small (7.4- to 12-kb) non-self-transferable plasmids approximately 20 bp downstream of the ISEcp1 insertion sequences. Some isolates carr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cystatin (CST)11, a novel member of the CST type 2 family of cysteine protease inhibitors, was identified in Macaca mulatta epididymis by subtractive hybridization cloning. The human CST11 gene on chromosome 20p11.2 is located near three other CST genes expressed predominantly in the male reproductive tract. The CST11 gene spans three exons, a structure similar to that of other CST family 2 genes. An exon 2-deleted alternative transcript (CST11Delta2) was also identified. CST11 mRNA is expressed only in the epididymis as judged by Northern blot hybridization and is androgen regulated. The prot
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Isolates of Vibrio harveyi, a prawn pathogen, have demonstrated multiple antibiotic resistance to commonly used antimicrobial agents, such as oxytetracycline. In this paper, we describe the cloning and characterization of two tetracycline resistance determinants from V. harveyi strain M3.4L. The first resistance determinant, cloned as a 4,590-bp fragment, was identical to tetA and flanking sequences encoded on transposon Tn10 from Shigella flexneri. The second determinant, cloned as a 3,358-bp fragment in pATJ1, contains two open reading frames, designated tet35 and txr. tet35 encodes a 369-am
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Streptomyces vinaceus viomycin phosphotransferase (vph) mRNA contains an untranslated leader with a conventional Shine-Dalgarno homology. The vph leader was removed by ligation of the vph coding sequence to the transcriptional start site of a Streptomyces or an Escherichia coli promoter, such that transcription would initiate at the first position of the vph start codon. Analysis of mRNA demonstrated that transcription initiated primarily at the A of the vph AUG translational start codon in both Streptomyces lividans and E. coli; cells expressing the unleadered vph mRNA were resistant to v
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the preliminary characterization of a 6.7-kilobase transposon, Tn4201, encoding resistance to penicillin associated with the conjugative plasmid pCRG1600 in Staphylococcus aureus. Tn4201 is capable of inverting in orientation (frequently observed in derivatives of pCRG1600) and is expressed equally well in either orientation. The element is also capable of movement to alternative plasmid and chromosomal sites. Tn4201 exhibits rec-independent transposition in an apparent site-specific manner and may play an important role in the resistance of staphylococci to beta-lactam compounds.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus aureus remains a major public health concern due to its capacity for colonization, transmission, and antimicrobial resistance. Both methicillin-resistant (MRSA) and methicillin-susceptible S. aureus (MSSA) serve as reservoirs for resistance determinants, including those conferring reduced susceptibility to topical decolonization agents. We analyzed 2,330 S. aureus isolates collected between 2022 and 2025 from hospitals and community clinics in New Jersey and New York City, including 962 MRSA infection isolates and 1,368 nasal carriage isolates (310 MRSA and 1,058 MSSA) obtained
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Candida auris was recently listed as a critical priority fungal pathogen by WHO due to its multidrug resistance and enhanced propensity for nosocomial transmission. This study investigated the molecular epidemiology and colonization patterns of C. auris in a tertiary care center in Eastern India.
METHODS: A total of 201 patients from different intensive care units (ICUs) were enrolled, with colonization rates determined through enrichment followed by culture on chromogenic agar and molecular confirmation using Candida auris specific polymerase chain reaction (PCR) and antifungal susc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeria monocytogenes poses significant public health and food safety risks due to its environmental resilience and pathogenicity. In this study, we utilized whole-genome sequencing to characterize 15 L. monocytogenes strains isolated from Nantong, China (2020-2023), recovered from food and clinical samples. Antimicrobial susceptibility testing revealed that the Nantong isolates exhibited high resistance rates to ciprofloxacin (93.3%) and oxacillin (66.6%). Of particular concern, isolate NTLM03 exhibited the most extensive resistance profile, demonstrating resistance to six antimicrobials, in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study aimed to characterize colistin-resistant K. pneumoniae (CoRKp) strains isolated from patients with urinary tract infections and bacteremia between 1999 and 2022 at a tertiary teaching hospital in Taiwan.
METHODS: A total of 1966 K. pneumoniae isolates were collected, among which 21 strains were identified as CoRKp. The antimicrobial susceptibility of these CoRKp strains to 19 antibiotics was assessed. The genome characteristics of 21 CoRKp strains were determined by Nanopore-Illumina hybrid whole genome sequencing. Additionally, conjugation assays were conducted to dete
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Detailed assessment of the population structure of group B Streptococcus (GBS) among adults is still lacking in Saudi Arabia. Here we characterized a representative collection of isolates from colonized and infected adults.
METHODS: GBS isolates (n=89) were sequenced by Illumina and screened for virulence and antimicrobial resistance determinants. Genetic diversity was assessed by single nucleotide polymorphisms and core-genome MLST analyses.
RESULTS: Genome sequences revealed 28 sequence types (STs) and nine distinct serotypes, including uncommon serotypes VII and VIII. Majori
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Resistant Helicobacter pylori to commonly used antimicrobial agents are associated with severe upper gastrointestinal disorders. To provide an epidemiological picture of H pylori and characterize the resistance pattern and genetic variation of clinical isolates, stomach biopsies from patients with functional dyspepsia were evaluated in northeast of Iran.
MATERIALS AND METHODS: In this study, 80 patients were recruited. Finally, fifty H pylori strains were isolated from antrum and corpus biopsies by culturing on Columbia agar. All strains were identified by standard laboratory proc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Whole genome sequencing has revolutionized epidemiological investigations of multidrug-resistant pathogenic bacteria worldwide. Aim of this study was to perform comprehensive characterization of ESBL-positive isolates of Escherichia coli obtained from clinical samples at the King Abdulaziz University Hospital utilizing whole genome sequencing.
METHODS: Isolates were identified by MALDI-TOF mass spectrometry. Genome sequencing was performed using a paired-end strategy on the MiSeq platform.
RESULTS: Nineteen isolates were clustered into different clades in a phylogenetic tree base
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Salmonella enterica serovar Enteritidis is a cause of both poultry- and egg-associated enterocolitis globally and bloodstream-invasive nontyphoidal Salmonella (iNTS) disease in sub-Saharan Africa (sSA). Distinct, multi-drug resistant genotypes associated with iNTS disease in sSA have recently been described, often requiring treatment with fluoroquinolone antibiotics. In industrialised countries, antimicrobial use in poultry production has led to frequent fluoroquinolone resistance amongst globally prevalent enterocolitis-associated lineages.
METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Twenty
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования