Diagnosis of joint infections is often challenging due to low specimen volumes, low sensitivity of Gram stains and long incubation times of cultures. Digital PCR (dPCR) is a molecular tool that can detect nucleic acid targets with high sensitivity and resistance to inhibition. A 3 hour dPCR assay targeting the 16S gene was performed on archived synovial fluids. The assay detected the 16S gene directly from 4 µL of joint fluid without nucleic acid extraction. In 43 culture positive neat synovial fluids, the dPCR instrument detected 31 (72%) as positive, and 12 (28%) as indeterminate. In 49 cult
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oropouche fever is a vector-borne disease endemic in Central and South America. Infection with Oropouche virus (OROV) was confirmed in June and July 2024 in 13 patients travelling from Cuba to Spain. These patients presented fever, headache, myalgia and arthralgia, and three patients exhibited a biphasic course, with two developing transient neurological symptoms. Oropouche virus infection was diagnosed using reverse transcription quantitative PCR (RT-qPCR) and neutralisation tests. Viral RNA was detected in specimens from serum, urine, plasma and whole blood; from four urine samples up to 24
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Jingmen tick virus (JMTV) is a novel segmented Flavivirus that was first identified from Rhipicephalus microplus in the Jingmen region of Hubei Province, China, in 2010. Subsequently, it was detected in a variety of countries and regions around the world. Meanwhile, JMTV has been proved to be pathogenic to humans and animals and could cause viremia in animals. However, the pathogenic mechanism of JMTV and what role animals play in the viral cycle have not yet been elucidated. In this study, 38 sheep sera were collected from Xinyang region of Henan Province, China and 204 ticks attached to the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, immunization with the S2 live-attenuated vaccine has been recognized as the most economical and effective strategy for preventing brucellosis in Inner Mongolia, China. However, there are still challenges related to vaccine toxicity and the inability to distinguish between vaccine immunization and natural infection. Therefore, in this study, we developed a digital droplet polymerase chain reaction (ddPCR) assay based on single-nucleotide polymorphism (SNP) loci to identify wild Brucella strains and S2 vaccine strains. The assay demonstrated excellent linearity (R2> 0.99) with a…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To develop a novel quadruplex real-time reverse transcription polymerase chain reaction (rRT-PCR) assay for the diagnosis of severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) infection, differential diagnosis and detection of co-infections.
METHODS: A one-step quadruplex rRT-PCR assay was developed for simultaneous detection and differentiation of SARS-CoV-2 ORF1ab and N genes, influenza A virus (hIAV) and influenza B virus (hIBV).
RESULTS: The quadruplex rRT-PCR assay had good sensitivity and specificity. Correlation coefficients and amplification efficiencies of all s…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Real-time molecular techniques have become the reference methods for direct diagnosis of pathogens. The reduction of steps is a key factor in order to decrease the risk of human errors resulting in invalid series and delayed results. We describe here a process of preparation of oligonucleotide primers and hydrolysis probe in a single tube at predefined optimized concentrations that are stabilized via lyophilization (Lyoph-P&P). Lyoph-P&P was compared versus the classic protocol using extemporaneously prepared liquid reagents using (i) sensitivity study, (ii) long-term stability at 4 °C, and (i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fluid regulation within the male gonad is an important process for promoting sperm differentiation and maturation. Aquaporins (AQPs) are a family of thirteen integral membrane proteins involved in these processes. The expression of several genes of AQPs occurs in the male reproductive tract of humans and other animal species, although there are few studies on domestic animals. In this study, the localization of AQP7, AQP8, and AQP9 as well as the abundances of protein and mRNA transcripts were examined in normal and cryptorchid dog testes. There was immunohistochemical localization of AQP7, AQ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Sexually transmitted diseases (STD) are a major cause of infertility, long-term disability, ectopic pregnancy, and premature birth. Therefore, the development of fast and low-cost laboratory STD diagnostic screening methods will contribute to reducing STD-induced reproductive tract damage and improve women's health worldwide. In this study, we evaluated a novel multiplex real-time PCR melting curve assay method for the simultaneous detection of 9 STD pathogens, including Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma genitalium, Trichomonas vaginalis, Mycoplasma hominis,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid identification of the infecting Salmonella serovar from porcine diagnostic samples is vital to allow implementation of appropriate on-farm treatment and management decisions. Although identification at the serogroup level can be rapidly achieved at most veterinary diagnostic laboratories, final Salmonella serovar identification often takes several weeks because of the limited number of reference laboratories performing the complex task of serotyping. Salmonella serogroup B, currently the dominant serogroup identified from swine clinical samples in the United States, contains serovars tha
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 30-year-old Colombian woman with past history of immune thrombocytopenia (ITP) presented to the emergency room with two days of global headache, arthralgia, myalgia, and low level fever and generalized erythematous rash. Platelets dropped to 9 × 109/L (fourth day of symptoms) without hemorrhagic manifestations but recovered to 30 × 109/L in 24 hours (fifth day). Dengue virus infection, as well as other viral infections, was ruled out. Zika virus (ZIKV) was evaluated in serum and urine samples by real-time reverse-transcriptase polymerase chain reaction (genomic regions within E protein and N…
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rift Valley fever virus (RVFV; Phlebovirus, Bunyaviridae) is a mosquito-borne, zoonotic pathogen. In Senegal, RVFV was first isolated in 1974 from Aedes dalzieli (Theobald) and thereafter from Ae. fowleri (de Charmoy), Ae. ochraceus Theobald, Ae. vexans (Meigen), Culex poicilipes (Theobald), Mansonia africana (Theobald) and Ma. uniformis (Theobald). However, the vector competence of these local species has never been demonstrated making hypothetical the transmission cycle proposed for West Africa based on serological data and mosquito isolates.
METHODS: Aedes vexans and Cx. poicil
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There are a number of reports regarding natural infection of Dermacentor reticulatus ticks with TBE virus; however, the transmission mode of TBE virus in this tick population has not been investigated. This study was conducted in Białowieża Primeval Forest, east Poland. Forty fully engorged nymphs of D. reticulatus were sampled from root voles (Microtus oeconomus). Ticks were kept until molting. All ticks were screened for the presence of TBE virus by nested RT-PCR. Three adult ticks were positive for infection with TBE virus. The present study for the first time demonstrates the possibility o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polioviruses (PVs) are the causal agents of acute paralytic poliomyelitis. Since the 1960s, poliomyelitis has been effectively controlled by the use of two vaccines containing all three serotypes of PVs, the inactivated poliovirus vaccine and the live attenuated oral poliovirus vaccine (OPV). Despite the success of OPV in polio eradication programme, a significant disadvantage was revealed: the emergence of vaccine-associated paralytic poliomyelitis (VAPP). VAPP is the result of accumulated mutations and putative recombination events located at the genome of attenuated vaccine Sabin strains. I
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: A preparation method for quantification of bacteria in tissues is obligatory to reduce tissue mass, concentrate the target, purify, remove inhibitory substances and to achieve constant target recovery rates. No preparation method has been available until now for a high mass of tissue applicable for routine use and analytical veterinary diagnostics.
RESULTS: This study describes an easy-to-use tissue preparation protocol to quantify Gram-positive bacteria from a large volume of tissue matrix. A previously published sample preparation method (Matrix-Lysis) from food science was succ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular diagnosis of malaria offers many potential advantages over microscopy, including identification of malaria to the species level in an era with few experienced microscopists. We developed high-throughput multiplex 5' nuclease quantitative PCR (qPCR) assays, with the potential to support large studies, to specifically identify Plasmodium falciparum, P. vivax, P. ovale, P. malariae, and P. knowlesi. We compared qPCR to microscopy and confirmed discordant results with an alternative target PCR assay. The assays specifically detected 1 to 6 parasites/μl of blood. The clinical sensitivitie
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: During the last few years many new human picornaviruses have been discovered due to advances in metagenomics and other molecular … months, and at episodes of gastroenteritis. Samples were tested by real-time reverse-transcriptase polymerase chain reaction assays. Each study participant had a diary, where the parents reported episodes of disease, including gastroenteritis.
RESULTS: Aichi virus, salivirus and saffold virus were detected in 6, 9 and 38 of the children, respectively, but cosavirus was n …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: JC virus (JCV) is the etiologic agent for progressive multifocal leukoencephalopathy (PML), a demyelinating disease occurring in the brain of patients with underlying immune compromised states. All viable JCV genomes contain a conserved region in the T protein coding nucleotide sequence that when detected by PCR in CSF is a confirmatory diagnostic marker for PML along with clinical and neuroradiological evidence. The non-coding regulatory region (NCRR) is hypervariable, as evidenced by nucleotide sequence of the non-virulent variant, which is predominantly excreted in urine, versus
Оценочное исследованиеСтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious diseases are common causes of significant morbidity and mortality events of wild aquatic birds (WABs) worldwide. Reports of Australian events are infrequent. A 3-yr passive surveillance program investigating the common causes of morbidity and mortality of WABs was conducted at Billabong Sanctuary near Townsville, North Queensland, from April 2007 to March 2010. Forty-two carcasses were obtained and evaluated by clinico-pathologic, histologic, bacteriologic, and virologic (molecular) examinations. Morbidity and mortality were sporadic and more commonly observed in chicks and juvenile
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diagnosis of human Lyme borreliosis is usually based on serology, which has a number of pitfalls. In the early phase of the disease serology can still be negative, whereas false-positive results are also common. The interpretation of confirmatory Western blot tests is not always easy. Furthermore, routine serology cannot discriminate between active and past infection. In addition, recombinant antigens are being introduced to improve serologic tests. New developments in the diagnosis of Lyme disease are the development of PCR tests. This review gives an overview of the molecular diagnostic poss
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Factors affecting the inhibition of RNA polymerase II from rat liver by the O-n-octyloxime of 3-formylrifamycin SV (AF/013) were investigated. Using either native or denatured calf-thymus DNA as template, almost complete inhibition of RNA polymerase II was observed when AF/013 was added directly to the enzyme. Considerable resistance to AF/013 was observed when RNA polymerase II was preincubated with denatured DNA at either 0 or 37 degrees. However, under similar conditions, no resistance was observed when enzyme was preincubated with native DNA. Only when AF/013 was added to the ongoing react
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.