Pigeon circovirus (PiCV) is a widespread circovirus of domestic pigeons and is frequently discussed in relation to young pigeon disease synd … and clinical context rather than relying on PCR positivity alone. Future studies should link viral genomics with transcriptomics, immune phenotyping, spatial pathology, and longitudinal clinical outcomes.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Patients with acute pancreatitis (AP) develop widely variable severity of organ failure. We hypothesized that genetic factors may influence the development of organ failure in AP. In this study, we identify candidate loci associated with organ failure in AP using genome-wide association analyses (GWAS) and transcriptomic analyses.
METHODS: Subjects enrolled in the Mass General Brigham Biobank were retrospectively queried to determine those with a history of AP. Patients with AP were categorized according to the presence of respiratory or renal failure during the first week of AP.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study presents a case of Ralstonia mannitolilytica isolated from a blood culture of a 50-year-old male patient with hepatocellular carcinoma. The patient underwent ultrasound-guided radiofrequency ablation for liver lesions associated with hepatocellular carcinoma and subsequently experienced recurrent fever, chills, and rigors. R. mannitolilytica was identified from blood culture. This bacterium, known to be an opportunistic pathogen, has not been extensively studied for its whole-genome characteristics and resistance profiles. Through whole-genome sequencing and bioinformatics analysis,
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial Resistance (AMR) represents a defining crisis of modern healthcare, severely limiting therapeutic options and driving a global increase in clinical mortality. Central to this crisis is Klebsiella pneumoniae, a ubiquitous gut commensal that has evolved into a formidable opportunistic pathogen through its remarkable ability to transition from a harmless organism to a hypervirulent, Multidrug-Resistant (MDR) threat. This review examines that pathogenic transition, emphasizing the dangerous convergence of virulence and resistance traits particularly within carbapenem-resistant lineag
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A certain proportion of patients with Mendelian diseases are overlooked, although substantial technical advances in molecular genetics have been achieved. Massively parallel sequencing (MPS) increasingly identifies genetic variants of unknown significance, which may remain clinically unhelpful. Furthermore, difficult niches in the genome exist, which cannot be solved by standard MPS. In the reported family, autosomal dominant kidney disease leading to renal failure in middle adulthood runs through the maternal and paternal family. Comprehensive genetic analyses and customized functional evalua
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Streptococcus pyogenes causes a broad spectrum of invasive and non-invasive infections globally, associated with high morbidity and mortality. In mainland China, distribution of the emm genotype has shifted markedly over recent decades, with emm12 emerging as the dominant type. Meanwhile, resistance to macrolides, lincosamides, and tetracyclines has reached extremely high levels, severely limiting clinical treatment options and leading to the designation of S. pyogenes as a medium-priority pathogen by the World Health Organization.
METHODS: A total of 133 non-duplicate S. pyogenes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here, we described the resistome and virulome of worldwide K. pneumoniae ST25 (Kp-ST25) genomes and established their phylogenetic relationship. Out of a collection of 32 KPC-2-producing Kp-ST25 recovered in Argentina during 2015-2017, eight isolates were selected for whole-genome sequencing (WGS). Additionally, 256 Kp-ST25 genomes were downloaded from NCBI. Bioinformatic analysis was carried out using Unicycler, PROKKA, and Quast. Resistome and virulome were inspected using Kleborate, AMRFinderPlus, BACMET, and VFDB. Phylogenetic estimation included a core genome SNP-based analysis carried ou
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Genomics-informed cancer care is central to precision oncology; however, integrating genomic competencies into routine practice remains challenging. Despite the development of competency frameworks, limited clarity exists regarding how these competencies are operationalised within oncology settings.
AIM: To synthesise and critically examine how genomic competencies are conceptualised across the literature, identify areas of convergence and gaps and examine implications for clinical implementation and cancer nursing workforce development.
DESIGN: Scoping review.
METHODS: The revi…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ticks, which are globally distributed, transmit a wide range of human and animal pathogens. Soft and hard ticks are two major tick families exhibiting distinct vector capacities and blood-feeding abilities. However, understanding the genetic basis of these differences is hindered by the scarcity of high-quality tick genomes, particularly for soft ticks. Here, we present high-quality genomes of two soft and two hard tick species of both evolutionary and medical importance, and compare the genomic characteristics of the two tick families. Compared with soft ticks, hard ticks exhibited faster gen
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Evolving genomic diversity of Mycobacterium tuberculosis complex pathogens is poorly known in French Polynesia, a remote archipelago in the southern Pacific Ocean. A total of 321 mycobacteria sampled from 321 patients presenting pulmonary tuberculosis between 1998 and 2010 at the microbiology laboratory of the French Polynesia Hospital Centre in Tahiti were whole genome sequenced (WGS), disclosing three major M. tuberculosis sensu stricto sublineages: L4.4.1.1 S-type, L4.1.1.3 X-Type, and L4.1.2.1 Haarlem. Furthermore, 20 isolates were identified as nontuberculous mycobacteria, including Mycob
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Somatic mutations accumulate throughout life in every cell, and this process constitutes one of the hallmarks of aging-genomic instability. Caloric restriction (CR) has been shown to extend lifespan across diverse species. Using high-fidelity duplex DNA sequencing of bulk liver, bulk kidney, hepatocytes, and cerebellar neurons, we found that CR in mice reduces genome-wide somatic mutation burdens across multiple tissues and cell types. CR reduced both substitution and insertion/deletion burdens, with the magnitude of these effects varying across sample types. CR also decreased the activity of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metastatic breast cancer (MBC) in older patients has distinct clinical and histologic characteristics. Elucidating the genomic basis of MBC helps identify potential therapeutic targets to improve outcomes for older patients with MBC.
PATIENTS AND METHODS: Using a prospective database and targeted DNA sequencing (OncoPanel), we examined MBC's genomic landscape in older patients (age ≥70 years at MBC diagnosis) and compared findings with those in younger (aged <50 years) and middle-aged (aged 50-69 years) patients. After classifying single nucleotide variants (SNVs) and copy number
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic imprinting is an epigenetic phenomenon in which chromosome behavior or gene expression depends on whether an allele was paternally or maternally inherited. Imprinting is commonly associated with a placenta or an analogous organ during embryo development; however, imprinting occurs in diverse species across animal and plant life, including those that lack a placenta. Common epigenetic modifications are associated with genome imprinting across these groups, although the exact mechanisms vary across taxa. There are also commonalities surrounding the evolutionary selection for imprinting.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To identify genetic variants associated with glucocorticoid (GC)-induced intraocular pressure (IOP) change using genome-wide association study (GWAS) and whole exome sequencing (WES) analyses.
DESIGN: A pharmacogenetic study within a clinical trial and cohort study.
PARTICIPANTS: Five hundred thirty discovery cohort participants were included from the Fluocinolone Acetonide in Diabetic Macular Edema (FAME) trials. Replication was performed in an independent cohort of 588 Mass Eye and Ear/Retina Health Center (MEE/RHC) participants. Participants were exposed to GC, primarily by intra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neocortical expansion and diversification in primates, especially humans, underpin advanced cognitive abilities, yet the molecular and cellular bases of neocortical area specification remain incompletely understood.
RESULTS: Here, we perform an integrative multimodal analysis combining single-nucleus multiomic and spatial transcriptomic sequencing, morphological and electrophysiological profiling, and secondary comparisons across humans, macaques, and mice. We uncovered enhanced area-specific cellular diversification in primates, including distinct upper-layer projection neuron an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Broad genomic profiling (BGP) is recommended for several types of metastatic cancer but remains underused. Over half of Medicare beneficiaries are enrolled in Medicare Advantage (MA), where cost-containment strategies may limit access to BGP. Whether Medicare payer type and geographic region are associated with BGP use is not well established.
OBJECTIVES: To evaluate whether BGP use differs by Medicare payer type (MA vs fee-for-service Medicare [FFS]) and to characterize geographic variation in BGP use across hospital referral regions (HRRs).
DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTS: Th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Imprinted genes play a pivotal role in regulating growth, development, and behavior through parent-of-origin-specific expression. This allelic specificity is orchestrated by "imprinting control regions" (ICRs), which depend on DNA methylation marks established on only one parental allele. The epigenetic life cycle of imprinting involves dynamic reprogramming: preexisting methylation is erased in primordial germ cells, followed by the establishment of new marks in either the female or male germline. After fertilization, these allele-specific methylation patterns are faithfully maintained throug
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Given the increasing number of diseases for which causative genes have been identified, we are facing the need for implementing comprehensive genome sequence analysis as a molecular diagnostic system for patients with hereditary diseases in daily clinical practice. We established a laboratory-developed test (LDT) with the implementation of whole-exome sequence analysis (WES) as the clinical sequencing system at an academic institution. WES was conducted on 81 patients with suspected hereditary disorders referred from clinical departments in our hospital from 2021 to 2024. Target genes were sel
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasmids are central drivers of antimicrobial resistance (AMR) dissemination, yet their modular, recombinogenic genomes defy concepts of relatedness derived from bacterial chromosomes. Long-read sequencing now routinely yields complete plasmid sequences, exposing a key gap: we can reconstruct plasmids but lack agreed principles for comparing them. In response, diverse clustering tools have emerged that emphasise different signals, such as marker genes, whole-sequence similarity, gene content, backbone structure, or explicit rearrangement events. Each encodes a distinct notion of plasmid distan
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To evaluate the feasibility and diagnostic yield of universal genome sequencing (GS) in infants receiving extracorporeal membrane oxygenation (ECMO).
STUDY DESIGN: Prospective multicenter study across eight Children's Hospital Neonatal Consortium sites (October 2021-August 2023). Infants initiated on ECMO were enrolled for GS regardless of suspected genetic disease. Demographics, ECMO indications, and results from standard-care testing and study-based GS were analyzed.
RESULTS: Twenty-five infants were enrolled. Primary ECMO indications included congenital diaphragmatic hernia (28
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.