During immature capsid assembly, HIV-1 genome packaging is initiated when Gag first associates with unspliced HIV-1 RNA by a poorly understood process. Previously, we defined a pathway of sequential intracellular HIV-1 capsid assembly intermediates; here we sought to identify the intermediate in which HIV-1 Gag first associates with unspliced HIV-1 RNA. In provirus-expressing cells, unspliced HIV-1 RNA was not found in the soluble fraction of the cytosol, but instead was largely in complexes ≥30S. We did not detect unspliced HIV-1 RNA associated with Gag in the first assembly intermediate, whi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) expression depends on the concerted action of Tax, which drives transcription of the viral genome, and Rex, which favors expression of incompletely spliced mRNAs and determines a 2-phase temporal pattern of viral expression. In the present study, we investigated the Rex dependence of the complete set of alternatively spliced HTLV-1 mRNAs. Analyses of cells transfected with Rex-wild-type and Rex-knockout HTLV-1 molecular clones using splice site-specific quantitative reverse transcription (qRT)-PCR revealed that mRNAs encoding the p30Tof,
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The original novel UGT1 complex locus previously shown to encode six different UDP-glucuronosyltransferase (transferase) genes has been extended and demonstrated to specify a total of 13 isoforms. The genes are designated UGT1A1 through UGT1A13p with four pseudo ones. UGT1A2p and UGT1A11p through UGT1A13p have either nucleotide deletions or flawed TATA boxes and are therefore pseudo. In the 5' region of the locus, the 13 unique exons 1 are arranged in a tandem array with each having its own proximal TATA box element and, in turn, are linked to four common exons to allow for the independent tra
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ehlers-Danlos syndrome (EDS) types I and II, which comprise the classical variety, are well characterized from the clinical perspective, but it has been difficult to identify the molecular basis of the disorder in the majority of affected individuals. Several explanations for this failure to detect mutations have been proposed, including genetic heterogeneity, failure of allele expression, and technical difficulties. Genetic heterogeneity has been confirmed as an explanation for such failure, since causative mutations have been identified in the COL5A1, COL5A2, and tenascin X genes and since t
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiomyocyte ferroptosis contributes to myocardial ischemia/reperfusion injury, but the upstream noncoding RNA mechanisms remain incompletely defined. This study examined whether nuclear factor I B-derived circular RNA (circNFIB) regulates hypoxia/reoxygenation (H/R)-induced ferroptosis in human ventricular cardiomyocyte-derived AC16 cells and whether the miR-338-3p/GPX4 pathway contributes to this effect. The circNFIB back-splice junction was verified by Sanger sequencing. Cell viability, malondialdehyde, intracellular Fe2+, boron-dipyrromethene (BODIPY) 581/591 C11 oxidation, and glutathion
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Breast cancer has remained a significant cause of mortality associated with cancer, necessitating a deeper molecular understanding to improve diagnostics and targeted therapies. Noncoding RNAs (ncRNAs) and their regulatory ncRNA-mRNA axes have recently emerged as important modulators of cancer progression and potential tools for earlier detection and more precise stratification of breast cancer. Among them, MIR17HG variants and the precise regulatory axes of miR-18a/miR-20a, and their mechanisms in stage II/III BC, remain elusive.
MATERIALS AND METHODS: This study addresses this c
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The long noncoding RNA LINC01012 is known to play critical roles in tumorigenesis. However, its underlying regulatory mechanisms remain largely unclear in hepatitis B (HBV)-related hepatocellular carcinoma (HCC). This study aimed to identify the potential protein targets of LINC01012 and to elucidate the molecular mechanisms by which LINC01012 promotes HBV-HCC progression. Bioinformatics analysis was employed to investigate whether LINC01012 expression is abnormal in HCC and whether such abnormalities hold clinical significance. HBV-HCC cases were collected to validate LINC01012 expression lev
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Marfan syndrome (MFS) is an autosomal dominant connective tissue disease with wide clinical heterogeneity, and mainly caused by pathogenic variants in fibrillin-1 (FBN1).
METHODS: A Chinese 4-generation MFS pedigree with 16 family members was recruited and exome sequencing (ES) was performed in the proband. Transcript analysis (patient RNA and minigene assays) and in silico structural analysis were used to determine the pathogenicity of the variant. In addition, germline mosaicism in family member (Ι:1) was assessed using quantitative fluorescent polymerase chain reaction (QF-PCR)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Castration-resistant prostate cancer (CRPC) is a big challenge in managing prostate cancer patients. The androgen receptor (AR) pathway is a major driver even in CRPC under androgen deprivation. The mechanism in maintaining of the AR pathway under androgen deprivation remains elusive. The recent discovery of biomolecular condensate, a membrane-less intracellular construct formed by liquid-liquid phase separation (LLPS), that facilitate molecular assembly, encouraged the re-screening of our previous microarray data list. We selected Rbm14 as a target molecule for further analysis because it wor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Efficient transmission of herpesviruses is essential for dissemination in host populations; however, little is known about the viral genes that mediate transmission, mostly due to a lack of natural virus-host model systems. Marek's disease is a devastating herpesviral disease of chickens caused by Marek's disease virus (MDV) and an excellent natural model to study skin-tropic herpesviruses and transmission. Like varicella zoster virus that causes chicken pox in humans, the only site where infectious cell-free MD virions are efficiently produced is in epithelial skin cells, a requirement for ho
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rare variants in hundreds of genes have been implicated in developmental delay (DD), intellectual disability (ID) and neurobehavioural phenotypes. TNRC6B encodes a protein important for RNA silencing. Heterozygous truncating variants have been reported in three patients from large cohorts with autism, but no full phenotypic characterisation was described.
METHODS: Clinical and molecular characterisation was performed on 17 patients with TNRC6B variants. Clinical data were obtained by retrospective chart review, parent interviews, direct patient interaction with providers and forma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circular RNAs (circRNAs) are ubiquitously expressed, covalently closed rings, produced by pre-mRNA splicing in a reversed order during post-transcriptional processing. Circularity endows 3'-5'-linked circRNAs with stability and resistance to exonucleolytic degradation which raises the question whether circRNAs may be relevant as potential therapeutic targets or agents. High stability in biological systems is the most remarkable property and a major criterion for why circRNAs could be exploited for a range of RNA-centred medical applications. Even though various biological roles and regulatory …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurodevelopmental disorders (NDDs) are characterized by aberrant and delayed early-life development of the brain, leading to deficits in la … ovalent histone marking are impacted. Conversely, others involve anomalies in chromatin-modelling, mRNA splicing/editing, mRNA translation, ribosome biogenesis and/or the regulatory actions of small nucleolar RNAs and micro-RNAs. Since epigenetic mechanisms are modifiable, this raises the hope of novel therapy, though questions remain concerning efficacy and s …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Oral keratinocytes on the mucosal surface are frequently exposed to HIV-1 through contact with infected sexual partners or nursing mothers. To determine the plausibility that oral keratinocytes are primary targets of HIV-1, we tested the hypothesis that HIV-1 infects oral keratinocytes in a restricted manner.
RESULTS: To study the fate of HIV-1, immortalized oral keratinocytes (OKF6/TERT-2; TERT-2 cells) were characterized for the fate of HIV-specific RNA and DNA. At 6 h post inoculation with X4 or R5-tropic HIV-1, HIV-1gag RNA was detected maximally within TERT-2 cells. Reverse t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Previous studies have shown that a large number of valuable and functional cell-free RNAs (cfRNAs) were found in follicular fluid. However, the species and characteristics of follicular fluid cfRNAs have not been reported. Furthermore, their implications are still barely understood in the evaluation of follicular fluid from follicles of different sizes, which warrants further studies. Objective: This study investigated the landscape and characteristics of follicular fluid cfRNAs, the source of organization, and the potential for distinguishing between follicles of different sizes.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Allele-specific analysis from RNA-seq is a powerful approach to characterize cis -regulatory effects. However, existing methods remain limited in both haplotype inference and allelic testing. Their haplotype-inference workflows separate variant calling, haplotype phasing, and read-haplotype assignment into sequential steps, failing to fully exploit within-read single-nucleotide variant (SNV) linkage information and propagating errors into downstream allelic analysis. At the testing stage, they ignore non-phasable reads lacking heterozygous SNVs, biasing calls and inflating false positives, and
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: CircRNAs are closely related to many human diseases; however, their role in acne remains unclear. This study aimed to determine the role of hsa_circ_0102678 in regulating inflammation of acne.
METHODS: First, microarray analysis was performed to study the expression of circRNAs in acne. Subsequently, RNase R digestion assay and fluorescence in situ hybridization assay were utilized to confirm the characteristics of hsa_circ_0102678. Finally, qRT-PCR, Western blotting analysis, immunoprecipitation, luciferase reporter assay, circRNA probe pull-down assay, biotin-labeled miRNA pul
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternatively spliced colony stimulating factor 3 receptor (CSF3R) isoforms Class III and Class IV are observed in myelodysplastic syndromes (MDS), but their roles in disease remain unclear. We report that the MDS-associated splicing factor SRSF2 affects the expression of Class III and Class IV isoforms and perturbs granulopoiesis. Add-back of the Class IV isoform in Csf3r-null mouse progenitor cells increased granulocyte progenitors with impaired neutrophil differentiation, while add-back of the Class III produced dysmorphic neutrophils in fewer numbers. These CSF3R isoforms were elevated in
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic variants in components of the minor spliceosome have been associated with several human diseases. Recently, it was reported that biallelic RNPC3 variants lead to severe isolated growth hormone deficiency and pituitary hypoplasia. The RNPC3 gene codes for the U11/U12-65K protein, a component of the minor spliceosome. The minor spliceosome plays a role in the splicing of minor (U12-type) introns, which are present in ~700-800 genes in humans and represent about 0.35% of all introns. Here, we report a second family with biallelic RNPC3 variants in three siblings with a growth hormone d
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mouse tail has an important role in the study of melanogenesis, because mouse tail skin can be used to model human skin pigmentation. To better understand the development of melanocytes in the mouse tail, we cloned two dominant ENU-generated mutations of the Adamts9 gene, Und3 and Und4, which cause an unpigmented ring of epidermis in the middle of the tail, but do not alter pigmentation in the rest of the mouse. Adamts9 encodes a widely expressed zinc metalloprotease with thrombospondin type 1 repeats with few known substrates. Melanocytes are lost in the Adamts9 mutant tail epidermis at a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.