Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) pipelines rely on the assumption that sequencing reads possess correct structural architecture, a premise we show is incomplete. Standard quantification tools treat errors exclusively as base mismatches, failing to identify structural aberrations arising from off-target priming or nonspecific amplification. We demonstrate that these pervasive artifacts, reads lacking essential anchor motifs like poly(T) tracts, linkers, or template-switching oligos, generate large numbers of spurious barcodes, artificially inflate cell counts, and substantially affect bio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Leptomeningeal disease (LMD) is a devastating complication of metastatic breast cancer that leads to severe neurologic symptoms and a poor prognosis. Current treatment options, including radiation and intrathecal chemotherapy, offer limited efficacy and are associated with significant toxicity. Generally, systemic therapy in LMD poorly penetrates the blood-brain barrier (BBB). Leveraging the L-type amino acid transporter 1 (LAT1) represents a unique therapeutic strategy, as LAT1 facilitates transport of medications across the BBB, and is also highly expressed in metastatic cancer c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the therapeutic efficacy of co-delivering a small molecule compound and an interfering RNA in triple-negative breast cancer (TNBC), a disease characterized by poor prognosis, this study developed pH-sensitive nanocomposite cationic liposomes for the simultaneous delivery of oridonin and siCX26. CX26 (Connexin 26), a gap junction protein associated with stem-like properties and chemoresistance, was targeted to enhance therapeutic efficacy against this aggressive subtype. Oridonin liposomes were prepared using thin-film dispersion followed by hydrated ultrasonication. Subsequently
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Recurrent spontaneous abortion (RSA) remains a major challenge in reproductive medicine, with unclear etiology in a substantial pro … n of SLC39A14 mRNA. This modification facilitated YTHDF2-dependent recognition, leading to reduced mRNA stability of SLC39A14. Functional rescue experiments further demonstrated that SLC39A14 overexpression reversed the protective effects mediated by METTL14.
CONCLUSION: AZTCT alleviates RSA, at least in part, by inhibiting trophoblast ferroptosis through the …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Periodontitis is a chronic inflammatory disease that severely affects oral and general health. N7-methylguanosine (m7G) methylati … s included m7G modification assays, luciferase reporter assays, RNA immunoprecipitation (RIP), and mRNA stability assays.
RESULTS: METTL1 was upregulated in LPS-induced HPDLSCs and a mouse model of periodontitis. METTL1 knockdown enhanced osteogenic differentiation and reduced pro-inflammatory cytokine levels in HPDLSCs. In the mouse model, METTL1 knockdown al …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoarthritis (OA) is a disease characterized by progressive cartilage degeneration. P21, as a cell cycle regulator, participates in maintaining cartilage homeostasis. This study aimed to evaluate the therapeutic potential of dihydroxyacetone (DHA) and its hyaluronic acid methacrylate (HAMA)-DHA nanoparticles in improving OA through the P21-mediated PI3K/AKT signaling pathway. Findings from the analyzed human cohorts and animal models revealed significantly reduced P21 expression in OA cartilage, which negatively correlated with disease severity within the examined stages. P21 overexpression
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: By analyzing the single-cell RNA-Seq libraries we established of OA joints during exercise therapy, we found cartilage intermediate zone might participate in early OA exercise therapy. METHODS: Early OA rat model was established by 4-week anterior cruciate ligament transection (ACLT). The radiomics was used to evaluate the relative damaged and undamaged area in OA patients’ cartilage. We overexpressed and knocked down CILP in early OA chondrocyte to explore its potential mechanism. The quantitative proteomics was used to examine the protein profiles of the CILP-treated chondorcyte.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug-resistant Staphylococcus aureus remains one of the major clinical challenges in both community and hospital settings. Increasing rates of resistance to conventional antibiotics have prompted the development of alternative therapeutic strategies capable of selectively targeting essential bacterial functions. Nucleic acid-based antimicrobial strategies have emerged as promising and precise approaches, enabling the inhibition of gene expression, suppression of virulence, restoration of antibiotic susceptibility, and inhibition of bacterial growth in a sequence-specific manner. This review in
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Osteoarthritis (OA) is a common orthopedic disease characterized by cartilage degeneration, osteophyte formation, and synovial hyperplasia. Although dysregulated O-GlcNAcylation has been implicated in various musculoskeletal and inflammatory disorders, its specific role and molecular targets in OA pathogenesis remain largely unexplored. In this study, we aimed to conduct a multidimensional investigation to demonstrate and delineate the chondrocyte-specific functions and mechanisms of O-GlcNAc transferase (OGT) during OA progression.
METHODS: To explore the mechanisms of OA progress
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Periodontitis progresses more rapidly and severely in individuals with type 2 diabetes mellitus (T2DM), yet whether the integrated stress response (ISR) contributes to the progression of diabetic periodontitis has not been elucidated.
OBJECTIVES: This study aims to clarify the impact and mechanisms of growth differentiation factor 15 (GDF15) in diabetic periodontitis.
METHODS: We performed single-cell RNA sequencing on periodontal tissues and integrated the datasets with bidirectional Mendelian randomization to identify ISR-related alterations associated with impaired periodont
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic lupus erythematosus (SLE) is a complex autoimmune disorder characterized by multi-organ involvement and a protracted clinical course. Current diagnostic strategies, which rely heavily on clinical symptoms and serology, are often insufficient for early detection. Therefore, highly accurate diagnostic biomarkers are urgently needed to facilitate early intervention and optimize personalized treatment strategies. D atasets GSE61635 and GSE135779 were integrated to identify differentially expressed genes. Weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) was performed to isolate the mod
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the association between severe hearing loss and systemic immune aging in older adults using participant-level clinical immunophenotyping, and to explore potential inflammatory pathways and cellular contexts using public mouse cochlear transcriptomic data.
METHODS: We analyzed a single-center cohort of 76 older adults, classified into normal hearing (NH), mild-to-moderate hearing loss (MMHL), or severe-to-profound hearing loss (SPHL) groups. Age- and sex-adjusted models were used to assess immune profiles. Prespecified sensitivity and diagnostic analyses evaluated age
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The maintenance of cochlear homeostasis requires precise metabolic regulation, yet the specific roles of monocarboxylate transporters in auditory function remain poorly understood. Monocarboxylate transporter 6 (Mct6), encoded by Slc16a5, is a membrane transporter of the solute carrier 16 family involved in the cellular transport of metabolites related to energy metabolism and signaling. Here, we investigated the impact of Mct6 deficiency on cochlear physiology, hair cell viability and molecular stability in mice. We identified Mct6 as a critical, sex-dependent regulator of cochlear stress res
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the recent outbreak of SARS-CoV-2, the global healthcare system experienced firsthand the importance of accurate and rapid detection techniques in the containment of pandemic situations. Conventional viral detection techniques, although highly specific, often suffer from slow, labour-intensive workflows that limit their applicability for rapid diagnosis. Moreover, their reliability can be compromised by factors such as inadequate technical expertise and improper sample handling, potentially leading to erroneous results. When the global public health system is continuously struggling to
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human liver in vitro models are indispensable for toxicity studies requiring metabolic competence. However, widely used two-dimensional hepatocyte-derived cell lines exhibit limited drug-metabolizing capacity, whereas primary human hepatocytes are constrained by limited availability, donor variability, dedifferentiation, and poor long-term functional stability. Although three-dimensional liver models offer greater physiological relevance, many existing methods depend on exogenous extracellular matrix (ECM) scaffolds or specialized equipment, thereby limiting standardization, scalability, and b
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intracellular microorganisms are widespread and housed within specialized host cells called bacteriocytes in many invertebrates. Although increasing attention has been devoted to understanding bacteriocyte development, differentiation, and proliferation, the molecular mechanisms that maintain these cells remain poorly understood. We previously showed that the transcription factor Adf-1 suppresses bacteriocyte cell death in whiteflies. Here, DNA affinity purification sequencing identified Adf-1 target genes involved in diverse cellular processes and revealed the DNA damage response kinase ataxi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Gene expression and regulation are central to the survival and adaptation of Plasmodium falciparum. However, the interplay bet … mited antisense control. NATs complementary to rRNA species reveal a potential regulatory role for rRNA stability in parasites. We report novel associations between mitochondrial respiration and disease severity. Despite globally low methylation levels, intragenic methylation is consistently associated with transcription, with the enrichment of differentially m …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cutaneous leishmaniasis (CL), a neglected infectious disease caused by the intracellular protozoan parasite Leishmania, affects … st a mechanism of drug-dependent immune gene regulation involving modulation of cell signalling and RNA stability in CL patients who have been cured after treatment.
CONCLUSIONS: The model presented herein can be used for evaluating immune gene expression, alongside parasite kill, as PD endpoints of antileishmanials, both for new drug developments and in optim …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study investigates the genetic basis of congenital tooth agenesis (CTA) using an omics approach. Whole exome sequencing (WES) identified novel variants, which were further analyzed in combination with RNA expression data to uncover genes associated with CTA, molecular mechanisms, and systemic disease links.
METHODS: WES was performed on 11 samples (6 CTA patients and 5 controls) to identify pathogenic variants. Integrative approaches, including gene expression profiling, protein interaction mapping, pathway enrichment, in silico functional assessments and molecular dynamics (MD)
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how individual cells respond to genetic or environmental perturbations is crucial for deciphering disease mechanisms and advancing precision medicine. However, predicting single-cell perturbation responses from standard single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data remains challenging because of cellular heterogeneity and the lack of paired pre- and post-perturbation samples in the dataset. Here, we present scVAEAT, a novel deep learning framework that integrates variational autoencoders with attention-enhanced optimal transport to accurately predict gene expression variations foll
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования