SARS-CoV-2 uses -1 programmed ribosomal frameshifting (-1 PRF) to control expression of key viral proteins. Because modulating -1 PRF can attenuate the virus, ligands binding to the RNA pseudoknot that stimulates -1 PRF may have therapeutic potential. Mutations in the pseudoknot have occurred during the pandemic, but how they affect -1 PRF efficiency and ligand activity is unknown. Studying a panel of six mutations in key regions of the pseudoknot, we found that most did not change -1 PRF levels, even when base-pairing was disrupted, but one led to a striking 3-fold decrease, suggesting SARS-C
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydroxychloroquine sulfate (HCQ) is a quinoline used for the prevention and treatment of uncomplicated malaria, lupus erythematosus, and rheumatoid arthritis. For each indication, HCQ is an option for treatment of pediatric and juvenile patients on a weight basis; however, no tailored pediatric product is available on the market. Preliminary research confirmed that a slightly buffered, ion-pairing system significantly reduces the bitterness of HCQ, suggesting a high likelihood that a pediatric taste-masking system could be interwoven into an adult immediate-release formulation allowing the cre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The secondary structure of DNA has been shown to be an important component in the mechanism of expansion of the trinucleotide repeats that a … concentration. Hydroxylamine probing allowed us to identify the C residues that are involved in C.G base pairing. P1 nuclease studies elucidated the presence of unpaired regions in the folded back structures. UV melting studies show biphasic melting curves for the oligonucleotides containing two and three EPM1 repeats. Our data suggests multiple hairpin struct …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Developing effective strategies for the sensitive and accurate detection of colorectal cancer biomarkers is of great significance for improving its early screening. Herein, a novel visual detection platform based on target-driven fluorogenic RNA switch lighting-up for label free measurement of miRNA-126 is demonstrated. For the first time, Pepper RNA with an acrydite group (acrydite-Pepper) is covalently immobilized into the hydrogel network via photopolymerization. The fluorogenic RNA switch simultaneously serves as both a capture probe and a signal output probe, and the conformational change
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNA, especially microRNA-21 (miRNA-21), is a key oncogenic regulator, motivating the development of ultrasensitive and operationally si … ic responses. The localized charge redistribution and volume-insertion effects through Watson-Crick base pairing elevate internal osmotic pressure, driving hydrogel swelling that increases the lattice spacing. The non-close-packed architecture provides large interstitial domains that facilitate rapid miRNA-21 penetration and magnify the resulting photonic resp …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The success of COVID-19 mRNA vaccines has made the in-solution stability optimization of mRNAs a key objective. However, we still lack a complete understanding of sequence metrics that influence mRNA in-solution stability. RNA secondary structure plays a critical role in protecting against hydrolysis, the primary degradation pathway under storage conditions. Yet, the structural metrics that best guide stability-focused mRNA design remain incompletely defined. Global metrics like minimum free energy and average unpaired probability have improved mRNA stability but fail to capture local structur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small interfering RNAs (siRNAs), bound by Argonaute, efficiently cleave target mRNAs through full complementary base pairing, achieving potent gene silencing. While chemical modifications are widely employed to improve siRNA stability and binding affinity, modifying the 5'-end nucleotide of the guide strand remains a primary strategy for enhancing potency. In this study, we performed a structural analysis of the 5'-end binding pocket of the RISC complex to design a novel series of uridine-derived modifications and screen a library including 001U-018U and vs30U as candidates. We further tested …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fe-S clusters are essential cofactors involved in many reactions across all domains of life. Their biogenesis in Escherichia coli and other enterobacteria involves two machineries: Isc and Suf. Under conditions where cells operate with the Suf system, such as during oxidative stress or iron limitation, the entry of aminoglycosides is reduced, leading to resistance to these antibiotics. The transition between Isc and Suf machineries is controlled by the transcriptional regulator IscR. Here, we found that two small regulatory RNAs (sRNAs), FnrS and OxyS, control iscR expression by base pairing t…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this work, the CdSe⁻ZnO flower-rod core-shell structure (CSZFRs) was prepared by ion-exchange method. The surface of CSZFRs was modified by 3-mercaptopropionic acid (MPA), and then the DNA probe was immobilized on the surface via chemical bond between -NH₂ of DNA probe and -COOH of MPA. Finally, the target norovirous (NV) RNA was combined with the probe according to the principle of complementary base pairing, resulting in a decrease of the photocurrent. The results show that the absorbance spectrum of visible light is enhanced for CSZFRs compared with pure ZnO. Under visible light irradiat…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alcohol abuse is a risk factor for a distinct form of congestive heart failure, known as alcoholic cardiomyopathy (ACM). Here, we investigat … ed by luciferase reporter assays, and we found that miR-378a-5p activity depends on a complementary base pairing at the 3'-UTR region of ALDH2 mRNA. Finally, ethanol-induced apoptosis in cardiomyocytes was attenuated in the presence of anti-miR378a-5p. Collectively, these data implicate a likely involvement of miR-378a-5p in the stimulation of cardiomyocyte ap …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
microRNAs (miRNAs) are small, noncoding RNA molecules that through imperfect base-pairing with complementary sequences of target mRNA molecules, typically cleave target mRNA, causing subsequent degradation or translation inhibition. Although an increasing number of studies have identified misregulated miRNAs in the neurodegenerative diseases (NDDs) Alzheimer's disease, Parkinson's disease, Huntington's disease, and amyotrophic lateral sclerosis, which suggests that alterations in the miRNA regulatory pathway could contribute to disease pathogenesis, the molecular mechanisms underlying the path
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We herein describe a novel and label-free electrochemical system to detect theophylline. The system was constructed by immobilizing duplex DNA containing an abasic site opposite cytosine on the gold electrode surface. In the absence of theophylline in a sample, silver ions freely bind to the empty abasic site in the duplex DNA leading to the highly elevated electrochemical signal by the redox reaction of silver ions. On the other hand, when theophylline is present, it binds to the abasic site by pseudo base pairing with the opposite cytosine nucleobase, which consequently prevents silver ions …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Four experiments were conducted to determine the effects of sodium pentobarbital (0, 3, 9, and 15 mg/kg) on the acquisition of the rabbit's classically conditioned nictitating membrane response (NMR) and to determine the locus of the drug's effects on sensory, motor, associative, and nonassociative processes. In experiment 1, classical conditioning of the NMR was accomplished by pairing tone and light conditioned stimuli (CSs) with paraorbital shock as the unconditioned stimulus (US). The experiment revealed that pentobarbital retarded the acquisition of conditioned responses (CRs) to both ton
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the relative stabilities, in the form of complex lifetimes, of complexes between the tRNAs complementary, or nearly so, in their anticodons. The results show striking parallels with the genetic coding rules, including the wobble interaction and the role of modified nucleotides S2U and V (a 5-oxyacetic acid derivative of U). One important difference between the genetic code and the pairing rules in the tRNA-tRNA interaction is the stability in the latter of the short wobble pairs, which the wobble hypothesis excludes. We stress the potential of U for translational errors, and suggest
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Isoguanine nucleosides constructed by different heterocyclic skeletons play a significant role in the context of genetic code expansion, as well as for purine-purine base pairing. However, with respect to structure analysis, only limited information is available on this class of nucleosides. In this study, the single-crystal X-ray structure of 8-ethynyl-2'-deoxyisoguanosine, C12H13N5O4·C12H13N5O4·2H2O (1), has been investigated. In the crystal of 1, the N1-H and N3-H tautomers exist together. They are connected by O3'-H to O3' hydrogen bonds. The conformation at the glycosylic bond is syn for …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acinetobacter baumannii (A. baumannii) is a significant pathogen associated with nosocomial infections, predominantly affecting immunocompromised patients, and is linked to high mortality rates. To control infection rates, there is an urgent need for a diagnostic method that is cost-effective, rapid, and user-friendly, meeting the current demand for timely diagnosis.
METHODS: We have developed a one-tube detection method for UV light unlocking based on RPA-CRISPR/Cas12a technology. This method utilizes the photodegradable chemical group NPOM-dt to chemically modify the crRNA base,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Under certain conditions, RNA repeat sequences phase separate, yielding protein-free biomolecular condensates. Importantly, RNA repeat sequences have also been implicated in neurological disorders, such as Huntington's disease. Thus, mapping repeat sequences to their phase behavior, functions, and dysfunctions is an active area of research. However, despite several advances, it remains challenging to characterize the RNA phase behavior at a submolecular resolution. Here, we have implemented a residue-resolution coarse-grained model in LAMMPS─that incorporates both the RNA sequence and structur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We are often confronted with a simple question, "which gene editing technique is the best?"; the simple answer is "there isn't one". In 2021, a year after prime editing first made its mark, we evaluated the landscape of this potentially transformative advance in genome engineering towards getting treatments to the clinic [1]. Nearly 20% of the papers we cited were still in pre-print at the time which serves to indicate how early-stage the knowledge base was at that time. Now, three years later, we take a look at the landscape and ask what has been learnt to ensure this tech is broadly accessib
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The use of lipid-based formulations (LBFs) can be hindered by low dose loading due to solubility limitations of candidate drugs in lipid vehicles. Formation of lipophilic salts through pairing these drugs with a lipophilic counterion has been demonstrated as a potential means to enhance dose loading in LBFs. This study investigated the screening of appropriate counterions to form lipophilic salts of the BCS class IV drug venetoclax. The physical properties, lipid solubility, and in vitro performance of the salts were analyzed. This study illustrated the versatility of alkyl sulfates and sulfon
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recently emerged severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) is a potent pathogen of humans and is capable of rapid global spread. Peptide-conjugated antisense morpholino oligomers (P-PMO) were designed to bind by base pairing to specific sequences in the SARS-CoV (Tor2 strain) genome. The P-PMO were tested for their capacity to inhibit production of infectious virus as well as to probe the function of conserved viral RNA motifs and secondary structures. Several virus-targeted P-PMO and a random-sequence control P-PMO showed low inhibitory activity against SARS coronavirus. Ce…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования