The chromatin dispersion test (CDT) is based on the removal of nuclear proteins under the assumption that cells with fragmented DNA produce a typical halo of circular DNA loops, which is absent in cells with non-fragmented DNA. This method represents a simple, rapid, accurate, highly reproducible, and inexpensive technique to assess nuclear DNA damage in somatic cells. The visualization of DNA damage and the capacity of the test to provide a threshold value to discriminate between high and low levels of cervical lesions would aid in determining the malignant transformation. All of these advant…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin is a crucial regulator of gene expression and tightly controls development across species. Mutations in only one copy of multiple histone genes were identified in children with developmental disorders characterized by microcephaly, but their mechanistic roles in development remain unclear. Here we focus on dominant mutations affecting histone H4 lysine 91. These H4K91 mutants form aberrant nuclear puncta at specific heterochromatin regions. Mechanistically, H4K91 mutants demonstrate enhanced binding to the histone variant H3.3, and ablation of H3.3 or the H3.3-specific chaperone DAXX…
ПрепринтСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Individuals affected with autism often suffer additional co-morbidities such as intellectual disability. The genes contributing to autism cluster on a relatively limited number of cellular pathways, including chromatin remodeling. However, limited information is available on how mutations in single genes can result in such pleiotropic clinical features in affected individuals. In this review, we summarize available information on one of the most frequently mutated genes in syndromic autism the Activity-Dependent Neuroprotective Protein (ADNP).
RESULTS: Heterozygous and predicted l…
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Precise gene dosage of the X chromosomes is critical for normal development and cellular function. In mice, XX female somatic cells show transcriptional X chromosome upregulation of their single active X chromosome, while the other X chromosome is inactive. Moreover, the inactive X chromosome is reactivated during development in the inner cell mass and in germ cells through X chromosome reactivation, which can be studied in vitro by reprogramming of somatic cells to pluripotency. How chromatin processes and gene regulatory networks evolved to regulate X chromosome dosage in the som…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Expanded CAG/CTG repeats underlie 13 neurological disorders, including myotonic dystrophy type 1 (DM1) and Huntington's disease (HD). Upon expansion, disease loci acquire heterochromatic characteristics, which may provoke changes to chromatin conformation and thereby affect both gene expression and repeat instability. Here, we tested this hypothesis by performing 4C sequencing at the DMPK and HTT loci from DM1 and HD-derived cells. We find that allele sizes ranging from 15 to 1700 repeats displayed similar chromatin interaction profiles. This was true for both loci and for alleles with differe…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The major biological role of red blood cells is to carry oxygen to the tissues in the body. However, another role of the erythroid cell is to participate in the immune response. Mature erythrocytes from chickens express Toll-like receptors and several cytokines in response to stimulation of the immune system. We previously reported the application of a biochemical fractionation protocol to isolate highly enriched transcribed DNA from polychromatic erythrocytes from chickens. In conjunction with next-generation DNA, RNA sequencing, chromatin immunoprecipitation-DNA sequencing, and formaldehyde-…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Globozoospermia is a severe form of teratozoospermia with low incidence in infertile patients, considered as one of the important causes of male infertility. The objective was to investigate the chromatin/DNA integrity as well as apoptosis in ejaculated spermatozoa of cases with partial or total globozoospermia. Fifty-seven semen samples were divided into three groups of partial globozoospermia (n = 17), total globozoospermia (n = 10) and normozoospermia (control; n = 30). Sperm chromatin condensation, DNA integrity and apoptosis were assessed using cytochemical assays. The results showed sign…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ATP-dependent BRG1/BRM associated factor (BAF) chromatin remodeling complexes are crucial in regulating gene expression by controlling chromatin dynamics. Over the last decade, it has become increasingly clear that during neural development in mammals, distinct ontogenetic stage-specific BAF complexes derived from combinatorial assembly of their subunits are formed in neural progenitors and post-mitotic neural cells. Proper functioning of the BAF complexes plays critical roles in neural development, including the establishment and maintenance of neural fates and functionality. Indeed, rece…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eukaryotic gene expression is developmentally regulated, in part by chromatin remodelling, and its dysregulation has been linked to cancer. CHD5 (chromodomain helicase DNA-binding protein 5) is a tumour suppressor gene (TSG) that maps to a region of consistent deletion on 1p36.31 in neuroblastomas (NBs) and other tumour types. CHD5 encodes a protein with chromatin remodelling, helicase and DNA-binding motifs that is preferentially expressed in neural and testicular tissues. CHD5 is highly homologous to CHD3 and CHD4, which are the core subunits of nucleosome remodelling and deacetylation (NuRD…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although both homologous recombination (HR) and nonhomologous end joining can repair DNA double-strand breaks (DSBs), the mechanisms by which one of these pathways is chosen over the other remain unclear. Here we show that transcriptionally active chromatin is preferentially repaired by HR. Using chromatin immunoprecipitation-sequencing (ChIP-seq) to analyze repair of multiple DSBs induced throughout the human genome, we identify an HR-prone subset of DSBs that recruit the HR protein RAD51, undergo resection and rely on RAD51 for efficient repair. These DSBs are located in actively transcribed…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The epithelium lining the epididymis in the male reproductive tract maintains a luminal environment that promotes sperm cell maturation. This process is dependent on the coordinated expression of many genes that encode proteins with a role in epithelial transport. We previously generated genome-wide maps of open chromatin in primary human epididymis epithelial (HEE) cells to identify potential regulatory elements controlling coordinated gene expression in the epididymis epithelium. Subsequent in silico analysis identified transcription factor-binding sites (TFBS) that were over-represented in …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antagonism of the kappa opioid receptor (KOR) has been reported to have anti-depressant-like properties. The dynorphin/KOR system is a cruci … vehicle. The corresponding brain regions from the opposite hemisphere were analyzed for underlying chromatin modifications of the prodynorphin gene promoter region using chromatin immunoprecipitation with antibodies against specifically methylated histones H3K27Me2, H3K27Me3, H3K4Me2, and H3K4Me3, as well as CREB-1 and MeCP2. Significant alterations in pro …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human ankyrin-1 gene (ANK1) contains 3 tissue-specific alternative promoters. We have shown previously that the erythroid-specific ankyr … cated 5.6 kb 3' of the ANK1E promoter at the 3' boundary of an erythroid-specific DNase I-sensitive chromatin domain. The 3' regulatory element exhibits enhancer activity in vitro and in transgenic mice, and it has the histone modifications associated with an enhancer element. One of the ANK1E 3'HS contains an NF-E2 binding site that is required for enhance …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 3D folding structure formed by different genomic regions of a chromosome is still poorly understood. So far, only relatively simple geom … nomic regions are statistically independent. Moreover, we reconstructed the average 3D structure of chromatin in a small genomic region (below 4 Mb) based on five BACs resulting from two overlapping four BAC regions. We found that geometric normalization with respect to the nucleus shape based on non-rigid image registration has a significant influence on t …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiac hypertrophy is an increase in the size of cardiac myocytes to generate increased muscle mass, usually driven by increased workload for the heart. Although important during postnatal development and an adaptive response to physical exercise, excessive hypertrophy can result in heart failure. One characteristic of hypertrophy is the re-expression of genes that are normally only expressed during foetal heart development. Although the involvement of these changes in gene expression in hypertrophy has been known for some years, the mechanisms involved in this re-expression are only now bein
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In conjunction with histone modifications, DNA methylation plays critical roles in gene silencing through chromatin remodeling. Changes in DNA methylation perturb neuronal function, and mutations in a methyl-CpG-binding protein, MeCP2, are associated with Rett syndrome. We report that increased synthesis of brain-derived neurotrophic factor (BDNF) in neurons after depolarization correlates with a decrease in CpG methylation within the regulatory region of the Bdnf gene. Moreover, increased Bdnf transcription involves dissociation of the MeCP2-histone deacetylase-mSin3A repression complex from …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In papillary thyroid carcinoma (PTC) in cytological and surgical specimens, fine chromatin, nuclear grooves and nuclear pseudoinclusions are the hallmarks of diagnosis. We investigated the significance of these nuclear changes in neoplastic non-PTC lesions. Fine needle aspiration biopsies (FNAB) of thyroid lesions were reviewed with histologic correlation. Twenty-five low-grade PTC and 35 neoplastic non-PTC lesions with a fine chromatin pattern in cytology specimens were identified. These lesions were studied along with five multinodular goiters and five follicular adenomas with a coarse chrom…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have recently reported the kinetics of chromosome rejoining and exchange formation in human lymphocytes exposed to gamma rays using the techniques of fluorescence in situ hybridization (FISH) and premature chromosome condensation (PCC). In this paper, we have extended previous measurements to cells exposed to charged particles. Our goal was to determine differences in chromatin break rejoining and misrejoining after exposure to low- and high-linear energy transfer (LET) radiation. Cells were irradiated with hydrogen, neon, carbon or iron ions in the LET range 0.3-140 keV/microm and were inc…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The circadian clock enhances plant fitness by aligning internal timing with the external photoperiod, but how it coordinates spatiotemporal regulation with chromatin dynamics to improve salt tolerance is not well understood. Here, we show that the clock component TIME FOR COFFEE (TIC) forms biomolecular condensates in response to salt stress, but not to osmotic stress alone. Consistently, tic mutants were hypersensitive to salt stress yet displayed enhanced salt tolerance under 21-hour light-dark cycles matching their shortened circadian period, highlighting the importance of circadian clock i…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long non-coding RNAs (lncRNAs) are increasingly recognized as critical regulators of gene expression underlying various cellular functions, … ut dispensable for normal hematopoiesis. Mechanistically, we find that elevated PAN3-AS1 influences chromatin accessibility, thus promoting leukemia gene expression programs. This is mediated, at least in part, by PAN3-AS1 association with the nuclear lamina through a defined functional region that is required for its leukemogenic function. We further chara …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования