Elevated serum urate levels, a complex trait and major risk factor for incident gout, are correlated with cardiometabolic traits via incompletely understood mechanisms. DNA methylation in whole blood captures genetic and environmental influences and is assessed in transethnic meta-analysis of epigenome-wide association studies (EWAS) of serum urate (discovery, n = 12,474, replication, n = 5522). The 100 replicated, epigenome-wide significant (p < 1.1E-7) CpGs explain 11.6% of the serum urate variance. At SLC2A9, the serum urate locus with the largest effect in genome-wide association studies (
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The life cycle of Taenia solium is characterized by different stages of development, requiring various kinds of hosts that can appropriately harbor the eggs (proglottids), the oncospheres, the larvae and the adults. Similar to other metazoan pathogens, T. solium undergoes transcriptional and developmental regulation via epigenetics during its complex lifecycle and host interactions.
RESULT: In the present study, we integrated whole-genome bisulfite sequencing and RNA-seq technologies to characterize the genome-wide DNA methylation and its effect on transcription of Cysticercus cel
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stress during pregnancy widely associates with epigenetic changes and psychiatric problems during childhood. Animal studies, however, show that under specific postnatal conditions prenatal stress may have other, less detrimental consequences for the offspring. Here, we studied mental health and epigenome-wide DNA methylation in saliva following intimate partner violence (IPV) during pregnancy in São Gonçalo, a Brazilian city with high levels of violence. Not surprisingly, mothers exposed to pregnancy IPV expressed elevated depression, PTSD and anxiety symptoms. Children had similar psychiatric
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Risk variants for schizophrenia affect more than 100 genomic loci, yet cell- and tissue-specific roles underlying disease liability remain poorly characterized. We have generated for two cortical areas implicated in psychosis, the dorsolateral prefrontal cortex and anterior cingulate cortex, 157 reference maps from neuronal, neuron-depleted and bulk tissue chromatin for two histone marks associated with active promoters and enhancers, H3-trimethyl-Lys4 (H3K4me3) and H3-acetyl-Lys27 (H3K27ac). Differences between neuronal and neuron-depleted chromatin states were the major axis of variation in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Biochemical DNA modification resembles a crucial regulatory layer among genetic information, environmental factors, and the transcriptome. To identify epigenetic susceptibility regions and novel biomarkers linked to myocardial dysfunction and heart failure, we performed the first multi-omics study in myocardial tissue and blood of patients with dilated cardiomyopathy and controls.
METHODS: Infinium human methylation 450 was used for high-density epigenome-wide mapping of DNA methylation in left-ventricular biopsies and whole peripheral blood of living probands. RNA deep sequencing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cardiovascular disease is associated with epigenomic changes in the heart; however, the endogenous structure of cardiac myocyte chromatin has never been determined.
METHODS: To investigate the mechanisms of epigenomic function in the heart, genome-wide chromatin conformation capture (Hi-C) and DNA sequencing were performed in adult cardiac myocytes following development of pressure overload-induced hypertrophy. Mice with cardiac-specific deletion of CTCF (a ubiquitous chromatin structural protein) were generated to explore the role of this protein in chromatin structure and cardia
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Evidence indicated ethanol exposure during development disrupts brain functions that induces fetal alcohol spectrum disorder (FASD) phenotypes with behavioral abnormalities. We aimed to investigate whether prenatal ethanol exposure has any potential impact on behavior of a FASD fish model. Fertilized Japanese medaka (Oryzias latipes) eggs were exposed to 100-300 mM ethanol or 2 mM 5-azacytidine (5-azaC), 0-2 day post fertilization (dpf), in embryo-rearing medium (ERM). Survived embryos were maintained in clean ERM and used either for gene expression analysis on 2- and 6-dpf or allowed to hatch
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic changes, which target DNA and associated histones, can be described as a pivotal mechanism of interaction between genes and the environment. The field of epigenomics aims to detect and interpret epigenetic modifications at the whole genome level. These approaches have the potential to increase resolution of epigenetic changes to the single base level in multiple disease states or across a population of individuals. Identification and comparison of the epigenomic landscape has challenged our understanding of the regulation of phenotype. Additionally, inclusion of these marks as bioma…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Familial prostate cancer (PCa) accounts for nearly 20% of all PCa cases and is associated with increased genetic susceptibility and earlier disease onset. However, early detection and risk stratification in genetically predisposed individuals remain challenging. Circulating cell-free DNA (cfDNA) provides a minimally invasive source of tumor-derived genomic and epigenomic information. Integrating multi-omic cfDNA analyses may enhance the discovery of biomarkers relevant to familial PCa biology. Methods: We conducted a pilot feasibility study employing whole-genome, strand-specific s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While maternal health has long been the focus of reproductive and developmental research, increasing attention is being given to the father's preconception health. Over the past two decades, growing evidence supports the Paternal Origins of Health and Disease (POHaD) paradigm, highlighting how paternal environmental factors prior to conception can significantly influence offspring development and long-term health. Rodent models have provided critical mechanistic insights into how paternal environmental exposure can alter the sperm epigenetic cargo. Emerging evidence indicates that paternal nut
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Olanzapine, an atypical antipsychotic agent, is widely used in treating psychotic disorders, yet its metabolic side effects remain a clinical concern. Emerging evidence suggests that dynamic alterations in histone methylation are implicated in olanzapine-induced hepatic lipid metabolic disorders. PHF2, a JmjC family histone demethylase mediating H3K9me2 demethylation, functions as a transcriptional repressor by regulating downstream targets. To elucidate PHF2's role in this process, we utilized an olanzapine-induced dyslipidemia rat model. ChIP-qPCR analysis demonstrated a significant reductio
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fetal development is a critical period that establishes reproductive efficiency and herd performance depending on in-utero epigenetic modifications. Dietary restrictions may affect fetal testis development and the offspring fertility. Several studies have connected genetic instability to circadian cycle disruptions, including epigenetic modifications to melatonin, a key regulator. On day 160 of gestation, 17 male-bearing Brangus heifers were assigned to one of four groups in a 2 × 2 factorial treatment arrangement: adequately fed (ADQ; 100% NRC recommendation, n = 3), nutrient restricted (RES;
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Calcific aortic valve stenosis (AVS) is the most prevalent valvular heart disease in Western adults, yet no disease-modifying therapy exists. High shear stress (HSS) generated by progressive valvular obstruction drives endothelial injury and immune-mediated inflammation, but the contribution of circulating T cells to AVS pathogenesis remains poorly defined.
OBJECTIVES: We tested whether chronic HSS corresponds with epigenomic reprogramming of peripheral T cells proportionate with hemodynamic severity to yield a clinically informative proxy of disease.
METHODS: A prospective cohor
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reprogramming of adult somatic cells into induced pluripotent stem cells (iPSCs) resets the aging clock. However, primed iPSCs can retain cell-of-origin epigenomic marks, especially those linked to heterochromatin. Here, we show that iPSCs produced from fibroblasts of late-onset sporadic Alzheimer's disease (AD) cases retain epigenomic alterations that correlate with developmental anomalies and neurodegeneration. Compared to controls, AD iPSCs show reduced BMI1 expression and H3K9me3 levels and an altered DNA methylome. Gene Ontology analysis of differentially methylated DNA regions reveals te
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Causal mediation analysis investigates whether the effect of an exposure on an outcome operates through intermediate variables known as mediators. Although progress has been made in high-dimensional mediation analysis, current methods do not reliably control the false discovery rate (FDR) in finite samples, especially when mediators are moderately to highly correlated or follow non-Gaussian distributions. These challenges frequently arise in DNA methylation studies. We introduce CoxMDS, a multiple data splitting method that uses Cox proportional hazards models to identify putative causal media
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since 2022, global outbreaks of monkeypox virus (MPXV) have been repeatedly designated by the World Health Organization (WHO) as a public health emergency of international concern (PHEIC), underscoring the urgent need to elucidate the multidimensional mechanisms underlying viral evolution and transmission. Current understanding remains largely focused on genomic variation, while the critical role of epigenetic regulation has been considerably overlooked. To address this gap, this study integrates high-throughput evolutionary genomic analysis with whole-genome DNA methylation profiling. Using p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Cathepsin D (Ctsd) has emerged as a promising therapeutic target for Alzheimer's disease (AD) due to its role in degrading intracellular amyloid beta (Aβ). Enhancing Ctsd activity could reduce Aβ42 accumulation and restore the Aβ42/40 ratio, offering a potential AD treatment strategy. Methods: This study explored Ctsd demethylation in AD mouse models using dCas9-Tet1-mediated epigenome editing. We identified dCas9-Tet1 as an effective tool for demethylating the endogenous Ctsd gene in primary neurons and in vivo brains. Results: Treatment with Ctsd-targeted dCas9-Tet1 in primary ne
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Cerebrospinal fluid (CSF) biomarkers of Alzheimer's disease (AD) are reliable predictors of future AD risk. We investigated whether pre-clinical changes in AD CSF biomarkers are reflected in blood DNA methylation (DNAm) levels in cognitively normal participants.
METHODS: We profiled blood-based DNAm with the EPIC array in participants without a diagnosis of cognitive impairment in the Emory Healthy Brain Study (EHBS; N = 495), Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (N = 122), and Parkinson's Progression Markers Initiative (N = 118) cohorts. Their CSF amyloid beta 42, total
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Child maltreatment (CM) is associated with adverse physical, psychological, and neurodevelopmental outcomes later in life. Epigenetic modifications, particularly DNA methylation, have been proposed as potential mechanisms underlying these long-term effects. To identify robust CM-associated methylation signatures, we conducted epigenome-wide analyses across three independent cohorts: judicial autopsy cases (CM:11, Controls:7), toddlers shortly after social intervention (CM:36, Controls:49), and adolescents who underwent brain MRI (CM:61, Controls:62). Each cohort was analyzed separately, follow
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite their ecological and biotechnological importance, the extent to which microalgae are regulated by epigenetic mechanisms has remained poorly understood. In the model industrial microalga Nannochloropsis oceanica, by comprehensive, multi-dimensional epigenomic analyses, this study uncovers an epigenetic regulatory network responsive to CO2 levels. This network involves intricate interactions among DNA methylation, histone modifications, dynamic nucleosome positioning, and three-dimensional chromatin organization during adaptation to low-CO2 conditions. Although DNA methylation is minimal
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования