Structure-based virtual screening requires repeated evaluation of protein-ligand interaction energies across receptor conformations, ligand identities, translations, and rotations. Here, AutoDock receptor energy maps and ligand charge or atom-type occupancy grids were reformulated as an indexed quantum-compatible inner-product representation for grid-based protein-ligand scoring. Receptor maps and ligand grids were represented on a shared 32 × 32 × 32 Cartesian grid, allowing direct classical dot-product evaluation and quantum-compatible readout to be compared under the same energy model. A 32
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vanilloid analogs, which can activate transient receptor potential vanilloid 1 (TRPV1), have been classified into two types based on susceptibility to forskolin (FSK). Treatment of cells expressing TRPV1 with FSK enhances TRPV1 responses to capsaicin-type ligands while diminishing the responses to eugenol-type ligands. In this study, we determined the effect of FSK on the activation of TRPV1 stimulated with vanilloid ligands, through the influx of Ca2+ in HEK293T cells expressing TRPV1. Our findings suggest that the effects of FSK can be attributed to the phosphorylation of TRPV1, as evidenced…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three gold(I) linear compounds, sharing the general formula [AuI(LPh3)], have been synthesized and characterized. The nature of the ligand has been modified by moving down among some of the elements of group 15, i.e. phosphorus, arsenic and antimony. The structures of derived compounds have been solved through XRD and the reactivity behaviour towards selected biomolecules has been investigated through a multi-technique approach involving NMR, high-resolution mass spectrometry and IR. Moreover, the biological activity of the investigated compounds has been comparatively analyzed through classic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Halides adjacent to nitrogen are conventionally more reactive in Pd-catalyzed cross-couplings of dihalogenated N-heteroarenes. However, a very sterically hindered N-heterocyclic carbene ligand is shown to promote room-temperature cross-coupling at C4 of 2,4-dichloropyridines with high selectivity (∼10:1). This work represents the first highly selective method with a broad scope for C4-coupling of these substrates where selectivity is clearly under ligand control. Under the optimized conditions, diverse substituted 2,4-dichloropyridines and related compounds undergo cross-coupling to form C4-C(
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding ligand properties is essential for computational high-throughput screening of transition metal complexes. However, ligand prop … es, and consensus across crystallographic observations, we confidently assign net charges to 66,810 ligands among 94,581 identified unique ligand structures to curate the Boston Open-Shell Ligand (BOS-Lig) data set. The workflow assigns ligand charges in homoleptic complexes first and then iteratively propagates these assignments across heteroleptic envir …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Elucidating the correct binding mode of drug-like compounds is crucial to reveal the molecular determinants underlying the recognition by the target protein and to estimate the binding affinity, thus guiding ensuing hit-to-lead optimization. However, identifying the near-native binding pose in docking experiments remains a major hurdle. Assuming that the hydropathic complementarity principle is the major driving force in ligand-protein recognition, the suitability of simple hydropathicity-based scoring functions to reveal the near-native pose was examined. A benchmarking dataset of 1000 ligand
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aquaporins (AQPs) are transmembrane proteins that facilitate the bidirectional transport of water, glycerol, and small solutes across cell membranes. AQPs are potential targets for drug development, namely for cancer treatment. In this work, we address the effect of several Cu-, Zn- and V-phen complexes on AQP1, which is selective for water transport, and AQP3, mainly involved in the transport of water and glycerol. A group of M(Xphen)22+ compounds (M = Cu2+, Zn2+, VIVO2+; Xphen = 1,10-phenanthroline, 5-amino-1,10-phenanthroline (Amphen), 4,7-dimethyl-1,10-phenanthroline), known to be cytotoxi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predicting the binding poses of ligands targeting RNAs is challenging. Here, we propose that using first-principles quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) simulations, which incorporate automatically polarization effects, can help refine the structural determinants of ligand/RNA complexes in aqueous solution. In fact, recent advances in massively parallel computer architectures (such as exascale machines), combined with the power of machine learning, are greatly expanding the domain of applicability of these types of notoriously expensive simulations. We corroborate this proposal by car…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A series of thiosemicarbazonato-hydrazinatopyridine zinc(II) complexes were evaluated as direct air CO2 capture agents. The complexes sequester CO2 in a methanol solution as a metal-coordinated methylcarbonate. The reaction is reversible upon sparging of solutions with an inert gas (N2 or Ar). The capture process involves metal-ligand cooperativity with the noncoordinating nitrogen of the hydrazinatopyridine functional group serving as a Brønsted-Lowry base and the zinc acting as a Lewis acid. In this study, the pendent amine of the thiosemicarbazonato group was varied to include 4-phenyl (ZnL
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A series of novel Zn(II) complexes [Zn2(nap)4] (1), [Zn(nap)21,10-phen](2), [Zn(nap)22,9-dmphen] (3), [Zn(nap)2(2-ampy)2] (4), [Zn(nap)2(imi … ed different activity against the different bacteria, and were compared with activity of the parent ligands. The complexes were tested also for their anti-malarial activity using two methods: a semi-quantitative micro-assay and a previously self-developed quantitative in-vitro method. Both were used to study the efficiency of these complexes in inhibiting …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The synthesis of photoluminescent Cr(III) complexes of the type [Cr(diimine)(2)(DPPZ)](3+) are described, where DPPZ is the intercalating dipyridophenazine ligand, and diimine corresponds to the ancillary ligands bpy, phen, DMP, and TMP (where bpy = 2,2'-bipyridine, phen = 1,10-phenanthroline, DMP = 5,6-dimethyl-1,10-phenanthroline, and TMP = 3,4,7,8-tetramethyl-1,10-phenanthroline). For TMP, DMP, and phen as ancillary ligands, the complexes have also been resolved into their Lambda and Delta optical isomers. A comparison of the photophysical and electrochemical properties reveal similar (2)E(…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CD40 ligand (CD40L) is a 33-kDa type II membrane glycoprotein mainly expressed on activated CD4(+) T cells in trimeric form. When it is mutated, the clinical consequences are X-linked hyper-IgM syndrome (XHIM), a primary immunodeficiency disorder characterized by low levels of IgG, IgA, and elevated or normal levels of IgM. Mutated CD40L can no longer bind CD40 nor provide signals for B cells to proliferate and to switch from IgM to other immunoglobulin isotypes. When considering gene therapy for XHIM, it is important to address the possibility that the mutated CD40L associates with transduced
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structures of coordination polymers are strongly influenced by the organic ligands and metal ions used for their construction, so it is important to choose suitable ligands and metal ions and appropriate synthetic processes. Two novel d(10) coordination polymers, namely poly[[diaquabis(2,2'-bipyridine)[μ4-4,4'-(1,4-phenylenedioxy)bis(benzene-1,2-dicarboxylato)]dizinc(II)] dihydrate], {[Zn2(C22H10O10)(C10H8N2)2(H2O)2]·2H2O}n, (1), and poly[[diaquabis(1,10-phenanthroline)[μ4-4,4'-(1,4-phenylenedioxy)bis(benzene-1,2-dicarboxylato)]dicadmium(II)] dimethylformamide disolvate], {[Cd2(C22H10O10)(…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integrins α1β1, α2β1, α10β1, and α11β1 are known to recognize the GxxGEx motif of the collagen triple helix through their αI domains, with t … ion of the α2I domain without metal coordination. This cryptic interaction, likely unused by native ligands, provides a new basis for the design of subtype-specific ligands targeting collagen-binding integrins.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chimeric antigen receptor (CAR)-T cell therapy has achieved remarkable success in hematologic malignancies, but durable efficacy remains limited by insufficient CAR-T cell persistence. Here, we show that activated CAR-T cells upregulate multiple NKG2D ligands (NKG2DLs), increasing their susceptibility to natural killer (NK) cell-mediated CAR-T cell cytotoxicity. To address this vulnerability, we engineer CAR-T cells to overexpress full-length NKG2D (CAR-NG). NKG2D overexpression reduces the surface accessibility of endogenous NKG2DLs without decreasing their total protein abundance. In paralle…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antagonism of purinergic P2Y2 receptors offers potential benefits in the treatment of inflammatory diseases, neurodegenerative disorders, an … unexpected affinity for 26a, and led to the identification of new stable, uracil-based fluorescent ligands targeting the P2Y2R.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Natural killer (NK) cells play a key role in immune defense against tumors and viral infections through a balance of activating and inhibito … ceptor expressions. Flow cytometric analysis demonstrated that the interaction between CD99 and its ligands modulates NK cell phenotypes, particularly through downregulation of natural cytotoxicity receptors (NCRs). Differential effects were observed between PBMCs and purified NK cell cultures, indicating the surrounding immune cell environment influences …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer (BC) is a global health problem. BC is a biologically heterogeneous disease in which novel immunotherapeutic strategies are needed, particularly in the metastatic setting. The NKG2D/NKG2D ligand (NKG2DL) axis is a key component of innate antitumor immunity and represents a potential therapeutic target, but its relevance in BC has not been fully characterized. We performed an in silico analysis of NKG2DL expression in BC cell lines, healthy breast tissue, and tumor samples using publicly available transcriptomic databases (DSMZCellDive, ShinyTHOR, GTEx, TCGA, Human Protein Atlas),
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The reactivity of IDipp·GeH2BH2OTf (1) (IDipp = 1,3-bis(2,6-diisopropylphenyl)imidazolin-2-ylidene) toward monodentate N-donor and bidentate pnictogen-donor ligands is reported. In the reaction of 1 with triethyl amine, the cationic adduct [IDipp·GeH2BH2·NEt3]+(2+) is formed. In contrast, primary and secondary amines exhibit a proton transfer to the germanium center, resulting in the formation of [IDipp·GeH3]+ (4+) and [IDipp·BH2·NHR'R'']+ (3+a-c) species. DFT calculations reveal that the driving force for the observed difference in reactivity is the tendency of NHEt2 to transfer a proton to 1…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The goal of this work was the discovery of moderate-efficacy, selective, partial agonists of the nociceptin/orphanin-FQ peptide (NOP) receptor.
METHODS: A novel collection of quinoxaline-containing molecules was designed, synthesized, and assayed against NOP and mu-opioid receptors in vitro to establish the relationship between structural modification and pharmacological activity. The lead molecule identified was further assessed in vivo to determine brain penetration, analgesic effects in rodent models of pain, and motor deficits.
RESULTS: This SAR approach revealed that the p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования