Climate change is driving more frequent and severe heat events, yet the developmental mechanisms by which organisms anticipate and adapt to thermal stress remain poorly understood. In zebra finches (Taeniopygia guttata), parents exposed to extreme heat emit distinctive "heat call" vocalizations during late incubation that trigger adaptive phenotypic responses in offspring, including altered growth, thermoregulation, and reproductive success. Recent transcriptomic analysis revealed that prenatal heat call exposure induces hypothalamic gene expression changes enriched in non-neuronal populations
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Medulloblastoma, the most common malignant brain tumor of childhood, exhibits significant biological complexity that demands deeper exploration. Here, we present a large multiomics dataset integrating data from 384 primary medulloblastoma patient samples across five omic layers: CpG methylome, transcriptome, proteome, phosphoproteome, and metabolome, paired with associated clinical metadata. Data integration revealed intertumoral heterogeneity of lipid metabolism across proteomic subtypes. Notably, while the MYC-FASN-SCD axis drives lipid biosynthesis, pathway inhibition elicits a compensatory…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis is a systemic inflammatory response syndrome caused by an infection featuring high morbidity and mortality due to complex mechanisms underlying immune dysfunction. In this study, based on the sepsis transcriptome profiles from the GEO datasets (GSE65682, GSE28750, GSE95233, and GSE167363), we used the machine learning method and other computational algorithms, such as differential gene expression analysis, weighted gene coexpression network analyses (WGCNA), and the building of PPI networks to identify four hub genes (DDX24, GZMM, KCNA3, and NCL). The quantitative reverse transcription
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The molecular mechanisms underlying frailty are under intense investigation. Independent observational studies revealed various biological processes and biomarkers differentially expressed in frail individuals and after interventions. Recently, several transcriptomic approaches have described molecular patterns associated with frailty status. However, the effects of physical exercise interventions remain unexplored. Two studies (FRAILOMIC and BIOFRAIL) identified molecular signatures associated with frailty. The objective of the study was to analyse the expression of the FRAILOMIC
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Systemic lupus erythematosus (SLE) shows clinical and molecular heterogeneity, and cardiovascular (CV) complications and lupus nephritis (LN) remain leading causes of morbidity and mortality. This study investigated whether omic profiling can reveal molecular endotypes linked to these outcomes.
METHODS: Serum from 199 patients with SLE underwent proximity extension assay-based proteomics and targeted nuclear magnetic resonance metabolomics. Unsupervised clustering was performed on proteomic data, followed by integrative multiomic factor analysis, logistic regression, and machine le
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent advances in spatially resolved molecular profiling have positioned matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry imaging (MALDI-MSI) as a powerful platform for multiomic tissue analyses. However, conventional workflows that sequentially target distinct molecular classes are time- and resource-intensive, requiring repeated sequential sample preparation, imaging, and data integration. Here, we evaluate streamlined strategies for simultaneous or combined acquisition of N-glycan and collagen-derived peptide information using PNGase F and collagenase. In-solution studies demo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inherited genetic variation substantially increases the risk for developing childhood B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL), the most common cancer in children, yet the underlying mechanisms remain poorly understood. To address this limitation, we employ a single-cell multiomic framework to functionally dissect common regulatory variants associated with B-ALL risk. Coupling this multiomic analysis with assessment of allelic skews in chromatin accessibility, we reveal the impact of risk alleles and disruptions in transcription factor networks specific to B-cell progenitors, thereby provid
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Aging is a leading risk factor for retinal degeneration. MicroRNAs (miRNAs) regulate posttranscriptional gene suppressors and influence inflammation and oxidative stress, two processes disrupted during retinal aging. This study aimed to identify age-related miRNA-mRNA-protein associations between young and older retinas and uncover dysregulated pathways that may contribute to retinal degeneration.
METHODS: Retinal function was assessed using electroretinography (ERG), and microgliosis was quantified by microglial immunohistochemistry (IHC). A multiomics approach was used to examine m…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) is a fatal interstitial lung disease characterized by progressive scarring and respiratory failure. While T cells are elevated in IPF lungs, their contributions to fibrosis beyond inflammation remain poorly understood. Here, we performed multiplex imaging and single-cell RNA and protein profiling on about 90,000 CD3+ T cells from control and fibrotic lungs, revealing 11 distinct subsets of CD4+ and CD8+ T cells, including a rare CD56+ regulatory T cell. In addition to increased T cell numbers in severely fibrotic lungs compared with non-diseased controls, we
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polycystic ovary syndrome (PCOS) affects reproductive and cardiometabolic health, yet its pathogenesis remains unclear. Emerging evidence links hemoglobin levels to metabolic disorders, suggesting a potential role in PCOS development. Here, we integrated a large-scale cohort study, Mendelian randomization (A genetic tool to infer causal relationships), bioinformatics analyses, and in vitro experiments to investigate the relationship between hemoglobin levels and PCOS. In a cohort of 20 602 women, each 10 g L-1 elevation in hemoglobin levels is associated with 22% higher odds of PCOS (adjusted
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A central determinant of successful reproduction is pregnancy establishment and maintenance that relies on proper development of the conceptus (embryo/fetus and associated extraembryonic membranes including the placenta). Pregnancy loss in cattle can be caused by inadequate development and differentiation of the placenta. However, the cellular and molecular mechanisms regulating bovine placenta development and, particularly, trophoblast differentiation are not well understood. Recent single-cell RNA-seq analyses revealed dynamic changes in cell populations and gene expression patterns during b
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single cell technologies have advanced at a rapid pace, providing assays for various molecular phenotypes. Droplet-based single cell technologies, particularly those based on nuclei isolation, such as simultaneous RNA+ATAC single-cell multiome, are susceptible to exogenous ambient molecule contamination, which can increase noise in cell type-level associations. We reasoned that genotype-based sample multiplexing can provide an opportunity to infer this ambient contamination by leveraging DNA variation in sequenced reads. Thus, we developed ambimux, a likelihood-based method to estimate ambient
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Total proctocolectomy with ileal pouch anal anastomosis is the standard of care for patients with severe ulcerative colitis. We generated a cell-type-resolved transcriptional and epigenetic atlas of ileal pouches using scRNA-seq and scATAC-seq data from paired biopsy samples of the ileal pouch and the ileal segment above the pouch (pre-pouch) from patients (male=4, female=2), and paired biopsies of the terminal ileum and ascending colon from healthy individuals (male=3, female=3) serving as reference. Our study finds an additional population of absorptive and secretory epithelial cells within
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a debilitating motor neuron disease and lacks effective disease-modifying treatments. This study utilizes a comprehensive multiomic approach to investigate the early and sex-specific molecular mechanisms underlying ALS. By analyzing the prefrontal cortex of 51 patients with sporadic ALS and 50 control subjects, alongside four transgenic mouse models (C9orf72-, SOD1-, TDP-43-, and FUS-ALS), we have uncovered significant molecular alterations associated with the disease. Here, we show that males exhibit more pronounced changes in molecular pathways compared
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chemical exposomes can now be comprehensively measured in human blood, but knowledge of their variability and longitudinal stability is required for robust application in cohort studies. Here, we applied high-resolution chemical exposomics to plasma of 46 adults, each sampled 6 times over 2 years in a multiomic cohort, resulting in 276 individual exposomes. In addition to quantitative analysis of 83 priority target analytes, we discovered and semiquantified substances that have rarely or never been reported in humans, including personal care products, pesticide transformation products, and pol
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The brown marmorated stink bug (Halyomorpha halys) poses a significant threat to hazelnut crops by affecting kernel development and causing quality defects, reducing the market value. While previous studies have identified bitter-tasting compounds in affected kernels, the impact of stink bug feeding on the hazelnut metabolome, particularly concerning aroma precursors, remains underexplored. This study aims to map the nonvolatile metabolome and volatilome of hazelnut samples obtained by caging H. halys on different cultivars in two locations to identify markers for diagnosing stink bug damage.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Repeated antigen exposure leads to T-cell exhaustion, a transcriptionally and epigenetically distinct cellular state marked by loss of effector functions (e.g., cytotoxicity, cytokine production/release), up-regulation of inhibitory receptors (e.g., PD-1), and reduced proliferative capacity. Molecular pathways underlying T-cell exhaustion have been defined for CD8+ cytotoxic T cells, but which factors drive exhaustion in CD4+ T cells, that are also required for an effective immune response against a tumor or infection, remains unclear. Here, we utilize quantitative proteomic, phosphoproteomic,
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The immune-specialized environment of the healthy brain is tightly regulated to prevent excessive neuroinflammation. However, after cancer development, a tissue-specific conflict between brain-preserving immune suppression and tumor-directed immune activation may ensue. To interrogate potential roles of T cells in this process, we profiled these cells from individuals with primary or metastatic brain cancers via integrated analyses on the single-cell and bulk population levels. Our analysis revealed similarities and differences in T cell biology between individuals, with the most pronounced di
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leishmania braziliensis is a parasitic infection that can result in inflammation and skin injury with highly variable and unpredictable clinical outcomes. Here, we investigated the potential impact of microbiota on infection-induced inflammatory responses and disease resolution by conducting an integrated analysis of the skin microbiome and host transcriptome on a cohort of 62 patients infected with L. braziliensis. We found that overall bacterial burden and microbiome configurations dominated with Staphylococcus spp. were associated with delayed healing and enhanced inflammatory responses, es
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ift88 gene mutations cause primary cilia loss and polycystic kidney disease (PKD) in mice. Nephron intraflagellar transport protein 88 (Ift88) knockout (KO) at 2 mo postnatal does not affect renal histology at 4 mo postnatal and causes PKD only in males by 11 mo postnatal. To identify factors associated with PKD development, kidneys from 4-mo-old male and female control and Ift88 KO mice underwent transcriptomic, proteomic, Western blot, metabolomic, and lipidomic analyses. mRNAs involved in extracellular matrix (ECM) synthesis and degradation were selectively upregulated in male KO mice. Prot
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования