Introduction. The difficulty in diagnosis of severe melanocytic lesions is a problem to be overcome in pathological practice. Melanin bleach … ethods. The applicability of the optimized depigmentation method was validated in 10 formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) blocks of ocular melanoma tissues. Specimens were demelaninized with 10% hydrogen peroxide at 60°C for immunohistochemical staining (Melan-A and SOX10), and tissue chromogenic staining was performed with DAB and AP detection systems, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In sporadic idiopathic pulmonary fibrosis (sIPF) and pulmonary fibrosis caused by a mutation in telomere (TRG-PF) or surfactant related genes (SRG-PF), there are a number of aberrant cellular processes known that can lead to fibrogenesis. We investigated whether RNA expression of genes involved in these processes differed between sIPF, TRG-PF, and SRG-PF and whether expression levels were associated with survival. RNA expression of 28 genes was measured in lung biopsies of 26 sIPF, 17 TRG-PF, and 6 SRG-PF patients. Significant differences in RNA expression of TGFBR2 (p = 0.02) and SFTPA2 (p =
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lectin microarray (LMA) is a high-sensitive glycan analysis technology used to obtain global glycomic profiles of both N- and O-glycans attached not only to purified glycoproteins but also to crude glycoprotein samples. Through additional use of laser microdissection (LMD) for tissue collection, we developed an LMA-based glycomic profiling technique for a specific type of cells in a tiny area of formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue sections. This LMD-LMA method makes it possible to obtain reproducible tissue glycomic profiles that can be compared with each other, using a unified prot…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this research, we developed a novel method of quantitative analysis to increase the detection potential for screening and classification … ablation and ablated tissue elemental and molecular analysis. For this purpose, melanoma and normal paraffin-embedded tissues are used as a sample for LIBS and Raman measurement. We studied the data provided by laser-based spectroscopic methods using different machine learning classification techniques of extreme learning machine (ELM), partial least squar …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Archived formalin fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues are powerful tools in medicine, capable of harboring diagnostic and genetic answers to challenging clinical questions. Successful utilization of DNA derived from FFPE samples is dependent upon repairing DNA damage generated from the fixation process. Methods to repair FFPE DNA have been successful in human medicine for a variety of research and clinical applications, yet remain underutilized in veterinary medicine. Despite the available technology, our study is the first to evaluate the repair of FFPE derived DNA from veterinary species …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identification of bacterial pathogens in formalin fixed, paraffin embedded (FFPE) tissue samples is limited to targeted and resource-intensive methods such as sequential PCR analyses. To enable unbiased screening for pathogens in FFPE tissue samples, we established a whole genome sequencing (WGS) method that combines shotgun sequencing and metagenomics for taxonomic identification of bacterial pathogens after subtraction of human genomic reads. To validate the assay, we analyzed more than 100 samples of known composition as well as FFPE lung autopsy tissues with and without histological signs …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with chronic lung disease are vulnerable to getting severe diseases associated with SARS-CoV-2 infection. Here, we describe protocols for subculturing and differentiating primary normal human bronchial epithelial (NHBE) cells of patients with chronic obstructive lung disease. The differentiation of NHBE cells in air-liquid interface mimics an in vivo airway and provides an in vitro model for studying SARS-CoV-2 infection. We also describe a protocol for detecting proteins in the sectioned epithelium for detailing SARS-CoV-2 infection-induced pathobiology with a vertical view.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Tissues submitted for histopathological diagnoses are routinely fixed in formaldehyde fixative which facilitates tissue storage for the extended period of time for further investigation or research purpose. The literature has reliable data relating to immunohistochemistry and molecular studies done using tissue fixed in formalin for longer duration and in paraffin-embedded tissue blocks. We have attempted to evaluate staining adequacy of archival specimens using hematoxylin and eosin (H&E) and trichrome stains.
METHODOLOGY: We compared staining adequacy in tissues stored in form…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues are routinely prepared and collected for diagnostics in pathology departments. These are, therefore, the most accessible research sources in pathology archives. In this study we investigated whether we can apply a targeted and quantitative parallel reaction monitoring (PRM) method for FFPE tissue samples in a sensitive and reproducible way. The feasibility of this technical approach was demonstrated for normal brain and glioblastoma multiforme tissues. Two methods were used: PRM measurement of a tryptic digest without phosphopeptide enrichment (D…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Formalin-fixed lung tissue and paraffin blocks containing peripheral lung tissue obtained from subjects with an occupational asbestos exposure are both regarded to be suitable to determine asbestos load. Because sample preparation of paraffin blocks requires a more intense treatment than formalin-fixed tissue, we tested whether asbestos analysis of formalin-fixed lung tissue and paraffin blocks obtained from the same patients deliver comparable results.
MATERIALS AND METHODS: We determined numbers of asbestos bodies (AB) and amphibole asbestos fibers (AF) in formalin-fixed lung ti…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histoplasma capsulatum var. duboisii (Hcd) infections have been well documented to cause chronic granulomatous disease, mainly involving the skin of baboons and humans in African countries primarily. This retrospective study classified the subspecies of Histoplasma and developed a phylogenetic tree utilizing DNA sequences extracted from formalin-fixed, paraffin embedded (FFPE) tissues from 9 baboons from a research colony in Texas histologically diagnosed with Hcd. Based on sequence analysis of ITS-2, Tub-1, and ARF, Hcd isolated from the archived samples closely aligns with the African clade …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Obtaining high-quality sections of the nail plate poses a significant challenge to histopathology technicians world over. Nail is a heavily … e role of various compounds as softening agents for nail biopsies with inflammatory disease. Thirty paraffin-embedded nail biopsies were subjected to four softening agents: distilled water (DIH20), 30% potassium hydroxide (KOH), hair removal cream, and fabric conditioner. The ease of sectioning, the incidence of juddering (i.e. 'venetian blind' effect), an …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In fluorescence microscopy, light radiation can be used to bleach fluorescent molecules in formalin-fixed and paraffin-embedded (FFPE) samples, in order to increase the ratio between signal of interest and background autofluorescence. We tested if the same principle can be exploited in bright field microscopy to bleach pigmented melanoma FFPE sections together with cell morphology maintenance. After dewaxing and rehydration, serial FFPE sections of a feline diffuse iris melanoma, a canine dermal melanoma, a gray horse dermal melanoma and a swine cutaneous melanoma were irradiated with visible …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydatidiform mole (HM) is an abnormal human pregnancy characterized by excessive trophoblastic proliferation and abnormal embryonic developm … non-molar abortions. Genotyping analysis is mostly performed on DNA and tissues from formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) products of conception, which have less than optimal quality and may consequently lead to wrong conclusions. In this article, detailed protocols for multiplex genotyping and flow cytometry analyses of FFPE molar tissues are provided, …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАVideo-Audio MediaПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sporadic outbreaks of Rift Valley fever virus (RVFV), a zoonotic, mosquito-borne Phlebovirus, cause abortion storms and death in sheep and c … ation and human risk, through the use of inactivated, noninfectious samples such as formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissues are needed. FFPE tissue in situ hybridization (ISH) enables the detection of nucleic acid sequences within the visual context of cellular and tissue morphology. Here, we present a chromogenic pan-RVFV ISH assay based on RNAsc …
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Glomeruli are excellent pre-determined natural structures for laser micro-dissection. Compartment-specific glomerular gene expression analysis of formalin-fixed paraffin-embedded renal biopsies could improve research applications. The major challenge for such studies is to obtain good-quality RNA from small amounts of starting material, as applicable for the analysis of glomerular compartments. In this work, we provide data and recommendations for an optimized workflow of glomerular mRNA analysis.
RESULTS: With a proper resolution of the camera and screen provided by the next gene…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs are considered as promising prognostic and diagnostic biomarkers of human cancer since their profiles differ between tumor types. Most of the tumor profiling studies were performed on rarely available fresh frozen (FF) samples. Alternatively, archived formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue samples are also well applicable to larger-scale retrospective miRNA profiling studies. The aim of this study was to perform systematic comparison of the miRNA expression profiles between FF and macrodissected FFPE tonsillar tumors using the TaqMan Low Density Array system, with the data pr…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The diagnosis of dysplasia in Barrett's oesophagus (BO) can be challenging, and reliable ancillary techniques are not available. This study examines if DNA content abnormality detected by flow cytometry can serve as a diagnostic marker of dysplasia and facilitate risk stratification of low-grade dysplasia (LGD) and indefinite for dysplasia (IND) patients using formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) BO samples with varying degrees of dysplasia.
DESIGN: DNA flow cytometry was performed on 80 FFPE BO samples with high-grade dysplasia (HGD), 38 LGD, 21 IND and 14 negative for dysplasi…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present report describes a real-time PCR-based procedure to reliably determine the quantity of Leishmania amastigotes in relation to the amount of host tissue in histological skin sections from canine and equine cases of cutaneous leishmaniasis. The novel diagnostic Leishmania-PCR has a detection limit of <0.02 amastigotes per μg tissue, which corresponds well to the detection limit of immunohistochemistry and is far beyond that of conventional histology. Our results emphasise the importance of PCR to complement routine histology of cutaneous leishmaniasis cases, particularly in laboratori
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coccidioides immitis and C. posadasii are the etiologic agents of coccidioidomycosis, an endemic fungal disease of the Americas. In Colombia, this mycosis is uncommon, and only five cases, two of them imported, have been documented.By means of DNA sequencing, C. immitis was identified in formalin-fixed, paraffin-embedded archival tissues samples from the 5th Colombian patient diagnosed in 1997. The patient was born in Pinto, Department of Magdalena, and had never visited other geographic regions, a reason to consider that the mycosis had been acquired locally.This species is primarily found in…
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования