Plumage colouration in birds is important for a plethora of reasons, ranging from camouflage, sexual signalling, and species recognition. The genes underlying colour variation have been vital in understanding how genes can affect a phenotype. Multiple genes have been identified that affect plumage variation, but research has principally focused on major-effect genes (such as those causing albinism, barring, and the like), rather than the smaller effect modifier loci that more subtly influence colour. By utilising a domestic × wild advanced intercross with a combination of classical QTL mapping
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A growing number of studies clearly demonstrate a substantial link between metabolic dysfunction and the risk of Alzheimer's disease (AD), especially glucose-related dysfunction; one hypothesis for this comorbidity is the presence of a common genetic etiology. We conducted a large-scale cross-trait GWAS to investigate the genetic overlap between AD and ten metabolic traits. Among all the metabolic traits, fasting glucose, fasting insulin and HDL were found to be genetically associated with AD. Local genetic covariance analysis found that 19q13 region had strong local genetic correlation betwee
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The translation of genetic variation into breeding gain relies on an integrated and sequential pipeline comprising high-quality DNA extraction, precise locus amplification and sequencing, accurate variant discovery, conversion of polymorphisms into diagnostic markers, high-throughput genotyping, and systematic integration into crossing and selection programs. This chapter presents a comprehensive framework for the development and application of molecular markers for aroma improvement in rice, with broader relevance to yield and stress-resilience traits in Oryza sativa. Rice aroma, a premium gr
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Understanding the genetic regulation of metabolism is essential for improving animal health and productivity and for strengtheni … biome composition, with human studies showing high heritability and identifying numerous metabolite quantitative trait loci (mQTLs). While such findings have advanced our understanding of disease biology in humans, comparable studies in pigs remain limited.
RESULTS: We performed GWAS of the serum metabolome in 213 three‑way crossbred pigs [(Landrace × Yorkshire) × Duroc …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Soybean (Glycine max (L.) Merrill), a vital food and oilseed crop native to China, has the development of high-yield and high-quality new varieties as a core objective in soybean breeding. However, studies on genetic diversity and marker-trait associations for yield-related traits across multiple environments using simple sequence repeat (SSR) markers remain limited. This study utilized 20 pairs of SSR primers to investigate genetic diversity and marker-trait associations (MTAs) between SSR markers and yield-related traits in 150 soybean accessions of diverse origins, which were grown under tw
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The impact of structural variants on gene regulation and complex traits in pigs remains poorly understood. Here, we present a resource comprising 60 long-read sequencing and 2445 high-quality short-read sequencing samples from 120 pig breeds/populations worldwide. These samples include 293 high-depth short-read sequencing samples and three long-read samples generated in this study. Integrating two graph-based genotyping approaches, we construct a structural variant map encompassing 158,288 deletions, 137,493 insertions, 660 inversions, and 10,063 duplications. We perform eQTL mapping in liver,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multi-environment QTL analysis uncovered reproducible and novel loci underlying grain color and milling-related recovery traits in foxtail millet, and Seita.5G392600 was prioritized as a putative candidate gene for kernel yellowness and a potential breeding target. Grain appearance and processing quality are major determinants of the market value and end-use performance of foxtail millet, yet the genetic basis of these traits remains incompletely understood, particularly for kernel color and milling-related recovery traits. Here, we used 256 recombinant inbred lines derived from Jingu 21 × Chu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Meta-QTL and transcriptomic integration prioritized transport, redox, and hormonal modules, while contrasting genotypes revealed coordinated differences in metal partitioning, cell-wall-associated spectral profiles and gene expression under combined stress. Rice in acidic and metal-affected soils may encounter aluminum (Al), cadmium (Cd), and manganese (Mn), whose distinct toxicities have partially overlapping effects on ion and redox homeostasis. We combined meta-quantitative trait locus (M-QTL) analysis with 14 public RNA-sequencing datasets and experimental evaluation of contrasting genotyp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cold tolerance in sorghum is largely stage- and environment-specific yet partially shared genetic control allows improvement across developmental stages with mostly modest, trait-specific trade-offs. Cold tolerance is a major constraint to sorghum production in temperate environments, and its improvement is therefore a key breeding objective. However, cold tolerance varies across developmental stages and environments, and selection based on stage-specific phenotypes may overlook shared genetic components. We analysed a diversity panel of 394 sorghum genotypes evaluated across 10 environments r
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoarthritis (OA) is a heterogeneous joint disease in which patients differ widely in onset, progression, pain burden, and inflammatory activity, yet clinical tools for early risk stratification and mechanism-informed subtyping remain limited. Human genetic studies have identified many OA-associated loci, but translation into deployable biomarkers has been slow because most signals are polygenic, largely noncoding, and dependent on tissue and cell state. Despite rapid progress in OA genomics, a major remaining challenge is how to systematically convert genetic discoveries into clinically act
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Emerging evidence links macrophage polarization to osteoporosis pathogenesis, yet the specific causal genes and underlying molecular mechanisms remain poorly defined.
METHODS: We used a multi-stage, summary-data-based Mendelian randomization (SMR) framework to integrate blood-derived methylation, expression, and protein quantitative trait loci (mQTL, eQTL, and pQTL) with large-scale osteoporosis genome-wide association study (GWAS) datasets. We performed SMR and colocalization analyses across predefined macrophage polarization-related genes, followed by multi-omics integration. To…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Avian leukosis virus (ALV) remains a major threat to the poultry industry due to its ability to establish persistent infection, induce immun … teomic, and epigenetic levels. Integrating these data with molecular phenotypes, such as expression quantitative trait loci (eQTLs) and protein quantitative trait loci (pQTLs), enables the linking of genetic variation to functional immune responses. Furthermore, CRISPR-based functional screening offers a systematic approach for validating candidate host factors and ident …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Meniere's disease (MD) is a heterogeneous, rare inner ear disorder characterized by recurrent vertigo, fluctuating sensorineural hearing loss, tinnitus, and aural fullness. Its molecular mechanisms remain unclear due to significant clinical and immunological heterogeneity. In this study, we integrated multi‑omics genetic data to systematically screen for palmitoylation regulatory genes associated with MD risk. We first intersected 31 core palmitoylation genes with blood cis‑eQTL datasets to identify candidate expression‑related genes, then performed two‑sample Mendelian randomization (MR) to e
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Huntington's disease (HD) exhibits substantial variability in age of onset and disease progression that is not fully explained by CAG repeat length alone. Part of this residual variation is heritable, implicating additional genetic mechanisms. cis-regulatory variation, genetic variants that alter transcription and splicing of nearby genes, represents one such mechanism that can be quantified through allele-specific expression (ASE) analysis. However, methods for integrating ASE profiles into patient stratification frameworks remain underdeveloped, particularly for rare diseases wit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Dong Tao (DT) chicken is a traditional Vietnamese breed characterized by extremely enlarged shanks, representing one of the … h linkage disequilibrium analyses, gene annotation, and comparison with previously reported chicken quantitative trait loci (QTLs).
RESULTS: Four significant genomic regions were identified on chromosomes 2, 4, 5, and 7. These regions harbored several biologically relevant candidate genes, including IGFBP1, IGFBP3, MYLK, CD44, and KALRN, which are involved in growth reg …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Egg production over a long laying cycle until 700 days of age is preferred for modern layer chicken breeding. It is influenced b … n additive-dominance model for cumulative egg number and egg number at different stages. Expression quantitative trait loci (eQTL) mapping was applied to investigate associations between SNPs and gene expression. A transcriptome-wide association study (TWAS) was conducted to explore the associations between gene expression and egg production traits to identify candidate …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Disease is a key factor to shorten productive lifespan of dairy cattle. Shifting from classical 'treating existing diseases' to … med ASE analysis and verified the identified ASE genes and ASE SNPs by using large-scale expression quantitative trait loci (eQTLs) data from immune tissues and cells. A total of 1,255 ASE genetic variants related to the CIG were identified in this study. These variants were significantly enriched in active promoters and enhancers in the spleen. Finally, we verified the …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Depression is a common and severe mental disorder that affects more than 300 million people worldwide. While it is known to have a moderate genetic component, identifying specific genes that contribute to the disorder has been challenging. Previous Genome-wide association studies (GWASs) have identified over 100 genomic loci that are significantly associated with depression. But finding useful therapeutic targets and diagnostic biomarkers from this information has proven difficult. To address this challenge, I conducted a plasma protein proteome-wide association study (PWAS) for depression, us
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We developed SpliPath as a generalizable framework to discover disease associations mediated by rare variants that induce experimentally supported mRNA splicing defects. Our approach integrates components of burden tests (BTs), traditional splicing quantitative trait locus (sQTL) analyses, and sequence-to-function AI models (SpliceAI and Pangolin). Central to the workings of SpliPath is our concept of collapsed rare variant splicing QTL (crsQTL). crsQTL groups rare variants that are predicted to alter splicing in the same way, specifically by linking them to shared splice junctions observed in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uterine capacity is critical to the economic value of pigs. Exploring the genetic mechanisms that underlie uterine capacity can provide vita … ominant-specific lead SNPs were shared across breeds to a certain degree. By integrating expression quantitative trait loci, we identified 40 potential dominant-effect and 10 potential additive-effect regulatory circuits, in which a genetic variant affects uterine capacity by modulating the expression of specific gene in specific tissue. For example, rs343882381 affects …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.