INTRODUCTION: DNA methylation is an important epigenetic feature associated with genetic regulation, gene expression, and phenotypic variation. However, the genetic architecture, regulatory organization, and trait relevance of the porcine skeletal muscle methylome remain poorly characterized.
OBJECTIVES: This study aimed to characterize the genetic regulation of DNA methylation in porcine skeletal muscle and identify genetically supported relationships among genotype, methylation, gene expression, and complex traits.
METHODS: We integrated 185 whole-genome bisulfite sequencing (WGBS) dataset
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous studies have confirmed that methylation regulates gene transcription in the hypothalamus-pituitary-gonadal axis during puberty initiation, but little is known about the regulation of DNA methylation on gene expression in the pineal gland. To screen pineal gland candidate genes related to the onset of goat puberty and regulated by genome methylation, we collected pineal glands from prepubertal and pubertal female goats, then, determined the DNA methylation profile by whole genome bisulfite sequencing and the transcriptome by RNA sequencing on Illumina HiSeqTM2500. We analyzed different
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chinese hamster ovary (CHO) cells remain the primary host system for recombinant therapeutic protein production. Enhancing transgene expression efficiency while maintaining stable production persists as a key challenge in CHO cell engineering. While N6-methyladenosine (m6A) modification - the most abundant RNA methylation - regulates RNA stability and translational efficiency, its role in modulating recombinant protein expression remains underexplored. In this study, through m6A-specific methylated RNA immunoprecipitation sequencing (MeRIP-seq) of high- (ADM-H) and low- (ADM-L) recombinant ada…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-adenosine methylation (m6A) of RNA is involved in the regulation of various diseases. However, its role in chemotherapy-related vascular endothelial injury has not yet been elucidated. We found that methyltransferase-like 3 (METTL3) expression was significantly reduced during doxorubicin (DOX)-induced apoptosis of vascular endothelial cells both in vivo and in vitro, and that silencing of METTL3 further intensified this process. Combined transcriptome and proteome sequencing analyses revealed that the expression levels of interferon-stimulated gene 15 (ISG15) mRNA and protein significantly
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ferroptosis occurs after myocardial ischemia-reperfusion (I/R) injury. Long non-coding RNA (lncRNA) AK020546 possesses the effect of protecting the myocardium from I/R injury; however, the underlying mechanisms remain not fully understood. This study aimed to investigate the effect of AK020546 on ferroptosis in cardiomyocytes and underlying molecular mechanisms. Hypoxia/reoxygenation (H/R) was used to induce H9C2 injury, and an I/R rat model was generated. Ferroptosis was evaluated by detecting lipid reactive oxygen species, Fe2+, glutathione, and malondialdehyde levels. The N(6)-methyladenosi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Melanoma, a malignant skin tumor, has an increasing incidence rate annually and affects the skin, eyes and mucous membranes. Despite advancements in early diagnosis and treatment improving survival rates, invasion and metastasis of melanoma remain major challenges. In-depth research into the pathogenesis of melanoma and novel therapies is essential to enhance patient outcomes. N6-methyladenosine (m6A) methylation, a key RNA modification, regulates gene expression and cellular functions, influencing cell proliferation, differentiation, apoptosis and signal transduction. It is implicated in vari
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Advanced glycation end products (AGEs), prevalent in Western thermally processed diets, contribute to metabolic dysfunction, oxidative stress, and impaired male reproduction; however, their effects on testicular RNA methylation remain unclear. This study investigated the effects of a 20-week high-fat, AGE-rich diet compared with a standard diet on global m6A RNA levels and m6A regulatory proteins in testicular tissue of male C57BL/6 mice (n=6/group). Molecular analyses were performed exploratorily in a randomly selected subset of three animals per group using archived testicular tissue from th…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the in vitro antiviral activity of DZNep (3-Deazaneplanocin A; an inhibitor of S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase) against SARS-CoV-2, besides demonstrating its protective efficacy against lethal infection of infectious bronchitis virus (IBV, a member of the Coronaviridae family). DZNep treatment resulted in reduced synthesis of SARS-CoV-2 RNA and proteins without affecting other steps of viral life cycle. We demonstrated that deposition of N6-methyl adenosine (m6A) in SARS-CoV-2 RNA in the infected cells recruits heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 (hnRNPA1), an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Coronary artery disease (CAD) and prostate cancer share common genetic and epigenetic risk factors. Xeroderma Pigmentosum group … -mediated XPF knockout or overexpression. TH cell differentiation, chromatin enrichment, global m6A RNA methylation, DNA methylation, R-loop formation, and tumor cell cytotoxicity were evaluated using molecular and functional assays.
RESULTS: XPF overexpression was associated with increased TH1 differentiation and elevated expression of XPF and TP53, whereas TH2 …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Congenital anomalies of the kidneys and urinary tracts (CAKUT) represent the most prevalent cause for renal failure in children. The RNA epigenetic modification N 6-methyladenosine (m6A) methylation modulates gene expression and function post-transcriptionally, which has recently been revealed to be critical in organ development. However, it is uncertain whether m6A methylation plays a role in the pathogenesis of CAKUT. Thus, we aimed to explore the pattern of m6A methylation in CAKUT.
METHODS: Using m6A-mRNA epitranscriptomic microarray, we investigated the m6A methylomic landsca
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hybrid male sterility (HMS) is a postzygotic reproductive isolation mechanism that enforces speciation. A bovine example of HMS is the yattle (also called dzo), an interspecies hybrid of taurine cattle (Bos taurus) and yak (Bos grunniens). The molecular mechanisms underlying HMS of yattle are not well understood. Epigenetic modifications of DNA methylation and P-element induced wimpy testis (PIWI)-interacting RNA (piRNAs) are important regulators in spermatogenesis. In this study, we investigated DNA methylation patterns and piRNA expression in adult testes in hybrid infertile yattle bulls and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-segmented negative-strand (NNS) RNA viruses, such as rabies, Nipah and Ebola, produce 5'-capped and 3'-polyadenylated mRNAs resembling higher eukaryotic mRNAs. Here, we developed a transcription elongation-coupled pre-mRNA capping system for vesicular stomatitis virus (VSV, a prototypic NNS RNA virus). Using this system, we demonstrate that the single-polypeptide RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) large protein (L) catalyzes all pre-mRNA modifications co-transcriptionally in the following order: (i) 5'-capping (polyribonucleotidylation of GDP) to form a GpppA cap core structure, (ii) 2'-O
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the changes in the m6A methylation modification profile of human periodontal ligament cells (hPDLCs) in response to inflammatory conditions.
BACKGROUND: Periodontitis is an infectious disease of the periodontal support tissue that leads to the loss of alveolar bone. HPDLCs are primary cells that can repair periodontal tissue defects caused by periodontitis. However, the inflammatory conditions induce inflammatory damage and decrease ossification of hPDLCs. This inflammatory response depends on genetic and epigenetic mechanisms, including m6A methylation.
METHODS: HP
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Preterm birth is one of the problems that pregnant women may encounter during pregnancy. Over-expression of Matrix metalloproteinases (MMPs) has the main role in the untimely remodeling of the extracellular matrix (ECM) and preterm delivery, but its exact mechanism is unknown. This study was undertaken to examine the methylation and expression patterns of this gene in women delivering preterm and also to analyze the correlation of serum B9 and B12 vitamins levels with expression and methylation of MMP-9 gene. The MMP-9 RNA and protein levels in 50 women delivering preterm and 50 women deliveri
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Needle biopsy-based molecular assays that are sensitive, cost-effective, and reproducible could improve prostate cancer (PCa) diagnosis and risk stratification. We developed a compact, biologically informed gene expression signature panel (ONECUT2, EZH2, BRCA2) for cancer detection and aggressiveness stratification. Methods: We designed and validated a multiplex real-time RT-qPCR assay for ONECUT2, EZH2, and BRCA2. Biomarker selection was guided by The Cancer Genome Atlas Prostate Adenocarcinoma (TCGA-PRAD) and Gene Expression Omnibus (GEO) cohort analyses. The assay was
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetes in pregnancy is associated with increased risk of long-term metabolic disease in the offspring, potentially mediated by in utero epigenetic variation. Previously, we identified multiple differentially methylated single CpG sites in offspring of women with gestational diabetes mellitus (GDM), but whether stretches of differentially methylated regions (DMRs) can also be identified in adolescent GDM offspring is unknown. Here, we investigate which DNA regions in adolescent offspring are differentially methylated in blood by exposure to diabetes in pregnancy. The secondary aim
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Changes in DNA methylation and gene expression play a major role in the epileptogenic process that turns a healthy brain into an epileptic brain. Previous investigations have focused either on changes in the transcriptome or epigenome, but rarely on both. The goal of this combined transcriptomic and epigenomic investigation was to identify shared and distinct changes in gene expression and DNA methylation in two widely used, but mechanistically distinct, rat models of temporal lobe epilepsy: intrahippocampal electrical kindling and systemic kainic acid induced epilepsy. RNA sequencing and redu
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dilated cardiomyopathy (DCM) is one of the main causes of heart failure and heart transplantation, with complex causes involving multiple factors such as genetics, epigenetics, and environment. In recent years, methylation, as a key epigenetic regulatory approach, has increasingly garnered attention for its role in the mechanisms of DCM onset. This review comprehensively summarizes the mechanisms, functions, and metabolic regulatory characteristics of DNA methylation, histone methylation, and RNA N6-methyladenosine (m6A) modification in the occurrence and development of DCM. Literature was sel
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundGene silencing is widely recognized as a promising therapeutic approach for dominant monogenic disorders. Current silencing strategies, many of which are transient, utilize RNA interference. Gene silencing may also be achieved through directed epigenetic editing using a CRISPR/dCas9 effector fused to DNA methyltransferase 3A (dCas9-DNMT3A). We used this system to direct DNA methylation to HTT, the causal gene underlying the autosomal dominant neurodegenerative disorder Huntington's disease, to assess the translational potential of this strategy for treating a genetic neurological dis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation at gene promoters is generally considered to be associated with transcriptional repression in vertebrates. However, lack of a clear picture of where promoter methylation is most important for transcriptional regulation has hindered our understanding of this relationship and resulted in the use of a wide variety of arbitrary promoter definitions. We demonstrate here that the use of different promoter definitions can lead to contradictory results between studies of promoter methylation. In response, we have developed Methodical, a computational method that combines RNA-seq and wh
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования