The intestinal anaerobic symbiont, Bacteroides fragilis, is highly aerotolerant and resistant to H(2)O(2). Analysis of the transcriptome showed that expression of 45% of the genome was significantly affected by oxidative stress. The gene expression patterns suggested that exposure to oxidative stress induced an acute response to rapidly minimize the immediate effects of reactive oxygen species, then upon extended exposure a broad metabolic response was induced. This metabolic response induced genes encoding enzymes that can supply reducing power for detoxification and restore energy-generating
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The roles of SitABCD, MntH, and FeoB metal transporters in the virulence of avian pathogenic Escherichia coli (APEC) O78 strain chi7122 were assessed using isogenic mutants in chicken infection models. In a single-strain infection model, compared to chi7122, the Deltasit strain demonstrated reduced colonization of the lungs, liver, and spleen. Complementation of the Deltasit strain restored virulence. In a coinfection model, compared to the virulent APEC strain, the Deltasit strain demonstrated mean 50-fold, 126-fold, and 25-fold decreases in colonization of the lungs, liver, and spleen, respe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The spread of plasmid-mediated quinolone resistance determinants QnrA and QnrS was evaluated in a collection of 186 extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-positive enterobacterial isolates from 2002 to 2005 and 185 nalidixic acid-resistant strains isolated during the first 6 months of 2005 at the Bicêtre hospital, France. Out of these 186 ESBL-positive isolates, 2.2 and 1.6% carried a QnrA1 and a QnrS1 determinant, respectively. The ESBLs associated with QnrA1 were VEB-1, SHV-12, and CTX-M-1, whereas those associated with QnrS1 were TEM-52, SHV-12, and CTX-M-1. Among the 185 nalidixic acid-re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Moraxella catarrhalis is a common commensal of the human respiratory tract that has been associated with a number of disease states, including acute otitis media in children and exacerbations of chronic obstructive pulmonary disease in adults. During studies to investigate the outer membrane proteins of this bacterium, two novel major proteins, of approximately 19 kDa and 16 kDa (named OMP J1 and OMP J2, respectively), were identified. Further analysis indicated that these two proteins possessed almost identical gene sequences, apart from two insertion/deletion events in predicted external loo
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As alternative regimens in therapy of Stenotrophomonas maltophilia infections are limited, epidemiological investigation of S. maltophilia is necessary for developing new strategies in prophylaxis of these infections. "Enterobacterial repetetive intergenic consensus-polymerase chain reaction (ERIC-PCR)", is a simple and rapid method to detect the genomic polymorphism at the strain level in nosocomial outbreaks due to S. maltophilia. The aim of this study was to investigate the molecular epidemiology of S. maltophilia strains isolated from paediatric patients in a university hospital. A total o
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing non-typhoidal Salmonella (NTS) isolates in Korea were characterized.
PATIENTS AND METHODS: Five isolates of ESBL-producing NTS were isolated from stool specimens of three infants and two adults with diarrhoea. Two infants acquired the infection in the community, and three other infections were hospital acquired.
RESULTS: The isolates were one each of serovars Saintpaul, Stanley and Agona, and two Enteritidis. Cell sonicates of the isolates hydrolysed cefotaxime more efficiently than ceftazidime, and had beta-lactamase bands of app
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Carbapenem- and colistin-resistant Klebsiella pneumoniae poses a major challenge to critical care due to limited therapeutic options. Combined with hypervirulence, the infections caused by multi-drug-resistant isolates become exceptionally difficult to treat, often resulting in prolonged illness and higher mortality.
METHODS: We analysed 65 clinical isolates of carbapenem and colistin resistant K. pneumoniae using whole genome sequencing to characterize resistance, virulence, and associated mobile genetic elements that may facilitate horizontal gene transfer.
RESULTS: The isolate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic otitis media with effusion (COME) is a prevalent pediatric condition characterized by persistent middle ear effusion, potentially leading to hearing loss and developmental delays.
METHODS: We investigated the diversity, antibiotic resistance, and virulence potential of Staphylococcus species in COME through whole genome sequencing of 16 clinically-derived strains isolated from pediatric patients in the United Kingdom. De novo genome assembly and annotation were performed on Illumina reads. Phylogenetic analyses using 16s rRNA gene, multilocus sequence typing (MLST) and cor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recurrent Achromobacter infections pose significant clinical challenges due to antimicrobial resistance and within-host evolution. This study investigates the genetic and phenotypic changes among Achromobacter isolates using next-generation sequencing. We retrospectively analyzed 65 Achromobacter infection cases at a tertiary hospital in Taiwan from 2016 to 2023. Whole-genome sequencing of 12 isolates from patients with recurrent bloodstream infections was performed using Oxford Nanopore Technology. Resistance genes and beta-lactamases were identified, and genome similarity was assessed using
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Staphylococcus aureus, particularly MRSA strains, poses a critical global health threat due to its multidrug resistance and virulence.
OBJECTIVES: This study elucidates the role of the acnA gene, encoding aconitase in the tricarboxylic acid (TCA) cycle, in governing virulence and antimicrobial resistance in MRSA.
METHODS: The identification of the acnA mutant was performed by a transposon mutant library. The function of the acnA gene on virulence was evaluated through deletion and complementation analyses. Other phenotypes of ΔacnA were also determined, including growth curve, ce
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although it is becoming evident that individual's immune system has a decisive influence on SARS-CoV-2 disease progression, pathogenesis is largely unknown. In this study, we aimed to profile the host transcriptome of COVID-19 patients from nasopharyngeal samples along with virus genomic features isolated from respective host, and a comparative analyses of differential host responses in various SARS-CoV-2 infection systems.
RESULTS: Unique and rare missense mutations in 3C-like protease observed in all of our reported isolates. Functional enrichment analyses exhibited that the hos
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Purpose. This study aimed to characterize 27 Escherichia coli isolates obtained from peritoneal dialysis (PD)-related peritonitis that occurred at the University Hospital of Botucatu Medical School, Brazil, between 1997 and 2015.Methodology. These isolates were characterized regarding the occurrence of 22 virulence factor-encoding genes, antimicrobial resistance and biofilm production. We then evaluated whether these factors influenced the clinical outcome.Results. Over an 18-year period, 726 episodes of PD-related peritonitis were diagnosed, with 27 of them (3.7 %) being due to E. coli. The m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stenotrophomonas maltophilia is a Gram-negative, nonfermenting, environmental bacillus that is an important cause of nosocomial infections, primarily associated with the respiratory tract in the immunocompromised population. Aiming to understand the population structure, microbiological characteristics and impact of allelic variation on β-lactamase structure and function, we collected 130 clinical isolates from across the United States. Identification of 90 different sequence types (STs), of which 63 are new allelic combinations, demonstrates the high diversity of this species. The majority of
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This work aimed to determine the prevalence, diversity, antibiotic-resistance phenotype/genotype and virulence factors in staphylococci of farm-animals. Nasal samples of 117 farm-animals (calve: 72; lamb: 37; goat: 8) were collected from one slaughterhouse in La Rioja/Spain and cultured for staphylococci and methicillin-resistant Staphylococcus (MRS) recovery. Identification was performed by MALDI-TOF. Antimicrobial resistance phenotype/genotype was determined by susceptibility testing and specific PCRs. Molecular typing (spa-typing, multilocus-sequence-typing, agr-typing, SCCmec), and detecti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objectives: Increasing macrolide resistance of Mycoplasma pneumoniae strains is becoming a public health concern worldwide. Nevertheless, no comprehensive genomic background of circulating isolates is available in our region. We aimed to study the genetic diversity of this microorganism using the multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis method and to investigate the relationships between MLVA types and macrolide susceptibility profiles of the isolates. Materials and Methods: A total of 270 patients attending Tehran general university hospitals were included in this study. One thro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Meningococcal disease incidence in Italy remains quite low in the overall population except for infants. Within a study on carriage isolates among high school students we aimed to define: i) the prevalence of carriage isolates, ii) the phenotypic and iii) the molecular features of meningococci by Whole Genome Sequencing (WGS). A total of 1697 pharyngeal samples from undergraduate students (age range 14-19 years) were collected from 2012 to 2013 from six larger cities in Italy. One hundred and twenty culture positive meningococci (7%) were analyzed. Carriage isolates were sent to the National R
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli K1 strains are major causative agents of invasive disease of newborn infants. The age dependency of infection can be reproduced in neonatal rats. Colonization of the small intestine following oral administration of K1 bacteria leads rapidly to invasion of the blood circulation; bacteria that avoid capture by the mesenteric lymphatic system and evade antibacterial mechanisms in the blood may disseminate to cause organ-specific infections such as meningitis. Some E. coli K1 surface constituents, in particular the polysialic acid capsule, are known to contribute to invasive poten
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Typhoid fever, caused by Salmonella enterica serovar Typhi, is a global public health concern due to increasing antimicrobial resistance (AMR). Characterization of S Typhi genomes for AMR and the evolution of different lineages, especially in countries where typhoid fever is endemic such as Bangladesh, will help public health professionals to better design and implement appropriate preventive measures. We studied whole-genome sequences (WGS) of 536 S Typhi isolates collected in Bangladesh during 1999 to 2013 and compared those sequences with data from a recent outbreak in Pakistan reported pre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reversal of antimicrobial resistance is an appealing and largely unexplored strategy in drug discovery. The objective of this study was to identify potential targets for "helper" drugs reversing cephem resistance in Escherichia coli strains producing β-lactamases. A CMY-2-encoding plasmid was transferred by conjugation to seven isogenic deletion mutants exhibiting cephem hypersusceptibility. The effect of each mutation was evaluated by comparing the MICs in the wild type and the mutant harboring the same plasmid. Mutation of two genes encoding proteins involved in cell wall biosynthesis, dapF
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) is posing a major threat to global TB control. In this study, we focused on two consecutive MDR-TB isolated from the same patient before and after the initiation of anti-TB treatment. To better understand the genomic characteristics of MDR-TB, Single Molecule Real-Time (SMRT) Sequencing and comparative genomic analyses was performed to identify mutations that contributed to the stepwise development of drug resistance and growth fitness in MDR-TB under in vivo challenge of anti-TB drugs. Result: Both pre-treatment and post-treatment strain d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования