Coxiella burnetii, the causative agent of Q fever, is a Gram-negative intracellular bacterium transmitted via aerosol. Regulatory approval of the Australian whole-cell vaccine Q-VAX® in the US and Europe is hindered by reactogenicity in previously exposed individuals. The aim of this study was to identify and rationally select C. burnetii epitopes for design of a safe, effective, and less reactogenic T-cell targeted human Q fever vaccine. Immunoinformatic methods were used to predict 65 HLA class I epitopes and 50 promiscuous HLA class II C. burnetii epitope clusters, which are conserved acros
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malaria, a vector-borne disease caused by Plasmodium and transmitted by Anopheles mosquitoes, remains a major health burden in tropical regions. During blood feeding, the mosquito midgut plays a key role in blood digestion and parasite development, where immune responses against the parasite occur. This study employed a stepwise immunoinformatics approach to design a conserved multiepitope vaccine based on the midgut-specific SGU protein of Anopheles. B and T-cell epitopes were selected based on antigenicity and non-allergenicity, linked using AAY and GPGPG linkers, and combined with β-defensi…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Visceral leishmaniasis (VL) is caused by the parasites of Leishmania donovani complex, leads to the death of 20 000 to 40 000 people from 56 affected countries, worldwide. Till date, there is not a single available vaccine candidate to prevent the VL infection, and treatment only relies upon expensive and toxic chemotherapeutic options. Consequently, immunoinformatics approach was applied to design a multiepitope-based subunit vaccine to enhance the humoral as well as cell-mediated immunity. Constructed vaccine candidate was further subjected to evaluation on allergenicity and antigenicity and…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sichuan pepper (Zanthoxylum bungeanum) is widely consumed in China, but its allergenicity raises food-safety concerns. In this study, the 11S globulin allergen Zan b 2 was identified as the major allergen and characterized through structural and immunological analyses. Integrated immunoinformatics, molecular docking, and molecular dynamics simulations were used to predict B-cell epitopes and screen proteases capable of specifically cleaving these regions. Prediction results indicate that proteinase K targets the following epitopes: Glu13, Thr100, Tyr149, Glu164, Glu229, Glu231, Leu239, Glu241,…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Middle East is a significant hotspot for human hydatidosis caused by Echinococcus granulosus, a complex multi-stage pathogen exhibiting antigenic variation with diverse epitopes. Multi-epitope vaccines, designed using immunoinformatics, represent a promising approach to effectively control this challenging parasite. A total of 1150 secreted, non-toxic, antigenic proteins were obtained from database and analyzed for their immunogenic potential, leading to the identification of 1024 CTL, 80 HTL, and 172 LBL prioritized epitopes, which were then ranked and clustered to prefer the most immunog…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine tuberculosis (bTB) diagnostics are frequently hindered by the structural instability and insolubility of recombinant multi-epitope proteins in prokaryotic expression systems. To address this, we developed an integrated strategy combining immunoinformatics with the ProteinMPNN deep learning framework. We constructed a fusion protein utilizing B-cell epitopes from MPB70 and MPB83, where ProteinMPNN was employed to redesign non-epitope scaffolds for optimized thermodynamic stability. The structural integrity was verified via 200-ns molecular dynamics (MD) simulations. MD analysis revealed …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute hepatitis C virus (HCV) infection is usually asymptomatic, therefore, early diagnosis is rare. It may remain undiagnosed in individuals who progress to chronic infection, often until serious liver damage has developed. To incorporate the diagnosis of this viral disease in a multiple-diagnostic assay, we first analyzed by immunoinformatics the HCV subtype 1a polyprotein (specifically Core, E2, NS3, NS5A proteins) to select antigenic peptides to be tested initially by the Pepscan technique. Next, we performed the immunodiagnosis of HCV infection, using the Multiple Antigen Blot Assay (MABA…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T cells are key mediators of adaptive immunity, yet their highly dynamic response states and immense T cell receptor (TCR) diversity pose challenges in deciphering their functional roles in human diseases. Recent advances in single-cell genomics and TCR sequencing provide unprecedented opportunities to resolve T cell heterogeneity, decode clonal response dynamics, and facilitate high-throughput antigen specificity mapping. In this review, we summarize major technological innovations that have transformed T cell research, from experimental tools for antigen-specific T cell profiling to machine
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The B-cell receptor (BCR) repertoire serves as a historical record of immunological events. However, deciphering antigen-specific sequences from this vast dataset remains a challenge, particularly for novel pathogens where prior knowledge is absent. While time-course analysis methods such as QASAS have proven effective for tracking immune responses, they rely on existing antibody databases, limiting their applicability to emerging diseases. To overcome this limitation, we introduce LM-QASAS, a reference-free computational framework that integrates antibody language models (AbLMs) with longitud
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The immune repertoire (IR) reflects the adaptive immune system of an organism by encompassing the diversity and composition of receptor sequences expressed by T and/or B lymphocytes. Despite significant advances in the efficiency and accuracy of antigen discrimination facilitated by high-throughput sequencing technologies, IR analysis remains challenging due to its extraordinary heterogeneity and the high dimensional nature of sequencing data. MAIN BODY: This review provides an overview of the key steps involved in IR profiling, highlighting factors that impact data accuracy, inclu
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ocular infectious diseases remain an important cause of preventable visual impairment worldwide, yet vaccine development for eye-specific pathogens has lagged behind systemic infections. This gap reflects the biology of the eye, including immune privilege, mucosal immunity, pathogen diversity, and limited understanding of ocular correlates of protection. Advances in data science, artificial intelligence, genomics, and systems biology are reshaping vaccine research by enabling antigen discovery, immune modeling, and surveillance. However, these approaches have not been integrated in
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Leishmania parasites are transmitted through the bite of infected female sand flies. The sand fly inoculum contains both the par … ontent were considered. To investigate the effect of immunization with the selected antigen through immunoinformatics analysis (PsSP42) against L. tropica infection, we immunized BALB/c mice with two distinct recombinant plasmids (conventional VR1020 and new-generation NTC9385R) two times at 3-week intervals followed by immediate electroporation. Eight weeks post-c …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human metapneumovirus (HMPV) is a respiratory viral pathogen classified within the Paramyxoviridae family and is a significant cause of acut … ics approaches to screen potential vaccine targets and design epitope vaccine constructs. Following immunoinformatics analysis, six proteins, including >YP_009513265.1 nucleoprotein, >YP_009513266.1 phosphoprotein, >YP_009513268.1 fusion protein, >YP_009513269.1 matrix protein 2-1, >YP_009513272.1 attachment glycoprotein, and >YP_009513273.1 RNA-dependent RNA polym …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cicada pupae are a traditional and promising food source, and it is crucial to evaluate the associated allergenic risks. In this study, 13 potential allergens were identified based on proteomics combined with immunoinformatics tools in cicada pupae. These allergens were produced as recombinant proteins, and their allergenicity was investigated. Malate dehydrogenase (MDH) and pyruvate kinase (PK) were finally identified as new allergens via immunoblot experiments. The secondary structures of the two new allergens predominantly consist of α-helices and β-sheets. Five IgE-binding epitopes of MDH …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mpox has emerged as a global public health concern, highlighting the limitations of traditional vaccinia-based vaccination strategies and the urgent need for precision vaccinology approaches. Advances in structural virology and immunoinformatics have enabled the identification of conserved immunodominant antigens from both mature virion and extracellular virion forms, supporting the development of multivalent antigen combinations capable of inducing broad neutralizing antibody (nAb) responses. Emerging delivery technologies including mRNA-lipid nanoparticles, viral vectors, and self-assembling…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tick-borne viruses (TBVs) pose significant public health challenges worldwide, causing severe diseases such as hemorrhagic fevers and enceph … rging or less common TBVs (e.g., Banna virus, Yezo virus). Emphasis is placed on the application of immunoinformatics and reverse vaccinology for the identification of epitopes capable of inducing robust humoral and cellular immune responses. We summarize epitope prediction methodologies, vaccine construct designs, immune simulation results, and molecular docking f …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human schistosomiasis, caused by the Schistosoma trematode, is a neglected parasitic disease affecting over 250 million people worldwide. Th … provoke robust immune responses by incorporating a blend of T- and B-cell epitopes. Structural and immunoinformatics evaluations predicted robust interactions of CMEV and SMEV with key immune receptors and prolonged immune responses. In addition, molecular docking identified several compounds from the MMV and SND libraries with strong binding affinities to vital S …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Novel types of the vaccines with high immunogenicity and low risks, including epitope-based vaccines, are sought. Among zoonotic disease, Q fever caused by Coxiella burnetii is an important target due to numerous outbreaks and the pandemic potential. Here we present a synthetic multi-epitope vaccine against Coxiella burnetii. This vaccine was developed using immunoinformatics approach. Antigenic proteins were studied, and five T cell epitopes were selected. Antigenicity, allergenicity, and toxicity of the selected epitopes were evaluated using the VaxiJen 2.0, AllerTOP, and ToxinPred servers, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CD3+ T-large granular lymphocyte (T-LGL) proliferations often present with cytopenias and splenomegaly and are linked to autoimmunity, espec … emarkably skewed T-cell receptor beta chain gene repertoire with overtime evolution (clonal drift). Immunoinformatics analysis and comparisons with clonotype sequences from various entities revealed (quasi)identities between (i) father and son, and (ii) father or son and patients with autoimmune disorders, T-LGL leukemia or chronic idiopathic neutropenia. Altogethe …
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The T-cell receptor (TCR) recognition of multiple peptides presented by the major histocompatibility complex (MHC) is a key natural phenomenon, enabling the T-cell repertoire to respond to a broad array of antigens. Despite its importance to the immune response, T-cell cross-reactivity poses a major challenge for the development of novel T cell-based therapies. In this study, we present MHCXGraph, a graph-based computational approach for identifying conserved and immunologically relevant regions across multiple structures of peptides bound to MHC molecules (pMHC). Our approach provides three o
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования