Soybean has been grown across diverse latitudes; however, its adaptation to low-latitude, high-altitude environments with short days and low temperature remains unclear. To understand the genetic basis of adaptation, we screened 200 diverse cultivars and conducted genome-wide association studies (GWAS) in Bamei and Xianshui, Daofu country, Sichuan Province, China, in 2019 and 2023, respectively. Six agronomic traits: flowering time (DTF), maturity time, node number on main stem (NNM), plant height (PH), effective number of pods per plant and 100-seed weight (HGW) were evaluated. Five MG I-II c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The primary objective of this study is to comprehensively investigate the genetic association between mitochondrial gene expression, methylation, and primary open-angle glaucoma (POAG) using Mendelian randomization (MR) analysis.
METHODS: In this study, mitochondrial-related genes and methylation sites were extracted from two expression quantitative trait locus (eQTL) datasets (eQTLGen and GTEx V8) and one methylation quantitative trait loci dataset for summary data-based Mendelian randomization (SMR) analysis and heterogeneity in dependent instrument (HEIDI) testing. Further MR anal…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: This study aims to identify potentially causal circulating proteins and novel drug targets for delirium using a Mendelian randomization (MR)-based analytical framework and various bioinformatics and genomics methods.
MATERIAL AND METHODS: Large-scale two-sample MR was employed to estimate the effects of thousands of plasma proteins on delirium. Additional analysis included Bayesian Colocalization, Steiger filtering, protein-altering variant assessment, and mapping of expression quantitative trait loci (eQTL) to protein quantitative trait loci (pQTL). Protein-protein interaction …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Spontaneous abortion is a complex disorder with a significant genetic component. Identifying genetic variants influencing spontaneous abortion risk could unveil biological pathways and potential therapeutic targets.
METHODS: We performed Mendelian randomization using cis- and trans-protein quantitative trait loci (pQTLs) as instrumental variables to assess causal effects of circulating proteins on spontaneous abortion. Proteins exhibiting differential expression between sexes were excluded. KEGG pathway enrichment was employed to investigate the pathways affected by susceptibility …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chemical stimuli, including odorants and tastants, provide information about food availability and allow animals to avoid harmful environmen … ral variation in chemosensory behavioral responses among wild C. elegans strains and describe 2 new quantitative trait loci associated with decreased response sensitivity to quinine.
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Circadian rhythms influence various physiological and behavioral processes, including sleep, metabolism, and immune response. Although key regulatory factors of biological clocks have been identified and genome-wide association studies have pinpointed some genetic variants linked to sleep traits, the genetic architecture underlying circadian rhythms remains incompletely understood.
RESULTS: Here, we introduce the circadian deviation score, a novel quantitative trait that measures circadian disruption at the molecular level. Derived from gene expression levels of thousands of circa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mitochondrial dysfunction is increasingly recognized as a key factor in neurodegenerative diseases (NDDs), underscoring the ther … ucted colocalization and summary-data-based Mendelian randomization (SMR) analyses using expression quantitative trait loci (eQTL) to validate the causal role of these candidate genes. Additionally, we assessed the druggability of the encoded proteins to prioritize potential therapeutic targets for further exploration.
RESULTS: Genetically predicted levels of 10 genes w …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Raynaud's syndrome is a dysautonomia where exposure to cold causes vasoconstriction and hypoxia, particularly in the extremities. We performed meta-analysis in four cohorts and discovered eight loci (ADRA2A, IRX1, NOS3, ACVR2A, TMEM51, PCDH10-DT, HLA, and RAB6C) where ADRA2A, ACVR2A, NOS3, TMEM51, and IRX1 co-localized with expression quantitative trait loci (eQTLs), particularly in distal arteries. CRISPR gene editing further showed that ADRA2A and NOS3 loci modified gene expression and in situ RNAscope clarified the specificity of ADRA2A in small vessels and IRX1 around small capillaries in …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus aureus (S. aureus) colonizes humans asymptomatically but can also cause opportunistic infections, ranging from mild skin infections to severe life-threatening conditions. Resistance and tolerance are two ways a host can survive an infection. Resistance is limiting the pathogen burden, while tolerance is limiting the health impact of a given pathogen burden. In previous work, we established that collaborative cross (CC) mouse line CC061 is highly susceptible to Methicillin-resistant S. aureus infection (MRSA, USA300), while CC024 is tolerant. To identify host genes involved in to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Clinical therapeutic targets for leukemia remain to be identified and the causality between leukemia and telomere length is unclear.
METHODS: This work employed cis expression quantitative trait locus (eQTL) for 2,200 druggable genes from the eQTLGen Consortium and genome-wide association studies (GWAS) summary data for telomere length in seven blood cell types from the UK Biobank, Netherlands Cohort as exposures. GWAS data for lymphoid leukemia (LL) and myeloid leukemia (ML) from FinnGen and Lee Lab were used as outcomes for discovery and replication cohorts, respectively. Robust
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brain imaging and genomics are critical tools enabling characterization of the genetic basis of brain disorders. However, imaging large coho … our neuropsychiatric disorders and verified them by analyzing annotations, pathways, and expression quantitative trait loci (eQTLs). A cerebellar-mediated mechanism was identified to be common to the four disorders. Simulations show that, if the goal is identifying genetic risk, our IMAS is more powerful than a hypothetical protocol in which the imaging results were avai …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aberrant expression of xenobiotic metabolism and DNA repair genes is critical to lung cancer pathogenesis. This study aims to identify the cis-regulatory variants of the genes modulating lung cancer risk among tobacco smokers and altering their chemotherapy responses. From a list of 2984 SNVs, prioritization and functional annotation revealed 22 cis-eQTLs of 14 genes within the gene expression-correlated DNase I hypersensitive sites using lung tissue-specific ENCODE, GTEx, Roadmap Epigenomics, and TCGA datasets. The 22 cis-regulatory variants predictably alter the binding of 44 transcription f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: A strong predictor for the development of alcohol use disorder (AUD) is altered sensitivity to the intoxicating effects of alcoh … e have taken advantage of the Diversity Outbred (DO) mouse population to identify and precisely map quantitative trait loci (QTL) associated with ethanol sensitivity. We phenotyped 798 male J:DO mice for three measures of ethanol sensitivity: ataxia, hypothermia, and loss of the righting response. We used high-density MegaMUGA and GigaMUGA to obtain genotypes ranging fro …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute appendicitis is one of the most common abdominal emergencies worldwide. Both environmental and genetic factors contribute … l-genomics approach to prioritize genes was employed.
RESULTS: Thirteen percent of significant CRP quantitative trait loci (QTLs) that were previously identified in a large cohort of healthy individuals were replicated in our small patient cohort. Significant enrichment of CRP-QTLs in association with appendicitis was observed. Among these shared loci, the two top loci …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Copy number variation (CNV) refers to a kind of structural variation, having functional and evolutionary effects on phenotypes. Thus far, further elucidation of the CNVs in different Chinese indigenous cattle breeds by whole genome sequencing have yet not been done. In this study, a comprehensive genomic analysis was performed on 75 cattle individuals including six Chinese indigenous cattle breeds and two non-native specialized beef cattle breeds. Based on the 11,486 CNVRs discovered, population analysis was performed, showed that all the cattle breeds clustered in to three clades, consistent
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica is among the most burdensome of foodborne disease agents. There are over 2,600 serovars that cause a range of disease manifestations ranging from enterocolitis to typhoid fever. While there are two vaccines in use in humans to protect against typhoid fever, there are none that prevent enterocolitis. If vaccines preventing enterocolitis were to be developed, they would likely protect against only one or a few serovars. In this report, we tested the hypothesis that probiotic organisms could compete for the preferred nutrient sources of Salmonella and thus prevent or treat inf
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To understand the role of genetic factors on chromosome 1 in the regulation of spontaneous arthritis in mice deficient in IL-1 receptor antagonist protein (IL_1RA), we previously used speed congenic breeding to transfer the QTL region from DBA/1(-/-) mice that are resistant to spontaneous arthritis into BALB/c(-/-) mice which are susceptible. We were able to establish two congenic strains which exhibited a delayed onset and reduced severity of disease. In this study, we asked a different set of questions. How will the QTL region from BALB/c(-/-) interact with the rest of the genome
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Porcine chromosome X harbors four QTL strongly affecting backfat thickness (BFT), ham weight (HW), intramuscular fat content (IMF) and loin eye area (LEA). The confidence intervals (CI) of these QTL overlap and span more than 30 cM, or approximately 80 Mb. This study therefore attempts to fine map these QTL by joint analysis of two large-scale F₂ populations (Large White × Meishan and White Duroc × Erhualian constructed by INRA and JXAU respectively) and furthermore, to determine whether these QTL are caused by mutations in three positional candidate genes (ACSL4, SERPINA7 and IRS4
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An F(3) resource population originating from a cross between two divergently selected lines for high (D+ line) or low (D- line) body weight at 8-weeks of age (BW55) was generated and used for Quantitative Trait Locus (QTL) mapping. From an initial cross of two founder F(0) animals from D(+) and D(-) lines, progeny were randomly intercrossed over two generations following a full sib intercross line (FSIL) design. One hundred and seventy-five genome-wide polymorphic markers were employed in the DNA pooling and selective genotyping of F(3) to identify markers with significant effects on BW55. Fif
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Initial sensitivity to ethanol is a predictor of alcohol abuse that has been studied extensively in both human and animal populations. Selection for initial sensitivity to the sedative/hypnotic effects of ethanol resulted in the long-sleep and short-sleep lines of mice. Some of the genes selected in these lines could also specify differential responses in other ethanol-related phenotypes and, perhaps, for other drugs of abuse. We assessed congenic mice carrying a single quantitative trait locus (QTL) from the inbred long-sleep (ILS) or inbred short-sleep (ISS) strain on the recipro
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования