BACKGROUND: The aim of this study was to investigate the methylation status of E2BSs in the HPV 16 long control region (LCR) in clinical cervical samples.
METHODS: Methylation status of the four E2BSs in 43 clinical cervical samples with HPV 16 infection was quantitatively detected using pyrosequencing. Meanwhile, Quantivirus® HPV E6/E7 RNA 3.0 assay (bDNA) was used to detect E6/E7 mRNA levels in the corresponding specimens.
RESULTS: Our results showed that methylation status of E2BS1, 2 and 4 sites in high-grade squamous intraepithelial lesions (HSIL) and cervical cancer were significantly
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is a major epigenetic mechanism to regulate gene expression. Epigenetic regulation, including DNA methylation, histone modifications and RNA interference, results in heritable changes in gene expression independent of alterations in DNA sequence. Epigenetic regulation often occurs in response to aging and environment stimuli, including exposures and diet. Studies have shown that DNA methylation is critical in the pathogenesis of fibrosis involving multiple organ systems, contributing to significant morbidity and mortality. Aberrant DNA methylation can silence or activate gene e
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) presents significant diagnostic and therapeutic challenges due to its rising incidence and poor prognosis. Liquid biopsy, utilizing biofluids such as blood and saliva, offers a noninvasive approach to detect circulating tumor DNA (ctDNA), circulating tumor RNA (ctRNA), and small extracellular vesicles (sEVs) containing DNA (sEV-DNA) and RNA (sEV-RNA), which reflect tumor biology. However, comprehensive comparisons of these liquid biopsy markers are limited.
METHODS: Paired plasma and saliva samples were collected from HNSCC patients an
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pathogenesis of Hirschsprung's disease (HSCR) is complex. Recently, it has been found that histone modifications can alter genetic susce … nd influences cell proliferation and migration in HSCR. Subsequently, quantitative detection of m6A RNA methylation revealed that SMYD2 can alter m6A methylation levels. Western blot analysis, RT-qPCR, co-immunoprecipitation (co-IP), and immunofluorescence colocalization were utilized to confirm that SMYD2 can regulate METTL3 expression and affect m6A methylation …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
1. Nuclei from rat liver incubated with S-adenosyl[methyl-(14)C]methionine incorporated radioactivity into RNA and into lipid and protein. 2. All of the labelled RNA was extracted from the nuclei with trichloroacetic acid at 90 degrees C. 3. The [(14)C]methyl-group incorporation into the hot-trichloroacetic acid extract was 30% inhibited by the addition of actinomycin D (100mug/mg of DNA) or by the omission of CTP, GTP and UTP. 4. Assuming that the main substrate for this triphosphate-dependent methylation was newly synthesized precursor rRNA containing one methyl group/30 uridylate residues,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arginine methylation, catalyzed by the protein arginine methyltransferase (PRMT) family, is a widespread post-translational modification yet its regulatory logic in cancer remains incompletely framed. Unlike rapidly reversible modifications, arginine methylation operates through a persistence-prone, forward-biased logic shaped by the lack of a broadly acting demethylase system, multisite substrates, and ongoing methylation flux. Here, we propose a regulatory ratchet framework in which PRMT-dependent methylation can reinforce cellular states through cumulative and network-level effects rather t
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the current era of epigenetics research, we have observed many examples of epigenetic modifications, like histone modification and DNA methylation, in various fatal diseases. These include solid tumors, hematological malignancies and viral infections with DNA or RNA viruses. The purpose of this review is to summarize the role of epigenetic modifications during the abovementioned viral infections, viral-associated and independent malignancies. In this article, the essential biological aspects of DNA methylation are discussed. Then, the relationship between cancer and DNA methylation is expla
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteoarthritis (OA), the most common degenerative joint disease worldwide, currently lacks effective disease-modifying therapies that can halt its progression. This therapeutic challenge stems from the complexity of multiple pathological mechanisms, including chondrocyte metabolic imbalance, inflammatory responses, and extracellular matrix (ECM) degradation. In recent years, epigenetics, particularly reversible methylation modifications, has provided a new perspective for understanding OA.
MAIN BODY: This review systematically analyzes the multi-dimensional methylation regulatory
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Various studies have described epigenetic inheritance through sperms. However, the detailed mechanisms remain unclear. In this study, we focused on DNA methylation in mice treated with valproic acid (VPA), an inducer of epigenomic changes, and analyzed the treatment effects on the sperm from the next generation of mice. The administration of 200 mg/kg/day VPA to mice for 4 weeks caused transient histone hyperacetylation in the testes and DNA methylation changes in the sperm, including promoter CpGs of genes related to brain function. Oocytes fertilized with VPA-treated mouse sperm showed methy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ribosomal RNA (rRNA) gene encodes rRNA for protein synthesis. Aberrant expression of the rRNA gene has been generally observed in tumor cells and levels of its promoter methylation as an epigenetic regulator affect rRNA gene transcription. The possible relationship between expression and promoter methylation of rDNA has not been examined in human clinical cervical cancer. Here we investigate rRNA gene expression by quantitative real time PCR, and promoter methylation levels by HpaII/MspI digestion and sodium bisulfite sequencing in the development of human cervical cancer. We find that ind
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is globally reprogrammed after fertilization, and as a result, the parental genomes have similar DNA-methylation profiles after implantation except at the germline differentially methylated regions (gDMRs). We and others have previously shown that human blastocysts might contain thousands of transient maternally methylated gDMRs (transient mDMRs), whose maternal methylation is lost in embryonic tissues after implantation. In this study, we performed genome-wide allelic DNA methylation analyses of purified trophoblast cells from human placentas and, surprisingly, found that more
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 5.8S rRNA of normal tissues contains a partially 2'-O-methylated uridylic acid residue which is methylated in the cytoplasm and undermethylated in rapidly growing neoplastic tissues (R. N. Nazar, T. O. Sitz, and K. D. Somers, J. Mol. Biol., 142: 117-121, 1980). This difference in methylation was further characterized by examining the effect of cell age or cell culture passage number on the level of methylation of 5.8S RNAs from normal and malignant cell lines and simultaneous changes in intracellular pools of S-adenosylmethionine and S-adenosylhomocysteine. The results indicate that the le
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: The Oxford Nanopore Technologies (ONT) platform allows for the direct detection of RNA and DNA modifications from unamplified nucleic acids, which is a significant advantage over other platforms. However, the rapid updates to ONT basecalling models and the evolving landscape of computational tools for modification detection bring about challenges for reproducible and standardized analyses. To address these challenges, we developed Dogme, which is a Nextflowbased workflow that automates the processing of ONT data, including basecalling, alignment, modification detection, and transcr
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Non-alcoholic fatty liver disease has seriously affected people's health. Recent studies have found that N6-methyladenosine (m6A) methylation is involved in the lipid metabolism process of the body, but the study on the level of m6A modification in NAFLD is still not available. This study aims to explore the changes in the level of RNA m6A methylation modification in NAFLD liver tissues, and to provide experimental and theoretical basis for in-depth study on the role of RNA m6A methylation in the occurrence and development of NAFLD.
METHODS: Changes in the m6A level in NAFLD liver
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV) causes substantial global losses in cucurbit crops, especially watermelon. N6-methyla … ve pathways. Combined with RNA-seq analysis, there was generally a negative correlation between m6A RNA methylation and transcript level in the watermelon transcriptome. Both the m6A methylation and transcript levels of 59 modified genes significantly changed in response to CGMMV infection and some were involved in plant immunity.
CONCLUSIONS: Our study represen …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Threatening public health, pulmonary disease (PD) encompasses diverse lung injuries like chronic obstructive PD, pulmonary fibrosis, asthma, pulmonary infections due to pathogen invasion, and fatal lung cancer. The crucial involvement of RNA epigenetic modifications in PD pathogenesis is underscored by robust evidence. These modifications not only shape cell fates but also finely modulate the expression of genes linked to disease progression, suggesting their utility as biomarkers and targets for therapeutic strategies. The critical RNA modifications implicated in PDs are summarized in this re
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoporosis is a systemic disease in which bone mass decreases, leading to an increased risk of bone fragility and fracture. The occurrence of osteoporosis is believed to be related to the disruption of the differentiation of mesenchymal stem cells into osteoblasts and adipocytes. N6-adenylate methylation (m6A) modification is the most common type of chemical RNA modification and refers to a methylation modification formed by the nitrogen atom at position 6 of adenine (A), which is catalyzed by a methyltransferase. The main roles of m6A are the post-transcriptional level regulation of the sta
ОбзорСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In mammals, the acquisition of the germline from the soma provides the germline with an essential challenge: the need to erase and reset genomic methylation1. In the male germline, RNA-directed DNA methylation silences young, active transposable elements2-4. The PIWI protein MIWI2 (PIWIL4) and its associated PIWI-interacting RNAs (piRNAs) instruct DNA methylation of transposable elements3,5. piRNAs are proposed to tether MIWI2 to nascent transposable element transcripts; however, the mechanism by which MIWI2 directs the de novo methylation of transposable elements is poorly understood, althoug
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HPV-16 L1 methylation and E6/E7 mRNA have suggested that they had close relationship with cervical neoplastic progression. This study aimed to evaluate the clinical performance of the HPV-16 L1 methylation assay and E6/E7 mRNA test for detecting high-grade cervical lesions (CIN2+). A total of 81 women with liquid-based cytology (LBC) samples, histological results, and positive HPV-DNA test for HPV type 16 only were included in this study. HPV-16 L1 methylation and E6/E7 mRNA levels were measured using methylation-sensitive high resolution melting (MS-HRM) analysis and Quantivirus®HPV E6/E7 RNA
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The PIWI-interacting RNA (piRNA) pathway guides the DNA methylation of young, active transposons during germline development in male mice1. piRNAs tether the PIWI protein MIWI2 (PIWIL4) to the nascent transposon transcript, resulting in DNA methylation through SPOCD1 (refs. 2-5). Transposon methylation requires great precision: every copy needs to be methylated but off-target methylation must be avoided. However, the underlying mechanisms that ensure this precision remain unknown. Here, we show that SPOCD1 interacts directly with SPIN1 (SPINDLIN1), a chromatin reader that primarily binds to H3
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования