Aberrant pre-mRNA splicing is a pervasive feature of cancer and an emerging therapeutic vulnerability. Recurrent mutations in core spliceosomal components, including SF3B1, SRSF2, U2AF1, and ZRSR2, are common in myeloid malignancies, while dysregulated splicing regulators and cis-acting splice-site alterations shape cancer-relevant isoform programs across solid tumors. Together with high transcriptional output, rapid proliferation, and oncogene-driven RNA-processing demand, these alterations can reduce the capacity of cancer cells to tolerate additional splicing perturbation, creating a therap
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cystic fibrosis (CF) is an autosomal recessive disorder caused by mutations in the CFTR gene. The 10th most common mutation, c.3178-2477C>T (3849+10kb C>T), involves a cryptic, intronic splice site. This mutation was corrected in CF primary cells homozygous for this mutation by delivering pairs of guide RNAs (gRNAs) with Cas9 protein in ribonucleoprotein (RNP) complexes that introduce double-strand breaks to flanking sites to excise the 3849+10kb C>T mutation, followed by DNA repair by the non-homologous end-joining pathway, which functions in all cells of the airway epithelium. RNP complexes
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic kidney disease caused by X-linked Alport syndrome (XLAS) is relatively rare. However, due to the nonspecific pathologic and clinical manifestations of this disease, it is easily misdiagnosed. Genetic testing is crucial in identifying suspected cases. In addition, the results of genetic testing are an important indicator of patient prognosis. This study demonstrated a novel pathogenic COL4A5 splicing site variant in a Chinese family with XLAS.
METHODS: Targeted next generation sequencing (NGS) was performed to identify the gene variant in the family members, and the gene mu
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BRCA1 and BRCA2 testing for hereditary breast and ovarian cancer (HBOC) does not identify all pathogenic variants. Sequencing of 20 complete genes in HBOC patients with uninformative test results (N = 287), including noncoding and flanking sequences of ATM, BARD1, BRCA1, BRCA2, CDH1, CHEK2, EPCAM, MLH1, MRE11A, MSH2, MSH6, MUTYH, NBN, PALB2, PMS2, PTEN, RAD51B, STK11, TP53, and XRCC2, identified 38,372 unique variants. We apply information theory (IT) to predict and prioritize noncoding variants of uncertain significance in regulatory, coding, and intronic regions based on changes in binding s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As one of the most abundant RNA post-transcriptional modifications, N6-methyladenosine (m6A) involves in a broad spectrum of biological and physiological processes ranging from mRNA splicing and stability to cell differentiation and reprogramming. However, experimental identification of m6A sites is expensive and laborious. Therefore, it is urgent to develop computational methods for reliable prediction of m6A sites from primary RNA sequences. In the current study, a new method called RAM-ESVM was developed for detecting m6A sites from Saccharomyces cerevisiae transcriptome, which employed ens
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The molecular mechanism of hereditary multiple exostoses (HME) remains ambiguous and a limited number of studies have investigated the pathogenic mechanism of mutations in patients with HME. In the present study, a novel heterozygous splice mutation (c.1284+2del) in exostosin glycosyltransferase 1 (EXT1) gene was identified in a three‑generation family with HME. Bioinformatics and TA clone‑sequencing indicated that the splice site mutation would result in exon 4 skipping. Reverse transcription‑quantitative polymerase chain reaction (RT‑qPCR) revealed that the expression levels of wild‑type EXT
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In addition to the long-term expression of the transgene provided by all retroviral vectors, lentiviruses present the opportunity to transduce nondividing cells and potentially achieve regulated expression. The development of lentiviral vectors requires the design of transfer vectors to ferry the transgene with efficient encapsidation of the transgene RNA and with full expression capability, and of a packaging vector to provide packaging machinery in trans but without helper virus production. For both vectors, a knowledge of packaging signal is required-the signal to be included in the transfe
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Very early onset inflammatory bowel disease (VEOIBD) is frequently driven by monogenic defects. Pathogenic variants in the syntaxin-binding protein 3 (STXBP3) gene have been implicated in VEOIBD; however, the relationship between specific variant types and clinical manifestations remains incompletely understood. This study aimed to identify the genetic cause in a patient with VEOIBD and explore the possible genotype-phenotype correlations of STXBP3-related disorders.
METHODS: We performed trio-whole-exome sequencing (trio-WES) on a male infant presenting with VEOIBD, sensorineural
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aristolochic acid (AA), a natural product of Aristolochia plants found in herbal remedies and health supplements, is a group 1 carcinogen that can cause nephrotoxicity and upper urinary tract urothelial cell carcinoma (UTUC). Whole-genome and exome analysis of nine AA-associated UTUCs revealed a strikingly high somatic mutation rate (150 mutations/Mb), exceeding smoking-associated lung cancer (8 mutations/Mb) and ultraviolet radiation-associated melanoma (111 mutations/Mb). The AA-UTUC mutational signature was characterized by A:T to T:A transversions at the sequence motif A[C|T]AGG, located p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD) is a common disorder mostly characterized by cyst formation in kidney tubules. The majority of ADPKD cases is caused by mutations in the PKD1 gene, but no prevalent mutation has been reported. By heteroduplex analysis of the 3' single-copy region of the gene, we have searched for mutations in subjects from 40 ADPKD families of Northern Italy. Seven novel polymorphisms and three novel disease-associated mutations (R3718Q, L3851P and IVS45+56del25) were identified. Both missense mutations are located in the major extracellular loop of polycyst
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteogenesis imperfecta (OI) type I is the mildest form of heritable bone fragility resulting from mutations within the COL1A1 gene. We studied fibroblasts established from a child with OI type I and demonstrated underproduction of alpha 1 (I) collagen chains and alpha 1 (I) mRNA. Indirect RNase protection suggested two species of alpha 1 (I) mRNA, one of which was not collinear with fully spliced alpha 1 (I) mRNA. The noncollinear population was confined to the nuclear compartment of the cell, and contained the entire sequence of intron 26 and a G-->A transition in the first position of the i
Клинический случайСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leber congenital amaurosis, Type 12 is an early onset, autosomal recessive retinal disease caused by mutations in RD3. We report the generation of a patient-specific iPSC line (LVPEIi006-B), using Sendai viral vector-based reprogramming approach and an isogenic, mutation-corrected iPSC line (LVPEIi006-B-1), using an en31FnCas9-based adenine base editor (ABE) system. Both lines were clonally expanded and genotyped to confirm the presence of patient-specific mutation and desired base correction in the edited line. Both lines maintained their stemness, pluripotency, genomic integrity and could di
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The HDR syndrome is a rare autosomal dominant disorder characterised by Hypoparathyroidism, Deafness, and Renal dysplasia, and is caused by inactivating heterozygous germline mutations in the GATA3 gene. We report an 11-year-old girl with HDR syndrome caused by a heterozygous mutation located at the splice acceptor site of exon 5 of the GATA3 gene (NM_001002295.2: c.925-1G>T). Functional studies using a minigene assay showed that this splice site mutation abolished the normal splicing of the GATA3 pre-mRNA and led to the use of a cryptic splice acceptor site, resulting in the loss of the first
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spinocerebellar ataxia, autosomal recessive-17 (SCAR17) is a rare hereditary ataxia characterized by ataxic gait, cerebellar signs and occasionally accompanied by intellectual disability and seizures. Pathogenic mutations in the CWF19L1 gene that code for CWF19 like cell cycle control factor 1 cause SCAR17. We report here two unrelated families with the clinical characteristics of global developmental delay, cerebellar ataxia, pyramidal signs, and seizures. Cerebellar atrophy, and T2/FLAIR hypointense transverse pontine stripes were observed in brain imaging. Exome sequencing identified novel
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Marfan syndrome (MFS) is a hereditary connective tissue disease whose clinical severity varies widely. Mutations of the FBN1 gene encoding fibrillin-1 are the most common genetic cause of Marfanoid habitus; however, about 10% of MFS patients are unaware of their genetic defects. Herein, we report a Korean patient with MFS and annuloaortic ectasia caused by an intronic c.5225-3C>G variant of the FBN1 gene identified by targeted panel sequencing. The reverse transcription analysis of FBN1 revealed that the intron 43 sequence from positions c.5297-1516 to c.5297-1 was retained at the coding seque
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary polyneuropathy in the context of Seip-Berardinelli type 1 seipinopathy, or congenital generalized lipodystrophy type 1 (CGL1) has not been previously reported. We report the case history of a 27 year old female CGL1 patient presenting with an unusual additional development of non-diabetic peripheral neuropathy and learning disabilities in early adolescence. Whole exome sequencing (WES) of the patient genome identified a novel variant, homozygous for a 52 bp intronic deletion in the AGPAT2 locus, coding for 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 2, which is uniquely associated wit
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schwartz-Jampel Syndrome type 1 is a rare autosomal recessive musculoskeletal disorder (OMIM #255800) caused by various mutations in the HSPG2 gene encoding protein perlecan, a ubiquitous heparan sulfate proteoglycan, which is an integral component of basement membranes and possesses angiogenic and growth-promoting attributes primarily by acting as a co-receptor for the basic fibroblast growth factors in human body. We report a novel homozygous intronic 5' splice site mutation in this gene (c.4740 + 5G>A) in a child with clinical features of Schwartz-Jampel syndrome type 1. The mutation was de
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since 1994, four cases of epidermal nevus with epidermolytic hyperkeratosis (EH) caused by keratin 10 gene mutations have been reported, although no keratin 1 (K1) gene mutation has yet been reported. We detected a K1 gene (KRT1) mutation in epidermal nevus with EH in a 10-year-old Japanese male. The patient showed well-demarcated verrucous, hyperkeratotic plaques mainly on the trunk, covering 15% of the entire body surface. No hyperkeratosis was seen on the palms or soles. He had no family history of skin disorders. His lesional skin showed typical granular degeneration and, ultrastructurally
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To study a family affected with osteogenesis imperfecta for potential mutations in COL1A1 gene.
METHODS: Clinical data of an affected family was collected. Potential mutation of the COL1A1 gene was screened using polymerase chain reaction and direct sequencing. Suspected mutation was detected in 20 unaffected relatives and 200 unrelated healthy controls.
RESULTS: Analysis of RNA splicing has revealed a c.3208G/A mutation, which created a new splice sites and led to a frameshift mutation. The same mutation was not detected in the unaffected relatives or the 200 healthy controls.
C
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования