BACKGROUND: Metastatic colorectal cancer (mCRC) is a heterogeneous disease. Predictive biomarkers are in great demand to optimize patient selection at high risk for death and to provide a novel insight into potential targeted therapy.
METHODS: The present study retrospectively analyzed the gene expression profiles of tumor tissue samples from 4 public CRC cohorts, including 1 RNA-Seq data set from The Cancer Genome Atlas (TCGA) CRC cohort and 3 microarray data sets from GEO. Prognostic analysis was performed to test the predictive value of prognostic gene signature.
RESULTS: Of 192 patients,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inclusion body myositis (IBM) is a disease with a poor prognosis and limited treatment options. This study aimed at exploring gene expression profile alterations, investigating the underlying mechanisms and identifying novel targets for IBM. We analysed two microarray datasets (GSE39454 and GSE128470) derived from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. The GEO2R tool was used to screen out differentially expressed genes (DEGs) between IBM and normal samples. Gene Ontology(GO)function and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)pathway enrichment analysis were performed using the Data
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epithelial sinonasal cancers (SNCs) are rare diseases with overlapping morphological features and a dismal prognosis. We aimed to investigate the expression differences among the histological subtypes for discerning their molecular characteristics. We selected 47 SNCs: (i) 21 nonkeratinizing squamous cell carcinomas (NKSCCs), (ii) 13 sinonasal neuroendocrine cancers (SNECs), and (iii) 13 sinonasal undifferentiated cancers (SNUCs). Gene expression profiling was performed by DASL (cDNA-mediated annealing, selection, extension, and ligation) microarray analysis with internal validation by quantit…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vestibular schwannoma (VS) is the fourth most common intracranial tumor, arising from neoplastic Schwann cells of the vestibular nerve and often causing debilitating sensorineural hearing loss (SNHL) and tinnitus. Previous research suggests that the abnormal upregulation of inflammatory pathways plays a highly significant, though infrequently described role in VS pathobiology, and that VS-associated SNHL is due not only to mechanical compression of the auditory nerve but also to differences in the intrinsic biology of these tumors. We hypothesize that patients who present with poor hearing ass
СтатьяМетаанализПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rad is the prototypic member of a subfamily of Ras-related small G-proteins and is highly expressed in the skeletal muscle of patients with type II diabetes. Our previous microarray analysis suggested that Rad may mediate fracture nonunion development. Thus, the present study used rat experimental models to investigate and compare the gene and protein expression patterns of both Rad and Rem1, another RGK subfamily member, in nonunions and standard healing fractures.
METHODS: Standard healing fractures and nonunions (produced via periosteal cauterization at the fracture site) were …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic modification may play an important role in pathophysiology of ischemic stroke (IS) risk. MicroRNAs (miRNAs), which constitute one of the modes of epigenetic regulation, have been shown to be associated with a number of clinical disorders including IS. The purpose of this study was to investigate the miRNA profile in the peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of IS patients and compare it with stroke-free controls. Blood samples were obtained from 19 healthy age-gender-race matched individuals who served as controls to 20 IS patients. miRNA microarray analysis with RNA from PBMCs…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver fibrosis is a major pathological feature of chronic liver diseases, including liver cancer. MicroRNAs (miRNAs), small noncoding RNAs, regulate gene expression posttranscriptionally and play important roles in various kinds of diseases; however, miRNA-associated hepatic fibrogenesis and its acting mechanisms are poorly investigated. Therefore, we performed an miRNA microarray in the fibrotic livers of Mus musculus treated with carbon-tetrachloride (CCl₄) and analyzed the biological functions engaged by the target genes of differentially-expressed miRNAs through gene ontology (GO) and in-d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aetiology and pathogenesis of salivary gland malignancies remain unknown. To reveal novel molecular factors behind the development of salivary gland cancer, we performed gene expression analyses from Smgb-Tag mouse salivary gland samples. The overall purpose was to apply these results for clinical use to find new approaches for both possible therapeutic targets and more accurate diagnostic tools. Smgb-Tag mouse strain, in which salivary neoplasms arise through a dysplastic phase in submandibular glands, was investigated using genome-wide microarray expression analysis, ingenuity pathway an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous studies demonstrated that Schwann cells (SCs) express distinct motor and sensory phenotypes, which impact the ability of these pathways to selectively support regenerating neurons. In the present study, unbiased microarray analysis was used to examine differential gene expression in denervated motor and sensory pathways in rats. Several genes that were significantly upregulated in either denervated sensory or motor pathways were identified and two secreted factors were selected for further analysis: osteopontin (OPN) and clusterin (CLU) which were upregulated in denervated motor and s…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methanol (MeOH) is considered to be a poison in humans because of the alcohol dehydrogenase (ADH)-mediated conversion of MeOH to formaldehyd … trations of MeOH and FA in their blood plasma when consuming citrus pectin, ethanol and red wine. A microarray analysis of white blood cells (WBC) from volunteers after pectin intake showed various responses for 30 significantly differentially regulated mRNAs, most of which were somehow involved in the pathogenesis of Alzheimer's disease (AD). There was also a decrea …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The detection of special bacterial species in patients with periodontitis is considered to be useful for clinical diagnosis and treatment. The collection of subgingival plaque samples is the common way for the determination of periodontopathic bacteria. However, recently, salivary analysis has been discussed as an advantageous future diagnostic method for periodontitis because it offers simple quantitative sampling and the possibility to assess various bacteria. The aim of this cross-sectional study is to investigate whether there is a correlation between the results of different b
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RAB38 is a new member of the RAB small G protein family that regulates intracellular vesicle trafficking. RAB38 is expressed in melanocytes and it has been shown that a point mutation in the postulated GTP-binding domain of RAB38 is the gene responsible for human Hermansky-Pudlak syndrome. However, the prognostic and molecular features of tumors with RAB38 expression is still unclear, as well as glioma. Whole genome mRNA expression microarray data on 220 glioma samples from the Chinese glioma genome atlas (CGGA) database (http://www.cgga.org.cn) was applied as discovery set. Each grade of glio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is estimated that 10-15 % of all clinically recognised pregnancies results in a miscarriage, most of which occur during the first trimester. Large-scale chromosomal abnormalities have been found in up to 50 % of first-trimester spontaneous abortions and, for several decades, standard cytogenetic analysis has been used for their identification. Recent studies have proven that array comparative genomic hybridisation (array-CGH) is a useful tool for the detection of genome imbalances in miscarriages, showing a higher resolution, a significantly higher detection rate and overcoming problems of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Experimental trial in an in vivo animal model in the laboratory facilities of a university department of obstetrics and gynecology and a microarray facility using seventeen female Wistar rats to investigate the regional expression level of TACR1 at specific locations in the peritoneum in a rodent animal model of post-operative adhesions.
METHODS: Peritoneal adhesions were induced by the placement of three unilateral ischemic lesions. A time course experiment was performed to identify when adhesions form in this model to determine the optimal time for tissue harvesting. To this effect
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thoracic perivascular adipose tissue (PVAT) is a unique adipose depot that likely influences vascular function and susceptibility to pathogenesis in obesity and the metabolic syndrome. Surprisingly, PVAT has been reported to share characteristics of both brown and white adipose, but a detailed direct comparison to interscapular brown adipose tissue (BAT) has not been performed. Here we show by full genome DNA microarray analysis that global gene expression profiles of PVAT are virtually identical to BAT, with equally high expression of Ucp-1, Cidea, and other genes known to be uniquely or very…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
West Nile (WNV), dengue (DENV) and yellow fever (YFV) viruses are (re)emerging, mosquito-borne flaviviruses that cause human disease and mortality worldwide. Alterations in mosquito gene expression common and unique to individual flaviviral infections are poorly understood. Here, we present a microarray analysis of the Aedes aegypti transcriptome over time during infection with DENV, WNV or YFV. We identified 203 mosquito genes that were ≥ 5-fold differentially up-regulated (DUR) and 202 genes that were ≥ 10-fold differentially down-regulated (DDR) during infection with one of the three flaviv…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aim: To explore the relationship between Chlamydia pneumonia (Cpn) infection and lung cancer using integrative methylome and transcriptome analyses. Methods: Twelve primary lung cancer patients who were positive for Cpn and twelve patients who were negative were selected for demographic, clinicopathological, and lifestyle matching. Genomic DNA and RNA were extracted and DNA methylation and mRNA levels were detected using the Infinium Human Methylation 450 Beadchip array and mRNA + lncRNA Human Gene Expression Microarray. We identified differentially expressed methylation and genes profiles. Re
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Yellow fever (YF) virus is currently found in tropical Africa and South America, and is responsible for a febrile to severe illness characte … ced early apoptosis in these cells. Molecular markers specific for the 17D virus were identified by microarray analysis and confirmed by quantitative RT-PCR analysis. As early as 1h postinfection, three genes, (IEX-1, IRF-1, DEC-1) all implicated in apoptosis pathways, were upregulated. Later in infection (48 h) two other genes (HSP70-1A and 1B), expressed in cases o …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several Borrelia burgdorferi outer surface proteins have been identified over the past decade that are up-regulated by temperature- and/or mammalian host-specific signals as this spirochete is transmitted from ticks to mammals. Given the potential role(s) that these differentially up-regulated proteins may play in B. burgdorferi transmission and Lyme disease pathogenesis, much attention has recently been placed on identifying additional borrelial outer surface proteins. To identify uncharacterized B. burgdorferi outer surface proteins, we previously performed a comprehensive gene expression pr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although the prognostic value of immune-related biomarkers is well characterized in many solid tumors, their significance in vulva squamous cell carcinoma (VSCC) remains unclear. In this study, we report a comprehensive analysis of programmed death ligand protein 1 (PD-L1) and immune cell infiltration in VSCC and establish immunoscore models for classification of the disease. Tissue microarrays, immunohistochemistry, and digital quantification were used to investigate the number of CD4+, CD8+, CD68+, CD14+, FoxP3+, and PD-L1+ cells in epithelial and stromal compartments of VSCC (n = 117). Immu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.