Despite substantial advances in radiotherapy and chemotherapy for nasopharyngeal carcinoma (NPC), a subset of patients still develops metastasis or recurrence following initial treatment. Additionally, the atypical early symptoms of NPC often lead to clinical misdiagnosis or missed diagnosis, resulting in late diagnosis and unfavorable prognosis. Thus, novel diagnostic biomarkers are urgently required. By integrating five GEO datasets and applying four machine learning models, namely LASSO, SVM-RFE, XGBOOST, and mRMR, this study identified two key NPC-related genes, BLK and OSBPL10. Bioinforma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aberrant sialylation is a persistent glycosylation change in cancer that reshapes interactions within the tumour microenvironment through the display of sialylated glycans (sialoglycans) on malignant and stromal cells. Many sialoglycans engage sialic acid-binding immunoglobulin-like lectins (Siglecs), a family of receptors expressed predominantly by immune cells that frequently transmit inhibitory signals and function as glyco-immune checkpoints. Increasing evidence indicates that tumour hypersialylation suppresses myeloid and lymphoid anti-tumour activity, promotes immune evasion, and contrib
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Oral squamous cell carcinoma (OSCC) has a poor prognosis because of its high metastatic potential and frequent chemoresistance. Although CLTC is aberrantly expressed and involved in fusion events in several tumors, its role in OSCC remains poorly defined.
METHODS: We integrated transcriptomic and clinical data from TCGA and GEO, scRNA-seq data, immune infiltration analysis, ligand-receptor based cell-cell communication analysis, drug sensitivity prediction, molecular docking, and in vitro functional validation to evaluate CLTC expression, prognostic value, and its association with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous research has predominantly focused on the regulatory role of lncRNA HOTAIR in gene silencing by interacting with the Polycomb repressive complex 2 (PRC2), but its direct role as a transcriptional activator remains less well characterized. Here, our study reveals a novel regulatory mechanism of HOTAIR, which facilitates prostate cancer (PCa) progression by enhancing transcription elongation. Integrating ChIRP-seq, RNA-seq, and ChIP-seq, we found that HOTAIR co-localizes with AR and facilitates the interaction between CDK9 and Pol II. This function requires the 1-442 nt region and intac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small nucleolar RNA host genes (SNHGs) are a distinctive subgroup of long non-coding RNAs whose loci can generate both host lncRNA transcripts and intronic small nucleolar RNAs. In hepatocellular carcinoma (HCC), dysregulated SNHGs have been linked to tumor growth, epithelial-mesenchymal transition, metastasis, stemness, immune remodeling, extracellular vesicle communication, and therapeutic resistance. However, the clinical meaning of these associations remains uneven because many reported mechanisms are based on limited cell-line experiments, retrospective cohorts, or non-stratified HCC mode
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor-associated neutrophils (TANs) are abundant across cancers, yet their phenotypic diversity and functional states remain poorly defined. Here, we introduce a cell-type probability classifier that recovers low-transcript neutrophils from scRNAseq datasets, enabling pan-cancer analyses of TAN heterogeneity. Across >190 human and murine tumors, we identify a conserved differentiation trajectory that culminates in a terminal CCL3hi state. This state exhibits pro-tumor transcriptional programs, including those involved in hypoxic adaptation and senescence. Consistently, CCL3hi TANs are enriched
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitenpyram (NIT) is an insecticide used primarily for flea control in pets, especially cats and dogs. Some studies suggest that NIT is associated with cancer development, but the mechanisms involved are unclear. In this study, we integrated multi-platform bioinformatics analysis, protein-protein interaction (PPI) network construction, gene enrichment analysis and molecular docking to explore the carcinogenic mechanism of NIT in depth. We first targeted the oncogenic targets under NIT exposure, and then mapped the cross-cancer expression profiles based on 26 core genes, and quantitatively analy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Breast cancer is the most common malignancy in women and includes molecular subtypes with distinct clinical outcomes, such as luminal A and luminal B. Although luminal tumors account for most cases, the epigenetic mechanisms differentiating luminal A from the more aggressive luminal B subtype remain unclear. We developed an interpretable machine learning pipeline to reduce genomic noise and identify methylation-dependent regulatory signatures by distinguishing these subtypes.
METHODS: The INTEND algorithm was trained on 4,441 paired RNA-seq and DNA methylation samples from 14 canc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Cervical cancer (CC) remains a significant global health concern, characterized by high incidence rates. Concurrently, the obesity epidemic continues to expand, affecting millions worldwide. Dysregulation of pro- and anti-inflammatory cytokines can promote chronic inflammation, which contributes to the pathogenesis of various diseases, including cancer. This study aimed to evaluate the gene expression levels of TNF-α, IL-6, IL-8, IL-10, and VEGF during CC progression in patients across different weight categories: normal weight, overweight, and obese.
MATERIALS AND METHODS: Ce
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prostate cancer remains largely refractory to immunotherapy, implying the existence of context-specific immune landscape programs that diverge between circulation and tumor. Here, we integrate bulk RNA sequencing from three cohorts (patient peripheral mononuclear cells, primary prostate tissue, and biochemical-recurrence tumors) with multiparameter flow cytometry, unsupervised UMAP/T-REX (Tracking Responders Expanding) mapping, and de novo discovery of long non-coding RNAs (lncRNAs) to characterize context-specific immunoregulation. Patient PBMCs revealed a coherent IL-1/TNF/IL-17 inflammatory
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer progression is increasingly recognized as a dynamic process shaped by reciprocal communication between malignant cells and the tumor microenvironment (TME). Among immune-cell populations, tumor-associated macrophages (TAMs) are major regulators of immune suppression, metabolic adaptation, angiogenesis, and therapeutic resistance. Emerging evidence indicates that extracellular vesicle (EV)-mediated transfer of long non-coding RNAs (lncRNAs) constitutes an important mechanism underlying tumor-immune communication in breast cancer. In this review, we summarize mechanistically charac
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The efficacy of immune checkpoint blockade (ICB) is heterogeneous across patients. Tumour immune phenotype classification (immune-inflamed, -excluded, and -desert) represents a foundational but inadequate framework for predicting ICB efficacy. Here we aimed to develop an integrated immunogenomic classification to improve ICB response prediction and identify subtype-specific therapeutic vulnerabilities.
METHODS: We analysed 13 public ICB cohorts and an in-house cohort. Using RNA-seq data, we developed ImmPred, a seven-gene classifier trained on IHC-defined immune phenotypes, and in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The isogenic, tumor-bearing Dark Agouti Mammary Adenocarcinoma (DAMA) model is commonly utilized in breast cancer research to evaluate mechanisms of, and interventions for chemotherapy-induced toxicity and tumor response. However, the biological subtype, immune landscape, and genomic profile of DAMA have remained uncharacterized. In this study, we comprehensively evaluated DAMA tumors naïve and exposed to methotrexate, assessing their histopathological, molecular, and genomic features. Our findings reveal that the DAMA model presents a platform to model the human triple-negative breast cancer
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Wilms tumor presents a heterogeneous tumor microenvironment. This study aimed to characterize the tumor microenvironment and identify prognostic genes to improve therapeutic strategies.
METHODS: We integrated single-cell RNA sequencing and transcriptomic data from paired tumor and normal tissues. Bioinformatics analyses included assessments of cellular heterogeneity, trajectories, and cell-cell communication. Prognostic genes were identified with differential expression, Cox regression, and machine-learning analyses. Furthermore, functional characterization, immune infiltration pa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aberrant O-glycosylation and miRNA dysregulation are established features of tumor aggressiveness, particularly in triple-negative breast cancer (TNBC). Using a Cosmc-silenced 4T1 murine model (Tn+), characterized by truncated O-glycans and enhanced metastatic potential, tissue and serum miRNA profiling identified miR-21-5p as a circulating marker associated with the Tn+ phenotype. Transcriptomic analysis revealed that miR-21-5p targets multiple tumor suppressor genes, including Btg2, Spry1, Tbx2, Rhob, and Dusp8, suggesting its involvement in epithelial-mesenchymal transition and immune modul
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Reprogramming of metabolic pathways represents a central indicator in cancer pathogenesis, but the metabolic heterogeneity of bladder cancer (BLCA) at different stages is not well understood. This study aims to analyze metabolic reprogramming in BLCA across stages and its impact on patient survival.
METHODS: Single-cell sequencing data were used to examine metabolic heterogeneity of epithelial cells and cell subpopulation differentiation in BLCA at various clinical stages. Spatial transcriptome data were analyzed for copy number variability and riboflavin metabolism in BLCA epithe
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The insulin receptor (IR) is expressed in breast cancer cells and plays a role in regulating tumor biology. There are two IR isoforms generated from the same gene. Alternate splicing with exclusion or inclusion of exon 11 accounts for the two isoforms. The exon 11 excluded isoform (IR-A) is expressed during fetal development while the full-length adult IR (IR-B) is the primary form expressed during adult life. This splice variant results in a 12 amino acid variation in peptide sequence. Breast cancer cells overexpress IR-A with an increased IR-A: IR-B ratio. Most of these data were
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung cancer remains a major cause of cancer-related mortality worldwide, with current treatments such as surgery, chemotherapy, and immunotherapy facing limitations, including severe side effects and high costs. Hyperthermia (H) has emerged as a promising strategy to enhance tumor sensitivity to treatments and reduce toxicity. This study investigates the effects of H in enhancing the anti-tumor efficacy of pemetrexed (PEM) and altering the expression profile of hsa-MiR-548c-3p (tumor suppressor) in the A549 cell line. A549 cells were cultured in DMEM medium and divided into four groups: Contro
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The zinc transporter SLC39A6, a member of the ZIP (Zrt-Irt-like protein) family, mediates zinc influx from the extracellular milieu into the cytosol and is indispensable for the function of numerous enzymes, transcription factors and signaling molecules. Previous studies have shown that SLC39A6 expression is associated with prognosis in esophageal squamous cell carcinoma and cervical cancer, indicating its potential impact on patient survival and tumor immunity. But a comprehensive pan-cancer analysis of SLC39A6 is still lacking. This study aimed to systematically delineate the onc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During recent years, a growing body of evidence has revealed that metabolic rewiring of glycogen is a hallmark of cancer that plays a significant role in tumor development and progression. Nonetheless, the molecular mechanism underlying the dysregulation of glycogen remains largely unknown. In this study, using liver-specific AKAP1 depletion and overexpression mouse models, we demonstrated that AKAP1 deficiency markedly suppressed both chemical diethylnitrosamine/carbon tetrachloride (DEN/CCl₄)-induced and Akt/β-catenin oncogene-driven spontaneous hepatocellular carcinoma (HCC) by reducing hep
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования