AprD5 is a member of the NAD+-dependent short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily. It participates in the apramycin biosynthetic pathway by catalyzing 4'-oxidation of UDP-β-d-glucose (UBG) to initiate the assembly of UDP-4'-amino-4'-deoxy-β-d-glucose in partnership with the aminotransferase AprL. Here, we report a 1.9 Å crystal structure of AprD5 in complex with NAD+ and its substrate UBG, which reveals a well-ordered ternary complex poised for catalysis. The cofactor and substrate are precisely aligned for hydride transfer by a conserved Ser-Tyr-Lys catalytic triad, while the nucl
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiac contraction is driven by double-headed myosin cycling on cardiac thin filaments, where troponin-tropomyosin regulates myosin access to actin. Prior high-resolution structural studies used a single-headed myosin bound to bare actin, thereby limiting insight into coordination between myosin heads and the influence of troponin-tropomyosin on actomyosin interactions. Here, we report a high-resolution structure of the native cardiac rigor cross-bridge formed by heavy meromyosin bound to the thin filament. We show that direct communication between the two bound heads, uneven interactions bet
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Developing effective antibody therapeutics requires not only high affinity, specificity, and potency but also optimal stability and safety. Comprehensive biophysical and biochemical profiling acts as an essential gatekeeper to predict the fate of a candidate and facilitate the transition from bench to bedside. This study evaluates the developability of Dia-T51, an anti-β-1,3-glucan monoclonal antibody humanized from the murine parental 2G8 and designed for antifungal therapy. We employed a multi-technique approach combining UV-Visible, Fluorescence, and Circular Dichroism spectroscopy with in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabotropic glutamate receptors (mGluRs) are prototypical, dimeric family C G protein-coupled receptors (GPCR) that perform crucial modulatory roles throughout the nervous system. While mGluR activation and signaling through G proteins has been studied extensively, how these receptors interact with and are desensitized by β-arrestins (β-arrs) is not well understood. Here, we use an integrative biophysical and structural approach to probe the coupling of mGluR8 and β-arrs. Using negative stain electron microscopy (EM), we identify tail- and core-bound orientations and stoichiometries of mGluR8
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis E virus, a single-stranded positive-sense RNA virus, is the causative agent of acute viral hepatitis in humans and can lead to chronic infection in immunocompromised individuals. In this setting, strains containing host genome insertions within the polyproline region (PPR) of the pORF1 polyprotein were characterized and shown to display an increased replication rate across all systems. Using in silico modeling of pORF1 across 25 strains, combined with molecular dynamics (MD) simulations, we explored the structural variations caused by these insertions to investigate potential mechani
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The self-assembly of peptides into amyloid fibrils enables the design of functional biomaterials, yet the conformational constraints of α-peptides limit the attainable supramolecular diversity. Here, we introduce β-amino acids, β-phenylalanine (β-Phe), and β-homophenylalanine (β-hPhe) into the reversible fibril-forming core sequence hnRAC1 to generate α/β-peptide variants with distinct architectures and enhanced thermal stability. Cryo-EM reveals that β-modified peptides assemble into polymorphic fibrils with cross-β structures that differ markedly from each other and from native hnRAC1. Compa
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methane- and ammonia-oxidizing bacteria play key roles in the global carbon and nitrogen cycles, respectively. These bacteria use homologous copper membrane monooxygenases to accomplish the defining chemical transformations of their metabolisms: the oxidations of methane to methanol by particulate methane monooxygenase (pMMO) and ammonia to hydroxylamine by ammonia monooxygenase (AMO), enzymes of prime interest for applications in mitigating climate change. However, investigations of these enzymes have been hindered by the need for disruptive detergent solubilization prior to structure determi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The secondary structures of polypeptides, such as an α-helix and a β-sheet, often impart specific properties and functions, making the regulation of their secondary structures of great significance. Particularly, water-soluble polypeptides bearing a β-sheet conformation are rare and challenging to achieve. Here, a series of oligo(ethylene glycol)-modified lysine N-carboxylic anhydrides (EGmK-NCA, where m = 1-3) and the corresponding polymers EGmKn are synthesized, with urethane bonds as the linker between the side-chain EG and lysine. The secondary structure of EGmKn is delicately regulated by
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Urease enzyme plays a key role in pathogenesis of gastritis and peptic ulcers. Its inhibition averts our bodies from many disorders including formation of urinary calculi. In agriculture, the high urease content causes severe environmental and hence economic problems. Due to deficiency of effective and safer drugs to tackle the aforementioned disorders, the quest for new scaffolds becomes mandatory in the field of medicinal chemistry. In this regard, we herein report a new series of N4-substituted thiosemicarbazones 3a-v as potential candidates for urease inhibition. These new N4-substituted t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The neuraminidases (NAs) of avian influenza viruses (IAVs) contain a second sialic acid-binding site (2SBS), historically known as the hemadsorption site, which is separated from the sialyl-hydrolase catalytic site and serves to facilitate NA catalytic activity towards multivalent sialyl-capped glycoconjugates. Transmission and adaptation of avian IAVs to humans decreases hemadsorption and catalytic activities of the NA. Here, we report the molecular recognition features of the NA 2SBS of two pandemic H1N1 IAVs, A/Brevig Mission /1/1918 (BM18) and A/California/04/2009 (CA09), differing by thei
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
C3larvinA was recently described as a mono-ADP-ribosyltransferase (mART) toxin from the enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC) III genotype of the agricultural pathogen, Paenibacillus larvae. It was shown to be the full-length, functional version of the previously described C3larvintrunc toxin, due to a 33-residue extension of the N-terminus of the protein. In the present study, a series of deletions and substitutions were made to the N-terminus of C3larvinA to assess the contribution of the α1-helix to toxin structure and function. Catalytic characterization of these variants
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SARS-CoV-2 has devastated the world with its rapid spread and fatality. The researchers across the globe are struggling hard to search a drug to treat this infection. Understanding the time constraint, the best approach is to study clinically approved drugs for control of this deadly pandemic of COVID 19. The repurposing of such drugs can be supported with the study of molecular interactions to enhance the possibility of application. The present work is a molecular docking study of proteins responsible for viral propagation namely 3Clpro, Nsp10/16, Spike protein, SARS protein receptor binding
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Particular fibrinogen γ chain mutations occurring in the γ-module induce changes that hamper γ-γ dimerization and provoke intracellular aggregation of the mutant fibrinogen, defective export and plasma deficiency. The hepatic storage predisposes to the development of liver disease. This condition has been termed hereditary hypofibrinogenemia with hepatic storage (HHHS). So far, seven of such mutations in the fibrinogen γ chain have been detected. We are reporting on an additional mutation occurring in a 3.5-year-old Turkish child undergoing a needle liver biopsy because of the concomitance of
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Persistence and replication of the gram-negative bacterium Legionella pneumophila in the human host cell depend on so-called effector proteins that target diverse cellular functions and modulate them in favor of the pathogen. We solved the crystal structure of the L. pneumophila effector protein MesI de novo to a resolution of 2.2 Å. The 34 kDa polypeptide chain folds into two distinct α-helical domains. The larger C-terminal domain shows similarity to tetratricopeptide repeat proteins. Using size-exclusion chromatography, we confirmed that MesI binds tightly to full-length SidI and that delet
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The flagellar hook protein FlgE from spirochaete bacteria self-catalyzes the formation of an unusual inter-subunit lysinoalanine (Lal) crosslink that is critical for cell motility. Unlike other known examples of Lal biosynthesis, conserved cysteine and lysine residues in FlgE spontaneously react to form Lal without the involvement of additional enzymes. Oligomerization of FlgE via its D0 and Dc domains drives assembly of the crosslinking site at the D1-D2 domain interface. Structures of the FlgED2 domain, dehydroalanine (DHA) intermediate and Lal crosslinked FlgE subunits reveal successive sna
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycobacterium tuberculosis heme-degrading protein MhuD degrades heme to mycobilin isomers and iron, while its closest homologues from Staphylococcus aureus, IsdG and IsdI, degrade heme to staphylobilin isomers, formaldehyde, and iron. Superposition of the structures of the heme-bound complexes reveals that the heme molecule in the MhuD active site is rotated ∼90° about the tetrapyrrole plane with respect to IsdG and IsdI active site heme molecules. Therefore, the variation in IsdG/IsdI and MhuD chromophore products may be attributed to the different heme orientations. In MhuD, two arginines, A
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloid aggregation initiates from a slow nucleation process, where the association of monomers is unfavorable in energetics. In principle, the enthalpy change for aggregation should compensate the entropy loss as new monomers attach to formed oligomers. However, the classical force fields with fixed point charges failed to yield the correct enthalpy change due to the lack of electrostatic polarization effect on amyloid aggregation. In this work, we performed molecular dynamics simulation for the full-length human islet amyloid using the polarized protein-specific charges and calculated the el
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The apicomplexan, Toxoplasma gondii, infects all warm-blooded animals as intermediate hosts but only felids as definitive hosts. Dense granule proteins are critical for the survival of Toxoplasma within host cells but, whilst these proteins have been studied intensively in tachyzoites, little is known about their expression in the coccidian stages in the cat intestine. Transcriptomic profiling indicates that two putative dense granule proteins, TgGRA11A and TgGRA11B, are expressed uniquely in merozoites. Immunofluorescent microscopy of Toxoplasma-infected cat intestine and tachyzoites engineer
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Multimeric naphthoquinones are redox-active compounds that exhibit antineoplastic, antiprotozoal, and antiviral activities. Due to their multimodal effect on perturbation of cellular oxidative state, these compounds hold great potential as therapeutic agents against highly proliferative neoplastic cells. In our previous work, we developed a series of novel dimeric naphthoquinones and showed that they were selectively cytotoxic to human acute myeloid leukemia (AML), breast and prostate cancer cell lines. We subsequently identified the oxidoreductase NAD(P)H dehydrogenase, quinone 1
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.