OBJECTIVE: To explore the natural mutations in Spike protein (S protein) of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and the changes of affinity between virus and associated receptors or drug molecules before and after the mutation based on whole length sequencing results.
METHODS: In the study, the bioinformatics analysis of all the published sequences of SARS-CoV-2 was conducted and thus the high frequency mutation sites were affirmed. Taking advantages of PolyPhen-2, the functional influence of each mutation in S protein was prospected. The 3D homologous modelling was p
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance in Neisseria gonorrhoeae has reached an alarming level, severely impacting the effective treatment of gonorrhea. Belonging to the resistance-nodulation-cell division (RND) superfamily of efflux transporters, the MtrD membrane protein of N. gonorrhoeae provides resistance to a broad range of antimicrobial compounds. A unique feature of MtrD is an 11-residue sequence (from N917 to P927 [N917-P927]) that connects transmembrane helices (TMS) 9 and 10; this sequence is not present in homologous RND proteins. This study explores the structural and functional roles of the N91
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology2017eng
BACKGROUND: White sponge nevus is a rare autosomal dominant disorder that affects the non-keratinised stratified squamous epithelium. Mutations in the genes that encode mucosa-specific keratin-4 and keratin-13 are strongly linked to the manifestation of white sponge nevus. This study involved mutational analysis of the genes encoding keratin-4 and keratin-13 in two Swedish families with white sponge nevus.
METHODS: The diagnosis of white sponge nevus was based on disease history, clinical characteristics of the lesions and, in the majority of the cases, histopathological examination. Samples
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epidemics of acute hemorrhagic conjunctivitis (AHC) caused by a coxsackievirus A24 variant (CA24v) appeared in Taiwan in 2000-2002 and again in 2006-2007.
OBJECTIVE: To analyze the molecular epidemiology of CA24v in recent outbreaks in Taiwan.
STUDY DESIGN: A 510bp fragment of 3C(pro) region was analyzed in 30 CA24v isolates during 2000-2007. Phylogenetic tree was constructed along with 130 CA24v isolates available from the GenBank. Moreover, the 235bp of 3'VP1 region was similarly analyzed in 15 randomly selected strains isolated during 1985-2007. Phylogenetic dendrogram was con
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study reports the occurrence of "Bartonella rochalimae" in Europe and the presence of Bartonella vinsonii subsp. berkhoffii genotypes II and III in dogs in southern Italy and provides DNA sequencing evidence of a potentially new Bartonella sp. infecting dogs in Greece and Italy.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HOXD13 is the most 5' of the HOXD cluster of homeobox genes in chromosome band 2q31.1. Heterozygous expansions of a polyalanine tract in HOXD13 are typically associated with synpolydactyly characterized by insertional digit duplication associated with syndactyly. We screened for mutations of HOXD13 in patients with a variety of limb malformations and identified a novel heterozygous mutation (758-2delA) in a three-generation family without the typical synpolydactyly phenotype in the hands, but with bilateral partial duplication of the 2nd metatarsals within the first web space of the feet. This
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sarcomatoid component occurs in various epithelial malignancies and is associated with an aggressive disease course and poor clinical outcome. As it is largely rare, the molecular events underlying sarcomatoid carcinomas (SCs) remain poorly characterised. Here, we performed targeted next-generation sequencing (NGS) on patients with surgically resected SCs comprising distinct tissues of origin.
METHODS: A total of 71 patients with pathological diagnosis of sarcomatoid carcinomas and underwent surgery were retrospectively enrolled in this study. Overall survival (OS) was defined as
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Due to the large size (150 kb) of the ataxia-telangiectasia mutated (ATM) gene and the existence of over 400 mutations, identifying mutations in patients with ataxia-telangiectasia (A-T) is labor intensive. We compared the SNP and STR haplotypes of A-T patients from varying ethnicities who were carrying common ATM mutations. We used SSCP to determine SNP haplotypes. To our surprise, all of the most common ATM mutations in our large multiethnic cohort were associated with specific SNP haplotypes, whereas the STR haplotypes varied, suggesting that ATM mutations predated STR haplotypes but not SN
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Proteins containing polyglutamine (polyQ) regions are found in almost all eukaryotes, albeit with various frequencies. In humans, proteins such as huntingtin (Htt) with abnormally expanded polyQ regions cause neurodegenerative diseases such as Huntington's disease (HD). To study how the presence of endogenous polyQ aggregation modulates polyQ aggregation and toxicity, we expressed polyQ expanded Htt fragments (polyQ Htt) in Schizosaccharomyces pombe In stark contrast to other unicellular fungi, such as Saccharomyces cerevisiae, S. pombe is uniquely devoid of proteins with more than
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uncoupling proteins (UCPs) are mitochondrial membrane transporters which are involved in dissipating the proton electrochemical gradient thereby releasing stored energy as heat. This implies a major role of UCPs in energy metabolism and thermogenesis which when deregulated are key risk factors for the development of obesity and other eating disorders. Recent studies have shown that the sympathetic nervous system, via norepinephrine (beta-adrenoceptors) and cAMP, as well as thyroid hormones and PPAR gamma ligands seem to be major regulators of UCP expression. From the three different UCPs ident
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein O-glucosyltransferase 1 (POGLUT1/Rumi) transfers an O-linked glucose (O-Glc) monosaccharide from UDP-Glc to a serine residue in epidermal growth factor (EGF)-like repeats with a specific consensus sequence. In mammals, GXYLT1 and GXYLT2 transfer xylose to this O-Glc monosaccharide. Previous studies showed that Poglut1 deletion in mice leads to embryonic lethality with defects in crumbs family member 2 (CRB2) trafficking and NOTCH1 signaling. Both CRB2 and Notch receptors have multiple EGF repeats with the O-Glc modification site. However, the roles of xylosyl elongation of O-Glc in pro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For many neurodevelopmental disorders, genetic treatment discovery is complicated by non-homology between human and non-human model system genomes. Antisense oligonucleotides (ASOs) influence protein expression by sequence-specific binding of RNA, resulting in targeted degradation or alternative splicing, and thereby provide a promising avenue for clinical therapeutics. Angelman Syndrome (AS), caused by loss-of-function of maternal UBE3A, has emerged as a monogenic neurodevelopmental disorder for which ASO therapy might be particularly amenable due to genomic imprinting. In an AS mouse model,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peptides alone often exhibit limited immunogenicity, necessitating the development of effective antigen delivery systems to facilitate recognition and presentation, ultimately eliciting robust immune responses and activating T and B lymphocytes. Filamentous bacteriophages, such as M13, are recognized as efficient platforms for peptide expression and presentation via their capsid surfaces. The conserved amino acid sequence HA2 1-9 (GLFGAIAGF) from the haemagglutinin (HA) transmembrane protein of Influenza A virus (IAV) has been identified as a promising immunogen for eliciting broad-spectrum im
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterovirus A71 (EV-A71), the primary causative agent of hand, foot, and mouth disease (HFMD), can cause severe neurological complications and even death, particularly in young children. Despite the availability of inactivated vaccines, their protective efficacy has been compromised due to frequent intra- and intertypic recombination events and ongoing mutations among circulating EV-A71 strains. To address this, we employed immunoinformatic approaches and identified conserved epitopes and constructed a multi-epitope vaccine (MEV) candidate against EV-A71. A total of 1,627 structural protein se
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porcine Rotavirus (PoRV), a predominant causative agent of neonatal diarrhea in piglets, shares substantial genetic homology with human rotavirus and represents a considerable threat to both public health and the global swine industry in the absence of specific antiviral interventions. The VP6 protein, an internal capsid component, is characterized by exceptional sequence conservation and robust immunogenicity, rendering it an ideal candidate for viral genotyping and vaccine development. In the present study, the recombinant plasmid pET28a(+)-VP6 was engineered to facilitate the high-yield exp
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mitochondrial genomes of apicomplexans comprise merely three protein-coding genes, alongside a set of thirty to forty genes encoding small RNAs (sRNAs), many of which exhibit homologies to rRNA from E. coli. The expression status and integration of these short RNAs into ribosomes remains unclear and direct evidence for active ribosomes within apicomplexan mitochondria is still lacking. In this study, we conducted small RNA sequencing on the apicomplexan Toxoplasma gondii to investigate the occurrence and function of mitochondrial sRNAs. To enhance the analysis of sRNA sequencing outcomes,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mitochondrial DNA (mtDNA) genetic variation is associated with neurocognitive (NC) impairment (NCI) in people with HIV (PWH). Other approaches use sequence conservation and protein structure to predict the impact of mtDNA variants on protein function. We examined predicted mtDNA variant pathogenicity in the CHARTER study using MutPred scores, hypothesizing that persons with higher scores (greater predicted pathogenicity) have more NCI.
METHODS: CHARTER included NC testing in PWH from 2003 to 2007. MutPred scores were assigned to CHARTER participants with mtDNA sequence; any score
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parainfluenza virus type 3 (PIV-3) and coronaviruses (CoV) are commonly found in respiratory tracts of ruminants and capable of causing clinical disease. Here, we investigated the cause of ill-thrift and sudden death in a five-month-old male fallow deer which occurred in December 2019. The calf was one of the five calves in a herd of 170 deer that, along with three adult hinds, died during a 2-week period. The deer calves were in a shed, sharing airspace with young cattle that had been reported to be coughing. Significant gross pathology was observed in the respiratory and alimentary tracts of
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hearing loss (HL) is the most common sensory defect and affects 450 million people worldwide in a disabling form. Pathogenic sequence alterations in the POU3F4 gene, which encodes a transcription factor, are causative of the most common type of X-linked deafness (X-linked deafness type 3, DFN3, DFNX2). POU3F4-related deafness is characterized by a typical inner ear malformation, namely an incomplete partition of the cochlea type 3 (IP3), with or without an enlargement of the vestibular aqueduct (EVA). The pathomechanism underlying POU3F4-related deafness and the corresponding transcriptional t
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ongoing pandemic of COVID-19 caused by the SARS-COV2 virus has triggered millions of deaths around the globe. Emerging several variants of the virus with increased transmissibility, the severity of disease, and the ability of the virus to escape from the immune system has a cause for concerns. Here, we compared the spike protein sequence of 91 human SARS CoV2 strains of Iraq to the first reported sequence of SARS-CoV2 isolate from Wuhan Hu-1/China. The strains were isolated between June 2020 and March 2021. Twenty-two distinct mutations were identified within the spike protein regions whic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.