Selenocysteine (Sec), the 21st amino acid, combines the structural compatibility of cysteine with the unique chemical properties of selenium, enabling exceptional redox and catalytic performance in both natural and engineered systems. Its low pKa, high nucleophilicity, and increased polarizability underpin the activity of selenoproteins involved in antioxidant defence, redox regulation, and metabolic processes. This work integrates biochemical, structural, and evolutionary perspectives on Sec with advances in protein engineering and synthetic biology, where strategic Sec incorporation in place
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ability to predict the three-dimensional structure of a protein from its amino acid sequence has potential to provide insights into its function, and in the context of disease, its pathogenic mechanisms and potential drug targets. Artificial intelligence (AI)-driven algorithms, particularly AlphaFold and RoseTTAFold, have revolutionized the field of protein modelling, enabling rapid, high-confidence predictions of protein structures. In nephrology, these advances have clarified the molecular architecture of key renal systems such as podocyte slit diaphragm complexes, the conformational sta
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transient receptor potential melastatin 1 (TRPM1) is a membrane protein essential for vision in dim light, and mutations in TRPM1 cause complete congenital stationary night blindness. Although TRPM1 shares sequence similarity to other TRPM ion channels such as TRPM3, whether it independently functions as an ion channel remains controversial. This controversy is largely caused by TRPM1's challenging biochemical behaviors that prevent detailed molecular characterization. In this work, we isolate TRPM1 and determine its structures using cryogenic electron microscopy (cryo-EM). The structures reve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein-RNA phase separation is at the center of membraneless biomolecular condensates governing cell physiology and pathology. Using an archetypical viral protein-RNA condensation model, we determined the sequence of events that starts with sub-second formation of a protomer with two RNAs per protein dimer. Association of additional RNA molecules to weaker secondary binding sites in this protomer kickstarts crystallization-like assembly of a molecular condensate. Primary nucleation is faster than the sum of secondary nucleation and growth, which is a multistep process. Protein-RNA nuclei grow
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A diverse subset of cyanobacteria can transiently modify their photosynthetic machinery during far-red light photoacclimation to drive photosynthesis with less energetic photons (700 nm-800 nm). To achieve this, all the main light-driven components of the photosynthetic apparatus, including their allophycocyanin antenna, are replaced with red-shifted paralogues. Recent studies based on the structure of an incomplete complex provided some insights into the tuning of the far-red phycobiliproteins. Here, we solved the structure of the intact bicylindrical allophycocyanin complex from the cyanobac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The classification of novel protein folds remains a central challenge in structural bioinformatics, particularly as deep learning models like AlphaFold2 dramatically expand the universe of predicted protein structures. In this study, we investigated 664 candidate novel fold (CNF) domains from the TED database that both TED and DPAM methods had classified with low confidence. These CNFs span a structurally diverse and largely non-redundant set of domains, most of which lack clear sequence or structural similarity to known folds. Many CNFs appear as insertions into known transmembrane or enzymat
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In response to various intracellular stress or damage-associated signals, inflammasomes can be activated and trigger a pyroptotic cell death process through the sequential assembly of structurally compatible and interacting filamentous oligomers involving the pyrin domains (PYD) of important inflammasome components. The PYD-containing interferon-inducible protein 16 (IFI16) has been suggested as a viral DNA sensor that can induce inflammasome formation, but it also has other inflammasome-independent functions, including interferon production. Here, the cryo-EM structure of the filament assembl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The accumulation of alpha-synuclein (Asyn) fibrils is the defining pathologic feature in Parkinson's disease, Lewy body dementia, and multiple system atrophy. As such, the process of Asyn fibril formation has been an important research area and fibrils themselves have become attractive targets for disease diagnosis and therapeutic intervention. Due to the presence of mixed populations of fibrillar proteins associated with neurodegenerative diseases in brain tissue, high-resolution structures of Asyn fibrils are essential for the design of high-specificity imaging and therapeutic agents. Approx
СтатьяОбзорПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Muscle-type nicotinic acetylcholine receptor (AChR) is the key signaling molecule in neuromuscular junctions. Here, we present the structures of full-length human adult receptors in complex with Fab35 in α-bungarotoxin (αBuTx)-bound resting states and ACh-bound desensitized states. In addition to identifying the conformational changes during recovery from desensitization, we also used electrophysiology to probe the effects of eight previously unstudied AChR genetic variants found in patients with congenital myasthenic syndrome (CMS), revealing they cause either slow- or fast-channel CMS charac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Persistent organic compounds, also known as "forever chemicals", present serious risk to both the human and environmental health because of their enduring stability, bioaccumulation, and long-range mobility. This study evaluates the capability of C4N3 as a sensitive and selective detecting nanomaterial for the sensing of POPs, utilizing DFT (density functional theory). Adsorption energies of benz[a]anthracene (BA), chrysene (CR), 3,3',4,4'-tetrachlorobiphenyl (TP), and 3,3',4,4'-tetrachlorodiphenyl ether (TD) on C4N3 were calculated, giving moderate values of -21.15, -7.0, -15.09, and -19.27 k
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurately predicting protein-ligand binding affinities is a central task in rational drug design, as it directly influences hit discovery, lead optimization, and compound prioritization. Traditional approaches often suffer from limited accuracy, high computational cost, or dependence on heuristic scoring functions. Recent advances in machine learning (ML) have introduced new paradigms for the binding affinity prediction. In this review, we survey the latest developments in ML-based predictions of protein-ligand binding affinities across various directions, including structure-based approaches
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pharmaceutical pollutants such as Diclofenac and Naproxen are emerging environmental contaminants due to their persistence and potential biological hazards. In this study, pristine and functionalized Kekulene nanorings (KNRs) were theoretically explored as novel adsorbents using density functional theory (DFT). Various functional groups (-COOH, -NO2, -NO, -N, -O, -S) were introduced to modulate the interaction with drug molecules. Adsorption energy (Ea) calculations confirmed spontaneous physisorption across all systems, with values ranging from -2.473 to -0.441 eV. Notably, the KNR-NO2-N syst
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbon dioxide (CO2) capture is crucial to address both energy and environmental challenges. In this study, density functional theory (DFT) calculations are performed to investigate the adsorption behaviour of the CO2 molecule on pristine (P-XO2) and vacancy-defective (V-XO2) XO2 (X = Pd, Pt) monolayers (MLs). XO2 MLs exhibit a semiconducting natureand to study vacancies, we created X monovacancy (VX-XO2), O monovacancy (VO-XO2), and X-O divacancy (VX/O-XO2). Our findings reveal that CO2 adsorbs physically on PdO2 and PtO2 MLs with adsorption energies (Ead) of -18.67 and -19.83 kJ/mol, respect
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This work investigates theoretically the activation and directing effects in a fluorinated allenic system, 1-(5,5-difluoropenta-3,4-dienyl)benzene (FPB), during a Cu+-catalyzed cycloaddition reaction with phenyl nitrile oxide (NO). The FPB…Cu+ interactions were studied and it was found coordination of Cu+ ion to the central carbon atom of the allenic system and a cation-π interaction in the most stable complex. Four potential possible reaction paths were considered between FPB and NO and the computational results corroborated the experimental findings, indicating that the formation of CA-2 is
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-particle cryo-electron microscopy (cryo-EM) has become a very powerful technique in the field of membrane protein structural biology. Historically, protein structure determination requires homogenous and pure samples, and sample heterogeneity often hampered the progress of drug design and development, especially those targeting membrane proteins and their complexes. With the rapid development of the instrumentation, software and methodologies of cryo-EM, it is now feasible to obtain high-resolution cryo-EM structural information of membrane proteins, from both pure/homogeneous and impur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary malignant tumors of small bowel constitute only about 1-2% of all gastrointestinal neoplasms. Although neuroendocrine tumors (NETs) are relatively rare, they still represent the second most common malignancy of the small bowel (after adenocarcinoma). Clinical manifestations include abdominal pain, bowel obstruction, diarrhea, weight loss and bleeding. The differential diagnosis of obscure gastrointestinal bleeding can sometimes be challenging for endoscopy as well as for radiology methods. We present the case of an 80-year-old man suffering from severe hypochromic anemia. Routine endos
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Apicomplexan parasites, responsible for toxoplasmosis, cryptosporidiosis and malaria, invade host cells through a unique gliding motility mechanism powered by actomyosin motors and a dynamic organelle called the conoid. Here, using cryo-electron microscopy, we determined structures of four essential complexes of the Toxoplasma gondii conoid: the preconoidal P2 ring, tubulin-based conoid fibers, and the subpellicular and intraconoidal microtubules. Our analysis identified 40 distinct conoid proteins, several of which are essential for parasite lytic growth, as revealed through genetic disruptio
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ferritins are ubiquitous and play a critical role in iron homeostasis. They are classified into four main subfamilies: classical, bacterial, bacterioferritin, and Dps. These are characterized by subunits with a four-helical bundle domain and interact through three distinct regions-one antiparallel interface (IntA) and two perpendicular interfaces (IntB and IntC), collectively forming a cage-like structure. Here, we attempt to characterize the variability of these interfaces across subfamilies. We found that IntA is essential for the dimeric unit assembly and is likely to assemble first, follow
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloidogenic transthyretin (ATTR) amyloidosis is a systemic disease characterized by the deposition of amyloid fibrils made of transthyretin. Transthyretin is primarily produced in tetrameric form by the liver, but also by retinal epithelium and choroid plexus. The deposition of these fibrils in the myocardium and peripheral nerves causes cardiomyopathies and neuropathies, respectively. Using cryoelectron microscopy (cryo-EM), we investigated fibrils extracted from cardiac and nerve tissues of an ATTRv-V30M patient. We found consistent fibril structures from both tissues, similar to cardiac f
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Butyrylcholinesterase (BChE) is a target of interest in late-stage Alzheimer's Disease (AD) where selective BChE inhibitors (BIs) may offer symptomatic treatment without the harsh side effects of acetylcholinesterase (AChE) inhibitors. In this study, we explore multiple machine learning strategies to identify BIs in silico, optimizing for precision over all other metrics. We compare state-of-the-art supervised contrastive learning (CL) with deep learning (DL) and Random Forest (RF) machine learning, across single and sequential modeling configurations, to identify the best models for BChE sele
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования