UNLABELLED: Our knowledge of the nitrogen cycle has been advanced by the discovery of anammox bacteria, ammonia-oxidizing archaea, and comammox bacteria, along with their high diversity. Direct ammonia oxidation (dirammox), a recently discovered heterotrophic nitrification pathway, converts ammonium and organic nitrogen directly to N2 through the DnfABC multienzyme system, further expanding our understanding of the nitrogen cycle. However, the taxonomic distribution, prevalence, and nitrogen metabolic potential of microorganisms encoding dirammox genes remain poorly understood. Here, large-sca…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present a multi-organism, ground-truth metaproteomic dataset generated using data-dependent acquisition Parallel Accumulation-Serial Fragmentation (ddaPASEF) and data-independent acquisition (diaPASEF) on a trapped ion mobility mass spectrometer. The dataset comprises 28 species (30 strains) spanning Archaea, Bacteria, Eukarya, and bacteriophages, assembled into an uneven mock community with a 400-fold dynamic range of organismal abundance. Four biological replicates were processed using a standardized sample preparation workflow and analyzed using described LC-MS conditions. Raw data, sear…
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Radiotherapy failure often arises from tumor repopulation by treatment-resistant cancer cells. Following irradiation, cancer cells can undergo endoreplication to form polyploid giant cancer cells (PGCCs)-radiation-persistent cells capable of generating progeny through a virus-like asymmetric budding process. While such membrane budding is evolutionarily conserved across archaea, viruses, and eukaryotic cells, its molecular mechanism in cancer remains poorly defined. Here, a radiation-induced SNCG-FLOT2-CHMP4B signaling axis is identified as a key regulator of PGCC budding. Mechanistically, ASA…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The presence of recalcitrant organic compounds in oilfield-produced-water poses significant challenges for conventional biological treatment … syntrophic interactions between iron-reducing bacteria (Trichococcus and Bacillus) and methanogenic archaea (Methanobacterium and Methanomethylovorans), thereby facilitating the biodegradation of long-chain hydrocarbons (e.g., eicosane and nonadecane). Further metabolic function analysis identified long-chain-fatty-acid CoA ligase (EC 6.2.1.3) as a key en …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitotic chromosome condensation, sister chromatid cohesion, and higher order folding of interphase chromatin are mediated by condensin and c … (Kleisin interacting winged-helix tandem elements), interact with Smc-kleisin rings from bacteria, archaea and the eukaryotic Smc5-6 complex, but not with either condensin or cohesin [2]. These instead possess proteins containing HEAT (Huntingtin/EF3/PP2A/Tor1) repeat domains whose origin and distribution have not yet been characterized. Using a combinat …
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR)-CRISPR-associated (Cas) systems in bacteria and archaea provide adaptive immunity against invading foreign nucleic acids. Previous studies suggest that certain bacteria employ their Type II CRISPR-Cas systems to target their own genes, thus evading host immunity. However, whether other CRISPR-Cas systems have similar functions during bacterial invasion of host cells remains unknown. Here we identify a novel role for Type I CRISPR-Cas systems in evading host defenses in Pseudomonas aeruginosa strain UCBPP-PA14. The Type I CRISPR…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 20 S proteasome is a ubiquitous, barrel-shaped protease complex responsible for most of cellular proteolysis, and its reduced activity is thought to be associated with accumulations of aberrant or misfolded proteins, resulting in a number of neurodegenerative diseases, including amyotrophic lateral sclerosis, spinal and bulbar muscular atrophy, Parkinson disease, and Alzheimer disease. The 20 S proteasomes of archaebacteria (archaea) are structurally simple and proteolytically powerful and thought to be an evolutionary precursor to eukaryotic proteasomes. We successfully reproduced the arc…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neelaredoxin, a small non-heme blue iron protein from the sulfate-reducing bacterium Desulfovibrio gigas [Chen, L., Sharma, P., LeGall, J., … of genomic data shows that neelaredoxin-like putative polypeptides are present in strict anaerobic archaea, suggesting that this is a primordial superoxide dismutase. The three proteins encoded in this operon may be involved in the oxygen-sensing mechanisms of this anaerobic bacterium, indicating a possible transcriptional mechanism to sense and respond …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The complete amino acid sequence of the hydantoinase from Arthrobacter aurescens DSM 3745 has been derived by automated Edman degradation. T … e families developed very early in evolution, probably prior to the formation of the three domains, Archaea, Eukarya and Bacteria. Hydantoinases related to ATP-dependent N-methylhydantoinases (EC 3.5.2.14) or 5-oxoprolinases (EC 3.5.2.9) do not belong to this superfamily.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extreme acidic environments represent natural laboratories for investigating the mechanisms of microbial community assembly, yet the ecological processes structuring these communities remain incompletely understood. Here, we investigate how spatial partitioning, hydrodynamics, and colonization history shape microbial succession in a unique sulfur-rich, acidic river of volcanic origin in northern Patagonia. We combined 16S rRNA gene profiling and shotgun metagenomics with a multi-scale experimental framework encompassing water column fractionation and colonization assays under native and contro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel methanogenic strain, CaP3V-MF-L2AT, was isolated from an exploratory oil well from Cahuita National Park, Costa Rica. The cells were irregular cocci, 0.8-1.8 μm in diameter, stained Gram-negative and were motile. The strain utilized H2/CO2, formate and the primary and secondary alcohols 1-propanol and 2-propanol for methanogenesis, but not acetate, methanol, ethanol, 1-butanol or 2-butanol. Acetate was required as carbon source. The novel isolate grew at 25-40 °C, pH 6.0-7.5 and 0-2.5% (w/v) NaCl. 16S rRNA gene sequence analysis revealed that the strain is affiliated to the genus Metha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, a continuous flow experiment was conducted in which a lab-scale upflow anaerobic sludge blanket (UASB) reactor at psychrophilic conditions (18-19°C) was fed with artificial wastewater, containing tetramethylammonium hydroxide (TMAH) and isoplophyl alcohol (IPA), from the electronics industry. This was done to evaluate process performance and microbial properties of the granular sludge that was retained in the reactor. The inoculated granular sludge was precultured with IPA containing wastewater but not TMAH; as a result, no degradation was observed in 30 days of operation. To en
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cadmium ion (Cd(2+)) toxicity on anaerobic systems, used for organic matter removal, was assessed by studying its effect on kinetic parameters and metabolic changes. This fundamental study was performed in a continuous fixed bed anaerobic bioreactor that treated synthetic wastewater simulating domestic sewage. The biomass was immobilized on a fixed bed made of polyurethane foam. Under influent cadmium concentrations of 0.0, 0.4, 4.4 and 6.2 mg Cd(2+) L(-1) the organic matter removal efficiencies were 84%, 82%, 72% and 52%, respectively. At influent concentration of 6.2 mg Cd(2+) L(-1) the reac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The global rise of antimicrobial resistance has significantly increased the difficulty treating infectious agents, creating an urgent need f … sms of action. Bacteriocins are antimicrobial peptides produced ribosomally by certain bacteria and archaea, capable of inhibiting the growth of similar pathogens through distinct modes of action. These peptides have been utilized in both human and veterinary medicine, as well as in agriculture, where they help in preventing unwanted growth of microorgani …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extremely acidophilic iron- and sulfur-oxidizing bacteria and archaea are used in the processing of different sulfide ores and concentrates (biohydrometallurgical technologies); therefore, studying their metabolic pathways and regulation is an urgent task. Thus, the goal of this work was to compare differential gene expression in the thermoacidophilic archaeal strain, representative of the genus Acidiplasma, a predominant microbial group in bioleach reactors, during growth in the presence of ferrous iron and elemental sulfur as well as pyrite and arsenopyrite, which are the most widespread sul…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gastrointestinal tract contains a diverse microbiome consisting of bacteria, fungi, viruses and archaea. Although these microbes usually reside as commensal organisms, it is now well established that higher abundance of specific bacterial or fungal species, or loss of diversity in the microbiome can significantly affect development, progression and outcomes in disease. Studies have mainly focused on the effects of bacteria, however, the impact of other microbes, such as fungi, has received increased attention in the last few years. Fungi only represent around 0.1% of the total gut microbia…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The methylerythritol phosphate (MEP) pathway is responsible for biosynthesis of the precursors of isoprenoid compounds in eubacteria and plastids. It is a metabolic alternative to the well-known mevalonate pathway for isoprenoid production found in archaea and eukaryotes. Recently, a role for the MEP pathway in oxidative stress detection, signalling, and response has been identified. This role is executed in part through the unusual cyclic intermediate, methylerythritol cyclodiphosphate (MEcDP). We postulate that this response is triggered through the oxygen sensitivity of the MEP pathway's te…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thermococcales, a major order of hyperthermophilic archaea inhabiting iron- and sulfur-rich anaerobic parts of hydrothermal deep-sea vents, are known to induce the formation of iron phosphates, greigite (Fe3S4) and abundant quantities of pyrite (FeS2), including pyrite spherules. In the present study, we report the characterization of the sulfide and phosphate minerals produced in the presence of Thermococcales using X-ray diffraction, synchrotron-based X ray absorption spectroscopy and scanning and transmission electron microscopies. Mixed valence Fe(II)-Fe(III) phosphates are interpreted as …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteriorhodopsin (BR) is a light-driven outward proton pump found mainly in halophilic archaea. A BR from an archaeon Haloquadratum walsbyi (HwBR) was found to pump protons under more acidic conditions compared with most known BR proteins. The atomic structural study on HwBR unveiled that a pair of hydrogen bonds between the BC and FG loop in its periplasmic region may be a factor in such improved pumping capability. Here, we further investigated the retinal-binding pocket of HwBR and found that Trp94 contributes to the higher acid tolerance. Through single mutations in a BR from Halobacteriu…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The key problem in human infectious diseases was posed at the turn of the 20th century: their pathogenesis. For almost any given virus, bact … lly, because the emergence and evolution of eukaryotes alongside more rapidly evolving prokaryotes, archaea, and viruses posed immunological challenges of an ecological and evolutionary nature. We need to study these challenges in natural, as opposed to experimental, conditions, and also at the molecular and cellular levels. According to the human genetic …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования