INTRODUCTION: Infections caused by pathogenic fungi such as Candida albicans have led to a continuous increase in disease morbidity and mortality, underscoring the urgent need for safer and more effective antifungal therapies. Current antifungal drugs are limited by toxicity and resistance, highlighting the necessity for innovative discovery strategies.
OBJECTIVES: The aim of this study was to identify novel antifungal compounds using a integrative computational approach targeting C. albicans CYP51 (14-α-sterol demethylase). Specifically, we sought to screen the Traditional Chinese Medicine S
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Developing high-affinity ligands targeting TDP-43 amyloid species is a potential therapeutic approach for amyotrophic lateral sclerosis (ALS). Here, we propose an integrated computational simulation strategy, which integrates multiple virtual screening methods, molecular dynamics simulations and binding free energy evaluations. Using this strategy, we successfully identified TDPL1, a high-affinity ligand for TDP-43 amyloid proteins. In vitro affinity assays confirmed the computational predictions. Based on the MD simulation results, we further investigated the binding mode between TDPL1 and TD
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infection of hosts by morbilliviruses is facilitated by the interaction between viral hemagglutinin (H-protein) and the signaling lymphocytic activation molecule (SLAM). Recently, the functional importance of the n-terminal region of human SLAM as a measles virus receptor was demonstrated. However, the functional roles of this region in the infection process by other morbilliviruses and host range determination remain unknown, partly because this region is highly flexible, which has hampered accurate structure determination of this region by X-ray crystallography. In this study, we analyzed th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An understanding of the fate of organic compounds originating from plants in soil is crucial for determining their persistence and concentrations in the environment. Aristolochic acids are believed to be the causal agents that induce Balkan endemic nephropathy by food contamination through soil adsorption of humic acids, major components of soil. Aristolochic acids are active chemicals in Aristolochia plant species found in endemic villages. In this article, molecular structure interactions between 18 structures of aristolochic acids with an inserted humic acid structure were studied. These st
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the companion article (Giovannelli et al., 10.1021/acs.jctc.7b00594), we presented an alchemical approach, based on nonequilibrium molecular dynamics simulations, to compute absolute binding free energies of a generic host-guest system. Two alternative computational routes, called binded-domain and single-point alchemical-path schemes, have been proposed. This study is addressed to furnish numerical validation and illustrative examples of the above-mentioned alchemical schemes. Validation is provided by comparing binding free-energy data relative to two poses of a Zn(II)·anion complex with
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A water surface is a dynamic and constantly evolving terrain producing a vast array of unique molecular properties and interactions with chemical species in the environment. The complex dynamics of water surfaces permit life on earth to continue, but also complicate the development of a complete microscopic picture of the specific behaviors that take place within interfacial aqueous environments. This computational study examines a piece of the water puzzle by elucidating the bonding, dynamic interactions, and hydrate structures of sulfur dioxide gas adsorbing to a water cluster. Results descr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA strand displacement reactions provide a promising approach for implementing information processing and have been successfully used for encoding combinational logic. However, the construction of circuits with state-dependent behavior and clock-controlled operation remains a significant challenge. In this paper, we present a programmable DNA circuit platform capable of emulating digital sequential logic elements, including a Set-Reset (SR) latch, a clocked Data (D) flip-flop, and a two-bit binary counter. These molecular devices are realized through hierarchically designed DNA strand displac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Researchers are investigating the medicinal properties of herbal plants throughout the world, which often leads to the discovery of novel plants and their chemicals for prophylactic needs of humans. Natural phytochemicals continue to be sought as alternative treatments for various diseases because of their non-toxic and therapeutic properties. In recent years, computational phytochemistry has enabled large-scale screening of phytochemicals, enabling researchers to pursue a wide range of therapeutic research alternatives to traditional ethnopharmacology. We propose to identify an anti-diabetic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Chiranthodendron pentadactylon Larreat is frequently used in Mexican traditional medicine as well as in Guatemalan for several medicinal purposes, including their use in the control of diarrhea.
AIM OF THE STUDY: This work was undertaken to obtain additional information that support the traditional use of Chiranthodendron pentadactylon Larreat, on pharmacological basis using the major antisecretory isolated compound from computational, in vitro and in vivo experiments.
MATERIALS AND METHODS: (-)-Epicatechin was isolated from ethyl acetate fraction of the plant
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The self-assembly of matter into ordered structures is ubiquitous throughout nature and engineered systems. Programming a material's macroscopic properties via molecular-level structural control is a grand scientific challenge, requiring methods for inverse design that can design a targeted molecule to achieve a given self-assembled structure. One model system that serves as a common proving ground for inverse design algorithms is block copolymers. In these systems, self-consistent field-theory (SCFT) provides a robust thermodynamic model for predicting self-assembly for a given molecular sequ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Janus kinase (JAK)/STAT signaling pathway plays a pivotal role in cancer biology as well as in inflammatory and autoimmune disorders such as psoriasis. Recent advances in biomedical research and targeted therapies have highlighted the importance of computational approaches for accelerating the discovery of selective kinase inhibitors. This study aimed to develop a robust computational framework for predicting the inhibitory potency of JAK2 ligands and for analyzing their binding interactions using structure-based methods. A curated dataset of 1869 chemically valid JAK2 ligands with experim
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The growing demand for sustainable food systems has accelerated research into alternative proteins derived from plant sources, microorganisms, insects, and cultured animal cells. These protein systems offer promising solutions to environmental, ethical, and nutritional challenges associated with conventional livestock production. However, designing and optimizing alternative proteins requires deep understanding of molecular structures, biochemical properties, and production processes. Computational biology has emerged as a powerful approach to address these challenges by enabling predictive mo
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Determination of potential drug toxicity and side effect in early stages of drug development is important in reducing the cost and time of drug discovery. In this work, we explore a computer method for predicting potential toxicity and side effect protein targets of a small molecule. A ligand-protein inverse docking approach is used for computer-automated search of a protein cavity database to identify protein targets. This database is developed from protein 3D structures in the protein data bank (PDB). Docking is conducted by a procedure involving multiple conformer shape-matching alignment o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-adiabatic coupling matrix elements (NACMEs) are important in quantum chemistry, particularly for molecular dynamics methods such as surface hopping. However, NACMEs are gauge dependent. This presents a difficulty for their calculation in general, where there are no restrictions on the gauge function except that it be differentiable. These cases are relevant for complex-valued electronic wave functions, such as those that arise in the presence of a magnetic field or spin-orbit coupling. In addition, the Berry curvature and Berry force play an important role in molecular dynamics in a magnet
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this research, we present a preliminary computational study of four Dermaseptin-related peptides from the skin exudate of the gliding tree frog Agalychnis spurrelli. Experimentally, the amino acid sequence of these peptides was elucidated through molecular cloning and tandem mass spectrometry and synthetic peptides were assayed against E. coli, S. aureus, and C. albicans to determine their antimicrobial properties. With the sequences on hand, a computational study of the structures was carried out, obtaining their physicochemical properties, secondary structure, and their similarity to othe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Network biology provides a systems-level framework for understanding how interactions among molecular components, cells, microbial communities, tissues, and organs generate biological function and disease phenotypes. Recent advances in multiomics, single-cell and spatial profiling, network inference, organoid and organ-on-chip technologies, computational modeling, and artificial intelligence have shifted the field from static molecular maps toward dynamic, multiscale, and predictive network models. Major branches include molecular interaction networks, intracellular regulatory networks, single
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vestibular schwannoma (VS) is the most common tumour of the cerebellopontine angle and poses a significant morbidity for patients. While many exhibit benign behaviour, others have a more aggressive nature and pattern of growth. Predicting who will fall into which category consistently remains uncertain. There is a need for a better understanding of the molecular landscape, and important subgroups therein, of this disease.
METHODS: We select all vestibular schwannomas from our tumour bank with both methylation and RNA profiling available. Unsupervised clustering methods were used t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present herein two complementary theoretical approaches for analyzing the transmission pathways of indirect nuclear spin-spin couplings in high-resolution nuclear magnetic resonance. This phenomenon is notably conceptually poorly understood in complex experimental situations in which both nonbonded ["through-space" (TS)] and more "classical" bonding ("through-bond") spin-spin coupling pathways are potentially involved. The computational approaches we propose allow the visualization and discussion of individual transmission pathways and estimation of their relative weight from numerical cont
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Larsen syndrome (LRS) is a rare genetic disease associated with variable manifestations including skeletal malformations, dislocations of the large joints, and notable changes in facial and limb features. Genetic variants in the Filamin B (FLNB) gene are associated with the development of LRS. We searched two literature databases (OMIM and PubMed) and three gene variant databases (HGMD, UniProt, & dbSNP) to capture all the possible variants associated with LRS phenotype, which may have an impact on the FLNB function. Our search yielded 77 variants that might impact the FLNB protein function in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Dysregulated melanogenesis underpins numerous hyperpigmentation disorders. Gancidin W, a naturally occurring diketopiperazine with diverse biological activities, has attracted interest as a potential bioactive compound; however, its role in melanogenesis remains largely unexplored. This study aimed to evaluate the anti-melanogenic potential of Gancidin W through an integrated experimental and computational approach. Methods: Network pharmacology analysis was performed to investigate the potential molecular mechanisms of Gancidin W against hyperpigmentation. The cellular
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования