The genome of enterobacterial phage T1 has been sequenced, revealing that its 50.7-kb terminally redundant, circularly permuted sequence contains 48,836 bp of nonredundant nucleotides. Seventy-seven open reading frames (ORFs) were identified, with a high percentage of small genes located at the termini of the genomes displaying no homology to existing phage or prophage proteins. Of the genes showing homologs (47%), we identified those involved in host DNA degradation (three endonucleases) and T1 replication (DNA helicase, primase, and single-stranded DNA-binding proteins) and recombination (Re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostasomes are secretory particles in human seminal fluid. Other than a microscopic description of these secretory particles and an incomplete two-dimensional gel electrophoresis (2DE) study, little is known about the composition of proteins in prostasomes.
METHODS: We employed a direct iterative approach using Gas phase fractionation and microcapillary HPLC-tandem mass spectrometry (microLC-MS/MS) to catalogue the prostasome proteome.
RESULTS: We identified 139 proteins that can be divided into the following categories: (1). enzymes (33.8% of total), (2). transport/structural (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Late-onset depression (LOD) is a common subtype of depression in the elderly, characterized by high disability and recurrence rates, along w … ffects of aging and stress on depressive-like behaviors, and combined this with cerebrospinal fluid proteomics to explore potential protein correlates and provide experimental evidence for identifying candidate therapeutic targets. In terms of results, aging and stress exhibited a synergistic association with depressive-like behaviors in LOD rats, and enrich …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Blood-based biomarkers could facilitate early detection and severity monitoring for Parkinson's disease (PD), yet the relative diagnostic utility of proteomic versus transcriptomic signals and the added value of multimodal integration under cross-cohort transfer remain unclear. We trained diagnostic classifiers (PD versus healthy control) using targeted plasma proteomics (Olink) and whole-blood RNA sequencing from a development cohort under participant-grouped cross-validation with nested preprocessing, then externally validated models on an independent cohort. RNA-only models were benchmarked…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Autism spectrum disorder (ASD) is a heterogeneous neurodevelopmental disorder with incompletely elucidated underlying biological mechanisms. Circulating proteins serve as an intermediate molecular layer linking genetic variation to downstream biological processes. This study aimed to systematically investigate the causal associations between the plasma proteome and ASD risk, followed by multi-omic and clinical validation.
METHOD: Two-sample Mendelian randomization (MR) was performed to screen 1124 plasma proteins for potential causal links with ASD. Genetically prioritized protein
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hypertension is a major cardiovascular risk factor with an incompletely understood cause. We aimed to unravel its proteomic landscape and investigate potential molecular mechanisms underlying its risk related to modifiable exposures.
METHODS: Leveraging protein quantitative trait loci from 3 biobank-scale studies (deCODE, Fenland, and UKB-PPP [UK Biobank Pharma Proteomics Project]) based on distinct proteomic platforms (SomaScan or Olink), we performed proteome-wide Mendelian randomization to identify and cross-platform validate proteins causally associated with hypertension and b…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plaque heterogeneity underlies the propensity of atherosclerotic lesions to rupture and trigger cardiovascular events. Most proteomic studies examine bulk changes, obscuring key spatial differences in protein abundance. We report a high-resolution spatial proteomics workflow exploring the molecular landscape of human plaques and a murine myocardium. By combining laser capture microdissection with high-sensitivity ion-mobility mass spectrometry, spatial profiling of cellular and extracellular matrix (ECM) proteomes was achieved. Over 2700 proteins were detected from 50,000 μm2 areas, revealing …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Moyamoya disease, a rare chronic cerebrovascular disorder, requires invasive digital subtraction angiography (DSA) for diagnosis. This study employed high-throughput proteomics to identify plasma biomarkers for Moyamoya disease diagnosis. We conducted immunopanel analysis using the Olink platform to evaluate 92 immune-related proteins in plasma samples from 88 Moyamoya disease patients and 88 healthy controls. Key proteins were identified through differential expression analysis, GO, and KEGG enrichment analysis. A diagnostic model was constructed using LASSO regression, Boruta algorithm, and …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Anxiety phenotypes - rumination, global anxiety, and worry (RAW) - are increasingly associated with Alzheimer's disease and related dementias (ADRD) risk, yet how anxiety phenotypes relate to coordinated, multi-system biology in the at-risk older adults is unknown.
OBJECTIVE: To map associations between anxiety phenotypes and plasma proteomic profile across five ADRD-relevant biological domains in older adults with high anxiety symptoms.
DESIGN SETTING AND PARTICIPANTS: Cross-sectional analysis of 110 older adults (aged 53-75 years) without dementia from the observational longitu
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic pancreatitis (CP) is characterized by progressive fibrosis and irreversible pancreatic dysfunction, lacking disease-modifying therapies. We aimed to identify druggable targets through proteome-wide mendelian randomization (PW-MR).
METHODS: Protein quantitative trait loci (pQTLs) from UK Biobank Pharma Proteomics Project (2923 proteins) and deCODE study (4719 proteins) were analyzed. Genome-wide association study (GWAS) data for CP were sourced from the FinnGen (3875 cases and 361,641 controls). PW-MR identified proteins meeting the 5 % false discovery rate (FDR) threshold …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Paracoccidioides spp. is the etiologic agent of Paracoccidioidomycosis (PCM), a systemic disease with wide distribution in Latin America. Macrophages are very important cells during the response to infection by P. brasiliensis. In this study, we performed a proteomic analysis to evaluate the consequences of P. brasiliensis yeast cells on the human THP-1 macrophage proteome. We have identified 443 and 2247 upregulated or downregulated proteins, respectively, in macrophages co-cultured with yeast cells of P. brasiliensis in comparison to control macrophages unexposed to the fungus. Proteomic ana
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Offspring conceived by assisted reproductive technologies (ART) have increased risk of suffering from gestational complications, and placental dysfunction is related with the adverse outcomes. Studies have revealed that abnormal or adaptive changes can occur in ART placentas, but the potential reasons are not fully understood. Hereby, we tried to use proteomics and phospho-proteomics to find the underlying mechanisms responsible for the changes of ART placentas. Liquid chromatography-tandem mass spectrometry was utilized to perform proteome and phospho-proteome detection on mouse placentas. Th…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polycystic ovary syndrome (PCOS) is the most common endocrinological disorder of fertile-aged women. Several adverse pregnancy outcomes and abnormalities of the placenta have been associated with PCOS. By using quantitative label-free proteomics we investigated whether changes in the plasma proteome of pregnant women with PCOS could elucidate the mechanisms behind the pathologies observed in PCOS pregnancies. A total of 169 proteins with ≥2 unique peptides were detected to be differentially expressed between women with PCOS (n = 7) and matched controls (n = 20) at term of pregnancy, out of whi…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eye disorders and resulting visual loss are major public health problems affecting millions of people worldwide. In this context, the sclera is an opaque, thick outer coat covering more than 80% of the eye, and essential in maintaining the shape of the eye and protecting the intraocular contents against infection and the external environment. Despite efforts undertaken to decipher the scleral proteome, the functional and structural picture of the sclera still remain elusive. Recently, proteomics has arisen as a powerful tool that enables identification of proteins playing a critical role in he…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The upper airway - which consists mainly of the naso- and oro-pharynx - is the first point of contact between the respiratory system and mic … e upper airways in health and disease. In this study, we aimed to develop a mass spectrometry based proteomics method for characterizing the upper airways proteome. Naso- and oropharyngeal swab samples used in all our experiments had been eluted in the Universal Transport Media (UTM) containing significantly high levels of bovine serum albumin. Our proteomic …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The spermatozoa undergo a series of changes in the epididymis to mature after their release from the testis and subsequently in the female reproductive tract after ejaculation to get capacitated and achieve fertilization potential. Despite having a silenced protein synthesis machinery, the dynamic change in protein profile of the spermatozoa is attributed either to acquisition of new proteins via vescicular transport or to several post-translational modifications (PTMs) occurring on the already expressed protein complement.
SCOPE OF REVIEW: In this review emphasis is given on the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tropidolaemus wagleri and Cryptelytrops purpureomaculatus are venomous pit viper species commonly found in Malaysia. Tandem mass spectrometry analysis of the crude venoms has detected different proteins in T. wagleri and C. purpureomaculatus. They were classified into 13 venom protein families consisting of enzymatic and nonenzymatic proteins. Enzymatic families detected in T. wagleri and C. purpureomaculatus venom were snake venom metalloproteinase, phospholipase A₂, ʟ-amino acid oxidase, serine proteases, 5'-nucleotidase, phosphodiesterase, and phospholipase B. In addition, glutaminyl cyclot
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Inflammatory demyelinating diseases of the CNS comprise a broad spectrum of diseases like neuromyelitis optica (NMO), NMO spectrum disorders (NMO-SD) and multiple sclerosis (MS). Despite clear classification criteria, differentiation can be difficult. We hypothesized that the urine proteome may differentiate NMO from MS.
METHODS: The proteins in urine samples from anti-aquaporin 4 (AQP4) seropositive NMO/NMO-SD patients (n = 32), patients with MS (n = 46) and healthy subjects (HS, n = 31) were examined by quantitative liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) after
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The photosynthetic flagellate Euglena gracilis (Euglena) exhibits a remarkable metabolic flexibility, enabling the dynamic coordination of energy production and resource partitioning during anaerobic adaptation. While the wax ester synthesis under hypoxia is well-documented, the regulatory interplay between protein abundance and post-translational modifications (PTMs) remains unexplored. A definitive understanding of this metabolic remodeling is hindered by the lack of high-depth proteomic resources and the fragmented genome annotations, which fail to capture Euglena's proteomic diversity and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Colorectal cancer (CRC) is common and associated with poor survival, and early detection is pivotal to improving patient outco … s (NCC), at Taleghani Hospital, Tehran, Iran, in this case-control study. A quantitative label-free proteomics approach was applied to determine global proteome differences between CRC patients and NCCs and to identify proteins with altered abundance. Proteins were extracted from saliva samples, digested with trypsin, and peptides were analyzed using LC-MS/M …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.