This study evaluated how plant protein type and heat treatment influence the structure and functionality of hybrid Cheddar-type cheese gels prepared using microbial transglutaminase (mTGase), with 40% partial replacement of bovine milk proteins by plant proteins (soy, pea or faba bean). Heating cheese milk preparations at 80 °C for 30 min prolonged the coagulation stage of gelation in cheese systems manufactured using mTGase. Compared with bovine milk gels, hybrid systems showed lower storage modulus (G'). Bovine milk exhibited a firmer gel structure, while the soy-based hybrid showed better i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) technique can play an important role in the early detection of fascioliasis. However, they have some diagnostic limitations, including cross-reaction with other helminths. It seems that the combination of recombinant parasite proteins as antigen can reduce these problems. Hence, the present study was aimed to design and confirm the antigenic recombinant multi-epitope (rMEP) construct of three protein epitopes (linear and conformational B-cell epitopes) of the parasite using immunoinformatic tools. For this purpose, the tertiary structures of Fascio
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations and deletions in SMARCAL1, an SWI2/SNF2 protein, cause Schimke immuno-osseous dysplasia (SIOD). SMARCAL1 preferentially binds to DNA molecules possessing double-stranded to single-stranded transition regions and mediates annealing helicase activity. The protein is critical for alleviating replication stress and maintaining genome integrity. In this study, we have analysed the ATPase activity of three mutations – A468P, I548N and S579L – present in SIOD patients. These mutations are present in RecA-like domain I of the protein. Analysis using active DNA-dependent ATPase A domain (ADAA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Instability of CAG triplet repeat encoding polyglutamine (polyQ) stretches in the gene for target protein has been implicated as a putative mechanism in several inherited neurodegenerative diseases. Expansion of polyQ chain length in the androgen receptor (AR) causes spinal and bulbar muscular atrophy (SBMA) or Kennedy's disease. Although the mechanisms underlying gain-of-neurotoxic function are not completely understood, suggested pathological mechanisms of SBMA involve the formation of AR nuclear and cytoplasmic aggregates, a characteristic feature of patients with SBMA. The fact that certai
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alpha-synuclein (αS) is a 140-amino-acid protein that is involved in a number of neurodegenerative diseases. In Parkinson's disease, the protein is typically encountered in intracellular, high-molecular-weight aggregates. Although αS is abundant in the presynaptic terminals of the central nervous system, its physiological function is still unknown. There is strong evidence for the membrane affinity of the protein. One hypothesis is that lipid-induced binding and helix folding may modulate the fusion of synaptic vesicles with the presynaptic membrane and the ensuing transmitter release. Here we
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The protein encoding zone of Mitochondrial DNA region (inherited from single lineage) seems most suitable and effective for taxonomic, systematic, ecological, evolutionary, DNA barcoding, cryptic species and population studies, exploiting nucleotide/amino acid datasets (1D/2D/3D conformational level). Nowadays, expeditious computerized methods are in trend for analyzing genetic material to demonstrate variations at various levels of protein structures. Structural proteomics have implemented here for genetic identification, differentiation and relationship of species from information rich data
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The β-class carbonic anhydrases (β-CAs) are widely distributed among lower eukaryotes, prokaryotes, archaea, and plants. Like all CAs, the β-enzymes catalyze an important physiological reaction, namely the interconversion between carbon dioxide and bicarbonate. In plants the enzyme plays an important role in carbon fixation and metabolism. To further explore the structure-function relationship of β-CA, we have determined the crystal structures of the photoautotroph unicellular green alga Coccomyxa β-CA in complex with five different inhibitors: acetazolamide, thiocyanate, azide, iodide, and ph
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular docking is one of the most established methods in computational drug discovery, due to its balance of speed and accuracy. However, the accuracy of docking results depends on a number of different parameters, and systematic reference data for comparisons to more advanced methods for binding affinity prediction are still scarce. This study assesses the impact of key parameters on the accuracy of binding free energy estimates from docking, using nine benchmark systems with 278 high-affinity ligands. Using the Molecular Operating Environment (MOE), we evaluated combinations of three rece
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucellosis (Malta fever) is a zoonotic disease that affects both humans and animals, including cattle, sheep, and goats. Brucella melitensis is the most virulent and clinically significant species in humans. It is a gram-negative bacterium with three groups of outer membrane proteins (OMPs): minor OMPs (Group 1) and major OMPs (Groups 2 and 3). OMPs with β-barrel architecture play important roles in nutrient transport, efflux, adhesion, and membrane biogenesis. Despite their importance, the structure, function, and interaction dynamics of several B. melitensis β-barrel OMPs and associated pro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The CRISPR-Cas system provides adaptive immunity in bacteria and archaea against invading genetic elements, while anti-CRISPR (Acr) proteins have evolved in phages to counteract this defense. Here, we report the first structural and biochemical characterization of ACZ01644, a protein previously predicted to be an Acr. The crystal structure of ACZ01644 reveals a unique cone-shaped architecture composed of five α-helices and five β-strands forming a compact core, which represents a fold distinct from any known Acr family. Biochemical analyses demonstrated that ACZ01644 assembles as a trimer in s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In response to the growth of emerging resistance to conventional antifungal drugs, antifungal proteins (AFPs) of filamentous Ascomycetes origin have been discovered in recent years. Understanding the structure of AFPs is crucial for elucidating their antifungal mechanisms and developing new therapeutic agents. While nuclear magnetic resonance (NMR) has proven effective in determining the structures of small proteins, some AFP structures remain unresolved, necessitating the use of alternative prediction methods. Through bioinformatics analysis and heatmaps of amino acid sequence identity and si
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antigen-antibody specific recognition constitutes fundamental research in molecular drug design and immune diagnostics, where cumulative non-covalent interactions critically determine binding affinities. Current mechanistic understanding of antibody affinity optimization remains incomplete, hindering rational structure-based design of therapeutic antibodies and bispecific variants. This study presents four cryo-EM structures of C-reactive protein (CRP) complexed with heavy-chain antibodies (HCAbs) of varying affinities, resolved at 3.0-3.4 Å resolution. Comparative structural analysis reveals
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In fragment-based drug design (FBDD), libraries of low molecular weight compounds are screened against a receptor. Due to their size, fragment hits typically bind with weak affinities by forming a handful of highly efficient interactions with the receptor. Such fragment hits must be expanded into more potent lead compounds in order to achieve higher binding affinities. Approaches for expanding fragments to leads include growing-the iterative expansion of the scaffold, and merging-the linking of two fragment hits. In both cases the design can be facilitated by information on the ligand binding
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transthyretin (TTR) is a vertebrate-exclusive transport protein that plays a key role in binding and distributing thyroid hormones. However, its evolutionary origin lies in the duplication of the gene that encoding the enzyme 5-hydroxyisourate hydrolase (HIUase), which is involved in uric acid metabolism. Unlike TTR, HIUase is ubiquitous in both prokaryotes and eukaryotes, with the exception of hominids. Both HIUase and TTR subfamilies form homotetramers, possessing an internal charged cavity between the two dimer pairs. Based on their high degree of structural similarity, we hypothesized that
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary transthyretin amyloidosis (ATTR) is an autosomal dominant disease characterized by the extracellular deposition of the transport protein transthyretin (TTR) as amyloid fibrils. Despite the progress achieved in recent years, understanding why different TTR residue substitutions lead to different clinical manifestations remains elusive. Here, we studied the molecular basis of disease-causing missense mutations affecting residues R34 and K35. R34G and K35T variants cause vitreous amyloidosis, whereas R34T and K35N mutations result in amyloid polyneuropathy and restrictive cardiomyopath
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The interfacial interaction within the amyloid protein corona based on MoS2 nanomaterial is crucial, both for understanding the biological effects of MoS2 nanomaterial and the evolution of amyloid diseases. The specific nano-bio interface phenomenon of human islet amyloid peptide (hIAPP) and MoS2 nanosheet was investigated by using theoretical and experimental methods. The MoS2 nanosheet enables the attraction of hIAPP monomer, dimer, and oligomer on its surface through van der Waals forces. Especially, the means of interaction between two hIAPP peptides might be changed by MoS2 nanosheet. In
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small molecule drugs form the backbone of modern medicine's therapeutic arsenal. Often less appreciated is the role that small molecules have had in advancing basic biology. In this Review, we highlight how resistance mutations have unlocked the potential of small molecule chemical probes to discover new biology. We describe key instances in which resistance mutations and related genetic variants yielded foundational biological insight and categorize these examples on the basis of their role in the discovery of novel molecular mechanisms, protein allostery, physiology and cell signaling. Next,
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
VAR2CSA is the placental-malaria-specific member of the antigenically variant Plasmodium falciparum erythrocyte membrane protein 1 (PfEMP1) family. It is expressed on the surface of Plasmodium falciparum-infected host red blood cells and binds to specific chondroitin-4-sulfate chains of the placental proteoglycan receptor. The functional ∼310 kDa ectodomain of VAR2CSA is a multidomain protein that requires a minimum 12-mer chondroitin-4-sulfate molecule for specific, high affinity receptor binding. However, it is not known how the individual domains are organized and interact to create the rec
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Apicomplexan parasites use a specialized cilium structure called the apical complex to organize their secretory organelles and invasion machinery. The apical complex is integrally associated with both the parasite plasma membrane and an intermediate filament cytoskeleton called the inner-membrane complex (IMC). While the apical complex is essential to the parasitic lifestyle, little is known about the regulation of apical complex biogenesis. Here, we identify AC9 (apical cap protein 9), a largely intrinsically disordered component of the Toxoplasma gondii IMC, as essential for apical complex d
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alterations in metal ion homeostasis appear coupled to neurodegenerative disorders but mechanisms are unknown. Amyloid formation of the protein α-synuclein in brain cells is a hallmark of Parkinson's disease. α-Synuclein can bind several metal ions in vitro and such interactions may affect the assembly process. Here we used biophysical methods to study the effects of micromolar concentrations of Cu2+ and Fe3+ ions on amyloid formation of selected α-synuclein variants (wild-type and A53T α-synuclein, in normal and N-terminally acetylated forms). As shown previously, Cu2+ speeds up aggregation o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.