BACKGROUND: Kidney transplant recipients are highly susceptible to opportunistic and nosocomial infections that demand rapid and accurate diagnosis due to the broad and complex spectrum of pathogens. Conventional microbiological testing (CMT) is often limited, particularly when patients are already receiving antimicrobial therapy at the time of sampling. This study aimed to evaluate the clinical value of metagenomic next-generation sequencing (mNGS) as a complementary diagnostic approach to CMT, with a focus on concordance and discrepancies between the two methods across peripheral blood, sput
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Varicella zoster virus (VZV) is a human neurotropic herpesvirus that remains latent in the dorsal root ganglia and can reactivate to cause herpes zoster. In immunocompromised patients, reactivation may lead to severe neurological complications such as encephalitis, meningitis, myelitis, and neuropathy. However, varicella zoster virus-related myelitis (VZVM) is relatively rare, particularly in immunocompetent adults. The pathogenesis may involve direct viral invasion of the spinal cord parenchyma during the acute phase or a postinfectious immune-mediated inflammatory response.
CA
СтатьяКлинический случайОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A strain of human adenovirus type C1 was isolated from multiple anatomical compartments in a pediatric patient with late-onset Pompe disease. Over a period of 23 days from the appearance of fever and respiratory symptoms until death, disease progression was rapid with severe disseminated disease and complications that included respiratory distress, liver failure, cardiac dysfunction, and hemophagocytic lymphohistiocytosis. Detected viral DNAemia peaked at log10 9.52 copies/mL on the last hospitalization day. Next-generation whole-genome sequencing with depth > 2700 reads/position identified th
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Tropheryma whipplei (TW), which causes Whipple disease, has recently been associated with respiratory diseases, particularly pneumonia. To understand its role in pediatric pneumonia, this study analyzed the clinical and pathogenetic characteristics of TW in pediatric pneumonia patients.
METHODS: We utilized metagenomic and targeted next-generation sequencing (mNGS/tNGS) data from 3,759 pediatric bronchoalveolar lavage fluid (BALF) samples (2023-2024). This case-control study included 103 TW-positive pediatric pneumonia patients (59 with severe pneumonia, SPTW+; 44 with mild pneu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bloodstream infections (BSI) in intensive care unit (ICU) patients are associated with high morbidity and mortality, necessitating rapid and accurate pathogen identification to guide early antimicrobial therapy. However, traditional blood culture (BC) is limited by the long turnaround time and low sensitivity. Metagenomic next-generation sequencing (mNGS) has been applied in infectious disease diagnostics, but its clinical utility for perioperative ICU patients with BSI requires further evaluation.
METHODS: This post-hoc analysis included 219 perioperative ICU patients (from a pro
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To evaluate the diagnostic performance of targeted next-generation sequencing (tNGS) for tuberculosis (TB) in patients with human immunodeficiency virus (HIV) and to compare it with traditional diagnostic methods.
METHODS: A total of 66 HIV patients were enrolled, including 25 with confirmed TB infection and 41 without TB. Statistical analyses were performed using SPSS 22.0. Diagnostic performance was assessed using the chi-square test. Sensitivity, specificity, positive predictive value (PPV), negative predictive value (NPV), Kappa coefficient, and the area under the curve (AUC)
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Next-generation sequencing is a more rapid and robust technique than phenotypic drug susceptibility testing (pDST) for diagnosing drug-resistant tuberculosis (DR-TB). Targeted next-generation sequencing (tNGS) using Oxford Nanopore Technology (ONT) is an easy, tabletop, and portable option for comprehensive drug resistance profiling. Sputum sample/Mycobacterium tuberculosis (M. tb) isolates from 351 bacteriologically confirmed TB patients between January 2022 and June 2023 were used in the study. We assessed the feasibility of using DNA isolated with an extraction device from a rou
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Non-tuberculous mycobacterial pulmonary disease (NTM-PD) poses significant diagnostic challenges due to its clinical similarity to pulmonary tuberculosis (PTB). This study aimed to compare the clinical characteristics, immune status and lower respiratory tract microbiome profiles of NTM-PD and PTB patients.
METHODS: A total of 113 NTM-PD patients and 105 PTB patients were enrolled. The clinical features, laboratory parameters, and comorbidity profiles were analyzed. Bronchoalveolar lavage fluid (BALF) samples were subjected to bacterial culture and targeted next-generation sequenc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hematogenous disseminated tuberculosis (Hematogenous disseminated tuberculosis, HDTB) is a rare, critical form of tuberculosis with a high case fatality ratio and is uncommon in HIV-negative patients. Early recognition of this disease is difficult, and limitations of traditional testing methods often lead to delayed diagnosis. This study aims to investigate the value of metagenomic Next-Generation Sequencing (metagenomic Next-Generation Sequencing, mNGS), as a promising tool, in the diagnosis of hematogenous disseminated tuberculosis in HIV-negative (Human Immunodeficiency Virus, H
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Molecular diagnostics in oncology is shifting from targeted NGS panels to comprehensive genomic profiling (CGP), which detects a broader range of alterations and expands access to clinical trials and therapies.
METHOD: This study assessed the added value of CGP compared with current Belgian practice using local NGS panels covering a minimally required set of genes set by cancer type. We prospectively recruited 1000 patients with metastatic or locally advanced cancer across 13 Belgian hospitals. Tumor tissue or liquid biopsies were analyzed with FoundationOne CDx assays. The added
СтатьяМногоцентровое исследованиеСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Precision oncology has significantly transformed the management of non-small cell lung cancer (NSCLC) through the integration of molecular diagnostics, targeted therapies, and biomarker-driven treatment selection. Advances in next-generation sequencing (NGS) and liquid biopsy have improved the identification of actionable molecular alterations and enabled dynamic monitoring of tumor evolution.
OBJECTIVE: To provide a structured narrative review of current evidence regarding actionable molecular biomarkers, diagnostic methodologies, targeted therapies, and future directions in NSCL
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleoporin 98 rearrangements (NUP98r) are recurrent in myeloid neoplasms and are subtype-defining for acute myeloid leukemia (AML) in the World Health Organization Classification 5th edition (WHO5) and the International Consensus Classification (ICC). Identification of NUP98r is essential given the frequency of treatment resistance and possibility of sensitivity to targeted therapies. However, NUP98r is often cryptic on karyotype and has over 40 described partners. Therefore, it is underdiagnosed in the absence of dedicated testing that is not always routine practice, e.g., RNA-based next gen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene fusions involving NUTM1 have been increasingly recognized in hematologic malignancies, though their role in acute myeloid leukemia (AML) remains poorly understood. We retrospectively analyzed 565 unique AML patients with reported fusion results who underwent comprehensive next-generation sequencing (NGS) between March 2022 and December 2023. Among them, three novel in-frame NUTM1 fusion transcripts, LARP1::NUTM1, ARHGAP15::NUTM1, and GABPB1::NUTM1, were identified in three relapsed or refractory AML cases, all with monocytic differentiation. Ancillary studies included flow cytometry, cyto
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent evidence suggests that the human stomach hosts a diverse microbiota beyond Helicobacter pylori, and that shifts in microbial composition may influence gastric health. In particular, oral-origin bacteria may dominate the gastric niche in the absence of H. pylori, yet their specific roles in different gastroduodenal disorders remain unclear. This study aimed to profile and compare the gastric microbiota composition in Turkish patients with non-ulcer dyspepsia (NUD) and peptic ulcer disease (PUD), in order to better understand microbial profiles potentially associated with gast
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The vast majority of patients with pancreatic cancer present with unresectable disease and precision medicine is lagging behind. Circulating tumor DNA (ctDNA) has emerged as a promising tool, both as a proxy for tumor burden and for capturing tumor heterogeneity, but optimal gene panels and prognostic cutoffs remain to be determined. Herein, we applied ultra-deep ctDNA sequencing using a customized panel targeting 23 genes and six frequently altered chromosomes on plasma samples obtained before, during and after chemotherapy from 60 patients enrolled in a prospective clinical study. At baselin
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the successful management of two cases of brain abscess and subdural empyema caused by Fusobacterium nucleatum and Streptococcus intermedius diagnosed using 16S ribosomal RNA (rRNA) sequencing where microbiological culture showed no growth. This report elucidates the utility of next-generation sequencing (NGS) in determining the microbial etiology and guiding appropriate antimicrobial treatment in life-threatening neurological infections.
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Fine-needle aspiration (FNA) cytological analysis fails to confirm the benignity or malignancy of Bethesda III, IV and V thyroid nodules. Molecular tests performed on FNA samples have demonstrated interesting results in improving the diagnosis of these nodules. The aim of this study was to assess the performance of a large next-generation sequencing (NGS) panel in thyroid nodules with indeterminate cytology (Bethesda III, IV and V).
METHODS: Retrospective, monocentric study including 121 patients with cytologically indeterminate thyroid nodules (Bethesda III, IV and V) who underwen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung abscess is a common disease in respiratory medicine, which is a suppurative lesion caused by various pathogens, and microbiological examination is crucial for the treatment of lung abscess. Due to the widespread use of antibiotics, it is difficult to obtain reliable microbiological evidence through routine tests. There are various pathogens present in the oral cavity, and periodontitis is a risk factor for the formation of lung abscess. Enhancing understanding of lung abscesses caused by Porphyromonas gingivalis and the importance of accurately interpreting NGS reports. This article will
СтатьяКлинический случайОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Early childhood caries (ECC), particularly severe early childhood caries (S-ECC), remains a prevalent chronic disease, significantly affecting children's health and quality of life. Despite extensive research, the detailed ecological and metabolic shifts underlying S-ECC pathogenesis are still poorly characterized. Integrating microbial and metabolic profiling of saliva may provide crucial insights and identify novel biomarkers and therapeutic targets.
METHODS: We performed high-throughput 16S rRNA gene sequencing and untargeted metabolomics to comprehensively profile the salivary
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Traumatic spinal cord injury (SCI) is a devastating complication of trauma, causing long-term disability and significant socioeconomic burden. Beyond the primary mechanical insult, secondary injury cascades involving apoptosis, oxidative stress, and inflammation amplify tissue damage. MicroRNAs (miRNAs) regulate these processes at the post-transcriptional level, yet data on circulating miRNAs in human SCI remain scarce. This study aimed to characterize acute plasma miRNA expression patterns in isolated traumatic SCI that may indicate SCI-specific signatures. Plasma was collected from five SCI
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования