Whole-genome sequencing is a powerful, high-resolution tool that can be used to generate accurate data on bacterial population structure, phylogeography and mutations associated with antimicrobial resistance. The ability to sequence pathogen genomes directly from clinical specimens, without the requirement for in vitro culturing, is attractive in terms of time- and labor-saving, especially in the case of slow growing, or obligate intracellular pathogens, such as Chlamydia trachomatis. However clinical samples typically contain too low levels of pathogen nucleic acid, plus relatively high level
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CtGEM typing was developed to subdivide the bacterial species Chlamydia trachomatis on the basis of genome phylogeny and anatomical tropism. The rationale was facilitation of surveillance for ocular strains, although the method is applicable to essentially any C. trachomatis surveillance application that does not require high resolution. CtGEM is a double-locus genotyping method. The loci included in the assay were identified by computerized analysis of 65 complete genomes for resolution optimized sets of single nucleotide polymorphisms (SNPs). From this, two PCR amplifiable fragments were def
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During epidemic control, containment of the disease is usually achieved through increasing a devoted resource to reduce the infectiousness. However, the impact of this resource expenditure has not been studied quantitatively. For disease spread, the recovery rate can be positively correlated with the average amount of resource devoted to infected individuals. By incorporating this relation we build a novel model and find that insufficient resource leads to an abrupt increase in the infected population size, which is in marked contrast with the continuous phase transitions believed previously.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia trachomatis is the most common cause of sexually transmitted bacterial infection globally. These infections translate to a significant public health burden, particularly women's healthcare costs due to serious disease sequelae such as pelvic inflammatory disease (PID), tubal factor infertility, chronic pelvic pain, and ectopic pregnancy. There is no evidence that natural immunity can provide complete, long-term protection necessary to prevent chronic pathology, making human vaccine development critical. Vaccine design will require careful consideration of protective versus pathologic
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The distribution of Chlamydia trachomatis serotypes in the sexually active population may change over time. Serum from C. trachomatis seropositive women representing the 1980s, 1990s, and 2000s were available from a stratified random sample (11,067) of the Finnish Maternity Cohort for microimmunofluorescence-based classification. The C. trachomatis serotype distributions in the 1980s and 2000s were comparable, with serotypes G, E, and J being the most prevalent. In the 1990s the numbers of women seropositive for ≥ 2 serotypes peaked, and serotypes G/J were replaced by serotypes E/D. The tempor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 9-week-old infant presented with respiratory distress. The presumptive diagnosis of Chlamydia trachomatis pneumonia was ultimately made in a novel manner by a positive nucleic acid amplification test on a urine sample.
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The koala (Phascolarctos cinereus) is an iconic Australian marsupial species that is facing many threats to its survival. Chlamydia pecorum infections are a significant contributor to this ongoing decline. A major limiting factor in our ability to manage and control chlamydial disease in koalas is a limited understanding of the koala's cell-mediated immune response to infections by this bacterial pathogen. To identify immunological markers associated with chlamydial infection and disease in koalas, we used koala-specific Quantitative Real Time PCR (qrtPCR) assays to profile the cytokine respon
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: To review recent clinical and epidemiological studies regarding the prevention, diagnosis, and treatment of trachoma.
RECENT FINDINGS: Newer studies propose novel diagnostic tests that appear sensitive for the detection of ocular chlamydial infection. For example, recent studies with ribosomal RNA-based nucleic acid amplification tests (NAATs) have demonstrated improved sensitivities compared to DNA-based NAATs; and the progression of scarring has now been characterized with confocal microscopy. Immunologic studies have further explored the etiology of clinical sequelae, su
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The initial host response in a primary chlamydial infection is the onset of acute inflammation. However, we still know very little about the early temporal events in the induction of the acute inflammatory response and how these events relate to the initial chlamydial developmental cycle in an actual genital infection. Because it was critical to initiate a synchronous infection in the endocervix in the first 24 h to evaluate the sequential expression of the host response, we developed the surgical methodology of depositing Chlamydia muridarum directly on the endocervix. Cervical tissue was col
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The accuracy of tests for chlamydia depends, among other things, upon the quality of the clinical specimen. Most chlamydia tests do not allow comment on specimen quality. It has been shown that examination of Papanicolaou stains or Diff-Quik stains of endocervical secretions can be used to assess the quality of endocervical sampling. This study has found that by analysing surrogate markers, such as the rates of inadequate cervical cytology and chlamydia detection rates in patients not identified as chlamydia contacts, it is possible to identify doctors performing less well in cervical sampling
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 24-year-old woman presented with renal insufficiency, macrohematuria, and mild urinary protein. Polyclonal hypergamma-globulinemia, thrombocytosis, increased concentration of serum, and urinary interleukin (IL)-6 all indicated persistent immune activation caused by a Chlamydia trachomatis infection of the fallopian tube. Gynecological treatment with levofloxacin was effective both for the renal symptoms and other immunological parameters. First and second renal biopsy specimens showed an immune-complex glomerulopathy with extensive interstitial infiltration of many types of inflammatory cell
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In order to investigate whether or not Chlamydia trachomatis infection is a risk factor for pregnancy loss, 77 spontaneous abortion patients (6-24 weeks gestation), admitted to gynaecology emergency of Safdarjang Hospital, New Delhi, India. Twenty-five pregnant women (6-16 weeks gestation) attending the same hospital for induced abortion, were included in the study. C. trachomatis antigen was detected in endometrial curretage tissue by enzyme immunoassay (EIA). The detection rate was 15.6% (12/77) among spontaneous abortion patients and 4% (1/25) among women undergoing induced abortion. There
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exceptions ot the common notion that tubal occlusion protects from recurrent pelvic inflammatory disease (PID) do exist. Since 1975, 71 cases of salpingitis and 38 tubo-ovarian abscesses (TOA) in sterilized women have been published. The majority of cases of salpingitis after previous tubal occlusion (SPOT) developed more than a year after either laparoscopic or laparotomy sterilization procedures. For tubo-ovarian abscess after previous tubal occlusion (TOAPOT), this time interval ranged from several weeks to almost two decades. Most cases of salpingitis showed inflammation of both tubal segm
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.