The constantly emerging evidence indicates a close association between coronary artery disease (CAD) and non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD). However, the exact mechanisms underlying their mutual relationship remain undefined. This study aims to explore the common signature genes, potential mechanisms, diagnostic markers, and therapeutic targets for CAD and NAFLD. We downloaded CAD and NAFLD datasets from the Gene Expression Omnibus (GEO) database and analyzed the differentially expressed genes (DEGs) by limma. Protein-protein interaction (PPI) network was constructed with common DEGs (c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metastasis is one of the leading factors of cancer-related deaths worldwide. New potential targets and treatment strategies are needed to extend survival and enhance the quality of life for these patients. We performed an in-depth bioinformatics analysis to identify potential genes and associated potential therapeutic compounds for metastasis of prostate adenocarcinoma. The differentially expressed genes (DEGs) were first identified using four datasets (GSE8511), (GSE3325), (GSE27616) and (GSE6919) present in the Gene Expression Omnibus (GEO) database and analyzed using the GEO2R. WGCNA was pe
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Myocardial metabolism is closely related to functional changes after myocardial infarction (MI).
OBJECTIVE: This study aimed to present an integrative examination of human ischemic cardiomyopathy.
METHODS: We used both GSE121893 single-cell suspension sequencing and GSE19303 transcription microarray data sets from the GEO database, along with a murine MI model for full-spectrum metabolite detection. Through a systematic investigation that involved differential metabolite identification and functional enrichment analysis, we shed light on the pivotal role of energy metabolism dysr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellular immunotherapy represented by CD19-directed chimeric antigen receptor T (CAR-T) cells has achieved great success in recent years. An increasing number of CAR-T therapies are being developed for cancer treatment, but the frequent and varied adverse events, such as "on-target, off-tumor toxicity", limit CAR-T application. Here, we identify the target antigen expression patterns of CAR therapies in 18 tissues and organs (peripheral blood mononuclear cells, bone marrow, lymph nodes, spleen, heart, ascending aortic tissue, trachea, lung, skin, kidney, bladder, esophagus, stomach, small inte
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The response rate and survival benefit of immunotherapy vary among patients, implying specific immune status of an individual could be associated with the effect of immunotherapy. However, in-depth studies of immune subtypes (ISs), immune landscape and tumour microenvironment of oesophageal cancer (ESCA) and their clinical implications are less reported.
METHODS: We first accessed data from publicly available databases and preprocessed it based on a standard protocol. Then, ISs were identified by unsupervised learning. Thereafter, the association of these ISs and tumour mutation b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The question of whether the tumor mutation burden (TMB) is associated with either improved survival outcomes or improvement of immunotherapies remains controversial in various malignancies. The aim of this study is to investigate the genomic landscape of the relationship between TMB and immune cell infiltration in thymic epithelial tumors (TETs).
METHODS: We downloaded somatic mutation data, transcriptome sequencing data, and clinical information of TETs from the Cancer Genome Atlas (TCGA) database. We assessed the abundance of 22 immune fractions between low-TMB (TMB-L) and high-T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We take advantage of a historic collection of 133 Staphylococcus aureus strains accessioned between 1924 and 2016, whose genomes have been long-read sequenced as part of a major National Collection of Type Cultures (NCTC) initiative, to conduct a gene family-wide computational analysis of enterotoxin genes. We identify two novel staphylococcal enterotoxin (pseudo)genes (sel29p and sel30), the former of which has not been observed in any contemporary strain to date. We provide further information on five additional enterotoxin genes or gene variants that either have recently entered the literat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ischemic cardiomyopathy (ICM) is one of the most usual causes of death worldwide. This study aimed to find the candidate gene for ICM.
METHODS: We studied differentially expressed genes (DEGs) in ICM compared to healthy control. According to these DEGs, we carried out the functional annotation, protein-protein interaction (PPI) network and transcriptional regulatory network constructions. The expression of selected candidate genes were confirmed using a published dataset and Quantitative real time polymerase chain reaction (qRT-PCR).
RESULTS: From three Gene Expression Omnibus (G
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inhibitors of the 20S proteasome such as bortezomib (Velcade®) and carfilzomib (Kypriolis®) are in clinical use for the treatment of patients with multiple myeloma and mantle cell lymphoma. In an attempt to identify novel inhibitors of the ubiquitin-proteasome system (UPS) we used the connectivity map (CMap) resource, based on alterations of gene expression profiles by perturbagens, and performed COMPARE analyses of drug sensitivity patterns in the NCI60 panel. Cmap analysis identified a large number of small molecules with strong connectivity to proteasome inhibition, including both well char
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The VACTERL (Vertebral anomalies, Anal atresia, Cardiac malformations, Tracheo-Esophageal fistula, Renal anomalies, Limb abnormalities) association is the non-random occurrence of at least three of these congenital anomalies: vertebral, anal, cardiac, tracheo-esophageal, renal, and limb anomalies. Diagnosing VACTERL patients is difficult, as many disorders have multiple features in common with VACTERL. The aims of this study were to clearly outline component features, describe the phenotypic spectrum among the largest group of VACTERL patients thus far reported, and to identify phe
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Since the establishment of chromosomal microarrays in clinical practice, many new microdeletion/microduplication syndromes have been identified, including 18q11.2 microdeletion. Chromosome 18q deletion syndrome is commonly classified into distal deletion and a much rarer proximal interstitial deletion spanning the 18q11.2-q21.1 region.
METHODS: We report two new patients and review 27 additional cases in DECIPHER/ClinGen databases and four cases from the literature, with more proximal 18q deletions involving 18q11-q12 (band 1 only; 17.2-43.5 Mb position) deletion.
RESULTS: Common
Клиническое исследованиеСтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Drug resistant HIV is a major threat to the long-term efficacy of antiretroviral treatment. Around 10% of ART-naïve patients in Europe are infected with drug-resistant HIV type 1. Hence it is important to understand the dynamics of transmitted drug resistance evolution. Thanks to routinely performed drug resistance tests, HIV sequence data is increasingly available and can be used to reconstruct the phylogenetic relationship among viral lineages. In this study we employ a phylodynamic approach to quantify the fitness costs of major resistance mutations in the Swiss HIV cohort. The viral phylog
СтатьяМногоцентровое исследованиеНаблюдательное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The guilt by association (GBA) principle has been widely used to predict gene functions, and a network‑based approach may enhance the confidence and stability of the analysis compared with focusing on individual genes. Fetal growth restriction (FGR), is the second primary cause of perinatal mortality. Therefore, the present study aimed to predict the optimal gene functions for FGR using a network‑based GBA method. The method was comprised of four parts: Identification of differentially‑expressed genes (DEGs) between patients with FGR and normal controls based on gene expression data; construct
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cervical proprioception and muscle endurance are essential for maintaining cervical functional joint stability. Proprioception and muscle endurance may be impaired in those with general joint hypermobility (GJH). Examining these aspects is crucial. This study's aims are to (1) compare the cervical joint position error (JPE) and muscle endurance holding capacities in GJH individuals with and without non-specific neck pain (NSNP) (2) to assess the relationship between hypermobility Beighton scores, cervical JPE's, and muscle endurance in GJH individuals with and without NSNP.
METHOD
СтатьяМетаанализПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The trace element selenium is found in polypeptides as selenocysteine, the 21(st) amino acid that is co-translationally inserted into proteins at a UGA codon. In proteins, selenocysteine usually plays a role as an efficient redox catalyst. Trypanosomatids previously examined harbor a full set of genes encoding the machinery needed for selenocysteine biosynthesis and incorporation into three selenoproteins: SelK, SelT and, the parasite-specific, Seltryp. We investigated the selenoproteome of kinetoplastid species in recently sequenced genomes and assessed the in vivo relevance of selenoproteins
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To generate new insights into the biology of Alzheimer's Disease (AD), we developed methods to combine and reuse a wide variety of existing data sets in new ways. We first identified genes consistently associated with AD in each of four separate expression studies, and confirmed this result using a fifth study. We next developed algorithms to search hundreds of thousands of Gene Expression Omnibus (GEO) data sets, identifying a link between an AD-associated gene (NEUROD6) and gender. We therefore stratified patients by gender along with APOE4 status, and analyzed multiple SNP data sets to iden
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Decorin is generally recognized as a tumor suppressing molecule. Nevertheless, although decorin has been shown to be differentially expressed in malignant tissues, it has often remained unclear whether, in addition to non-malignant stromal cells, cancer cells also express it. Here, we first used two publicly available databases to analyze the current information about decorin expression and immunoreactivity in normal and malignant human colorectal tissue samples. The analyses demonstrated that decorin expression and immunoreactivity may vary in cancer cells of human colorectal tissues. Therefo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute rejection is a major complication of solid organ transplantation that prevents the long-term assimilation of the allograft. Various populations of lymphocytes are principal mediators of this process, infiltrating graft tissues and driving cell-mediated cytotoxicity. Understanding the lymphocyte-specific biology associated with rejection is therefore critical. Measuring genome-wide changes in transcript abundance in peripheral whole blood cells can deliver a comprehensive view of the status of the immune system. The heterogeneous nature of the tissue significantly affects the sensitivity
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cluster-detection approaches, commonly used in epidemiology and astronomy, can be applied in the context of genetic sequence data for the identification of genetic regions significantly enriched with rare disease-risk variants (DRVs). Unlike existing association tests for sequence data, the goal of cluster-detection methods is to localize significant disease mutation clusters within a gene or region of interest. Here, we focus on a chromosome 2q replicated linkage region that is associated with autism spectrum disorder (ASD) and that has been sequenced in three independent datasets. We found t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The etiology of most central nervous system (CNS) malformations remains unknown. We have utilized the fact that autosomal chromosome aberrations are commonly associated with CNS malformations to identify new causative gene loci. The human cytogenetic database, a computerized catalog of the clinical phenotypes associated with cytogenetically detectable human chromosome aberrations, was used to identify patients with 14 selected brain malformations including 541 with deletions, and 290 carrying duplications. These cases were used to develop an autosomal deletion and duplication map consisting of
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования