The present study aimed to investigate the comprehensive expression profiles of long non-coding RNA (lncRNA) in ankylosing spondylitis (AS).The peripheral blood samples were collected from 6 AS patients and 6 age- and gender-matched healthy controls (HCs), and separated for peripheral blood mononuclear cells, followed by RNA-sequencing. Further bioinformatics analyses were performed to explore the significantly enriched biological processes, signaling pathways of differentially expressed lncRNAs (DElncRNAs) (based on cis-target and trans-target genes) and differentially expressed mRNAs (DEmRNA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Frontotemporal dementia is characterized by progressive atrophy of frontal and/or temporal cortices at an early age of onset. The disorder shows considerable clinical, pathological, and genetic heterogeneity. Here we investigated the proteomic signatures of frontal and temporal cortex from brains with frontotemporal dementia due to GRN and MAPT mutations to identify the key cell types and molecular pathways in their pathophysiology. We compared patients with mutations in the GRN gene (n = 9) or with mutations in the MAPT gene (n = 13) with non-demented controls (n = 11). Using quantitative pro
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Obsessive-Compulsive Disorder (OCD) is one of the complex neuropsychiatric conditions. This disorder disables individuals in many different aspects of their personal and social life. Interactome analysis may provide a better understanding of this disorder's molecular origin and its underlying mechanisms.
METHODS: In this study, the OCD-associated genes were extracted from the literature. The criterion for gene selection was to choose genes with at least one significant report. Furthermore, by applying Cytoscape and its plugins, protein-protein interaction network, and gene ontol
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycosis fungoides (MF) is the most common cutaneous T-cell lymphoma; in advanced stages, it can involve multiple organs and has a poor prognosis. Early detection of the disease is still urgent, but there is no optimal therapy for advanced MF. In the present study, quantitative proteomic analyses (label-free quantitation, LFQ) were applied to tissue samples of different stages of MF and tissue samples from controls (eczema patients and healthy donors) to conduct preliminary molecular analysis to clarify the pathogenesis of the disease. Differential protein expression analysis demonstrated that
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe invasive aspergillosis infection occurs when human immune function is impaired. The interaction between Aspergillus fumigatus (A. fumigatus) conidia and type II lung epithelial cells serves an important role in disease progression. The present study compared the proteomes of A549 human lung epithelial cells with and without A. fumigatus infection. Gene Ontology (GO), Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) and protein interaction analyses were performed, and differential protein expression was verified by western blotting and reverse transcription‑quantitative PCR (RT‑qPCR). In a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM OF STUDY: Since the effect of placental growth factor (PlGF) on MicroRNAs (miRNAs) at molecular level was remained unknown, the aim was to predict the transcription factors (TFs) and their regulated miRNAs that activated by PlGF and analysis the function, biological processes, and cancer stem cells (CSCs)-related signaling pathways of miRNAs that regulated in PlGF signaling pathway.
SUBJECTS AND METHODS: The aim of this study is to find the TFs that activated by PlGF, we used three online software programs PCViz, PubAngioGen, and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway. The
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND Spinal cord injury (SCI) is a serious nervous system condition that can cause lifelong disability. The aim of this study was to identify potential molecular mechanisms and therapeutic targets for SCI. MATERIAL AND METHODS We constructed a weighted gene coexpression network and predicted which hub genes are involved in SCI. A compression model of SCI was established in 45 Sprague-Dawley rats, which were divided into 5 groups (n=9 per group): a sham operation group, and 1, 3, 5, and 7 days post-SCI groups. The spinal cord tissue on the injured site was harvested on 1, 3, 5, and 7 days
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gilles de la Tourette Syndrome (TS) is a neurodevelopmental disorder that causes children to make repeated, brief involuntary movements or sounds. TS can be co-morbid with other neurodevelopmental disorders, including autism spectrum disorder (ASD). Clusters of biologically related genes have been associated with neurodevelopmental disorders, suggesting shared pathologies. However, the genetic contribution to TS remains poorly defined. We asked whether children with both TS and ASD differed clinically from children with ASD alone, and identified potentially deleterious genetic events in childr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterovirus 71 (EV71) and Coxsackievirus A16 (CA16) remain the predominant pathogens in hand, foot, and mouth disease (HFMD), but the factors underlying the pathogenesis of EV71 and CA16 infections have not been elucidated. Recently, the functions of microRNAs (miRNAs) in pathogen-host interactions have been highlighted. In the present study, we performed comprehensive miRNA profiling in EV71- and CA16-infected human umbilical vein endothelial cells (HUVECs) at multiple time points using high-throughput sequencing. The results showed that 135 known miRNAs exhibited remarkable differences in ex
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Furunculosis caused by Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida is an epidemic disease among salmonids, including rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). However, the immune mechanisms that are elicited in rainbow trout against the invasion of A. salmonicida are not yet fully understood. In this study, we examined the spleen to investigate the immune response of rainbow trout at 3days post-infection by A. salmonicida at the transcriptome and proteome levels by using Illumina-seq and iTRAQ methods, respectively. A total of 1036 genes and 133 proteins were found to undergo differential
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Transgenerational epigenetics (TGE) are currently considered important in disease, but the mechanisms involved are not yet fully understood. TGE abnormalities expected to cause disease are likely to be initiated during development and to be mediated by aberrant gene expression associated with aberrant promoter methylation that is heritable between generations. However, because methylation is removed and then re-established during development, it is not easy to identify promoter methylation abnormalities by comparing normal lineages with those expected to exhibit TGE abnormalities.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To explore the differential proteome pattern in mouse fibrosis liver in comparison to wild type. Mice were fed with carbon tetrachloride or olive oil vehicle for 15 weeks. Mouse livers from both groups were collected and submitted to MS platform for proteome screening. GO (Gene Ontology) biological process and KEGG (Kyoto Enyoolpedia of Genes and Genomes) pathway enrichment analysis were used to analyze differentially expressed proteins. As the results, we identified 17 382 and 20 486 unique peptides in control and carbon tetrachloride-induced groups, respectively. A total of 4 991 proteins (a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To study mechanisms underlying generalized effects of 3β hydroxysteroid dehydrogenase (HSD3B) inhibition, reproductively mature zebrafish (Danio rerio) were exposed to trilostane at two dosages for 24, 48, or 96 h and their gonadal RNA samples profiled with Agilent zebrafish microarrays. Trilostane had substantial impact on the transcriptional dynamics of zebrafish, as reflected by a number of differentially expressed genes (DEGs) including transcription factors (TFs), altered TF networks, signaling pathways, and Gene Ontology (GO) biological processes. Changes in gene expression between a tre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To decipher the biological pathways involved in keratoconus pathophysiology by determining the patterns of differential gene expression between keratoconus and control corneas.
METHODS: RNA was extracted from surgically removed corneas of 10 keratoconus patients and from normal corneas of 10 control patients who had undergone enucleation of an eye for ocular melanoma. Several hundred thousand RNA transcripts were assessed using exon microarrays. Statistical comparison and identification of differentially regulated and differentially spliced RNA transcripts was performed by comparing
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The journal of maternal-fetal & neonatal medicine : the official journal of the European Association of Perinatal Medicine, the Federation of Asia and Oceania Perinatal Societies, the International Society of Perinatal Obstetricians2009eng
OBJECTIVE: The aim of this study was to identify changes in the cervical transcriptome in the human uterine cervix as a function of ripening before the onset of labor.
STUDY DESIGN: Human cervical tissue was obtained from women at term not in labor with ripe (n = 11) and unripe (n = 11) cervices and profiled using Affymetrix GeneChip HGU133Plus2.0 arrays. Gene expression was analyzed using a moderated t-test (False Discovery Rate 5%). Gene ontology and pathway analysis were performed. Quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction (qRT-PCR) was used for confirmation of selected
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: Psoriasis is a chronic immune-mediated skin disease, with plaque psoriasis being its most prevalent form. Although biologic therapies have significantly improved outcomes for patients with moderate to severe disease, certain anatomical regions often remain resistant to treatment. Given the observed variability in treatment response depending on lesion location, we aimed to explore anatomical site-specific differences in the skin transcriptome. Methods: Using a non-invasive tape-stripping technique, we collected and analyzed 44 psoriatic plaque samples from the scalp, tru
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Skin ageing emerges from the interplay of intrinsic biological decline, environmental exposures and disease-related remodelling, yet the pathway-level epigenetic programs that integrate these processes remain largely unresolved. Here, we develop a skin-specific PathwayAge clock that aggregates DNA methylation into biologically interpretable gene ontology pathways, enabling both precise quantification of epigenetic age and mechanistic dissection of cutaneous ageing. The model demonstrates high accuracy and strong generalisability across multiple independent cohorts, providing a robust foundatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: This cross-sectional study investigated the salivary proteomic profile associated with generalized gingivitis in pregnant women with obesity.
METHODOLOGY: Pregnant women in the third trimester (≥27 weeks of gestation) were divided into two groups based on bleeding on probing (BOP): G1 (BOP>50%; n=9) and G2 (BOP 0-30%; n=9). Collected unstimulated saliva samples were individually analyzed using nano liquid chromatography electron spray ionization tandem mass spectrometry. Identified proteins were classified according to gene ontology for biological processes, molecular functions, immune s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candida albicans, an opportunistic and systemic infection causing fungus, causes skin, nail, and mucosal layer lesions in healthy individuals and hospital borne catheter-related and nosocomial infections. This particular fungus exists in two distinct stages in its life cycle: yeast and hyphae. In this study, 20 signaling pathways associated with 177 proteins from C. albicans were identified to construct a PPI network. The core part of the network consisted of 165 proteins. Network topology analyses revealed that the formed PPI network is biologically robust and scale-free, with significant int
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Survivors of COVID-19 are facing a new vulnerability of encountering post-COVID complications, including cardiovascular diseases (CVDs). Despite the increasing prevalence of CVDs, post-COVID-induced cardiac abnormalities significantly escalate mortality and morbidity. However, some recent studies have begun to elucidate complex pathological signaling pathways in these conditions, further investigation is required to distinguish key genetic and proteomic regulators in post-COVID states precisely. Gene Expression Omnibus (GEO) databases were used to investigate gene expression profiles in post-C
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.