Mutations and aberrant gene expression during cellular differentiation lead to neurodevelopmental disorders, such as Prader-Willi syndrome (PWS), which results from the deletion of an imprinted locus on paternally inherited chromosome 15. We analyzed chromatin-associated RNA in human induced pluripotent cells (iPSCs) upon depletion of hybrid small nucleolar long non-coding RNAs (sno-lncRNAs) and 5' snoRNA capped and polyadenylated long non-coding RNAs (SPA-lncRNAs) transcribed from the locus deleted in PWS. We found that rapid ablation of these lncRNAs affects transcription of specific gene cl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
REV-ERB receptors are members of the nuclear receptor superfamily of proteins, which act as both intracellular receptors and transcription factors, therefore modulating the expression of target genes. REV-ERBs act as transcription repressors because of their unique structure. Their predominant role involves the control of peripheral circadian rhythmicity by participating in a transcription-translation feedback loop with other major clock genes. Regarding their role in cancer pathogenesis, recent studies in various cancerous tissues have revealed that their expression was downregulated in the m
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shwachman-Diamond syndrome is a rare inherited bone marrow failure syndrome characterized by neutropenia, exocrine pancreatic insufficiency, and skeletal abnormalities. In 10-30% of cases, transformation to a myeloid neoplasm occurs. Approximately 90% of patients have biallelic pathogenic variants in the SBDS gene located on human chromosome 7q11. Over the past several years, pathogenic variants in three other genes have been identified to cause similar phenotypes; these are DNAJC21, EFL1, and SRP54. Clinical manifestations involve multiple organ systems and those classically associated with t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We constructed a reversed methylotrophic pathway that produces methanol, a promising feedstock for production of useful compounds, from fructose 6-phosphate (F6P), which can be supplied by catabolism of biomass-derived sugars including glucose, by a synthetic biology approach. Using Escherichia coli as an expression host, we heterologously expressed genes encoding methanol utilization enzymes from methylotrophic bacteria, i.e. the NAD+-dependent methanol dehydrogenase (MDH) from Bacillus methanolicus S1 and an artificial fusion enzyme of 3-hexulose-6-phosphate synthase and 6-phospho-3-hexulois
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quinolones are a family of synthetic broad-spectrum antimicrobial drugs. These molecules have been widely prescribed to treat various infectious diseases and have been classified into several generations based on their spectrum of activity. Quinolones inhibit bacterial DNA synthesis by interfering with the action of DNA gyrase and topoisomerase IV. Mutations in the genes encoding these targets are the most common mechanisms of high-level fluoroquinolone resistance. Moreover, three mechanisms for plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR) have been discovered since 1998 and include Qnr protei
СтатьяСистематический обзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The biosynthetically well-studied landomycin A cluster has been used to demonstrate the unbalancing of gene transcription as an efficient method for the generation of new compounds. Landomycin A structural genes were decoupled from the native regulators LanI and LanK and placed under the control of a single synthetic promoter and expressed in a heterologous host Streptomyces albus J1074. In contrast to their native quantitative and temporal regulation, these genes were transcribed as a single polycistronic mRNA leading to the production of four novel and two known compounds. No glycosylated la
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiplex ligation dependent probe amplification (MLPA) assays were designed for the genes HEXB (OMIM: 606873), GM2A (OMIM: 613109) and SMARCAL1 (OMIM: 606622) of humans. Two sets of synthetic MLPA probes for these coding exons were tested. Changes in copy numbers were detected as well as single nucleotide polymorphisms (SNPs) by complementary DNA sequence analyses. The MLPA method was shown to be reliable for mutation detection and identified five published and 12 new mutations. In all cases from a Morbus Sandhoff cohort of patients, exclusively one variation in copy number was observed and l
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomonas aeruginosa is an important nosocomial opportunistic human pathogen and a major cause of chronic lung infections in individuals with cystic fibrosis. Serious infections by this organism are often treated with a combination of aminoglycosides and semi-synthetic penicillins. Subinhibitory concentrations of antibiotics are now being recognized for their role in microbial persistence and the development of antimicrobial resistance, two very important clinical phenomena. An extensive screen of a P. aeruginosa PAO1 luciferase gene fusion library was performed to identify genes that were d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This review describes the role of nuclear receptors in the regulation of genes involved in cholesterol transport and synthetic modulators of these receptors. Increasing the efflux of cholesterol from peripheral cells, such as lipid-laden macrophages, through a process called reverse cholesterol transport (RCT) requires HDL. Increasing the circulating levels of HDL, as well as the efficiency of the RCT process, could result in a reduction in the development of coronary artery disease and atherosclerosis. Nuclear receptors of the RXR heterodimer family have recently been shown to regulate key ge
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dihydrofolate reductase (DHFR)-based selection system widely used to develop Chinese hamster ovary (CHO) cell lines for the production of therapeutic proteins is limited by low selection stringency, reliance on stepwise gene amplification, and restricted capacity for efficient multigene selection. In this study, we developed a highly stringent split DHFR selectable marker by integrating a computationally guided split-site design with split intein-mediated protein ligation (SiMPl) in CHO cells. Using the synthetic SiMPl-DHFR selection system, the proportion of Fc-fusion glycoprotein-produci
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The antifungal agent amphotericin B (AmB) is a polyketide produced by Streptomyces nodosus. The synthetic precursors of the amphotericin macrolactone skeleton are acetyl-CoA, malonyl-CoA and methylmalonyl-CoA. The genome sequence of the wild type S. nodosus ATCC14899 revealed a type II polyketide synthase (PKS) competing for malonyl-CoA. The same competitive branch was sequenced and verified in a mutant named S. nodosus ZJB2016050 (S. nodosus N3) screened in our lab. The transcriptome of the secondary metabolic synthetic gene cluster comparisons suggested that type II PKS (PKS5) competition is
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitamin A is important for the circadian timing system; deficiency disrupts daily rhythms in activity and clock gene expression, and reduces the nocturnal peak in melatonin in the pineal gland. However, it is currently unknown how these effects are mediated. Vitamin A primarily acts via the active metabolite, retinoic acid (RA), a transcriptional regulator with emerging non-genomic activities. We investigated whether RA is subject to diurnal variation in synthesis and signaling in the rat pineal gland. Its involvement in two key molecular rhythms in this gland was also examined: kinase activat
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The farnesoid X receptor (FXR) is a ligand-activated transcription factor that plays important roles in regulating bile acid homeostasis. The aim of the present study was to investigate the effects of obeticholic acid (OCA), a novel synthetic FXR agonist, carbon tetrachloride (CCl4)-induced acute liver injury. Mice were intraperitoneally injected with CCl4 (0.15ml/kg). In CCl4+OCA group, mice were orally with OCA (5mg/kg) 48, 24 and 1h before CCl4. As expected, hepatic FXR was activated by OCA. Interestingly, OCA pretreatment alleviated CCl4-induced elevation of serum ALT and hepatic necrosis.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chloroquine (CQ) and other quinoline-containing antimalarials are important drugs with many therapeutic benefits as well as adverse effects. However, the molecular targets underlying most such effects are largely unknown. By taking a novel functional genomics strategy, which employs a unique combination of genome-wide drug-gene synthetic lethality (DGSL), gene-gene synthetic lethality (GGSL), and dosage suppression (DS) screens in the model organism Saccharomyces cerevisiae and is thus termed SL/DS for simplicity, we found that CQ inhibits the thiamine transporters Thi7, Nrt1, and Thi72 in yea
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The presence of hepatitis B virus (HBV) covalently closed circular (ccc) DNA (cccDNA), which serves as a template for viral replication and integration of HBV DNA into the host cell genome, sustains liver pathogenesis and constitutes an intractable barrier to the eradication of chronic HBV infection. The current antiviral therapy for HBV infection, using nucleos(t)ide analogues (NAs), can suppress HBV replication but cannot eliminate integrated HBV DNA and episomal cccDNA. Clustered regularly interspaced short palindromic repeat (CRISPR)/Cas9 is a powerful genetic tool that can edit integrated
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The vaccine efficacy of the gene sequence encoding the signal peptide of the antigen known as antigen 2 or proline-rich antigen (Ag2/PRA), an immunodominant antigen present in the cell wall of the fungal pathogen Coccidioides immitis, was investigated in a murine model of coccidioidomycosis. Expression plasmids for Ag2/PRA(1-18) DNA (signal sequence), Ag2/PRA(19-194) DNA (lacking the signal sequence), and Ag2/PRA(1-194) DNA (full length) were inserted in the pVR1012 vector, and the constructs were used to vaccinate the highly susceptible BALB/c mouse strain. Immunization with the signal gene s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cementum is a key component of a functional periodontal organ. However, regenerating lost cementum is difficult and often incomplete. Identifying molecular mediators of cementoblast differentiation and function should lead to better targeted treatment for periodontitis. Prostaglandins increase mineralization of murine cementoblastic OCCM cells and alveolar bone formation, whereas the cytokine interleukin-1 (IL-1) inhibits alveolar bone formation. We hypothesized that differentially induced primary genes in OCCM cells may mediate anabolic and catabolic responses. Our objective was t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung adenocarcinoma (LUAD) exhibits considerable heterogeneity and therapeutic resistance. Here, we integrated single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomics, and machine learning to characterize synthetic lethality (SL)-associated transcriptional activity in LUAD. We quantified SL activity across malignant epithelial cells and stratified them into high-, dominant-, and low-SL groups. High-SL cells were enriched in advanced-stage and metastatic samples and showed reduced differentiation potential. Through multiple machine learning algorithms, we identified 13 high-SL signature genes, with
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlorophylls are essential for photosynthesis, yet their heterologous production is a major challenge in synthetic biology due to pathway complexity and the diversion of resources away from essential cofactor biosynthesis. Here, we reconstruct the complete chlorophyll biosynthetic pathway in Saccharomyces cerevisiae. By integrating 13 heterologous genes and deleting 3 endogenous genes, we engineered a yeast chassis capable of producing chlorophyll a at titers of 26 micrograms per gram of dry cell weight. This platform was further expanded with a ketocarotenoid biosynthetic module to produce ec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Growing resistance toward ribosome-targeting macrolide antibiotics has limited their clinical utility and urged the search for superior compounds. Macrolones are synthetic macrolide derivatives with a quinolone side chain, structurally similar to DNA topoisomerase-targeting fluoroquinolones. While macrolones show enhanced activity, their modes of action have remained unknown. Here, we present the first structures of ribosome-bound macrolones, showing that the macrolide part occupies the macrolide-binding site in the ribosomal exit tunnel, whereas the quinolone moiety establishes new interactio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования