We report the case of a 48-year-old man admitted with severe pneumonia, profound immunosuppression and multiple co-infections, showing unusual pattern of HIV-1 viremia. With the Aptima HIV-1 Quant Dx assay, a dual-target diagnostic assay for monitoring of viral RNA in people living with HIV-1 (PWH), the patient showed viral RNA consistently detected exclusively through the pol target, while the LTR signal remained absent in all samples during one year of follow-up on antiretroviral therapy. Despite this persistent atypical viral load (pol+/LTR-), near full-length next-generation sequencing of
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: HIV-1C has been shown to have a greater risk of virological failure and reduced susceptibility towards boosted protease inhibitors (bPIs), a component of second-line combination antiretroviral therapy (cART) in South Africa. This study entailed an evaluation of HIV-1 drug resistance-associated mutations (RAMs) among minor viral populations through high-throughput sequencing genotypic resistance testing (HTS-GRT) in patients on the South African national second-line cART regimen receiving bPIs.
METHODS: During 2017 and 2018, 67 patient samples were sequenced using high-throughput s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To determine effects of cryptococcal meningitis (CM) on human immunodeficiency virus (HIV)-1C cerebrospinal fluid (CSF) viral escape, CSF/plasma viral discordance, and drug resistance mutation (DRM) discordance between CSF and plasma compartments, we compared CSF and plasma viral load (VL) and DRMs in individuals with HIV-associated CM in Botswana.This cross-sectional study utilized 45 paired CSF/plasma samples from participants in a CM treatment trial (2014-2016). HIV-1 VL was determined and HIV-1 protease and reverse transcriptase genotyping performed. DRMs were determined using the Stanford
Сравнительное исследованиеСтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dystrophin gene (DMD) is the largest gene in the human genome, mapping on the Xp21 chromosome locus. It spans 2.2Mb and accounts for approximately 0,1% of the entire human genome. Mutations in this gene cause Duchenne and Becker Muscular Dystrophy, X-linked Dilated Cardiomyopathy, and other milder muscle phenotypes. Beside the remarkable number of reports describing dystrophin gene expression and the pathogenic consequences of the gene mutations in dystrophinopathies, the full scenario of the DMD transcription dynamics remains however, poorly understood. Considering that the full transcrip
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The plumb line (PL) is a common tool for assessing the sagittal curvatures of the spine, but its accuracy depends on the ability of the physician to use it correctly. This study aimed to present a fixed plumb line (FPL) no longer held by a physician but fixed to a support, evaluating the reliability in posture assessment, comparing it with PL in both adolescent with and without scoliosis.
METHODS: The study evaluated the sagittal distances of the spine using a PL and a FPL in 80 young adults aged between 28.7 ± 7.2 and 55 adolescents aged between 12.4 ± 2.3, with and without scoli
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prevalence of porcine endogenous retrovirus (PERV) proviral DNA among various pig breeds raised in Japan was investigated by polymerase chain reaction (PCR). Moreover, potential infection of PERV was investigated by PCR and reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) in experimentally induced diabetic dogs (n=5) implanted with the diffusion chamber type bio-artificial endocrine pancreas (Bio-AEP) containing porcine pancreatic endocrine (PE) cells. No immunosuppressant was used after the transplantation. PERV gag, pol, env-A and env-B genes were detected in any pigs examined. I
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hainan is experiencing a continuous increase in newly diagnosed HIV-1 infections, highlighting the need for a comprehensive understanding of local transmission dynamics. This study aims to elucidate the genetic diversity and potential HIV-1 molecular transmission networks among people living with HIV-1 in Hainan, China.
METHODS: We used the HIV-TRACE to infer the transmission dynamics of HIV-1 at a 1.5% gene distance threshold. The role of HIV-1 diversity in transmission networks was assessed through node influence measurement and centrality analysis.
RESULTS: A total of 986 pol
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To investigate the epidemic patterns of pretreatment drug resistance (PDR) and acquired drug resistance (ADR) in HIV-1 sequences from China.
METHODS: HIV-1 pol sequences and associated epidemiological data were collected from the Los Alamos HIV Sequence Database, NCBI, HIV Gene Sequence Database and PubMed. Genotypic resistance and subtypes were identified using the Stanford HIV Drug Resistance Database.
RESULTS: A total of 36 263 sequences from ART-naïve individuals and 1548 sequences from ART-experienced individuals with virological failure were evaluated. PDR prevalence was 6.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Understanding the dynamics of HIV-1 transmission is essential for developing effective screening and intervention strategies. Viral genetic sequences provide valuable information that can be used to infer the history and patterns of viral transmission.
PURPOSE: Our study explores the structure and dynamics of HIV transmissions in Poland from 1999 to 2022 to elucidate key patterns related with national epidemics.
METHODS: To understand the temporal dynamics of transmission routes we examined HIV pol sequence data from 5705 Polish PWH. The HIV-TRAnsmission Cluster Engine (HIV-TRACE
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterovirus A71 (EV-A71) is a highly contagious virus that poses a major threat to global health, representing the primary etiological agent for hand-foot and mouth disease (HFMD) and neurological complications. It has been established that interferon signaling is critical to establishing a robust antiviral state in host cells, mainly mediated through the antiviral effects of numerous interferon-stimulated genes (ISGs). The host restriction factor SHFL is a novel ISG with broad antiviral activity against various viruses through diverse underlying molecular mechanisms. Although SHFL is widely a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To understand the prevalence of drug resistance in treatment-naive injecting drug users (IDUs) infected with HIV-1 in Guangzhou. Methods: HIV-1 RNA were extracted from the serum specimens of the newly confirmed HIV-1 positive IDUs living in Guangzhou, being infected through injecting drug use and receiving no antiretroviral therapy at the time of confirmation during 2008-2015. Full sequence of pol protease (PR) gene and partial sequence of reverse transcriptase (RT) gene were amplified by nested reverse transcription polymerase chain reaction (nested-PCR) and sequenced. After that,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Syphilis is a systemic and sexually transmitted infection caused by Treponema pallidum ssp. pallidum. This spirochete causes different clinical and subclinical stages depending on the duration of infection and immune status of the host. Several tests have been developed for diagnosis, and are classified into direct and indirect methods. The first one includes dark field microscopy, direct fluorescent antibody test in fluids or tissue, and molecular biology techniques. In the indirect method (serologic), the routine tests are used, and are divided in two categories: non-treponemal and treponema
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Translational readthrough--suppression of termination at a stop codon--is exploited in the replication cycles of several viruses and represents a potential target for antiviral intervention. In the gammaretroviruses, typified by Moloney murine leukemia virus (MuLV), gag and pol are in the same reading frame, separated by a UAG stop codon, and termination codon readthrough is required for expression of the viral Gag-Pol fusion protein. Here, we investigated the effect on MuLV replication of modulating readthrough efficiency. We began by manipulating the readthrough signal in the con
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arboviruses with genomes composed of 12 segments of double-stranded (ds) RNA have previously been classified as members or probable members of the genus Coltivirus within the family REOVIRIDAE: A number of these viruses have been isolated in North America and Europe and are serologically and genetically related to Colorado tick fever virus, the Coltivirus type species. These isolates constitute subgroup A of the coltiviruses. The complete genome sequences are now presented of two Asian arboviruses, Kadipiro virus (KDV) and Banna virus (BAV), which are currently classified as subgroup B coltivi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candida albicans, a major human fungal pathogen undergoes filamentation from yeast to hyphal state under filamentation-inducing conditions. Gcn5 and Esa1 are key histone H3 and H4 acetyltransferases, respectively, encoded by the budding yeast and other eukaryotes. While Gcn5, a subunit of the SAGA complex, and Esa1, a subunit of the NuA4 complex, are critical for C. albicans virulence and hyphal induction, how the relative HAT activities impinge on hyphal gene expression during filamentation is less understood. We found that hyphal gene promoters are hyperacetylated at H3K9 and H4 upon filamen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Human endogenous retroviruses (HERVs) are ancient retroviruses that infected the germline cells of our ancestors millions of years ago. Due to the typical replication process, they have endogenized and are fixed in the host genome, and at present, HERVs comprise approximately 8% of the human genome. HERVs play several roles in human physiology, but they are also involved in certain diseases, particularly in autoimmune diseases. However, there is limited information regarding the interplay of HERVs on vitiligo. Therefore, the aim of this study was to determine the frequency and th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alterations in biological rhythms are a common feature of aging, and disruption of circadian rhythms can exacerbate age-associated pathologies. The retina is critical for detecting light for both vision and for transmitting time-of-day information to the brain, synchronizing rhythms throughout the body. Disruption of circadian rhythms by manipulating the molecular clock leads to premature retinal degeneration in flies and mice, and gene expression rhythms are altered in models of age-associated ocular disease. Despite this, it is unknown how or why the gene expression rhythms of the retina cha
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV transgenic mice bearing multiple copies of a noninfectious (Deltagag/pol) proviral DNA were tested for the systemic production of nitric oxide (NO). Serum levels of NO metabolites were reduced about 50% in HIV transgenic mice compared with nontransgenic sibling mice. This difference persisted when NO production was induced with peritoneal injections of bacterial endotoxin (LPS). Peritoneal inflammatory macrophages, but not resident peritoneal macrophages, derived from HIV-1 transgenic mice and activated in vitro with LPS and IFN-gamma (or tumor necrosis factor alpha and IFN-gamma) also pro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleotide excision repair (NER) defects are associated with cancer, developmental disorders and neurodegeneration. However, with the exception of cancer, the links between defects in NER and developmental abnormalities are not well understood. Here, we show that the ERCC1-XPF NER endonuclease assembles on active promoters in vivo and facilitates chromatin modifications for transcription during mammalian development. We find that Ercc1(-/-) mice demonstrate striking physiological, metabolic and gene expression parallels with Taf10(-/-) animals carrying a liver-specific transcription factor II
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To determine whether macropodid herpesvirus 1 (MaHV-1) could infect brushtail possums (Trichosurus vulpecula) and whether such infection would lead to latency in possums.
METHODS: Possums (n=9) were instilled with 1.9 x 10(8) TCID50 of MaHV-1 into the conjunctivae and nostrils, while controls (n=3) were administrated with sterile saline. For virus isolation, all possums were swabbed from the conjunctivae and nasal cavities prior to inoculation, and on Days 1, 3, 7, 10 and 14 post-inoculation (p.i.), and then at weekly intervals for up to a further 6 weeks. Sera were collected on Day 0 im
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.