BACKGROUND: Total neoadjuvant therapy (TNT) has emerged as a promising treatment strategy for locally advanced rectal cancer; however, robust biomarkers predicting treatment response remain lacking. We aimed to identify pretreatment transcriptomic determinants of TNT response, focusing on cytotoxic immune activity and its broader immune context.
METHODS: We analyzed two independent cohorts of patients with rectal cancer treated with TNT: a laser-capture microdissection (LCM) cohort (n = 154) and a bulk tumor cohort (n = 80). Differential gene expression, gene set enrichment, and immune deconv
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Fontan surgery improves outcomes in univentricular heart disease; however, some patients develop severe Fontan-associated liver disease (FALD). Even during adolescence, hepatocellular carcinoma occurs in some patients with FALD, although the mechanism remains unclear. In this study, we conducted proteomic analyses of liver tissues obtained using laser capture microdissection (LCM) and serum samples to investigate FALD-related peripheral liver oncogenic factors and explore potential biomarkers.
METHODS: Ten-week-old mice underwent sham surgery, and age-matched mice underwent partial ligat…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Netrin1, a developmental cue, is a master regulator of tumour epithelial-to-mesenchymal transition (EMT)1, a mechanism that is known to driv … ing alive at the time of data cut-off. Post-therapy conversion surgery occurred in 23% of patients. Laser capture microdissection was performed on pre-therapeutic biopsies and surgical specimens. Microbulk RNA sequencing confirmed that the main pathway that was down-regulated with the combination of mFOLFIRINOX plus NP137 was EMT. Moreover, survival outcomes were extended for …
СтатьяКлиническое исследование I фазыПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is characterised by the intraneuronal aggregation of phosphorylated Tau (pTau) into neurofibrillary tangles and by the extracellular deposition of β-amyloid (Aβ). Tau pathology restricted to the medio-temporal lobe is frequently observed in the elderly brain in the absence of any Aβ deposition and considered as "primary age-related tauopathy" (PART). Here, we applied an unbiased proteomic approach to determine if and how concomitant Aβ pathology modifies the neurofibrillary tangle proteome. Neurofibrillary tangles were isolated by laser capture microdissection from hip…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurodegenerative disease risk following traumatic brain injury (TBI) has been associated with vascular abnormalities and brain inflammation … erative diseases. At 6-months post-injury, a timepoint with known cognitive impairment, we employed laser capture microdissection (LCM) to isolate parenchymal blood vessels from the CA1 subregion of the hippocampus in Sprague-Dawley rats subjected to either sham or midline fluid percussion injury. LCM vessels were processed for RNA sequencing and differentially expressed gene …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometriosis is a chronic inflammatory condition affecting 10% of reproductive-age women. Current treatments remain limited and non-curativ … polymerase chain reaction (qPCR), immunohistochemistry (IHC), RNA in situ hybridization (ISH), and laser capture microdissection (LCM) coupled with qPCR. In silico analyses revealed small effect sizes and inconsistent directional change in MAP4K4 dysregulation across public datasets. MAP4K4 mRNA levels differed significantly between pipelle and full-thickness eutopic biopsies …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ABSTRACT Multiple myeloma is a genetically complex plasma cell malignancy in which profound intra-tumoral heterogeneity shapes disease progr … l states. To test this, we here demonstrate a proof-of-concept spatial tri-omics workflow combining laser capture microdissection-based genomics and deep LC-MS/MS proteomics with single-cell spatial transcriptomics, integrated by digital co-registration of adjacent tissue sections. Applied to a myeloma bone marrow trephine, this approach enabled coordinated profiling of matche …
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Individuals with Down syndrome (DS) have intellectual disability and develop Alzheimer's disease (AD) pathology during midlife, … dependent on spatial localization and innervation patterns within discrete CA1 subfields.
METHODS: Laser capture microdissection was performed on trisomic CA1 PNs in an established mouse model of DS/AD compared to disomic controls, isolating the entire CA1 pyramidal neuron layer and sublayer microisolations of deep and superficial PNs from the distal CA1 (CA1a) region.
RESUL …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ovary is one of the first organs to exhibit signs of aging, characterized by reduced tissue function, chronic inflammation, and fibrosis … oss age and species using advanced imaging technologies as well as their unique transcriptome using laser capture microdissection. MNGCs form complex interconnected networks that increase with age in both mouse and nonhuman primate ovaries. MNGCs are characterized by high Gpnmb expression, a putative marker of ovarian and non-ovarian MNGCs 5,6 . Pathway analysis highlighted fu …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Seborrheic keratosis (SK) is a common benign tumour, often associated with hyperpigmentation. To investigate the mechanism of melanin accumulation in SK, we have conducted comprehensive gene expression and histological analyses. We obtained five pairs of skin samples, including non-lesional and SK samples, from the backs of three male Japanese participants aged 40-59 years. To examine melanocytes and keratinocytes in SK, three pairs of skin samples were separated by laser capture microdissection into the basal layer and the other layer in the epidermis. We performed a comprehensive gene expres…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intestinal edema is a common manifestation of numerous gastrointestinal diseases and is characterized by the accumulation of fluid in the interstitial space of the intestinal wall. Technical advances in laser capture microdissection and low-biomass proteomics now allow us to specifically characterize the intestinal edema proteome. Using advanced proteomics, we identify peptides derived from antimicrobial factors with high signal intensity, but also highlight major contributions from the blood clotting system, extracellular matrix (ECM) and protease-protease inhibitor networks. The ECM is a com…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Although recent efforts have led to the development of highly effective androgen receptor (AR)-directed therapies for the treatm … in reduced NEPC tumor cell proliferation and migration in vitro. We provide in vivo data including laser capture microdissection followed by RNA-seq data supporting a causal role of CELSR3 in the development and/or maintenance of the phenotype associated with NEPC. Finally, we provide initial data that suggests CELSR3 is a target for T-cell redirection therapeutics. Further w …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ocular lens, along with the cornea, focuses light on the retina to generate sharp images. Opacification of the lens, or cataract, is the … in large amounts. High-throughput RNA-sequencing (RNA-seq) on specific organoid regions isolated by laser capture microdissection (LCM) and immunofluorescence assays demonstrate that these lens organoids display spatiotemporal expression of key lens genes, e.g. , Jag1 , Pax6 , Prox1 , Hsf4 and Cryab . Further, these lens organoids are amenable to induction of opacities. Finall …
ПрепринтСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer stem cells (CSCs) usually account for a very small tumor cell population but play pivotal roles in human cancer development and recur … r cells of liver cancer patients. We then developed a robust method combining immunohistochemistry, laser capture microdissection and genome sequencing with ultra-low-input cells (CIL-seq) to study the detailed genetic and DNA methylation changes in human LCSL cells. We first used clinical samples of mixed hepatocellular carcinoma-cholangiocarcinoma (HCC-CCA) with stem cell fe …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Animal models are important to mimic certain pathways or biological aspects of human pathologies including acute and chronic pulmonary diseases. We developed a novel and flexible mouse model of acute epithelial lung injury based on adeno-associated virus (AAV) variant 6.2-mediated expression of the human diphtheria toxin receptor (DTR). Following intratracheal administration of diphtheria toxin (DT), a cell-specific death of bronchial and alveolar epithelial cells can be observed. In contrast to other lung injury models, the here described mouse model provides the possibility of targeted injur
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The acquisition of oncogenic drivers is a critical feature of cancer progression. For some carcinomas, it is clear that certain … munohistochemistry on fixed paraffin-embedded tissue.
RESULTS: By combining the HER2-FISH with the laser capture microdissection (LCM) Smart-3SEQ method, we found that HER2 amplification in DCIS alters the transcriptomic profiles and increases diversity of copy number variations (CNVs). Particularly, interferon signaling pathway is activated by HER2 amplification in DCIS, whi …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tissue-resident-memory T cells (TRM) populate the body's barrier surfaces, functioning as frontline responders against reencountered pathogens. Understanding of the mechanisms by which CD8TRM achieve effective immune protection remains incomplete in a naturally recurring human disease. Using laser capture microdissection and transcriptional profiling, we investigate the impact of CD8TRM on the tissue microenvironment in skin biopsies sequentially obtained from a clinical cohort of diverse disease expression during herpes simplex virus 2 (HSV-2) reactivation. Epithelial cells neighboring CD8TRM…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the period of maternal recognition of pregnancy (MRP) in the mare, the embryo needs to signal its presence to the endometrium to prevent regression of the corpus luteum and prepare for establishment of pregnancy. This is achieved by mechanical stimuli and release of various signaling molecules by the equine embryo while migrating through the uterus. We hypothesized that embryo's signals induce changes in the endometrial gene expression in a highly cell type-specific manner. A spatiotemporal transcriptomics approach was applied combining laser capture microdissection and low-input-RNA se…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thyroid carcinoma incidence rates in western societies are among the fastest rising, compared to all malignant tumors over the past two decades. While risk factors such as age and exposure to ionizing radiation are known, early-state carcinogenic processes or pre-lesions are poorly understood or unknown. This study aims at the identification and characterization of early-state radiation-associated neoplastic processes by histologic and transcriptomic analyses of thyroid tissues derived from a mouse model. Comprehensive histological examination of 246 thyroids (164 exposed, 82 non-exposed) was
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To develop a comprehensive diagnostic system for mucormycosis from formalin-fixed paraffin-embedded tissues, consisting of own-de … PE) tissues from forty-four mouse model infected by above fungi were collected and extracted DNA by laser capture microdissection (LCM) and direct extraction methods for real-time PCR assays. In addition, seventeen clinical specimens histopathologically proven for mucormycosis were included for specific detection with the new diagnostic system.
RESULTS: The real-time PCR assa …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования