Metachromatic leukodystrophy (MLD) is an autosomal recessive disorder caused by mutations in arylsulfatase A (ARSA) gene. No work on molecul … ied out for two novel missense mutations identified, to assess the effect of these mutations on the protein conformation. Nine pathogenic alleles were found in 13 patients (65%). Four previously reported mutations and five novel variants were identified. Five patients (35%) were found to have pseudodeficiency alleles, c.1049A>G (p.Asn350Ser) and c.1524+95A>G. Genotype …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
α-Synuclein (α-syn), an aggregation-prone amyloid protein, has been suggested as a potential cause of Parkinson's disease. When misfolded, α-syn aggregates as Lewy bodies in the brain, the loss of which can disrupt protein homeostasis. To investigate the potential of nanoparticle-mediated therapy for amyloid diseases, α-syn adsorption onto positively charged poly(allylamine hydrochloride) coated gold nanoparticles (PAH Au NPs) was studied. α-Syn adsorbs in multilayers onto PAH Au NPs, which with increasing α-syn/PAH Au NP ratios (>2000 α-syn/PAH Au NP) results in the flocculation and sedimenta
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The transmissible spongiform encephalopathies (TSE), or prion diseases are a group of transmissible neurodegenerative disorders of humans and animals. Although the infectious agent (the 'prion') has not yet been formally defined at the molecular level, much evidence exists to suggest that the major or sole component is an abnormal isoform of the host encoded prion protein (PrP). Different strains or isolates of the infectious agent exist, which exhibit characteristic disease phenotypes when transmitted to susceptible animals. In the absence of a nucleic acid genome it has been hard to accommod
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In Alzheimer's disease (AD), the interaction between many AD-relevant proteins, including amyloid precursor protein (APP) and tau, with the cysteine protease caspase-3 (Cas3) enhances AD pathogenesis. Searching for effective Cas3 inhibitors, we turned to the sensor calbindin-D28K (D28K) which specifically inhibits Cas3. The specific D28K conformation that elicits Cas3 inhibition remains elusive. To shed more light on this D28K conformation, we investigated likely environmental regulators. Recently, evidence of pH imbalance in aging brains has been implicated in AD pathologies. Using pull-down
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tetracycline (TC) and its derivatives have recently been proposed as a new class of antagonists in prion diseases as they prevent the aggregation of prion protein peptides and their acquisition of protease resistance in vitro and in vivo. Looking for relationships between conformational flexibility and biological activity, we searched for a geometrical pharmacophore by investigating, in aqueous solution, the conformational behavior of 15 TCs in both the zwitterionic and the anionic forms. For TC similar conformational flexibility was found for the two forms and two main conformational families
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aggregation of alpha-synuclein is believed to be a critical factor in the etiology of Parkinson's disease. alpha-Synuclein is an abundant neuronal protein of unknown function, which is enriched in the presynaptic terminals of neurons. Although alpha-synuclein is found predominantly in the cytosolic fractions, membrane-bound alpha-synuclein has been suggested to play an important role in fibril formation. The effects of alpha-synuclein on lipid bilayers of different compositions were determined using fluorescent environment-specific probes located at various depths. alpha-Synuclein-membrane
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
NMR spectroscopy provides a unique means to study molecular conformation, mechanisms of action and structure-function relationships for peptides and proteins in solution under conditions approaching those of their physiological environment. Development of NMR techniques, especially directed to the peptide and protein conformational analysis, is considered under the topics of two-level signal assignment and structural significance of homo- and heteronuclear spin-spin couplings. The results of NMR conformational analysis are presented for solution spatial structure of valinomy cin and gramicidin…
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pleural mesothelial cells (PMCs) have been identified as key contributors to pleural fibrosis. Cellular communication network factor 1 (CCN1), a matricellular protein, regulates cell–matrix interactions and fibrotic signaling in multiple contexts. However, the specific role and mechanism of CCN1 in PMCs during pleural fibrosis remained unclear. METHODS: Expression of CCN1 was evaluated in human pleural fibrosis samples and bleomycin-induced mouse models. In vitro, PMCs were treated with recombinant CCN1 or fibrotic matrix. Mechanistic studies included gene knockdown, immunoprecipit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding conformational changes of the coronavirus spike protein is critical for developing broad-spectrum therapies. The pan-coronavirus epitope spike residues 815-825 (centred on the S2' site) are buried in the prefusion spike but are transiently exposed upon ACE2 binding1,2. Here, using integrated functional and structural analyses, we demonstrate that 76E1, an antibody targeting spike residues 815-825, specifically recognizes an open early fusion intermediate conformation in which this epitope adopts a helical conformation, designated the S2'-helix. SARS-CoV-2 Omicron variants evade s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-structural protein 15 (Nsp15) of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) forms a homo hexamer and functions as an endoribonuclease. Here, we propose that Nsp15 activity may be inhibited by preventing its hexamerization through drug binding. We first explored the stable conformation of the Nsp15 monomer as the global free energy minimum conformation in the free energy landscape using a combination of parallel cascade selection molecular dynamics (PaCS-MD) and the Markov state model (MSM), and found that the Nsp15 monomer forms a more open conformation with larger drugga
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pemphigus vulgaris (PV) is an autoimmune blistering disease, in which autoantibodies against PV antigen (PVA or Dsg3) play a pathogenic role in inducing blister formation. Bacterial fusion proteins of PVA failed to absorb pathogenic autoantibodies from PV patients' sera probably because they did not represent the proper conformation. Therefore, a chimeric protein, PVIg, consisting of the whole extracellular domain of PVA and the constant region of human IgG1, was produced in either in COS7 or in insect Sf9 eucaryotic cells. Both PVIg-COS7 and PVIg-Sf9 were recognized by all of the 35 PV sera t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This method describes the combination of chemical cross-linking and high-resolution mass spectrometry for analyzing conformational changes in target proteins that are induced by drug binding. Our approach is exemplified for detecting conformational changes within the peroxisome proliferator-activated receptor alpha upon binding of low-molecular weight compounds, proving that our strategy provides a basis to efficiently characterize target protein-drug interactions.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Earlier studies have failed to detect covalent modifications in beta-sheet-rich scrapie isoform prion protein (PrP(Sc)) and have concluded that the conversion of alpha-helix-rich cellular form prion protein (PrP(C)) to PrP(Sc) represents purely conformational transition not involving chemical reactions. However, recent studies have shown that the intradisulfide bond of PrP(C) can play an important role for instability and conformational change to PrP(Sc). Interestingly, we found overexpressed protein disufide isomerase (PDI) in brains of sporadic Creutzfeldt-Jakob disease (sCJD, human prion di
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lysosomal accumulation of cholesterol is a hallmark of Niemann Pick type C (NPC) disease caused by mutations primarily in the lysosomal membrane protein NPC1. NPC1 contains a transmembrane sterol-sensing domain (SSD), which is supposed to regulate protein activity upon cholesterol binding, but the mechanisms underlying this process are poorly understood. Using atomistic simulations, we show that in the absence of cholesterol in the SSD, the luminal domains of NPC1 are highly dynamic, resulting in the disengagement of the NTD from the rest of the protein. The disengaged NPC1 adopts a flexed con
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Certain proteins undergo a substantial conformational change in response to a given stimulus. This conformational change can manifest in different manners and result in an actuation, that is, catalytic or signalling event, movement, interaction with other proteins, and so on. In all cases, the sensing-actuation process of proteins is initiated by a recognition event that translates into a mechanical action. Thus, proteins are ideal components for designing new nanomaterials that are intelligent and can perform desired mechanical actions in response to target stimuli. A number of approaches hav
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For a protein to perform its biological functions, it must adopt a specific three-dimensional conformation. In addition, many proteins require the assistance of other protein complexes known as chaperonins to fold -i.e., to acquire such a specific conformation-, although the exact mechanisms whereby the chaperonins act and assist the folding process have not been completely determined. In this work, we characterize the physical environment at the interior of the chaperonin HSP60/HSP10 via Molecular Dynamics Simulations. We found that, inside the cavity of the chaperonin (within a region coveri
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polyvalent antigen display is an effective strategy to enhance the immunogenicity of subunit vaccines by clustering them in an array-like ma … ot affect protein assembly, thermal stability or exposure of the epitope, but had a minor impact on protein conformation. Formaldehyde crosslinking considerably improved protein thermal stability with only minor impact on protein conformation. All LS_PB10 constructs, when administered to mice by injection without adjuvant, elicited measurable anti-ricin serum IgG tite …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aggregation of the 140-amino acid protein α-synuclein (α-syn) is linked to the development of Parkinson's disease (PD). α-Syn is a copper binding protein with potential function as a regulator of metal-dependent redox activity. Epidemiological studies suggest that human exposure to excess copper increases the incidence of PD. α-Syn exists in both solution and membrane-bound forms. Previous work evaluated the Cu(2+) uptake for α-syn in solution and identified Met1-Asp2 and His50 as primary contributors to the coordination shell, with a dissociation constant of approximately 0.1 nM. When bound t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An inhibitory receptor for cardioactive steroids such as digoxin and ouabain is located at the extracellular surface of the Na-K-adenosinetriphosphatase (ATPase) molecule. Besides cardioactive steroids, mercury is a potent inhibitor of the Na-K-ATPase activity. The half-maximal inhibitory concentration (IC50), determined within 30 min at 37 degrees C at 1 microgram protein/ml, was 200 nM, despite the presence of 1 mM EDTA; the IC50 decreased with increasing protein/inhibitor ratio, and it reached 2.7 microM at 0.1 mg protein/ml and 20 microM at 1 mg protein/ml. The IC50 for Na-K-ATPase inhibit
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Resistance to antibiotics has become a major threat to modern medicine. The ribosome plays a fundamental role in cell vitality by the translation of the genetic code into proteins; hence, it is a major target for clinically useful antibiotics. We report here the cryo-electron microscopy structures of the ribosome of a pathogenic aminoglycoside (AG)-resistant Pseudomonas aeruginosa strain, as well as of a nonresistance strain isolated from a cystic fibrosis patient. The structural studies disclosed defective ribosome complex formation due to a conformational change of rRNA helix H69, an essenti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования