The objective of this study was to investigate the changes of the proteins in bovine milk serum after retort processing by label-free quantification proteomics techniques. A total of 96 and 106 proteins were quantified in control group (CG) and retort group (RG), respectively. Hierarchical clustering analysis of the identified milk serum proteins showed a decrease in the abundance of most proteins, such as serum albumin, lactoperoxidase, lactotransferrin, and complement C3, and an increase in the abundance of other proteins such as κ-casein, lipocalin 2, and Perilipin. Student's t-test showed …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toxoplasma gondii has a complex two-host life-cycle between intermediate host and definitive host. Understanding proteomic variations across the life-cycle stages of T. gondii may improve the understanding of molecular adaption mechanism of T. gondii across life-cycle stages, and should have implications for the development of new treatment and prevention interventions against T. gondii infection. Here, we utilized LC-MS/MS coupled with iTRAQ labeling technology to identify differentially expressed proteins (DEPs) specific to tachyzoite (T), bradyzoites-containing cyst (C) and sporulated oocys
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recent emergence of methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius (MRSP) has complicated considerably the treatment of infections caused by these bacteria. Therefore new treatment strategies are urgently needed, namely through the development of vaccines towards the control of bacterial infections. Our study describes an extensive characterization of the proteome of S. pseudintermedius through a 2-DE MALDI-TOF/TOF approach, followed by SERological Proteome Analysis (SERPA) to identify potential vaccine candidate antigens. We were able to identify 361 unique proteins, of which 39 ar
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Sex hormones, particularly androgens, may influence not only adipose tissue distribution but also its functions.
OBJECTIVE: We aimed to evaluate if sexual dimorphism in body composition is accompanied by differences in the protein abundance of adipose tissue by applying a nontargeted proteomic approach.
DESIGN: This was a case-control study.
SETTINGS: The setting was an academic hospital.
PATIENTS: Twenty-one morbidly obese patients, including 7 men, 7 women showing no evidence of androgen excess, and 7 hyperandrogenic women with polycystic ovary syndrome.
INTERVENTIONS: We obtai
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hydroxyurea (HU) is an effective oral drug for the management of homozygous sickle cell anemia (SS) in part because it increases fetal hemoglobin (HbF) levels within sickle red blood cells (RBCs) and thus reduces sickling. However, results from the Multicenter Study of HU suggested that clinical symptoms often improved before a significant increase in HbF levels occurred. This indicated that HU may be acting through the modification of additional cellular mechanisms that are yet to be identified. Hence, in this study, we focused on the analysis of the sickle RBC membrane proteome +/- HU treatm
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteomics, the comprehensive study of protein expression, localization, and modifications, has evolved from a fundamental research tool into a key complementary layer to genomics in antitumor drug development and precision oncology. This review highlights its multi-dimensional applications, including differential, chemical, and post-translational modification proteomics, for drug-target discovery and mechanism-of-action elucidation. It further discusses proteomics strategies, such as mass spectrometry-based quantitative approaches, protein microarray and single-cell proteomics, which enable t…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The systemic molecular regulatory landscape of sperm capacitation remains incompletely understood. This study utilized Four-dimensional independent data acquisition (4D-DIA) high-throughput quantitative proteomics to systematically analyze the global proteomic changes in healthy human sperm before and after in vitro capacitation. A total of 5812 quantifiable proteins were identified, of which 201 were significantly differentially expressed (Fold Change > 1.5, P < 0.05). Functional analysis revealed that upregulated proteins were highly enriched in core energy metabolism pathways, such as oxida…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteomics represents a fundamental layer for understanding the molecular complexity of solid tumors by quantifying protein abundance and capturing proteoforms and post-translational modifications undetected in genomics or transcriptomics analyses. As mass spectrometry-based technologies and public proteomics repositories have expanded, opportunities for large-scale data reuse have grown accordingly. Nevertheless, data availability has not been translated into straightforward reuse: differences in experimental design, acquisition strategies, quantification workflows and metadata quality still …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To explore whether the proteome of aqueous collected during primary repair of rhegmatogenous retinal detachment (RD), differs between patients who experience recurrency (Recurrent RD Group) and those who do not (No Recurrent RD Group).
METHODS: The aqueous proteome collected during primary surgery of 13 patients undergoing Recurrent RD was compared with 11 age- and sex-matched patients successfully operated for rhegmatogenous RD with no recurrency after 12-month follow-up, regardless of surgical technique. A label-free shotgun proteomics approach identified and quantified the reperto…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Non-invasive biomarkers predicting major adverse liver outcomes (MALO) are urgently needed.
AIMS: We assessed a novel, proximity extension assay-based high-throughput targeted proteomics.
METHODS: Plasma proteomic data (> 2900 proteins) and clinical information were accessed from the population-based UK Biobank cohort, comprising ~52,000 individuals with a median follow-up of > 10 years, including obese (~12,700) and diabetic (~1500) participants. Validation cohorts comprised 287 participants with severe alpha1-antitrypsin deficiency (Pi*ZZ genotype), and 960 people living with H…
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tape-stripping of the stratum corneum is a promising non-invasive approach for proteomic analysis of skin lesions, but the effects of sampling design and disc pressure on proteome readout remain poorly defined. Here, we assessed how inclusion of surrounding normal-looking skin and variation in adhesive disc pressure influence protein detection from small melanocytic lesions. D-squame tape strips were collected from six participants, including three moles and one matched normal skin site per participant. For lesion 1 (L1), discs were applied using light finger pressure. For lesion 2 (L2), the m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic islets, in which β cells constitute 50%-80% of the endocrine mass, are the body's site for glucose-regulated insulin secretion. Pancreatic islet dysfunction is a hallmark of type 2 diabetes. Nevertheless, the molecular changes that impair their function remain insufficiently understood. To determine how islet cellular organization supports function and how it deteriorates in disease, we used machine learning-based organelle proteomics to build an organelle atlas of pancreatic islets from mice, humans, and pig neonatal islet-like cells. This cross-species resource maps localization o…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how tumor cells interact with tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) is crucial for improving immunotherapy, yet protein-level changes remain largely unexplored. To address this, we profile the early responses of patient-derived melanoma cells co-cultured with matched autologous TILs. To distinguish tumor from TIL proteomes without physical sorting, we apply stable isotope labeling by amino acids in cell culture (SILAC) coupled with Orbitrap Astral data-independent acquisition (DIA) mass spectrometry (MS). This approach enables cell type-specific profiling of protein phosphorylati
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigates the use of quantitative LC-MS/MS-based proteomics and surface-enhanced Raman spectroscopy (SERS) for biomarker detection in classical Hodgkin lymphoma (HL). Two HL cell models with distinct TP53 status were utilized to evaluate the effects of etoposide, a DNA-damaging chemotherapeutic agent, and resveratrol, a polyphenolic compound with known chemosensitizing activity. For SERS, the best performance was achieved by applying logistic regression to classify different treatment conditions and identify discriminative spectral features in the data. Proteomics showed highly r…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Immune thrombocytopenic purpura (ITP) is an autoimmune bleeding disorder with substantial variability in bleeding manifestations … erapies, and enhancing patient outcomes.
OBJECTIVE: This review summarizes mass spectrometry-based proteomics studies investigating the pathogenesis of ITP and their diagnostic, prognostic, and therapeutic implications.
CONCLUSION: Despite significant clinical heterogeneity, proteomic research in ITP remains limited, underscoring the need for comprehensive …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Despite existing proteomics studies of other cell types, a comprehensive proteome of mesothelial cells has not been characterized. This study establishes a crucial baseline proteome for mesothelial cells to better understand their fundamental bioprocesses in healthy and injured states. Methods: Using mass spectrometry-based shotgun proteomics, we characterized the cellular fraction (CF) and conditioned medium (CM) proteomes of mesothelial cell line MeT-5A. The datasets were analyzed for Gene Ontology (GO) terms and canonical pathway enrichments to identify biological themes. Result…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell proteomics (SCP) reveals cellular heterogeneity and biological insights inaccessible to bulk analysis. Existing limitations are cost, sample loss during processing, and accessibility to state-of-the-art instrumentation. We describe a label-free SCP methodology in human tissue, combining FACS, oil-immersion cell handling, mass spectrometry, and neural-network-derived spectral libraries, which address these issues. We tested this methodology in a skin tumor syndrome, CYLD cutaneous syndrome (CCS), assessing tumor heterogeneity. Using a Bruker timsTOF HT platform, we quantified >4,000…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An adult's health, indicated by measurable parameters, is stable over time. With the exception of circadian rhythms, variability in these parameters typically does not exceed 20%. In this pilot study, we looked into the stability of proteome in intensive care unit (ICU) patients. This was a single-center, prospective, observational pilot study of blood plasma from adult ICU patients with statistically heterogeneous patterns of clinically observed parameters. Eight week-long batches from seven patients (one patient participated twice) were analyzed by means of bottom-up proteomics. The data wer…
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The molecular determinants for lung graft-versus-host disease-associated bronchiolitis obliterans syndrome (BOS) are poorly understood, and biomarkers in children following haematopoietic stem cell transplant do not exist. To address this gap, we analysed plasma samples from 21 paediatric stem cell transplant recipients prior to and at diagnosis of BOS.
METHODS: Participants included three cohorts: seven with BOS; seven sex-, age- and timepoint-matched with severe graft-versus-host disease alone; and seven sex-, age- and timepoint-matched transplant recipients without BOS or other
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования