Infertility, a worldwide reproductive health concern, impacts approximately one in five couples. Male infertility, stemming from spermatogenic dysfunction and reduced sperm quality, stands as a primary factor contributing to infertility. Given the global decrease in male fertility linked to environmental factors like the greenhouse effect, it is crucial to develop a comprehensive understanding of how increased temperatures impact both the quantity and quality of sperm. In this study, we utilized Pandora-seq technology to detect the small non-coding RNAs (sncRNAs) expression profile in the test
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The COVID-19 pandemic showcased the power of genomic sequencing to tackle the emergence and spread of infectious diseases. However, metagenomic sequencing of total microbial RNAs in wastewater has the potential to assess multiple infectious diseases simultaneously and has yet to be explored.
METHODS: A retrospective RNA-Seq epidemiological survey of 140 untreated composite wastewater samples was performed across urban (n = 112) and rural (n = 28) areas of Nagpur, Central India. Composite wastewater samples were prepared by pooling 422 individual grab samples collected prospectivel…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Hua-Feng-Dan is a patent Chinese medicine for stroke recovery and various diseases. This study used GC-MS to profile its ingredients and RNA-Seq to analyze the induced adaptive response in the liver. Methods: Hua-Feng-Dan was subjected to steam distillation and solvent extraction, followed by GC-MS analysis. Mice were orally administered Hua-Feng-Dan and its "Guide drug" Yaomu for 7 days. Liver pathology was examined, and total RNA isolated for RNA-Seq, followed by bioinformatic analysis and quantitative real-time PCR (qPCR). Results: Forty-four volatile and fifty liposoluble compo…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long non-coding RNAs (lncRNAs) are untranslated regulatory transcripts longer than 200 nucleotides that can play a role in transcriptional, post-translational, and epigenetic regulation. Traditionally, RNA-sequencing (RNA-seq) libraries have been created by isolating transcriptomic RNA via poly-A+ selection. In the past 10 years, methods to perform ribosomal RNA (rRNA) depletion of total RNA have been developed as an alternative, aiming for better coverage of whole transcriptomic RNA, both polyadenylated and non-polyadenylated transcripts. The purpose of this study was to determine which libra…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pre-treatment of tumors with hyperthermia is often used to increase the efficacy of radiotherapy. One of the main proteins induced in response to hyperthermia is heat shock protein 70 (HSP70). The aim of our study was to investigate up- and down-regulated genes in response to (thermo)radiotherapy in HSP70 proficient and deficient canine osteosarcoma cell line (Abrams), and functional role of HSP70 in the mechanism of thermoradiosensitization. Cells were transfected with negative control siRNA or siRNA targeting HSP70 and treated with hyperthermia (HT), radiotherapy (RT), and thermoradiotherapy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brown adipose tissues have unique non-shivering thermogenesis functions, can be found in newborn ruminate animals, and then are gradually replaced by white adipose tissues in adulthood. For the purpose of exploring the intrinsic mechanism underlying the conversion process from brown (BAT) to white adipose tissue (WAT), it is necessary to utilize Quantitative PCR (qPCR) to study gene expression profiling. In this study, we identified reference genes that were consistently expressed during the transformation from goat BAT to WAT using RNA-seq data. Then, twelve genes were evaluated as candidate …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Strontium ranelate (SrR) is an anti-osteoporosis drug with excellent osteogenic and angiogenic capacity. In this study, we aimed to investigate the osteogenesis and angiogenesis effects of SrR and the underlying mechanism involved. RNA-Seq was conducted to examine the effects of SrR on gene expression in ovariectomy rat bone marrow mesenchymal stem cells (OVX-rBMSCs). To validate the different expressed gene in vitro, the effects of gene interference and overexpression in osteogenic induction environment of OVX-rBMSCs and in primary osteoblasts were studied. RNA-Seq showed that ROCK1 significa…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Climate change and disease have large negative impacts on poultry production, but little is known about the interactions of responses to these stressors in chickens. Fayoumi (heat and disease resistant) and broiler (heat and disease susceptible) chicken lines were stimulated at 22 days of age, using a 2x2x2 factorial design including: breed (Fayoumi or broiler), inflammatory stimulus (lipopolysaccharide (LPS) or saline), and temperature (35°C or 25°C). Transcriptional changes in spleens were analyzed using RNA-sequencing on the Illumina HiSeq 2500. Thirty-two individual cDNA libraries were seq…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we demonstrate the use of a genome-wide association mapping together with RNA-seq in a reduced number of samples, as an efficient approach to detect the causal mutation for a Mendelian disease. Junctional epidermolysis bullosa is a recessive genodermatosis that manifests with neonatal mechanical fragility of the skin, blistering confined to the lamina lucida of the basement membrane and severe alteration of the hemidesmosomal junctions. In Spanish Churra sheep, junctional epidermolysis bullosa (JEB) has been detected in two commercial flocks. The JEB locus was mapped to Ovis ari…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternatively activated macrophages (AAMϕ) are a major component of the response to helminth infection; however, their functions remain poorly defined. To better understand the helminth-induced AAMϕ phenotype, we performed a systems-level analysis of in vivo derived AAMϕ using an established mouse model. With next-generation RNA sequencing, we characterized the transcriptomes of peritoneal macrophages from BALB/c and IL4Rα(-/-) mice elicited by the nematode Brugia malayi, or via intraperitoneal thioglycollate injection. We defined expression profiles of AAMϕ-associated cytokines, chemokines, a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endometriosis (EM) is a condition that impacts roughly 10% of women within the reproductive age demographic on a global scale. Due to the limitations of conventional diagnostic techniques for endometriosis, a concerted effort is necessary to improve the existing diagnostic and develop novel diagnostic tools or biomarkers. With improvements in gene sequencing methods and a steady drop in sequencing prices, more endometriosis-associated genes have been discovered recently. Utilizing a random forest classifier, we conducted a screening of differentially expressed genes (DEGs) pertaining to EM sou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Equine metabolic syndrome (EMS) is characterized by insulin dysregulation and obesity, which increase the risk of the development of hyperinsulinemia-induced laminitis (HAL). The present report describes a case of severe endocrinopathic laminitis associated with EMS, refractory to treatment. A 5-year-old mare with recurrent HAL presented transient relief upon a low nonstructural carbohydrate diet and conventional therapy. An SGLT2 inhibitor was introduced to reduce resting insulin levels, and improvement was observed until October 2024, when the most severe episode started. Despite adding perg
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The trigeminal ganglion (TG) plays a key role in allergic rhinitis (AR), mediating symptoms like nasal itching and sneezing via sensory neuron activation. Yet, the underlying transcriptomic mechanisms remain unclear. While short-read RNA-seq struggles to accurately capture complex transcript isoforms, long-read sequencing offers full-length coverage but limited quantitation. Here, we combine both technologies to comprehensively profile the TG transcriptome in an AR mouse model.
RESULTS: We identify 25,988 high-confidence full-length isoforms from 13,011 known and 237 novel genes, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis is a severe disease and induces skeletal muscle atrophy, which has a significant impact on patients. Moreover, the onset and severity of muscle atrophy can vary across different anatomical regions during sepsis. Our previous study demonstrated that ZBED6 knockout not only promotes skeletal muscle growth under physiological conditions, but also alleviates systemic muscle atrophy during sepsis. However, its region-specific effects on sepsis-induced muscle atrophy have not been analyzed. In this study, we performed RNA sequencing for 54 samples of skeletal muscle from nine different anatom
СтатьяDatasetПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Shentong Zhuyu Decoction (STZYD) is a traditional prescription for promoting the flow of Qi and Blood which … valuated by Mechanical withdrawal thresholds (MWT) and thermal withdrawal latency (TWL). Meanwhile, RNA-seq assay was used to detect the changed mRNAs and lncRNAs in CCI rats after STZYD intervention. GO analysis, KEGG pathway analysis, and IPA analysis were used to find key target genes and pathways, verified by qPCR and Western Blot. The regulatory effe …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Integrin-based focal adhesion is one of the major mechanosensory in osteocytes. The aim of this study was to mine the hub genes associated with focal adhesion and investigate their roles in osteoporosis based on the data of single-cell RNA sequencing and RNA-sequencing. Two hub genes (FAM129A and RNF24) with the same expression trend and AUC values greater than 0.7 in both GSE56815 and GSE56116 cohorts were uncovered. The nomogram was created to predict the risk of OP based on two hub genes. Subsequently, the competing endogenous RNA network was established based on two hub genes, 14 microRNAs…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to clarify whether genetic mutations participate in renal cell carcinoma (RCC) metastasis to the adrenal gland (AG). Our study analyzed whole mitochondrial gene and ribonucleic acid sequencing (RNA-seq) data from a male patient in his 60s with metastatic RCC. We confirmed common mutation sites in the mitochondrial gene and carried out Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analysis using RNA-seq data for RCC and adrenal carcinoma. Furthermore, we confirmed the common mutation sites of mitochondrial genes in which the T3394Y (p.H30Y) site transitioned from histidine (Hi…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human retina, located in the innermost layer of the eye, plays a decisive role in visual perception. Dissecting the heterogeneity of retinal cells is essential for understanding the mechanism of visual development. Here, we performed single-cell RNA-seq to analyze 194,967 cells from the donors of infants and young children, resulting in 17 distinct clusters representing major cell types in the retina: rod photoreceptors (PRs), cone PRs, bipolar cells (BCs), horizontal cells (HCs), amacrine cells (ACs), retinal ganglion cells (RGCs), Müller glial cells (MGs), microglia, and astrocytes (ASTs…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RESEARCH QUESTION: What are the molecular mechanisms leading to human sperm DNA damage?
DESIGN: Semen samples were collected and the sperm DNA fragmentation index (DFI) was assessed. Differentially expressed RNA in spermatozoa with a high (DFI ≥30%, experimental group) or normal (DFI <30%, control group) DFI were identified by RNA-sequencing (RNA-seq) technology, and Gene Ontology and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) analysis was performed. Three differentially expressed RNA related to sperm DNA damage and repair, namely PMS1, TP53BP1 and TLK2, were validated using real-time qua…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mechanical compression on the trigeminal root entry zone (TREZ) by microvascular is the main etiology of primary trigeminal neur … trigeminal nerve root (CCT) operation. Gene expression in the TREZ were analyzed by RNA sequencing (RNA-Seq) technique. KEGG analysis, GO analysis, and PPI analysis were performed in the DEGs. Key signaling pathways analyzing by GSEA and the hub genes in the DEGs were also studied. Reverse transcription real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR) was us …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования