Human herpesviruses are double-stranded DNA viruses that are classified into nine species. More than 90% of adults are ever infected with one or more herpesviruses. The symptoms of infection with different herpesviruses are diverse ranging from mild or asymptomatic infections to deadly diseases such as aggressive lymphomas and sarcomas. Timely and accurate detection of herpesvirus infection is critical for clinical management and treatment. In this study, we established a single-tube nonuple qPCR assay for detection of all nine herpesviruses using a 2-D multiplex qPCR method with a house-keepi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Downy mildew is a serious threat to opium poppy production globally. In recent years, two pathogen species, Peronospora somniferi and Peronospora meconopsidis, which induce distinct symptoms, have been confirmed in Australia. In order to manage the spread of these pathogens, identifying the sources of inoculum is essential. In this study, we assessed pathogen presence associated with poppy seed. We developed PCR and qPCR assays targeting the coxI and coxII gene regions, for the detection, differentiation, and quantification of P. somniferi and P. meconopsidis in poppy seed. These results were
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor protein D52 (TPD52) is located at chromosome 8q21, a region that is frequently gained or amplified in multiple human cancer types. TPD52 has been suggested as a potential target for new anticancer therapies. In order to analyze TPD52 expression in the most prevalent human cancer types, we employed quantitative PCR to measure TPD52 mRNA levels in formalin-fixed tissue samples from more than 900 cancer tissues obtained from 29 different human cancer types. TPD52 was expressed at varying levels in all tested normal tissues, including skin, lymph node, lung, oral mucosa, breast, endometrium,
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Information on the molecular epidemiology of rubella has been valuable in supporting efforts to control and eliminate rubella in several countries. The preferred samples for virus isolation or RNA detection, such as throat swabs, are often not available making it difficult to obtain a robust database of rubella virus sequences. A method for obtaining rubella virus genotypes from more commonly collected samples such as sera or dried blood spots using real-time RT-PCR to screen samples followed by nested set amplification is described. Rubella genotypes were obtained from dried blood spots and r
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microbial source tracking (MST) using Bacteroidales markers provides information on faecal contamination in environmental waters. The marker BacUni targets a range of sources, while HF183 is primarily associated with human faeces. Duplex quantitative PCR (qPCR) assays allow simultaneous detection of both markers, though competition between primer-probe sets can affect accuracy. Digital PCR (dPCR) offers absolute quantification and higher sensitivity, but multiplexing can be challenging when marker concentrations differ. This study compared HF183 and BacUni quantification across singleplex and
СтатьяСравнительное исследованиеОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial meningitis is a life-threatening disease, requiring timely diagnosis and rapid onset of antimicrobial therapy. Herein, we describe a case of culture-positive meningococcal meningitis caused by a non-encapsulated strain in an immunocompetent individual. Notably, this case yielded negative results using commercially-available real-time PCR assays.
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing incidence and global spread of mpox have prompted the World Health Organization to twice declare a Public Health Emergency of International Concern. Sustained human-to-human transmission, largely through sexual contact, and waning population immunity to smallpox have accelerated monkeypox virus evolution and driven the emergence of variants that can adversely affect the performance of existing molecular diagnostic tests. To minimize the risk of PCR target drop out and better detect and monitor emerging monkeypox virus variants, we have developed and validated a multiplex real-ti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: We aimed to evaluate the performance of the FilmArray (FA) meningitis/encephalitis (ME) panel. Secondarily, we analyzed the false positive (FP) and false negative (FN) results, as well as the predictive values of the technique, regarding the cerebrospinal fluid (CSF) characteristics.
METHODS: FA is a multiplex real-time PCR detecting 14 of the most common ME pathogens in CSF. All FA performed at our hospital (2018-2022) were retrospectively reviewed. FA was compared to conventional techniques and its performance was assessed based on the final diagnosis of the episode.
RESULTS: FA w
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To monitor the burden and changes in Haemophilus influenzae (Hi) disease, direct real-time PCR (drt-PCR) assays have been developed for Hi detection in monoplex form and its six serotypes in triplex form, directly from cerebrospinal fluid (CSF) specimens. These assays target the phoB gene for the species detection (Hi-phoB) and serotype-specific genes in region II of the capsule biosynthesis locus (Hi-abf and Hi-cde), identified through comparative analysis of Hi and non-Hi whole-genome sequences. The lower limit of detection (LLD) is 293 CFU/mL for the Hi-phoB assay and ranged from 11 to 130
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Short half-life doping substances are, quickly eliminated and therefore difficult to control with traditional analytical chemistry methods. Indirect methods targeting biomarkers constitute an alternative to extend detection time frames in doping control analyses. Gene expression analysis (i.e., transcriptomics) has already shown interesting results in both humans and equines for erythropoietin (EPO), growth hormone (GH), and anabolic androgenic steroid (AAS) misuses. In humans, circulating cell-free microRNAs in plasma were described as new potential biomarkers for control of major doping agen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibrio cholerae and Vibrio parahaemolyticus are common diarrheal pathogens of great public health concern. A multiplex TaqMan-based real-time PCR assay was developed on the BD MAX platform; this assay can simultaneously detect and differentiate V. cholerae and V. parahaemolyticus directly from human fecal specimens. The assay includes two reactions. One reaction, BDM-VC, targets the gene ompW, the cholera toxin (CT) coding gene ctxA, the O1 serogroup specific gene rfbN, and the O139 serogroup specific gene wbfR of V. cholerae. The other, BDM-VP, targets the gene toxR and the toxin coding genes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We demonstrate the development of a multiplex droplet digital PCR assay for human cytomegalovirus (CMV), human adenovirus species F, and an internal plasmid control that may be useful for PCR inhibition-prone clinical samples. This assay performs better on inhibition-prone stool samples than a quantitative PCR assay for CMV and is the first published clinical virology droplet digital PCR assay to incorporate an internal control.
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Central nervous system (CNS) tuberculosis, particularly tuberculous meningitis (TBM), is one of the severest forms of tuberculosis. At present, the diagnosis of CNS tuberculosis remains a complex issue because the most widely used conventional "gold standard" based on bacteriological detection methods, such as direct smear and culture identification, cannot rapidly detect Mycobacterium tuberculosis (M.Tb) bacilli in CSF specimens with sufficient sensitivity in the acute phase of TBM. Recently, instead of the conventional "gold standard", the various molecular-based methods, such as polymerase
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Pertussis is an acute respiratory disease primarily caused by Bordetella pertussis, and its incidence has shown a resurgence. Polymerase chain reaction (PCR) is a recognized molecular detection method, and various related detection methods have emerged.
METHODS: This study is performed according to the PRISMA checklist. Relevant literature is adopted from the online databases. The quality of the included studies is assessed based on the REVMAN software (version 5.4). Statistical analysis is performed by STATA 14.0 and Meta-DiSc 1.4 software.
RESULTS: The results of this meta-an
СтатьяМетаанализОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present a compact and cost-effective real-time PCR system designed for point-of-care testing (POCT), utilizing a PCB-based disposable chip and an open-platform CMOS camera. The system integrates precise thermal cycling with software-synchronized fluorescence detection and provides real-time analysis through a dedicated user interface. To minimize cost and complexity, a polycarbonate reaction chamber was integrated with a PCB-based heater and thermistor. A slanted LED illumination setup and an open-platform USB camera were employed for fluorescence imaging. Signal alignment was enhanced usin
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Boxwood blight can be challenging to detect in the field, especially when symptoms are mild, thus requiring large numbers of plants to be screened. Therefore, a rapid diagnostic assay that can detect the pathogen from large amounts of plant tissue would be useful. Here, we present a crude DNA extraction protocol that is rapid and scalable. The DNA extraction protocol can process large volumes of tough boxwood tissue rapidly without using cetyltrimethylammonium bromide or phenol-chloroform to remove inhibitors. Additionally, to detect the boxwood blight pathogen Calonectria pseudonaviculata, we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Low abundance, small size, and sequence similarities render microRNA (miRNAs) detection challenging, particularly in real samples, where quantifying weakly expressed miRNAs can be arduous due to interference of more abundant molecules. The standard quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (qRT-PCR) requires multiple steps, thermal cycles, and costly enzymatic reactions that can negatively affect results. Here we present a direct, precise, enzyme-free assay based on microgels particles conjugating molecular beacons (MB) capable of optically detecting low abundant miRNAs in r
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Canine adenoviruses (CAdVs) include type 1 (CAdV-1, virulent strain) and type 2 (CAdV-2, attenuated strain). In recent years, the incidences of CAdV infections are increasing. However, they are difficult to distinguish when the symptoms are untypical. It is pivotal to find the differences between the two virus types for scientific, epidemiological, and specific treatment. CAdV-1 (virulent strain) and CAdV-2 (attenuated strain) induced canine hepatitis (ICH) and tracheobronchitis (ITB), respectively, but the clinical symptom is not obvious. CAdV-1 and CAdV-2 have the same genome structure, diam
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular methodologies providing data on viral concentration and infectivity have been successfully used in environmental virology, supporting quantitative risk assessment studies. The present study aimed to assess human mastadenovirus (HAdV) intact particles using a derivative of propidium monoazide associated with qPCR (PMAxx-qPCR) in aquatic matrices. Initially, different concentrations of PMAxx were evaluated to establish an optimal protocol for treating different naturally contaminated matrices, using 10 min incubation in the dark at 200 rpm at room temperature and 15 min of photoactivat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Syphilis continues to be a public health problem, and its diagnosis still has limitations. Molecular diagnosis provides an alternative for rapid and effective management. The objective is to determine the accuracy of tests in the molecular diagnosis of syphilis.
METHODS: We searched PubMed and Web of Sciences for articles related to molecular detection of syphilis from January 1, 2009, to December 31, 2019. The bivariate Reitsma model and the hierarchical receiver operating characteristic curve model were used to evaluate the diagnostic performance of molecular tests at a 95% conf
СтатьяМетаанализСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования