Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae, particularly sequence type 11 (ST11), has become the dominant epidemic clone in Asia. In this study, we collected 113 clinical ST11 isolates from a tertiary hospital in Beijing, China. Whole genome sequencing was performed, followed by capsular serotyping, resistome, and virulome analysis, and core-genome single nucleotide polymorphism-based phylogenetic and nosocomial transmission analysis. The aim was to elucidate the distribution of antimicrobial resistance genes, hypervirulence-associated genes, plasmid replicons, and phylogenetic relationships a…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The rapid global spread of hypervirulence in Enterobacteriaceae, particularly in carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae, pos … associated Hva-PCTs mainly originate in Escherichia coli and spread through IncFIB-containing multi-replicon plasmids (commonly combined with IncFIC(FII) and/or IncFII, while rmpA/rmpA2/peg-344-containing modules originate in K. pneumoniae and are disseminated via IncHI1B/repB plasmids. Three Hva-PCTs were detected on both plasmids and chromosomes (xHva-PC …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbapenem-hydrolysing enzymes belonging to the OXA-48-like group are encoded by blaOXA-48-like alleles and are abundant among Enterobactera … nia. The seven plasmid groups varied in size, G+C content, presence of antibiotic resistance genes, replicon family and gene content. The pOXA-48-1 to pOXA-48-5 plasmids were variable, and the pOXA-181 and pOXA-232 plasmids were conserved. The pOXA-48-1, pOXA-48-2, pOXA-48-3 and pOXA-48-5 groups contained a putative conjugation system, but this was absent …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated the prevalence of 16S rRNA methylase genes in 267 Enterobacteriaceae isolates collected from pets. The rmtB gene was detected in 69 isolates, most of which were clonally unrelated. The coexistence of the rmtB gene with the bla(CTX-M-9) group genes and/or qepA within the same IncFII replicons was commonly detected. The two dominant types of IncF plasmids, F2:A-:B-, carrying rmtB-qepA, and F33:A-:B-, carrying the rmtB-bla(CTX-M-9) group genes (and especially bla(CTX-M-65)), shared restriction patterns within each incompatibility group.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
On the plasmid DNA pOX01 of the anthrax pathogen two BamHI fragments were localized which facilitate detection of the Bacillus anthracis strains carrying pXO1 replicon. These fragments, after complete hydrolysis of plasmid DNA by HindIII, were cloned on the vector plasmids pUC19 and pBR322 by the "shot-gun" method in Escherichia coli cells. It is shown that the 900 bp BamHI/HindIII fragment from the pZAT1 recombinant plasmid has an ability for specific hybridization with DNA of toxigenic strains of B. anthracis and could be used as species-specific anthracic DNA probe which identifies toxigeni…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Self-amplifying RNA (saRNA) derived from alphavirus replicons enables robust intracellular RNA amplification and high-level protein expression at substantially lower doses than nonreplicating messenger RNA (mRNA) platforms. Venezuelan equine encephalitis virus (VEEV)-based replicons lacking the viral structural genes are among the most extensively characterized saRNA backbones, combining efficient cytoplasmic replication with a favorable safety profile. However, incorporating chemical nucleoside modifications such as N1-methylpseudouridine (m1ψ), now standard in conventional mRNA workflows, ca…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance (AMR) threatens human and animal health worldwide, driven by the spread of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-pro … aCTX-M-15 and blaTEM-1B, while colistin resistance was linked to mcr-1.1 on an IncHI2A/IncFIC multi-replicon plasmid. Plasmid typing identified 22 replicons, the most common being IncFIB and IncFII. Virulence factor analysis identified enterotoxin-encoding genes in one E. coli isolate, suggesting a potentially pathogenic strain with diarrheagenic propertie …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Feline infectious peritonitis (FIP) is a lethal, immune-mediated disease in cats caused by feline infectious peritonitis virus (FIPV), a bio … P viruses. In addition, by replacing the S, E, M, and ORF3abc genes with msfGFP and Rluc genes, the replicon systems repFIPV-msfGFP and repFIPV-Rluc were generated on the basis of the cDNA construct of rFIPV-WT. Last, the use of reporter recombinant viruses and replicons in antiviral screening assays demonstrated their high sensitivity for quantifying the …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Working with severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2) is restricted to biosafety level III (BSL-3) laboratory. The study used a trans-complementation system consisting of virus-like particles (VLPs) and DNA-launched replicons to generate SARS-CoV-2 single-round infectious particles (SRIPs) with variant-specific spike (S) proteins. S gene of Wuhan-Hu-1 strain (SWH1) or Omicron BA.1 variant (SBA.1), along with the envelope (E) and membrane (M) genes, were cloned into a tricistronic vector, co-expressed in the cells to produce variant-specific S-VLPs. Additionally, the replico…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of carbapenem resistant Escherichia coli represents a serious public health concern. This study investigated the resistome, virulence, plasmids content and clonality of 27 carbapenem resistant E. coli isolated from 27 hospitalized patients at the American University of Beirut Medical Center (AUBMC) in Lebanon between 2012 and 2016. Whole-genome sequencing (WGS) data were used to identify resistance determinants. Multilocus sequence typing (MLST), pulsed field gel electrophoresis (PFGE), phylogenetic grouping and PCR-based replicon typing (PBRT) were also performed. The 27 isolate…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Miravirsen is a β-D-oxy-locked nucleic acid-modified phosphorothioate antisense oligonucleotide targeting the liver-specific microRNA-122 (miR-122). Miravirsen demonstrated antiviral activity against hepatitis C virus (HCV) genotype 1b replicons with a mean 50% effective concentration (EC50) of 0.67 μM. No cytotoxicity was observed up to the highest concentration tested (>320 μM) in different cell culture models, yielding a therapeutic index of ≥ 297. Combination studies of miravirsen with interferon α2b, ribavirin, and nonnucleoside (VX-222) and nucleoside (2'-methylcytidine) inhibitors of NS…
Клиническое исследование II фазыСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 2-month survey of extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) producers was performed in a Czech hospital. Klebsiella pneumoniae produced SHV-2, -5, or -12, Escherichia coli produced CTX-M-9 or -15, and other species produced TEM-92 or -132. All K. pneumoniae and E. coli isolates belonged to sequence types (STs) or clonal complexes (CCs) spread across the world (K. pneumoniae clonal complex 11 [CC11], CC14, and sequence type 101 [ST101] and E. coli CC31, CC73, CC131, and CC405) and carried various plasmids (mainly with A/C- and FII-type replicons).
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Klebsiella pneumoniae (Kp) Gram-negative bacteria cause nosocomial infections and rapidly acquire antimicrobial resistance (AMR) … ypes (e.g. ST11 15.0%, ST258 9.5%), and 2174 (16.5%) hypervirulent strains. We analysed the plasmid replicons and carbapenemase and siderophore encoding genes to understand the movement of hypervirulence and AMR genes located on plasmids, and their convergence in carbapenem-resistant hypervirulent Kp.
RESULTS: We identified and analysed 3034 unique plasmi …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis E virus (HEV) infections are a leading cause of acute viral hepatitis in humans and pose a considerable threat to public health. C … t least eleven compounds showed inhibitory activities against the HEV genotype 3 (HEV-3) subgenomic replicon below 30 nM (EC50 value) as determined by Gaussia luciferase assay. Three amidino-rocaglates (ADRs) (CMLD012073, CMLD012118, and CMLD012612) possessed antiviral activity against HEV with EC50 values between 1 and 9 nM. In addition, these three selec …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective of this study was to perform an inventory of the extended-spectrum-β-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae isolates re … investigated by the use of the DiversiLab system. ESBL-encoding plasmids were compared by PCR-based replicon typing and plasmid multilocus sequence typing. CTX-M-15, CTX-M-1, CTX-M-14, and SHV-12 were the most prevalent ESBLs (8% to 46.5%). The three CTX-M-type EBSLs were significantly observed in Escherichia coli (37.1%, 24.2%, and 21.8%, respectively), a …
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Simeprevir (TMC435) is a once-daily, single-pill, oral hepatitis C virus (HCV) NS3 protease inhibitor approved for the treatment of chronic HCV infection. Phenotypic characterization of baseline isolates and isolates from HCV genotype 1-infected patients failing with a simeprevir-based regimen was performed using chimeric replicons carrying patient-derived NS3 protease sequences. Cutoff values differentiating between full susceptibility to simeprevir (≤ 2.0-fold reduction in simeprevir activity) and low-level versus high-level resistance (≥ 50-fold reduction in simeprevir activity) were determ…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to characterise extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Klebsiella pneumoniae isolated from urinary tract and wound infections from Pakistan (n=25). Isolates were subjected to commercially available microarray analysis to determine the presence of ESBLs and acquired AmpC enzymes. The genetic diversity of the isolates was determined by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and multilocus sequence typing (MLST). Plasmid replicon typing and capsular serotyping were conducted by PCR. Finally, screening for virulence genes, plasmid-mediated quinolone resistance (P…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The impact of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae of food animal origins on human health has caught considerable attention worldwide. Intestinal Escherichia coli obtained from healthy food animals (pigs, cattle and poultry) in China were tested for the presence of ESBL genes. CTX-M-producing isolates were further characterised by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), phylogenetic grouping, genetic environment analysis, conjugation and plasmid replicon typing. A total of 127 of the 896 E. coli isolates showed reduced susceptibility to cefotaxime (minimal inhibit…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The worldwide prevalence of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae is increasing rapidly both in hospitals and in the community. A connection between ESBL-producing bacteria in food animals, retail meat, and humans has been suggested. We previously reported on the genetic composition of a collection of ESBL-producing Escherichia coli (ESBL-EC) from chicken meat and humans from a restricted geographic area. Now, we have extended the analysis with plasmid replicons, virulence factors, and highly discriminatory genomic profiling methods.
METHODS: One hundre…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The large plasmid pXO1 encoding the anthrax toxin is important for the virulence of Bacillus anthracis. It is essential to cure pXO1 from B. anthracis to evaluate its role in the pathogenesis of anthrax infection. Because conventional methods for curing plasmids (e.g., curing agents or growth at elevated temperatures) can induce mutations in the host chromosomal DNA, we developed a specific and reliable method to eliminate pXO1 from B. anthracis using plasmid incompatibility. Three putative replication origins of pXO1 were inserted into a temperature-sensitive plasmid to generate three incompa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования