Epstein-Barr virus (EBV) infects >90% of humans and is associated with both hematological and epithelial malignancies. Here, we analyzed 990 EBV genomes (319 newly sequenced and 671 from public databases) from patients with various diseases to comprehensively characterize genomic variations, including single nucleotide variations (SNVs) and structural variations (SVs). Although most SNVs were a result of conservative evolution and reflected the geographical origins of the viral genomes, we identified several convergent SNV hot spots within the central homology domain of EBNA3B, the transactiva
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Haarlem genotype is a significant yet understudied part of the Euro-American lineage of Mycobacterium tuberculosis, characterized by unique pathogenetic features. Spoligotyping is a primary method for its detection, but it is not suitable for isolates with long blocks of deleted spacers. We have developed a simple and robust method to detect the Haarlem genotype. The real-time PCR (RT-PCR) assay with LNA probes was designed to detect the Rv0282 211 C > T mutation that was shown to be specific for the Haarlem genotype. The developed RT-PCR assay was optimized with 68 isolates with known who
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Циркуляция цитокинес оркестрирует иммунную реакцию и является перспективной целью для лечения иммунных и подстрекательских заболеваний. Изучение генетической архитектуры циркулирующих уровней цитокина могло бы дать ключевые знания о причинно-следственных посредниках в связи с человеческими заболеваниями. Здесь мы провели исследования по общегеномной ассоциации (GWAS) 40 циркуляции цитокинов в мета-анализах 74,783 Люди. Мы обнаружили 359 между уровнями цитокина и вариантами 169 независимых лоси, включая 150 Транс- и 19 Носящая ножи лоси. Интеграция с транскриптивомными данными указывает на ключ
СтатьяМетаанализПолный текст найденМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CaPCR1 (Capana12g002165) was a candidate gene regulating fruit concave/pointed tip shape in pepper. The concave shape of the fruit tip in pepper plants is highly susceptible to drought and low temperature stresses, resulting in the appearance of a pointed tip fruit, which affects its commercial value. However, few studies on the process of fruit tip development and regulatory genes in pepper have been reported. Herein, the developmental process of the ovary before anthesis, especially changes in the shape of the ovary tip, was studied in detail. The results showed that the final fruit tip shap
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The North Caucasus played a key role during the ancient colonization of Eurasia and the formation of its cultural and genetic ancestry. Previous archeogenetic studies described a relative genetic and cultural continuity of ancient Caucasus societies, since the Eneolithic period. The Koban culture, which formed in the Late Bronze Age on the North Caucasian highlands, is considered as a cultural "bridge" between the ancient and modern autochthonous peoples of the Caucasus. Here, we discuss the place of this archeological culture and its representatives in the genetic orbit of Caucasian cultures
СтатьяИсторическая статьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The oral cavity and gut tract, being interconnected and rich in microbiota, may have a shared influence on gingivitis. However, the specific role of distinct gut microbiota taxa in gingivitis remains unexplored. Utilizing Mendelian Randomization (MR) as an ideal method for causal inference avoiding reverse causality and potential confounding factors, we conducted a comprehensive two-sample MR study to uncover the potential genetic causal impact of gut microbiota on gingivitis.
METHODS: Instrumental variables were chosen from single nucleotide polymorphisms (SNPs) strongly associ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: A growing body of strong evidence shows that the dysfunction of miRNAs plays key roles in the development and progression of Parkinson's disease (PD), however, little data has been reported on the association of their SNPs with PD susceptibility. In this study, we investigated the association of regulatory miR-SNP rs4636297A > G with a functional effect on the expression of miRNA-126, as a key dysregulated miRNA in the PD, with the susceptibility and clinical features of the PD.
METHODS AND MATERIALS: In current study, we included a population consisting of 120 patients with PD
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The SNP rs2414739 of Vacuolar protein sorting 13 homolog C(VPS13C) gene was identified to be linked with Parkinson's Disease (PD).
OBJECTIVES: Explore the clinical progression feature of PD patients with rs2414739 variant.
METHODS: Longitudinal data were obtained from the Parkinson's Progression Marker Initiative (PPMI) cohorts. Linear mixed models were used to test the effects of VPS13C with the progression of PD assessed by different scales.
RESULT: A total of 333 patients with PD were included and divided into rs2414739 carriers (n = 138) and noncarriers (n = 195). Patients
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Uterine fibroids (UF), that can disrupt normal uterine function and cause significant physical and psychological health problems, are observed in nearly 70% of women of reproductive age. Although heritable genetics is a significant risk factor, specific genetic variations and gene targets causally associated with UF are poorly understood. Here, we performed a meta-analysis on existing fibroid genome-wide association studies (GWAS) and integrated the identified risk loci and potentially causal single nucleotide polymorphisms (SNPs) with epigenomics, transcriptomics, 3D chromatin organization fr
МетаанализСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Anti-vascular endothelial growth factor (anti-VEGF) agents have a variable effect on patients with age-related macular degeneration (AMD) that has been attributed to several causes, including genetic factors. We evaluated the effects of Complement Factor H (CFH) rs1061170/Y402H polymorphism on the response to anti-VEGF therapy among AMD patients.
METHODS: PubMed, Scopus, EMBASE, Web of Science, and Google Scholar were used for a literature search. Pooled odds ratios (ORs) and their 95% confidence intervals (CIs) were estimated to assess the effects of CFH Y402H polymorphism on t
СтатьяМетаанализСистематический обзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular studies identifying alterations associated with PTSD have predominantly focused on candidate genes or conducted genome-wide analyses, often encountering issues with replicability. This review aims to identify robust bi-directional epigenetic and microRNA (miRNA) regulators focusing on their functional impacts on post-traumatic stress disorder (PTSD) and their utility in clinical diagnosis, whilst examining knowledge gaps in the existing research. A systematic search was conducted across multiple databases, including Web of Science, Scopus, Global Health (CABI), and PubMed, augmented
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The relationship between peripheral immune cells and immunoglobulin A nephropathy (IgAN) is widely known; however, causal evidence of this link is lacking. Here, we aimed to determine the causal effect of peripheral immune cells, specifically total white blood cells, lymphocytes, monocytes, basophils, eosinophils, and neutrophils, as well as lymphocyte subset traits, on the IgAN risk using a Mendelian randomization (MR) analysis.
METHODS: The inverse-variance weighted (IVW) method was used for the primary analysis. We applied three complementary methods, including the weighted med
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cholecystitis, characterized by inflammation of the gallbladder, is intricately linked to immune cells and the cytokines they produce. Despite this association, the specific contributions of immune cells to the onset and progression of cholecystitis remain to be fully understood. To delineate this relationship, we utilized the Mendelian randomization (MR) method to scrutinize the causal connections between 731 immune cell phenotypes and cholecystitis. By conducting MR analysis on 731 immune cell markers from public datasets, this study seeks to understand their potential impact on the risk of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Late-onset Alzheimer's disease (LOAD) represents a growing health burden. Previous studies suggest that blood metabolite levels influence risk of LOAD.
OBJECTIVE: We used a genetics-based study design which may overcome limitations of other epidemiological studies to assess the influence of metabolite levels on LOAD risk.
METHODS: We applied Mendelian randomization (MR) to evaluate bi-directional causal effects using summary statistics from the largest genome-wide association studies (GWAS) of 249 blood metabolites (n = 115,082) and GWAS of LOAD (ncase = 21,982, ncontrol = 41,944
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amphotericin B (AmB) is a potent antifungal and antiparasitic medication that exerts its action by disrupting the cell membrane of the leishmanial parasite, leading to its death. Understanding the genetic alterations induced by Amphotericin B is crucial for gaining insights into drug resistance mechanisms and developing more effective treatments against Leishmania infections. As a new Leishmania species, the molecular response of Leishmania orientalis to anti-leishmanial drugs has not been fully explored. In this study, Leishmania orientalis strain PCM2 culture was subjected to AmB exposure at
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: This study employs the Mendelian Randomization (MR) approach to explore the potential causal relationship between schizophrenia and the risk of developing narcolepsy.
METHODS: Genome-Wide Association Studies (GWAS) data from European populations were used to identify independent genetic variants associated with schizophrenia and narcolepsy, which were then used as instrumental variables in the analysis. The inverse variance weighting (IVW) method was performed to validate the findings. Effect sizes were presented as odds ratios (OR) and beta coefficients (β).
RESULTS: The IVW a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Hashimoto's thyroiditis (HT) is a common autoimmune disease whose etiology involves a complex interplay between genetics and environment. Previous studies have demonstrated an association between immune cells and HT. However, the casual relationship was not clear. We aimed to explore the causal associations between signatures of immune cells and HT.
METHODS: In this study, bidirectional two-sample Mendelian randomization (MR) analysis was conducted to investigate the potential causal relationship between 731 immune cell signatures and HT by using genome-wide association study (GWA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the pig immune function is crucial for disease-resistant breeding and potentially for human health research due to shared immune system features. Immune cell ratios, like monocyte/lymphocyte ratio (MLR) and neutrophil/lymphocyte ratio (NLR), offer a more comprehensive view of immune status compared to individual cell counts. However, research on pig immune cell ratios remains limited. This study investigated MLR and NLR in a Duroc × Erhualian F2 resource population. Heritability analysis revealed high values (0.649 and 0.688 for MLR and NLR, respectively), suggesting a strong gen
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is a metabolic disorder. Discovering the metabolic products involved in the development of AD may help not only in the early detection and prevention of AD but also in understanding its pathogenesis and treatment. This study investigated the causal association between the latest large-scale plasma metabolites (1091 metabolites and 309 metabolite ratios) and AD. Through the application of Mendelian randomization analysis methods such as inverse-variance weighted (IVW), MR-Egger, and weighted median models, 66 metabolites and metabolite ratios were identified as potentia
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic variation in CD38-a putative oxytocin pathway gene-has been linked to higher oxytocin levels, empathy, and sensitive parenting, but also to more negative interpersonal outcomes (e.g., alienation from friends and family, poorer romantic relationship quality). To reconcile these seemingly contradictory findings, we drew upon the idea that CD38 variation may heighten social-emotional sensitivity and, consequently, make individuals prone to negative emotions in distressing interpersonal situations. To test this hypothesis, we performed a secondary analysis of a dataset including participan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.