1.Pan-genome analysis across 26 maize inbred lines identified 13 Zm4CL genes (nine core and four near-core) classified into three evolutionary clades.2.Structural variations (SVs) are significantly associated with the expression and altered conserved protein domains of key Zm4CL genes.3.Zm4CL genes exhibit distinct tissue-specific expression patterns and dynamic enzymatic and transcriptional responses to stresses, particularly cold and drought.4-Coumarate:CoA ligase (4CL) is a key enzyme in the phenylpropanoid pathway and plays important roles in plant growth, development, and responses to env
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ERF-VII gene family, a critical branch of the AP2/ERF superfamily, is central to plant stress adaptation. However, its evolutionary history and function in tea plant (Camellia sinensis) remain unclear. Here, we performed integrated evolutionary, genomic, and functional analyses of ERF-VII genes across 14 plant lineages and 20 tea plant cultivars. The phylogenetic analysis revealed that ERF-VII proteins originated after vascular plant divergence, coinciding with the emergence of the N-terminal MCGGA/I motif linked to the oxygen-dependent N-degron pathway. Gymnosperms retained few conserved
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cyclic dinucleotides (CDNs), such as cyclic di-AMP (c-di-AMP) and cyclic di-GMP (c-di-GMP), are key second messengers that regulate fundamental bacterial processes, including cell wall synthesis, biofilm formation, antibiotic resistance, stress response, and virulence. These pathways are particularly relevant in major pathogens like Mycobacterium tuberculosis. Increasing evidence highlights the pathogenic potential of non-tuberculous mycobacteria (NTM), originally environmental species that are emerging as significant human pathogens. Understanding the evolution of CDN signaling may therefore
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Marine mammals, particularly seals, are susceptible to both avian and human influenza A viruses (IAVs), making them potential intermediates for zoonotic virus emergence. In recent decades, repeated transmissions of avian influenza viruses (AIVs) from wild aquatic birds, their natural reservoir, have caused significant mortality in seals. Defining the molecular determinants of viral adaptation in marine mammals, and their implications for replication in human cells, is therefore essential. The non-structural protein 1 (NS1) of AIV, a key antagonist of the interferon (IFN) response, plays a cent
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study examines the genomic characteristics of the RSV G protein from 2017 to 2024, describing the progression of RSV lineages in Taiwan before and after the pandemic. A total of 428 RSV G ectodomain sequences were analyzed, with the sequence distribution by period as follows: 130 (2017-2019), 86 (2020-2021), 102 (2022), 58 (2023), and 52 (2024). Since 2020, RSV A and B have alternated in predominance, resulting in four separate epidemics in 2020, 2022, 2023, and 2024. All identified RSV strains in Taiwan are derived from the GA2.3.5 and GB5.0.5a genotypes. RSV-A showed complex lineage dyn
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mutations in human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) enable the virus to evade recognition and killing by human leucocyte antigen (HLA)-restricted T cells. These viral adaptations are specific to the HLA type of individuals and are therefore evident as HLA allele-HIV sequence associations at the population level. Most studies of HLA associations have been cross-sectional and may not capture selective changes that have accumulated to reach fixation at the population level, with potential impacts on viral replication and clinical outcomes. In this study, we examined the populatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The receptor-binding domain (RBD) of the SARS-CoV-2 spike (S) protein continues to evolve, facilitating antibody evasion. It remains unclear whether any conserved RBD epitopes persist across SARS-CoV-2 variants and whether vaccination and/or breakthrough infection (BTI) can elicit antibodies capable of targeting these conserved regions to counter future variants. Here, using a heterogeneous double-bait single B-cell sorting strategy, we identify a subset of antibodies with broad-spectrum RBD binding, including recognition of SARS-CoV-1 and emerging variants such as EG.5.1, BA.2.86, JN.1, and K
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mosquito-borne diseases pose a significant global health challenge, highlighting the need for innovative biocontrol agents. In this study, a novel mosquitocidal bacterium was isolated from clay soil and subjected to Whole Genome Sequencing (WGS) and bioinformatics analysis to understand its genetic composition and potential applications. WGS revealed that the bacterium a circular genome of size 6,622,317 bp comprising 6930 genes, 115 tRNA and 17 rRNA. The (G + C)s content was found to be 34.83% at the contig level and 34.83% at the scaffold level. Bioinformatics tools, including KmerFinder, Ba
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monoclonal antibodies that recognize conformational epitopes in protein aggregates are important for research, diagnostic, and therapeutic applications related to neurodegenerative disorders such as Alzheimer's and Parkinson's diseases. Unfortunately, it remains challenging to discover and engineer high-quality conformational antibodies that are specific for protein aggregates and possess optimal combinations of three key binding properties, namely high affinity, high conformational specificity, and low off-target binding. Here we report a directed evolution approach for generating high-qualit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exons within transcripts are traditionally classified as first, internal or last exons, each governed by different regulatory mechanisms. We recently described the widespread usage of 'hybrid' exons that serve as terminal or internal exons in different transcripts. Here, we employ an interpretable deep learning pipeline to dissect the sequence features governing the co-regulation of transcription initiation and splicing in hybrid exons. Using ENCODE data from human tissues, we identified 80 000 hybrid first-internal exons. These exons often possess a relaxed chromatin state, allowing transcrip
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene amplification is thought to be common in bacterial populations, providing a rapid and reversible mode of adaptation to diverse stresses, including the acquisition of antibiotic resistance. We previously showed that the opportunistic pathogen Staphylococcus aureus evolves resistance to the dual-targeting fluoroquinolone delafloxacin (DLX) that inhibits both the DNA gyrase and DNA topoisomerase IV via amplification of an efflux pump encoding gene sdrM. However, the pathways that control gene amplification, and consequently adaptive trajectories, remain understudied, especially in gram-posit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Madagascar has maintained an influenza surveillance program for decades. Following the emergence of SARS-CoV-2 in 2020, the country implemented strict nonpharmaceutical interventions (NPIs) that disrupted influenza circulation. We studied the evolutionary dynamics of influenza viruses in Madagascar over a 5-year period, spanning both the pre-pandemic and COVID-19 pandemic periods: 2019-2023. We showed that global genetic evolution profiles for A(H1N1)pdm09, A(H3N2), and B/Victoria viruses occurred from the pre-pandemic to the pandemic period of COVID-19 in Madagascar. In addition, we observed
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: The increasing prevalence of HIV drug resistance poses a significant challenge. This study aimed to investigate the epidemiological dynamics and molecular characteristics of pretreatment drug resistance (PDR) and acquired drug resistance in Shaoxing, Eastern China.
METHODS: From 2022 to 2024, 571 newly diagnosed HIV-infected individuals and 119 individuals with antiretroviral treatment failure were enrolled. Molecular transmission networks and Bayesian analysis were employed to identify key drug-resistant clusters and trace their origins.
RESULTS: The overall PDR prevalence was 1
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candida glabrata (Nakaseomyces glabrata) is an emergent and opportunistic fungal pathogen that colonizes and persists in different niches within its human host. In this work, we studied five clinical isolates from one patient (P7), that have a clonal origin, and all of which come from blood cultures except one, P7-3, obtained from a urine culture. We found phenotypic variation such as sensitivity to high temperature, oxidative stress, susceptibility to two classes of antifungal agents, and cell wall porosity. Only isolate P7-3 is highly resistant to the echinocandin caspofungin while the other
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite a rapid expansion of Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) sublineage 8.7 over recent years, very little is known about the patterns of virus evolution, dispersal, and the factors influencing this dispersal. Relying on a national PRRSV surveillance project established over 20 years ago, we expand the available genomic data of sublineage 8.7 from China. We perform independent interlineage and intralineage recombination analyses for the entire study period, which showed a heterogeneous recombination pattern. A series of Bayesian phylogeographic analyses uncover the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phosphorylation of proteins on tyrosine (Tyr) residues evolved in metazoan organisms as a mechanism of coordinating tissue growth1. Multicellular eukaryotes typically have more than 50 distinct protein Tyr kinases that catalyse the phosphorylation of thousands of Tyr residues throughout the proteome1-3. How a given Tyr kinase can phosphorylate a specific subset of proteins at unique Tyr sites is only partially understood4-7. Here we used combinatorial peptide arrays to profile the substrate sequence specificity of all human Tyr kinases. Globally, the Tyr kinases demonstrate considerable divers
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent months, several SARS-CoV-2 variants have emerged that enhance transmissibility and escape host humoral immunity. Hence, the tracking of viral evolutionary trajectories is clearly of great importance. Little is known about SARS-CoV-2 evolution in nonhuman primate models used to test vaccines and therapies and to model human disease. Viral RNA was sequenced from rectal swabs from Chlorocebus aethiops (African green monkeys) after experimental respiratory SARS-CoV-2 infection. Two distinct patterns of viral evolution were identified that were shared between all collected samples. First,
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Human endogenous retroviruses (HERV), a type of transposable elements (TE), play crucial roles in human placental morphogenesis, immune response, and cancer progression. Emerging evidence suggests that TEs have been a rich source of regulatory elements in the human genome, but little is known about the global impact of HERVs on transcriptional networks in cancer. Using genome-wide approaches, we show that HERVs are composed primarily of three ancient superfamilies: ERVL-MaLR, ERVL, and ERV1. This analysis suggests that the integration of exonic, intronic, and intergenic HERVs, as w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Technical challenges remain in the sequencing of RNA viruses due to their high intra-host diversity. This bottleneck is particularly pronounced when interrogating long-range co-evolved genetic interactions given the read-length limitations of next-generation sequencing platforms. This has hampered the direct observation of these genetic interactions that code for protein-protein interfaces with relevance in both drug and vaccine development. Here we overcome these technical limitations by developing a nanopore-based long-range viral sequencing pipeline that yields accurate single molecule sequ
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Avian influenza virus (AIV) subtypes H5 and H7, possessing the ability to mutate spontaneously from low pathogenic (LP) to highly pathogenic (HP) variants, are major concerns for enormous socio-economic losses in the poultry industry, as well as for fatal human infections. Through antigenic drift and shift, genetic reassortments of the genotypes pose serious threats of increased virulence and pathogenicity leading to potential pandemics. In this study, we isolated the H7-subtype AIVs circulating in the Republic of Korea during 2018-2019, and perform detailed molecular analysis to study their c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования