Protein misfolding and aggregation are central pathological processes underlying amyloidosis, a group of disorders characterized by the deposition of insoluble amyloid fibrils. These toxic aggregates form due to conformational destabilization and exposure of hydrophobic protein regions, leading to aberrant interactions that disrupt normal cellular functions. Amyloid fibrillation is a key pathological event in both neurodegenerative and systemic disorders. In metabolic and systemic amyloidosis, such as lysozyme derived and insulin derived amyloidosis, peripheral fibril deposition leads to progr
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recently identified CARF (CRISPR-associated Rossman-fold) family of proteins play a critical role in prokaryotic defense, mediating cOA (cyclic oligoadenylate)-stimulated ancillary immune responses in the type III CRISPR-Cas systems. Whereas most previously characterized CARF proteins contain nucleic acids or protein degradation effectors, a subset of the family, including the CARF-fused adenosine deaminase (ADA) (Cad1), has recently been shown to convert ATP to ITP. The enzymatic mechanism and the activation process of Cad1, however, remain incompletely understood. Here we present biochem
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: The rapid evolution of SARS-CoV-2 highlights the importance of computational approaches to explore mutational effects on the viral spike protein. In this work, we present a genetic algorithm (GA) framework applied to the structural optimization of spike protein variants, with a focus on energetic and binding properties rather than direct evolutionary prediction.
RESULTS: Our GA-driven pipeline generated spike variants with progressively improved structural stability as indicated by lower discrete optimized protein energy scores across generations. The approach also enabled evaluat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dengue virus is a critical worldwide health concern, and efforts to identify useful antiviral drugs remain imperative. This study utilized computational techniques to investigate the flavonoids as a potential inhibitor of the dengue virus envelope protein (PDB ID: 1OKE). 33 flavonoids were docked among them, 5-hydroxy-3-(4-hydroxyphenyl)-7-[(2S, 3R, 4S, 5S, 6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxychromen-4-one (FLA1) showed the best binding affinity of -9.1 kcal/mol towards the E protein. Molecular dynamics simulations (100 ns) were carried out to analyze the stability and interacti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To evaluate, through in silico analysis, the cross-reactivity between Sco m 5 and arthropod proteins and to identify potential IgE-binding epitopes.
METHODS: The homology between Sco m 5 and 15 arthropod allergens (Vespula, Polistes, Polybia, Solenopsis, Brachyponera, Phoneutria, and Dermatophagoides) was assessed using the ALLERMATCH server for pairwise alignments and PRALINE for multiple alignments. Phylogenetic trees were constructed using Molecular Evo-lutionary Genetics Analysis (MEGA). Epitope prediction was performed with the Ellipro server. Protein visualization was carried
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV), the first identified human tumor virus, is implicated in various human malignancies, infectious mononucleosis, and more recently, multiple sclerosis. Prophylactic vaccines have the potential to effectively prevent EBV infection. Glycoprotein B (gB) serves as the fusogen and plays a pivotal role in the virus entry process, making it a critical target for EBV vaccine development. Surface membrane proteins of enveloped viruses serve as native conformational antigens, making them susceptible to immune recognition. Utilizing lipid membrane-bound viral antigens is a promisi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Due to the length of time required to develop specific antiviral agents, the World Health Organization adopted the strategy of repurposing existing medications to treat Coronavirus disease 2019 infection. Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) main protease is possible biological target for potential antiviral drugs. We selected various compounds from PubChem database based on the structure of main protease inhibitors in Protein Data Bank database. Ten compounds showed nontumorigenic and nonmutagenic potential and met Egan's and Lipinski's rules. Molecular docking analysi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biased agonists and pharmacological chaperones have demonstrated their potential to harness G protein-coupled receptor signaling and trafficking, and have collectively opened new possibilities in G protein-coupled receptor drug discovery. Combining pharmacological chaperoning and biased agonism properties into a unique given molecule would be of high therapeutic interest in many human diseases resulting from G protein-coupled receptor mutation and misfolding. This strategy perfectly fits to congenital Nephrogenic Diabetes Insipidus which is a typical conformational disease. In most of the case
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Duchenne muscular dystrophy is the most common and severe of the muscular dystrophies, a group of inherited myopathies caused by different genetic mutations leading to aberrant expression or complete absence of cytoskeletal proteins. Dystrophic muscles are prone to injury, and regenerate poorly after damage. Remorseless cycles of muscle fibre breakdown and incomplete repair lead to progressive and severe muscle wasting, weakness and premature death. Many other conditions are similarly characterized by muscle wasting, including sarcopenia, cancer cachexia, sepsis, denervation, burns, and chroni
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this work, different approaches were investigated to enhance the expression rabies virus glycoprotein (RABV-G) in the yeast Pichia pastoris; this membrane protein is responsible for the synthesis of rabies neutralizing antibodies. First, the impact of synonymous codon usage bias was examined and an optimized RABV-G gene was synthesized. Nevertheless, data showed that the secretion of the optimized RABV-G gene was not tremendously increased as compared with the non-optimized one. In addition, similar levels of RABV-G were obtained when α-factor mating factor from Saccharomyces cerevisiae or
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The enzyme TcpG is a periplasmic protein produced by the Gram-negative pathogen Vibrio cholerae. TcpG is essential for the production of ToxR-regulated proteins, including virulence-factor pilus proteins and cholera toxin, and is therefore a target for the development of a new class of anti-virulence drugs. Here, the 1.2 Å resolution crystal structure of TcpG is reported using a cryocooled crystal. This structure is compared with a previous crystal structure determined at 2.1 Å resolution from data measured at room temperature. The new crystal structure is the first DsbA crystal structure to b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The intrinsic flexibility of DNA and the difficulty of identifying its interaction surface have long been challenges that prevented the development of efficient protein-DNA docking methods. We have demonstrated the ability our flexible data-driven docking method HADDOCK to deal with these before, by using custom-built DNA structural models. Here we put our method to the test on a set of 47 complexes from the protein-DNA docking benchmark. We show that HADDOCK is able to predict many of the specific DNA conformational changes required to assemble the interface(s). Our DNA analysis and modelling
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chaperones assist the metamorphosis of polypeptides to fully functional proteins. The family of heat shock proteins 70 (HSP70) bind at an early stage, while the HSP90 bind to proteins near their active conformation. We studied HSP90 and HSP70 in muscle biopsies from controls and patients diagnosed with the three main idiopathic inflammatory myopathies (IIM), namely dermatomyositis (DM), sporadic inclusion body myositis (IBM), and polymyositis (PM). Human skeletal muscle displayed constitutive levels of protein, but in IIM both HSP90 and HSP70 were upregulated. Regenerating muscle fibers of IIM
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mg-chelatase catalyzes the insertion of Mg2+ into protoporphyrin IX at the first committed step of the chlorophyll biosynthetic pathway. It consists of three subunits: I, D, and H. The I subunit belongs to the AAA protein superfamily (ATPases associated with various cellular activities) that is known to form hexameric ring structures in an ATP-dependant fashion. Dominant mutations in the I subunit revealed that it functions in a cooperative manner. We demonstrated that the D subunit forms ATP-independent oligomeric structures and should also be classified as an AAA protein. Furthermore, we add
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multidrug resistance of tumors, characterized by resistance against a variety of chemically unrelated anticancer agents, can be caused by overexpression of ATP-binding cassette (ABC) proteins, such as P-glycoprotein and MRP1. These multidrug-resistance proteins are plasma-membrane proteins that actively extrude chemotherapeutic agents from the cell interior, decreasing drug accumulation and thus, allowing the cells to survive in the presence of toxic levels of anticancer agents. ABC proteins contain multispanning transmembrane domains and nucleotide-binding domains (NBDs). The NBDs are respons
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two novel proteins, BM8 and BM14, were isolated from Bungarus multicinctus (Taiwan banded krait) venom using the combination of chromatography on a SP-Sephadex C-25 column and a reverse-phase HPLC column. Both proteins contained 82 amino acid residues including 10 cysteine residues, but there were two amino acid substitutions at positions 37 and 38 (Glu37-Ala38 in BM8; Lys37-Lys38 in BM14). CD spectra and acrylamide quenching studies revealed that the gross conformation of BM8 and BM14 differed. In contrast to BM8, BM14 inhibited the binding of [3H]quinuclidinyl benzilate to the M2 muscarinic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The complete covalent structure of the insect toxin purified from the venom of the North-African scorpion Androctonus australis Hector was described. Its amino acid sequence was established by phenylisothiocyanate degradation of several protein derivatives and proteolytic fragments in a liquid protein sequencer using either a "protein" or a "peptide" program. The position of the four disulfide bridges were deduced by analysis of proteolytic peptides before and after diperformic oxidation, and by partial labeling of the half cystine residues with [14C]-iodoacetic acid and determining the specif
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In bacteria, the second committed step in the diaminopimelate/lysine anabolic pathways is catalyzed by the enzyme dihydrodipicolinate reductase (DapB). DapB catalyzes the reduction of dihydrodipicolinate to yield tetrahydrodipicolinate. Here, the cloning, expression, purification, crystallization and X-ray diffraction analysis of DapB from the human-pathogenic bacterium Bartonella henselae, the causative bacterium of cat-scratch disease, are reported. Protein crystals were grown in conditions consisting of 5%(w/v) PEG 4000, 200 mM sodium acetate, 100 mM sodium citrate tribasic pH 5.5 and were
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epichaperomes are stable, stress-induced supramolecular assemblies formed through extensive integration of molecular chaperones, co-chaperones, signaling proteins, and client proteins. Although increasing evidence indicates that epichaperomes act as organizational hubs that coordinate proteostasis and signaling networks in cancer, neurodegenerative disorders, and chronic inflammatory diseases, their potential physical roles in cellular organization remain largely unexplored.
RESULTS: Here, the Epichaperome Matrix Theory, a systems-level theoretical framework that conceptualizes th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The monoamine neurotransmitter dopamine (DA) acts across phylogeny to modulate both simple and complex behaviors. The presynaptic DA transporter (DAT) is a major determinant of DA signaling capacity in ensuring efficient extracellular DA clearance. In humans, DAT is also a major target for prescribed and abused psychostimulants. Multiple structural determinants of DAT function and regulation have been defined, though largely these findings have arisen from heterologous expression or ex vivo cell culture studies. Loss of function mutations in the gene encoding the Caenhorhabditis elegans DAT (d
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования