Sumerlaeota is a mysterious, putative phylum-level lineage distributed globally but rarely reported. As such, their physiology, ecology, and evolutionary history remain unknown. The 16S rRNA gene survey reveals that Sumerlaeota is frequently detected in diverse environments globally, especially cold arid desert soils and deep-sea basin surface sediments, where it is one dominant microbial group. Here, we retrieved four Sumerlaeota metagenome-assembled genomes (MAGs) from two hot springs and one saline lake. Including another 12 publicly available MAGs, they represent six of the nine putative S
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trans-acyltransferase polyketide synthases (trans-AT PKSs) are bacterial multimodular enzymes that biosynthesize diverse pharmaceutically and ecologically important polyketides. A notable feature of this natural product class is the existence of chemical hybrids that combine core moieties from different polyketide structures. To understand the prevalence, biosynthetic basis, and evolutionary patterns of this phenomenon, we developed transPACT, a phylogenomic algorithm to automate global classification of trans-AT PKS modules across bacteria and applied it to 1782 trans-AT PKS gene clusters. Th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zoonotic transfer of animal pathogens to human hosts can generate novel agents, but the genetic events following such host jumps are not well studied. Here we characterize the mechanisms driving adaptive evolution of the emerging zoonotic pathogen Bordetella hinzii in a patient with interleukin-12 receptor β1 deficiency. Genomic sequencing of 24 B. hinzii isolates cultured from blood and stool over 45 months revealed a clonal lineage that had undergone extensive within-host genetic and phenotypic diversification. Twenty of 24 isolates shared an E9G substitution in the DNA polymerase III ε-subu
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Norovirus is a major cause of acute gastroenteritis. Human noroviruses present >30 different genotypes, with a single genotype (GII.4) predominating worldwide. Concurrent outbreaks of norovirus are often associated with the emergence of new viruses. While different hypotheses have been presented, the source of new mutations in noroviruses is still unknown. In this study, we applied high-resolution sequencing to determine the intra-host viral diversity presented by noroviruses during the acute and shedding phase of infection in children. Profiling viral intra-host diversification at nearly full
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genome of influenza A viruses (IAV) is encoded in eight distinct viral ribonucleoproteins (vRNPs) that consist of negative sense viral RNA (vRNA) covered by the IAV nucleoprotein. Previous studies strongly support a selective packaging model by which vRNP segments are bundling to an octameric complex, which is integrated into budding virions. However, the pathway(s) generating a complete genome bundle is not known. We here use a multiplexed FISH assay to monitor all eight vRNAs in parallel in human lung epithelial cells. Analysis of 3.9 × 105 spots of colocalizing vRNAs provides quantitati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
About 1-2% of European population are redheaded, meaning they synthesize more pheomelanin than eumelanin, the main melanin pigment in humans. Several mutations could be responsible for this phenotype. It has been suggested that corresponding mutations spread in Europe due to a founder effect shaped either by a relaxation of selection for dark, UV-protective phenotypes or by sexual selection in favour of rare phenotypes. In our study, we investigated the levels of vitamin D precursor 25(OH)D3 (calcidiol) and folic acid in the blood serum of 73 redheaded and 130 non-redheaded individuals. In red
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonrecombining sex chromosomes are widely found to be more differentiated than autosomes among closely related species, due to smaller effective population size and/or to a disproportionally large-X effect in reproductive isolation. Although fungal mating-type chromosomes can also display large nonrecombining regions, their levels of differentiation compared with autosomes have been little studied. Anther-smut fungi from the Microbotryum genus are castrating pathogens of Caryophyllaceae plants with largely nonrecombining mating-type chromosomes. Using whole genome sequences of 40 fungal strain
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Australian funnel-web spiders are infamous for causing human fatalities, which are induced by venom peptides known as δ-hexatoxins (δ-HXTXs). Humans and other primates did not feature in the prey or predator spectrum during evolution of these spiders, and consequently the primate lethality of δ-HXTXs remains enigmatic. Funnel-web envenomations are mostly inflicted by male spiders that wander from their burrow in search of females during the mating season, which suggests a role for δ-HXTXs in self-defense since male spiders rarely feed during this period. Although 35 species of Australian funne
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Legionella pneumophila governs its interactions with host cells by secreting >300 different "effector" proteins. Some of these effectors contain eukaryotic domains such as the RCC1 (regulator of chromosome condensation 1) repeats promoting the activation of the small GTPase Ran. In this report, we reveal a conserved pattern of L. pneumophila RCC1 repeat genes, which are distributed in two main clusters of strains. Accordingly, strain Philadelphia-1 contains two RCC1 genes implicated in bacterial virulence, legG1 (Legionella eukaryotic gene 1), and ppgA, while strain Paris contains only one, pi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Due to its rapid lethal effect in the early development stage of shrimp, acute hepatopancreatic necrosis disease (AHPND) has been causing great economic losses, since its first outbreak in southeast China in 2009. Vibrio parahaemolyticus, carrying the pirA and pirB toxin genes is known to cause AHPND in shrimp. The overall objective of this study was to sequence the whole genome of AHPND positive V. parahaemolyticus strains isolated from shrimp (Peneaus monodon) of the south-west region of Bangladesh in 2016 and 2017 and characterize the genomic features and emergence pattern of th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Free ranging ungulates, represented in Europe mostly by several deer species, are important hosts for ticks and reservoirs of tick-borne infections. A number of studies have focused on the prevalence of tick borne pathogens in deer chiefly with the aim to determine their potential role as reservoir hosts for important human and livestock pathogens. However, genetic similarity of Babesia spp. forming a group commonly termed as a clade VI that accommodates the deer piroplasms, complicates this task and has led to the description of a bewildering array of poorly characterised strains. This study
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bovine viral diarrhea virus (BVDV) is a major pathogen worldwide, causing significant economic losses to the livestock sector. In Uruguay, BVDV seroprevalence at the farm level is >80%. In this work, 2546 serum, blood or tissue samples collected from animals suspected of being affected by BVD between 2015 and 2017 were analyzed by reverse transcription PCR and sequencing. Analysis of the BVDV genomic regions 5'UTR/Npro, Npro and E2 revealed that BVDV-1a, 1i and 2b circulate in the country, with BVDV-1a being the most prevalent subtype. Population dynamics studies revealed that BVDV-1a has been
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since late 2011, outbreaks of pseudorabies virus (PRV) have occurred in southern China causing major economic losses to the pig industry. We previously reported that variant PRV forms and recombination in China could be the source of continued epidemics. Here, we analyzed samples from intensive pig farms in eastern China between 2017 and 2019, and sequenced the main glycoproteins (gB, gC, gD, and gE) to study the evolution characteristics of PRV. Based on the gC gene, we found that PRV variants belong to clade 2 and detected a founder effect during by the PRV epidemic. In addition, we detected
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenovirus E1A is the first viral protein expressed during infection. E1A controls critical aspects of downstream viral gene expression and cell cycle deregulation, and its function is thought to be highly conserved among adenoviruses. Various bioinformatics analyses of E1A from 38 human adenoviruses of species D (HAdV-D), including likelihood clade model partitioning, provided highly significant evidence of divergence of HAdV-Ds into two distinct groups for the conserved region 3 (CR3), present only in the E1A 13S isoform. This variance within E1A 13S of HAdV-Ds was not found in any other hum
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The threat of bacteria resistant to multiple antibiotics poses a major public health problem requiring immediate and coordinated action worldwide. While infectious pathogens have become increasingly resistant to commercially available drugs, antibiotic discovery programs in major pharmaceutical companies have produced no new antibiotic scaffolds in 40 years. As a result, new strategies must be sought to obtain a steady supply of novel scaffolds capable of countering the spread of resistance. The bacterial ribosome is a major target for antimicrobials and is inhibited by more than half of the a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Metal tolerance is often an integrative result of metal uptake and distribution, which are fine-tuned by a network of signaling cascades and metal transporters. Thus, with the goal of advancing the molecular understanding of such metal homeostatic mechanisms, comparative RNAseq-based transcriptome analysis was conducted to dissect differentially expressed genes (DEGs) in maize roots exposed to cadmium (Cd) stress.
RESULTS: To unveil conserved Cd-responsive genes in cereal plants, the obtained 5166 maize DEGs were compared with 2567 Cd-regulated orthologs in rice roots, and this co
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The management of the tsetse species Glossina pallidipes (Diptera; Glossinidae) in Africa by the sterile insect technique (SIT) has been hindered by infections of G. pallidipes production colonies with Glossina pallidipes salivary gland hypertrophy virus (GpSGHV; Hytrosaviridae family). This virus can significantly decrease productivity of the G. pallidipes colonies. Here, we used three highly diverged genes and two variable number tandem repeat regions (VNTRs) of the GpSGHV genome to identify the viral haplotypes in seven Glossina species obtained from 29 African locations and det
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Enteroviruses (EV) 71 and coxsackievirus A (CVA) 16 are the most prevalent EV serotypes responsible for hand, foot and mouth disease (HFMD). Nevertheless, CVA6 was found to be the leading cause of HFMD in the Nanjing area, of China in 2013. This study aims to provide insights into the occurrence of the emergent recombinant CVA6 through examination of the evolutionary history and the involved recombination events.
METHODOLOGY: The viral protein1 (VP1) and non-structural (NS) 2C and 3D of 28 Nanjing CVA6 strains were aligned, among which the full-length sequences of eight strains were
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Influenza A virus (IAV) RNA packaging signals serve to direct the incorporation of IAV gene segments into virus particles, and this process is thought to be mediated by segment-segment interactions. These packaging signals are segment and strain specific, and as such, they have the potential to impact reassortment outcomes between different IAV strains. Our study aimed to quantify the impact of packaging signal mismatch on IAV reassortment using the human seasonal influenza A/Panama/2007/99 (H3N2) and pandemic influenza A/Netherlands/602/2009 (H1N1) viruses. Focusing on the three most divergen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Newcastle disease virus (NDV) infections are one of the most devastating causes of economic losses in the poultry industry and despite extensive vaccination, outbreaks are being reported around the globe especially from developing and tropical countries. Analysis of NDV field strains from vaccinated flocks would highlight essential areas of consideration not only to design effective immunization strategies but also to devise vaccines that provide sterile immunity. For this purpose, 91 NDV suspected outbreaks were investigated and screened for NDV genetic material. A total of 16 NDV-positive is
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования