Patients with rheumatoid arthritis (RA) appear to be at a higher risk of lung cancer (LC). Although the connection between RA and LC has been an active area of research for many years, the molecular pathogenesis of the disease process remains unclear. The cyclooxygenase (COX)-2/thromboxane A2 (TxA2) pathway has been shown to play a potential role in LC development through an auto-regulatory feedback loop. An increased level of TxA2 has been found in RA patients, and intriguingly, the positive feedback loop for the COX-2/TxA2 pathway was shown to have a potential function in RA fibroblast-like
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exposition to pharmaceutical compounds released to the environment is considered as a potential risk for various organisms. We exposed Arabidopsis thaliana plants to naproxen (NAP) and praziquantel (PZQ) in 5 µM concentration for 2 days and recorded transcriptomic response in their roots with the aim to estimate ecotoxicity and to identify gene candidates potentially involved in metabolism of both compounds. Nonsteroidal anti-inflammatory drug NAP up-regulated 105 and down-regulated 29 genes (p-value ≤ 0.1, fold change ≥ 2), while anthelmintic PZQ up-regulated 389 and down-regulated 353 genes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recurrence of high-risk advanced retinoblastoma (RB) is still a major obstacle even after enucleation due to resistance to adjuvant chemotherapy, especially in China. To identify any germline alterations or candidate genes associated with RB prognosis, we obtained whole-exome sequencing (WES) and reduced-representation bisulfite sequencing (RRBS) profiles by using patient peripheral blood samples, followed by clinical validation and functional characterization. For follow-up studies, we selected 17 candidate genes from the WES and RRBS analyses. Among them, MBD4, which carries a germline loss-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Transcription factors (TFs) act together with co-regulators to modulate the expression of their target genes, which eventually dictates their pathophysiological effects. Depending on the co-regulator, TFs can exert different activities. The Estrogen Related Receptor α (ERRα) acts as a transcription factor that regulates several pathophysiological phenomena. In particular, interactions with PGC-1 co-activators are responsible for the metabolic activities of ERRα. In breast cancers however, ERRα exerts several tumor-promoting, metabolism-unrelated activities that do not depend on PGC
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aedes aegypti is the primary arboviral vector globally, and its affinity to feed on human hosts is a key determinant of transmission intensity. Despite the epidemiological importance of anthropophily, the genomic architecture underlying the molecular basis of host-feeding behavior remains understudied.
METHODS: Here, we present an integrated genome-wide association study (GWAS) and structural variant analysis of host-feeding behavior in 21 field-collected Ae. aegypti females phenotyped as human-blood-fed (HF; n = 11) or non-human-blood-fed (NHF; n = 10). Whole-genome sequencing yi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucella spp. are widespread intracellular animal pathogens that cause brucellosis, a significant zoonosis. Despite the global impact of brucellosis on animal and human health, the host genes that support Brucella infection remain incompletely defined. To address this knowledge gap, we developed a flow cytometry-based infection assay with fluorescent Brucella and performed a genome-wide CRISPR-Cas9 loss-of-function screen in human macrophage-like cells. Disruption of >150 host genes significantly reduced intracellular B. abortus burden at 3 h post-infection. In addition to recovering known hos
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INDETERMINATE DOMAIN (IDD) transcription factors are plant-specific regulators essential for plant development and stress adaptation. As a globally important staple crop, common wheat (Triticum aestivum L.) is frequently threatened by fungal diseases such as powdery mildew and stripe rust. To date, however, the IDD gene family in wheat has not been systematically characterized, and its roles in biotic stress responses remain unclear. In this study, we performed genome-wide identification and a comprehensive analysis of the TaIDD gene family. A total of 41 TaIDD genes were identified, which wer
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Avian pathogenic Escherichia coli (APEC) is the primary pathogen causing avian colibacillosis, leading to significant economic losses in the global poultry industry. Its pathogenicity relies on a complex network of virulence factors, among which the type III secretion system 2 (ETT2) is a key component. However, unlike the classical T3SS, the ETT2 gene cluster in APEC commonly exhibits pseudogenization and deletions, suggesting that its function may have undergone adaptive remodeling. Notably, the YgeP gene located at the end of this pathogenicity island is highly conserved, implying that it m
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are key post-transcriptional regulators of plant development and stress responses, with many being conserved across diverse plant lineages. In this study, we investigated the expression profiles of miRNAs and their corresponding target genes in Arachis stenosperma, a wild peanut relative that exhibits robust resistance to root-knot nematodes (RKN). Small RNA sequencing of nematode-infected roots identified 107 miRNA loci, of which 93 corresponded to conserved miRNA families and 14 represented novel candidates, designated as miRNOVO. Among these, 18 miRNAs belonging to 11 con
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver zonation characterizes the separation of metabolic pathways along the lobules and is required for optimal hepatic function. Wnt signaling is a master regulator of spatial liver zonation. A perivenous-periportal Wnt activity gradient orchestrates metabolic zonation by activating gene expression in perivenous hepatocytes, while suppressing gene expression in their periportal counterparts. However, the understanding as to the liver gene zonation and zonation regulators in diseases is limited. Non-alcoholic steatohepatitis (NASH) is a chronic liver disease characterized by fat accumulation,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Retinal function changes dramatically from day to night, yet clinical diagnosis, treatments, and experimental sampling occur during the day. To begin to address this gap in our understanding of disease pathobiology, this study investigates whether diabetes affects the retina's daily rhythm of gene expression. Diabetic, Ins2Akita/J mice, and non-diabetic littermates were kept under a 12 h:12 h light/dark cycle until 4 months of age. mRNA sequencing was conducted in retinas collected every 4 h throughout the 24 hr light/dark cycle. Computational approaches were used to detect rhythmicity, predic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bivalent epigenomic regulatory domains containing both activating histone 3 lysine 4 (H3K4me3) and repressive lysine 27 (H3K27me3) trimethylation are associated with key developmental genes. These bivalent domains repress transcription in the absence of differentiation signals but maintain regulatory genes in a poised state to allow for timely activation. Previous studies demonstrated that enhancer of zeste homolog 2 (Ezh2), a histone 3 lysine 27 (H3K27) methyltransferase, suppresses osteogenic differentiation and that inhibition of Ezh2 enhances commitment of osteoblast progenitors in vitro a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Growing evidence has suggested that Type I Interferon (I-IFN) plays a potential role in the pathogenesis of Down Syndrome (DS). This work investigates the underlying function of MX1, an effector gene of I-IFN, in DS-associated transcriptional regulation and phenotypic modulation.
METHODS: We performed assay for transposase-accessible chromatin with high-throughout sequencing (ATAC-seq) to explore the difference of chromatin accessibility between DS derived amniocytes (DSACs) and controls. We then combined the annotated differentially expressed genes (DEGs) and enriched transcripti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcriptional changes involved in neuronal recovery after sports-related concussion (SRC) may be obscured by inter-individual variation in mRNA expression and nonspecific changes related to physical exertion. Using a co-twin study, the objective of this study was to identify important differences in mRNA expression among a single pair of monozygotic (MZ) twins discordant for concussion. A pair of MZ twins were enrolled as part of a larger study of concussion biomarkers among collegiate athletes. During the study, Twin A sustained SRC, allowing comparison of mRNA expression to the nonconcusse
СтатьяTwin StudyПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Elevated levels of interleukin 17A (IL-17A) have been found in systemic lupus erythematosus (SLE). Forkhead box protein P3 (FOXP3) activates T-regulation lymphocytes and is a master regulator cell function. The cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4 (CTLA4) gene plays a similar role. We investigated the role of these expressions in SLE patients with/without nephritis.
METHODS: The present study was a case-controlled study including 49 patients with SLE and 26 healthy controls. The genes expression of IL-17A, FOXP3, and CTLA4 were measured by quantitative Real-Time PCR. The
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Invasive aspergillosis is a severe opportunistic infection with high mortality in immunocompromised patients. Recently, the roles of microRNAs have been taken into consideration in the immune system and inflammatory responses. Using bioinformatics approaches, we aimed to study the microRNAs related to invasive aspergillosis to understand the molecular pathways involved in the disease pathogenesis. Data were extracted from the gene expression omnibus (GEO) database. We proposed 3 differentially expressed genes; S100B, TDRD9 and TMTC1 related to pathogenesis of invasive aspergillosis. Using miRW
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Members of the Burkholderia cepacia complex (Bcc) have been isolated from various environmental and clinical samples and reportedly pose a threat to human health. Here we examine the draft genome sequence of Burkholderia sp. LS-044, an antibiotic-resistant endophytic strain affiliated to the Bcc (ST895) inhabiting rice (Oryza sativa ssp. japonica cv. Tainung 71) root.
METHODS: Antimicrobial susceptibility of LS-044 was evaluated comparatively with other Burkholderia sp. (CC-Al74 and CC-3XP9) using commercial ATB PSE 5 test strips. The genome of LS-044 was sequenced using an Illumi
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The growth hormone / insulin-like growth factor-1 (GH/IGF-1) pathway of the somatotropic axis is the major controller for growth rate and body size in vertebrates, but the effect of selection on the expression of GH/IGF-1 somatotropic axis genes and their association with body size and growth performance in farm animals is not fully understood. We analyzed a time series of expression profiles of GH/IGF-1 somatotropic axis genes in two chicken breeds, the Daweishan mini chickens and Wuding chickens, and the commercial Avian broilers hybrid exhibiting markedly different body sizes and growth rat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dyskeratosis congenita (DC) is an inherited bone marrow failure syndrome caused by germline mutations in telomere biology genes. Patients have extremely short telomeres for their age and a complex phenotype including oral leukoplakia, abnormal skin pigmentation, and dysplastic nails in addition to bone marrow failure, pulmonary fibrosis, stenosis of the esophagus, lacrimal ducts and urethra, developmental anomalies, and high risk of cancer. We evaluated a patient with features of DC, mood dysregulation, diabetes, and lack of pubertal development. Family history was not available but genome-wid
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute kidney injury (AKI) is a syndrome of reduced glomerular filtration rate and urine production caused by a number of different diseases. It is associated with renal tissue damage. This tissue damage can cause tubular atrophy and interstitial fibrosis that leads to nephron loss and progression of chronic kidney disease (CKD). This review describes the in-common mechanisms behind tissue damage in AKI caused by different underlying diseases. Comparing six high-quality microarray studies of renal gene expression after AKI in disease models (gram-negative sepsis, gram-positive sepsis, ischemia-
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.