The chlamydial small non coding RNA, IhtA, regulates the expression of both HctA and DdbA, the uncharacterized product of the C. trachomatis L2 CTL0322 gene. HctA is a small, highly basic, DNA binding protein that is expressed late in development and mediates the condensation of the genome during RB to EB differentiation. DdbA is conserved throughout the chlamydial lineage, and is predicted to express a small, basic, cytoplasmic protein. As it is common for sRNAs to regulate multiple mRNAs within the same physiological pathway, we hypothesize that DdbA, like HctA, is involved in RB to EB diffe
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The bacterium Vibrio cholerae is the etiologic agent of the severe human diarrheal disease cholera. The gut microbiome, or the native community of microorganisms found in the human gastrointestinal tract, is increasingly being recognized as a factor in driving susceptibility to infection, in vivo fitness, and host interactions of this pathogen. Here, we review a subset of the emerging studies in how gut microbiome structure and microbial function are able to drive V. cholerae virulence gene regulation, metabolism, and modulate host immune responses to cholera infection and vaccination. Improve
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infections with Salmonella enterica pose a challenge for antibiotic treatment. In this issue of Cell Chemical Biology, Tsai et al. use a chemical genomics approach to identify dephostatin as an inhibitor of intracellular Salmonella virulence in vitro and in vivo by targeting the two-component systems SsrA-SsrB and PmrB-PmrA.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАКомментарийПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genome of methylotrophic bacteria Methylorubrum extorquens DM4 contains two homologous groESL operons encoding the 60-kDa and 10-kDa subunits of GroE heat shock chaperones with highly similar amino acid sequences. To test a possible functional redundancy of corresponding GroEL proteins we attempted to disrupt the groEL1 and groEL2 genes. Despite the large number of recombinants analysed and the gentle culture conditions the groEL1-lacking mutant was not constructed suggesting that the loss of GroEL1 was lethal for cells. At the same time the ∆groEL2 strain was viable and varied from the wi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dormancy is a protective state in which diverse bacteria, including Mycobacterium tuberculosis, Staphylococcus aureus, Treponema pallidum (syphilis), and Borrelia burgdorferi (Lyme disease), curtail metabolic activity to survive external stresses, including antibiotics. Evidence suggests dormancy consists of a continuum of interrelated states, including viable but nonculturable (VBNC) and persistence states. VBNC and persistence contribute to antibiotic tolerance, reemergence from latent infections, and even quorum sensing and biofilm formation. Previous studies indicate that the protein mecha
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The foodborne pathogen Listeria monocytogenes is able to survive a variety of stress conditions leading to the colonization of different niches like the food processing environment. This study focuses on the hypervariable genetic hot spot lmo0443 to lmo0449 haboring three inserts: the stress survival islet 1 (SSI-1), the single-gene insert LMOf2365_0481, and two homologous genes of the nonpathogenic species Listeria innocua: lin0464, coding for a putative transcriptional regulator, and lin0465, encoding an intracellular PfpI protease. Our prevalence study revealed a different distribution of t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospirosis is a zoonotic disease that affects ∼1 million people annually, with a mortality rate of >10%. Currently, there is an absence of effective genetic manipulation tools for targeted mutagenesis in pathogenic leptospires. Transcription activator-like effectors (TALEs) are a recently described group of repressors that modify transcriptional activity in prokaryotic and eukaryotic cells by directly binding to a targeted sequence within the host genome. To determine the applicability of TALEs within Leptospira spp., two TALE constructs were designed. First, a constitutively expressed TALE
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The oral commensal Streptococcus gordonii must adapt to constantly fluctuating and often hostile environmental conditions to persist in the oral cavity. The arginine deiminase system (ADS) of S. gordonii enables cells to produce, ornithine, ammonia, CO(2), and ATP from arginine hydrolysis, augmenting the acid tolerance of the organism. The ADS genes are substrate inducible and sensitive to catabolite repression, mediated through ArcR and CcpA, respectively, but the system also requires low pH and anaerobic conditions for optimal activation. Here, we demonstrate that the CiaRH and ComDE two-com
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OspE, a Shigella type III effector binds to integrin-like kinase and enhances cell adhesion to better disseminate and colonize the intestinal epithelium. Because of the existence of OspE orthologues in other enteropathogens such as enteropathogenic Escherichia coli or Salmonella sp., maintenance of cell adhesion appears as a widespread strategy for bacteria that interact with the intestinal epithelium.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Globalisation has entailed a massive increase in trade and human mobility facilitating the rapid spread of infectious agents, including those that are drug resistant. A particularly serious threat to human health is posed by methicillin-resistant staphylococcal strains which have acquired molecular mechanisms to evade the action of beta-lactam antibiotics (BLAs). Full expression of high-level methicillin resistance involves a complex network of molecules and depends primarily on sufficient expression of a penicillin-binding protein with low sensitivity towards BLAs. Other factors include the f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycoplasma genitalium is the causative agent of non-gonococcal, chlamydia-negative urethritis in men and has been linked to reproductive tract disease syndromes in women. As with other mycoplasmas, M. genitalium lacks many regulatory genes because of its streamlined genome and total dependence on a parasitic existence. Therefore, it is important to understand how gene regulation occurs in M. genitalium, particularly in response to environmental signals likely to be encountered in vivo. In this study, we developed an oligonucleotide-based microarray to investigate transcriptional changes in M.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteria show remarkable adaptability under several stressful conditions by shifting themselves into a dormant state. Less is known, however, about the mechanism underlying the cell transition to dormancy. Here, we report that the transition to dormant states is mediated by one of the major toxin-antitoxin systems, RelEB, in a cell density-dependent manner in Escherichia coli K-12 MG1655. We constructed a strain, IKA121, which expresses the toxin RelE in the presence of rhamnose and lacks chromosomal relBE and rhaBAD. With this strain, we demonstrated that RelE-mediated dormancy is enhanced at
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial pathogenesis depends on changes in metabolic and virulence gene expression in response to changes within a pathogen's environment. The plague-causing pathogen, Yersinia pestis, requires expression of the gene encoding the Pla protease for progression of pneumonic plague. The catabolite repressor protein Crp, a global transcriptional regulator, may serve as the activator of pla in response to changes within the lungs as disease progresses. By using gene reporter fusions, the spatial and temporal activation of the crp and pla promoters was measured in a mouse model of pneumonic plague.
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Topoisomerases are an important class of enzymes for regulating the DNA transaction processes. Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is one of the most formidable pathogens also posing serious challenges for therapeutic interventions. The organism contains only one type IA topoisomerase (Rv3646c), offering an opportunity to test its potential as a candidate drug target. To validate the essentiality of M. tuberculosis topoisomerase I (TopoI(Mt) ) for bacterial growth and survival, we have generated a conditionally regulated strain of topoI in Mtb. The conditional knockdown mutant exhibited delayed g
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology2011eng
BACKGROUND: Toll-like receptors (TLR) are membrane proteins that recognize conserved molecules derived from bacterial, viral, fungal or host tissues. They are responsible for promoting the production of cytokines and chemokines, increasing the expression of costimulatory molecules and influencing the T Helper response (Th) toward either a Th1 or Th2 profile, thereby modulating the regulatory T cell response and controlling the integrity of the epithelial barrier. The key factors responsible for increased susceptibility to recurrent aphthous ulceration (RAU) are unclear, and because TLRs are in
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Lactobacillus salivarius serves as a probiotic potentially capable of preventing dental caries both in vitro and in vivo. This study focused on understanding the key antibiofilm agents and the mechanisms of action of the Lactobacilli supernatant against Streptococcus mutans.
METHODS: Streptococcus mutans biofilm was constructed and the cell-free supernatant of Lactobacillus salivarius was added. After the biofilm was collected, RNA-seq and qRT-PCR were then performed to get gene information. The influence of temperature, pH and other factors on the supernatant were measured and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gaseous chlorine dioxide (ClO2) is a potent antimicrobial agent used to control microbial contamination in food and water. This study evaluates the bactericidal activity of gaseous ClO2 released from a sodium chlorite (NaClO2) pad against Campylobacter jejuni. Exposure to a low concentration (0.4 mg/L) of dissolved ClO2 for 2 h resulted in a >93% reduction of C. jejuni, highlighting the bacterium's extreme sensitivity to gaseous ClO2. To elucidate the molecular mechanism of ClO2-induced bactericidal action, transcriptomic analysis was conducted using RNA sequencing (RNA-seq). The results indic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The rising prevalence of multidrug-resistant bacteria poses a looming threat to healthcare and necessitates novel therapeutic strategies beyond conventional antibiotics. One such organism is Serratia marcescens, which possesses a broad range of virulence factors and has been listed as a high-priority pathogen by the WHO due to its increasing antibiotic resistance. Small RNAs are promising targets against antibiotic-resistant bacteria, as they are key regulators of bacterial gene expression. This study aimed to identify novel sRNA and elucidate their roles in regulating virulence-as
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of the study was to characterize the antimicrobial activity of clinically-relevant biocides (chlorhexidine digluconate, benzalkonium chloride, PVP-iodine and triclosan) and to determine the sRNA expression profiles under biocide exposure in two major bacterial opportunistic pathogens, Enterococcus faecium and Staphylococcus aureus. In vitro activities were evaluated against S. aureus HG003 and E. faecium Aus0004. We determined MIC, MBC, sub-inhibitory concentrations (SIC) and growth curves under SIC conditions. sRNA expression study under SIC exposure of biocides was performed by RT-qP
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Subgenomic DNA microarrays were employed to evaluate the expression of the accessory gene regulator (agr locus) as well as multiple virulence-associated genes in Staphylococcus aureus. Gene expression was examined during growth of S. aureus in vitro in standard laboratory medium and rabbit serum and in vivo in subcutaneous chambers implanted in either nonimmune rabbits or rabbits immunized with staphylococcal enterotoxin B. Expression of RNAIII, the effector molecule of the agr locus, was dramatically repressed in serum and in vivo, despite the increased expression of secreted virulence factor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.