BACKGROUND: Malaria is still a major public health problem in subtropical and tropical regions. The rapid and accurate diagnosis of malaria remains a challenge in most of the endemic areas. The primary objective of the present study was to evaluate the performance of multiplex/nested PCR in detecting Plasmodium falciparum at low parasite densities and mixed infection.
METHODS: The study was performed in the Sistan-Baluchestan province of the southeastern Iran, from May 2015 to July 2016. A total of 105 patients suspected to malaria infection were enrolled in the study. The obtained DNA produc
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nasopharyngeal swabs (NPSs) are being widely used as specimens for multiplex real-time reverse transcription (RT)-PCR for respiratory virus detection. However, it remains unclear whether NPS specimens are optimal for all viruses targeted by multiplex RT-PCR. In addition, the procedure to obtain NPS specimens causes coughing in most patients, which possibly increases the risk of nosocomial spread of viruses. In this study, paired NPS and saliva specimens were collected from 236 adult male patients with suspected acute respiratory illnesses. Specimens were tested for 16 respiratory viruses by mu
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Resistance to antibiotics used against Neisseria gonorrhoeae infections is a major public health concern. Antimicrobial resistance (AMR) testing relies on time-consuming culture-based methods. Development of rapid molecular tests for detection of AMR determinants could provide valuable tools for surveillance and epidemiological studies and for informing individual case management. We developed a fast (<1.5-h) SYBR green-based real-time PCR method with high-resolution melting (HRM) analysis. One triplex and three duplex reactions included two sequences for N. gonorrhoeae identification and seve
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiplex real-time PCR with quantification of targets in a single fluorescence channel has been the demand in biotechnology industry. Here, we develop a novel analytical real-time PCR technique to detect multiple targets in a single fluorescence channel without melting curve analysis. In this technique, we show the intensity of the fluorescence signals of two discrete Tm targets is different at certain temperatures called detection temperatures, by which a high Tm target can be detected regardless of a low Tm target. We then identify the low Tm target by utilizing a change of the fluorescence
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Placental mRNA can now be detected in maternal whole blood, raising the possibility of using maternal blood for noninvasive prenatal diagnosis (NIPD) of trisomy 21. We aimed to identify new mRNA-single nucleotide polymorphism (mRNA-SNP) markers suitable for use in reverse-transcriptase multiplex ligation-dependent probe amplification (RT-MLPA) to develop a more reliable diagnostic method for trisomy 21 in Chinese subjects.
MATERIALS AND METHODS: Using sequencing, we determined the status of SNPs in genes expressed in the placenta and calculated their heterozygote frequencies to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this work was to improve the validity of laboratory-developed real-time PCR protocols implemented in the laboratory for molecular diagnosis of opportunistic DNA virus infections using the Simplexa™ extraction and amplification control (SEAC) which allows the monitoring of the whole extraction and amplification process. Herpes simplex virus (HSV), varicella-zoster virus (VZV), human cytomegalovirus (CMV), Epstein-Barr virus (EBV), BK virus (BKV), and adenovirus (AdV) genomes were investigated in 152 different clinical specimens. The use of the SEAC did not influence the results of th
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe combined immunodeficiency (SCID) and X-linked agammaglobulinemia (XLA) are inborn errors of immune function that require prompt diagnosis and treatment to prevent life-threatening infections. The lack of functional T or B lymphocytes in these diseases serves as a diagnostic criterion and can be applied to neonatal screening. A robust triplex PCR method for quantitation of T-cell receptor excision circles (TRECs) and κ-deleting recombination excision circles (KRECs), using a single Guthrie card punch, was developed and validated in a cohort of 2560 anonymized newborn screening cards and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD) is a serious genetic disorder that can lead to chronic renal disease. Protein dysfunction caused by mutations in the genes polycystic kidney disease 1 (PKD1) and polycystic kidney disease 2 (PKD2) is an important factor in the pathogenesis of ADPKD. In the present study, 30 Chinese patients with confirmed diagnosis of ADPKD, based on ultrasound or computerized tomography (CT) findings were selected, and the exon copy numbers of PKD1 and PKD2 were determined using multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA). MLPA identified exon d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic analysis of von Willebrand disease by von Willebrand factor gene sequencing has not yet become routine practice. Nevertheless, the prospects for molecular diagnosis have changed dramatically in recent years with the unveiling of next-generation sequencing platforms. With the goal of applying this technology to von Willebrand disease, we designed a strategy for von Willebrand factor gene enrichment and multiplexing based on short polymerase chain reactions. Forty patients were simultaneously analyzed enabling the identification of 43 mutations, including 36 substitutions, 2 intronic spl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Four major malaria-causing Plasmodium spp. and lymphatic filariasis-causing Wuchereria bancrofti are co-endemic in many tropical and sub-tropical regions. Among molecular diagnostic assays, multiplex polymerase chain reaction (PCR)-based assays for the simultaneous detection of DNAs from these parasite species are currently available only for P. falciparum and W. bancrofti or P. vivax and W. bancrofti. Using a post-PCR oligonucleotide ligation detection reaction-fluorescent microsphere assay (LDR-FMA), we developed a multiplex assay that has the capability to simultaneously detect all four Pla…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Due to difficulties concerning morphological identification of planorbid snails of the genus Biomphalaria, and given a high variation of characters and in the organs with muscular tissue, we designed specific polymerase chain reaction (PCR) primers for Brazilian snail hosts of Schistosoma mansoni from available sequences of internal transcribed spacer 2 (ITS2) of the ribosomal RNA gene. From the previous sequencing of the ITS2 region, one primer was designed to anchor in the 5.8S conserved region and three other species-specific primers in the 28S region, flanking the ITS2 region. These four p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study aimed to determine if vulvar cutaneous candidosis and dermatophytosis can be distinguished by routine histopathology.
MATERIALS AND METHODS: Twenty-four cases of periodic acid-Schiff-stained vulvar biopsies with a diagnosis of cutaneous mycosis were reviewed and histopathological characteristics on both periodic acid-Schiff and hematoxylin and eosin were recorded. Data were collected on age, clinical impression, microbiological results, and treatment, and all specimens underwent multiplex polymerase chain reaction analysis.
RESULTS: The mean age was 60 years, and all b…
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A 23-year-old woman from Vanuatu presented to an Australian hospital with a 3-week history of a non-healing ulcer on the lower leg. A swab was submitted for a multiplex polymerase chain reaction designed to investigate genital ulcerative conditions. Haemophilus ducreyi was detected and the gene product was subsequently sequenced, confirming the diagnosis of cutaneous chancroid. The lesion responded to intramuscular benzathine penicillin. This report adds further evidence that cutaneous chancroid should be considered in the evaluation of skin ulcers in the south Pacific.
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
West Nile virus (WNV) remains the most frequently reported locally acquired arboviral infection in the United States, yet many small and mid-sized mosquito abatement districts lack the diagnostic capacity and integrated data systems needed for rapid detection and response. The Canyon County Mosquito Abatement District (CCMAD) in southwestern Idaho undertook a multi-year capacity-building effort to expand arbovirus surveillance, standardize mosquito identification and pooling procedures, and implement triplex RT-qPCR testing for WNV, Western equine encephalitis virus (WEEV), and St. Louis encep
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Brucellosis, a disease of major veterinary and public health concern, remains widespread in several regions, including Egypt. This study reports the isolation and molecular confirmation of Brucella canis from dogs in Egypt and provides genetic relatedness of Brucella melitensis and Brucella canis in dogs to evaluate their public health significance. METHODS: A total of 785 dogs (both stray and owned) in Cairo and Giza (Feb–Dec 2024) were examined for Brucella spp.; all blood samples were examined using serological tests only (RBPT, SAT with 2-ME) however, 365 reproductive tissue sa
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid evolution of SARS-CoV-2 has led to the emergence of variants of concern (VOCs) characterized by increased transmissibility, pathogenicity, and resistance to neutralizing antibodies. Identifying these variants is essential for guiding public health efforts to control COVID-19. Although whole genome sequencing (WGS) is the gold standard for variant identification, its implementation is often limited in developing countries due to resource constraints. In Bolivia, genomic surveillance is a challenge due to its limited technological infrastructure and resources. An RT-qPCR-based strategy
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aleutian mink disease, mink viral enteritis and canine distemper are known as the three most serious diseases that cause great economic loss in the mink industry. In clinical practice, aleutian mink disease virus (AMDV), mink enteritis virus (MEV) and canine distemper virus (CDV) are common mixed infections, and they have similar clinical clinical signs, such as diarrhoea. Therefore, a rapid and accurate differential diagnosis method for use on mink ranches is essential for the control of these three pathogens. Here, we developed multiplex one-step real-time quantitative PCR (RT‒qP
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Brucellosis is a prevalent and significantly endemic cause of abortion in goat. Among the various diagnostic methods used for th … mples for Brucella spp. detection of investigation the kind to Brucella spp. using the technique of multiplex polymerase chain reaction (m-PCR) and to comparative the c-PCR methodology with RBPT and indirected enzyme-linked immunosorbent as approaches to illness diagnosis.
METHODS: This study inspected 40 aborted goats of different ages gathered from various areas of Tikrit, Iraq, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Microsatellite instability (MSI) indicates DNA mismatch repair deficiency in certain types of cancer, such as colorectal cancer. The current gold standard technique, PCR-capillary electrophoresis (CE), requires matching normal samples and specialized instrumentation. We developed VarTrace, a rapid and low-cost quantitative PCR (qPCR) assay, to evaluate MSI using solely the tumor sample DNA, obviating the requirement for matching normal samples.
METHODS: One hundred and one formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tumor samples were tested using VarTrace and compared with the Promeg
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: It is crucial to start early treatment in Spinal Muscular Atrophy (SMA) with available drugs to stop the progression of the disease, therefore making SMA screening preferable. This study assessed Quantitative Real-Time Polymerase Chain Reaction (qRT-PCR) compared to Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) for detecting Spinal Muscular Atrophy (SMA) through SMN1 gene copy number analysis in a Turkish cohort.
METHODS: We analyzed 249 DNA samples, previously tested for SMN1 and SMN2 gene deletion via MLPA, using qRT-PCR kits from three different companies. Accuracy, se
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования