Cells employ global genome nucleotide excision repair (GGR) to eliminate a broad spectrum of DNA lesions, including those induced by UV light. The lesion-recognition factor XPC initiates repair of helix-destabilizing DNA lesions, but binds poorly to lesions such as CPDs that do not destabilize DNA. How difficult-to-repair lesions are detected in chromatin is unknown. Here, we identify the poly-(ADP-ribose) polymerases PARP1 and PARP2 as constitutive interactors of XPC. Their interaction results in the XPC-stimulated synthesis of poly-(ADP-ribose) (PAR) by PARP1 at UV lesions, which in turn ena…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The RNA World hypothesis presupposes that abiotic reactions originally produced nucleotides, the monomers of RNA and universal constituents of metabolism. However, compatible prebiotic reactions for the synthesis of complementary (that is, base pairing) nucleotides and mechanisms for their mutual selection within a complex chemical environment have not been reported. Here we show that two plausible prebiotic heterocycles, melamine and barbituric acid, form glycosidic linkages with ribose and ribose-5-phosphate in water to produce nucleosides and nucleotides in good yields. Even without purific…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ZTP, the pyrophosphorylated analog of ZMP (5-amino-4-imidazole carboxamide ribose-5'-monophosphate), was identified as an alarmone that senses 10-formyl-tetrahydroflate deficiency in bacteria. Recently, a pfl riboswitch was identified that selectively binds ZMP and regulates genes associated with purine biosynthesis and one-carbon metabolism. We report on the structure of the ZMP-bound Thermosinus carboxydivorans pfl riboswitch sensing domain, thereby defining the pseudoknot-based tertiary RNA fold, the binding-pocket architecture, and principles underlying ligand recognition specificity. Mole…
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We examined the impact of EGFR-ERK signaling on poly (ADP-ribose) polymerase (PARP) activation following ionizing irradiation of human prostate cancer (PCa) cell lines displaying marked differences in ERK dependence. PARP activation was indicated by the appearance of polyADP-ribose, the incorporation of P32-labelled NADH, and by cellular NADH. EGFR-ERK signaling was manipulated through ligand activation or signal interruption using the tyrphostin AG1478, or MEK inhibitor PD 184352. EGF activation of ERK prior to irradiation was associated with a marked increase in PARP activation and decreased…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new aerobic gram-positive non-sporeforming bacillus has been isolated from infected genital hair of patients with white piedra in association with Trichosporon beigelii. This species has been characterised morphologically, nutritionally, by DNA base composition, cell-wall analysis and cellular fatty-acid profile on the basis of 14 isolates. The G+C content of DNA is 63.05 mol%. Cell walls possess meso-diaminopimelic acid (Type IV) and the sugars glucose, galactose, xylose and ribose; mycolic acids are not present. The species has a distinct colonial and microscopic morphology, is strongly pr…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The inhibition of poly(ADP-ribose) polymerase by 3-aminobenzamide (3AB) has been reported to have very different effects on X-ray-induced chromosome aberrations in G0 human lymphocytes. One group of investigators observed a 2-3-fold increase in the yield of rings, dicentrics and chromosome breaks after X-irradiation and 3AB treatment, whereas another group found that 3AB had no effect on X-ray-induced chromosome aberrations. To resolve this discrepancy, we repeated the experiments as described by both groups and found no effect of 3 mM or 5 mM 3AB on the frequency of chromosome aberrations ind…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitric oxide-releasing compounds were shown to activate an ADP-ribosyltransferase activity in the cytosol of Dictyostelium discoideum. The enzyme ADP-ribosylated a cytosolic protein of approximately 41 kDa, p41. Neither cGMP nor GTP and its analogues affected this ADP-ribosylation. p41 differs from other substrates ADP-ribosylated by cholera, pertussis, or diphtheria toxins. Treatment of ADP-ribosylated p41 with snake venom phosphodiesterase released adenosine 5'-monophosphate, indicating a mono-ADP-ribose-protein linkage. This linkage was stable to neutral hydroxylamine but was sensitive to m…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this issue of Cancer Cell, Singh and colleagues report a role for MUC1-induced HIF expression in rewiring ribose synthesis, which drives pyridimine production as a possible resistance mechanism to gemcitabine, adding to complexity and multiple paths to resistance.
СтатьяКомментарийПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The pentose-initiated Maillard reaction may serve as an oxygen-independent, non-enzymatic crosslinking (CxL) mechanism, but its slow kinetics limit clinical applicability. We hypothesize that glycation-mediated CxL can be accelerated by reactive oxygen species (ROS), potentially enabling its use in the treatment of keratoconus.
METHODS: Rabbit corneal buttons were exposed to 20% ribose and irradiated with femtosecond oscillator laser pulses at 450 mW (1,069 nm) and 250 mW (400 nm). In addition to laser-based light sources, a 365 nm UVA lamp at 3 mW/cm2 was used in combination with…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Homeostasis and repair in the nervous system are thought to rely on distinct molecular programs. Here, we uncover an unexpected role for the pentose phosphate pathway (PPP) in peripheral sensory axons, where it supports both homeostatic mechanosensation and axonal regeneration after injury. We show that the PPP is enriched and active in sciatic nerve axoplasms, where it maintains redox balance via NADPH production, enabling physiological mechanical sensation. However, following sciatic nerve injury, the PPP is required for regeneration by fueling ribonucleotide synthesis through ribose-5-phosp…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Triple M syndrome is a rare and life-threatening overlap presentation of myocarditis, myositis and myasthenia gravis, secondary to immune checkpoint inhibition. We report a case of an 80-year-old female with metastatic cholangiocarcinoma, presenting with progressive asthenia, ptosis and dysphagia, following completion of six cycles of combination chemotherapy and immunotherapy, durvalumab. Her symptoms emerged 2 weeks after the commencement of maintenance therapy with immune checkpoint inhibitor, durvalumab, and poly(ADP-ribose) polymerase inhibitor, olaparib. Biochemical investiga…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rab4A, a small GTPase overexpressed in T cells of patients with systemic lupus erythematosus (SLE), has been shown to activate mechanistic t … T cells. Rab4A-driven CD38-mediated NAD+ depletion elicits the accumulation of nicotinamide and ADP-ribose and secondary depletion of cyclic ADP-ribose. Surprisingly, rapamycin further enhanced CD38 expression and reduced IL-2 secretion, suggesting that IL-2 depletion is mTOR-independent. Alternatively, Rab4A-driven upregulation of CD38 promoted STAT3 ex …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: During the evolution of the novel severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) pandemic, several drug candidates have been proposed for repositioning towards a quest for more effective treatments.
METHODOLOGY: We reviewed recent literature (Pubmed, Google, Clinicaltrials.gov), as of the middle of May 2021, for evidence regarding the potential benefit from poly(ADP-ribose)-polymerase inhibitors and vascular endothelial growth factor blockade in severe SARS-CoV-2 infection.
RESULTS: poly(ADP-ribose)-polymerase inhibitors have been suggested as potential agents aga…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Poly(ADP-ribose)ylation (PARylation) by PAR polymerase 1 (PARP1) and PARylation removal by poly(ADP-ribose) glycohydrolase (PARG) critically regulate DNA damage responses; yet, conflicting reports obscure PARG biology and its impact on cancer cell resistance to PARP1 inhibitors. Here, we found that PARG expression is upregulated in many cancers. We employed chemical library screening to identify and optimize methylxanthine derivatives as selective bioavailable PARG inhibitors. Multiple crystal structures reveal how substituent positions on the methylxanthine core dictate binding modes and indu…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
XRCC1 is a molecular scaffold protein that assembles multi-protein complexes involved in DNA single-strand break repair. Here we show that b … me caused by mutations in the XRCC1 partner protein PNKP and implicates hyperactivation of poly(ADP-ribose) polymerase/s as a cause of cerebellar ataxia. Indeed, remarkably, genetic deletion of Parp1 rescued normal cerebellar ADP-ribose levels and reduced the loss of cerebellar neurons and ataxia in Xrcc1-defective mice, identifying a molecular mechanism …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nucleotide excision repair (NER) is the principal pathway that removes helix-distorting deoxyribonucleic acid (DNA) damage from the mammalia … ich strictly required functional DDB2 and involved the activity of poly(adenosine diphosphate [ADP]-ribose) polymerase 1. Finally, we show that lesion recognition by XPC, but not DDB2, was strongly reduced in ATP-depleted cells and was regulated by the steady-state levels of poly(ADP-ribose) chains.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Male germ cell DNA damage, after exposure to radiation, exogenous chemicals, or chemotherapeutic agents, is a major cause of male infertilit … rial function and biomarkers of the DNA damage response: γH2AX foci, 53BP1 reactivity, and poly(ADP-ribose) polymer formation. Mitochondrial activities did not differ between embryos sired by control- and cyclophosphamide-exposed males. At the two-cell stage, there was no treatment-related increase in DNA double-strand breaks; by the eight-cell stage, a …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phosphorus is an essential element for all known forms of life. In living systems, phosphorus is an integral component of nucleic acids, car … essential for C-P bond cleavage. Here we show that methylphosphonate reacts with MgATP to form α-D-ribose-1-methylphosphonate-5-triphosphate (RPnTP) and adenine. The triphosphate moiety of RPnTP is hydrolysed to pyrophosphate and α-D-ribose-1-methylphosphonate-5-phosphate (PRPn). The C-P bond of PRPn is subsequently cleaved in a radical-based reaction p …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An Arg-specific mono(ADP-ribosyl)transferase activity on the surface of human polymorphonuclear neutrophil leucocytes (PMNs) was confirmed by the use of diethylamino-(benzylidineamino)guanidine (DEA-BAG) as an ADP-ribose acceptor. Two separate HPLC systems were used to separate ADP-ribosyl-DEA-BAG from reaction mixtures, and its presence was confirmed by electrospray mass spectrometry. ADP-ribosyl-DEA-BAG was produced in the presence of PMNs, but not in their absence. Incubation of DEA-BAG with ADP-ribose (0.1-10 mM) did not yield ADP-ribosyl-DEA-BAG, which indicates that ADP-ribosyl-DEA-BAG f…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human peripheral blood leukocytes were studied for the presence and the regulatory properties of the pathway of de novo synthesis of purine … of purine synthesis. On the other hand, no clear-cut evidence was obtained for the availability of ribose-5-phosphate in the leukocyte being rate limiting at physiological extracellular Pi concentration for PRPP generation, and thus for purine synthesis. However, the addition of methylene blue, which accelerates the oxidative pentose shunt that produces …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования